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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-05-15 |
Construction of a Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Based on Cell Death-related Genes and Characterization of Immune Microenvironment
2026-Apr-22, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
DOI:10.18502/ijaai.v25i3.21259
PMID:42130143
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研究论文 | 基于细胞死亡相关基因构建肝细胞癌预后模型并表征免疫微环境 | 整合25种细胞死亡模式相关基因,通过多步骤分析筛选出6个预后基因并构建风险评分模型和列线图,结合单细胞RNA测序解析关键细胞类型和细胞间通讯 | 研究基于公开转录组数据集,样本规模有限,且单细胞分析结果需进一步实验验证 | 阐明与25种细胞死亡模式相关的基因在肝细胞癌发生发展中的作用,并构建预后模型 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | Cox比例风险模型,多变量回归模型 | 基因表达数据 | 多项公开数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2026-05-15 |
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Apr-15, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00744-w
PMID:41986506
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研究论文 | 对人类胰腺胰岛进行深度单细胞解码,揭示了2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 | 首次对来自非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态的48名供体的245,878个人类胰岛细胞进行全面的单细胞转录组分析,并识别出14种不同细胞类型,发现T2Dβ细胞中511个差异表达基因,包括维生素A代谢相关基因,并通过多模态功能验证与β细胞活力受损关联;整合T2D遗传学、蛋白质组学和小鼠模型代谢表型,确定了58个候选因果T2D基因 | 可能受限于样本来源和数量,尚未充分验证所有候选基因在T2D病理生理中的具体作用机制 | 揭示2型糖尿病中人类胰岛细胞类型特异性的改变及其基因表达缺陷 | 48名供体的人类胰岛细胞,包括非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 245,878个细胞来自48名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-05-15 |
Loss of MITF activity leads to emergent cell states from the melanocyte stem cell lineage
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.695681
PMID:41993564
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研究论文 | 利用斑马鱼模型研究MITF活性缺失对黑素细胞干细胞谱系中细胞状态涌现的影响 | 首次通过活体成像结合单细胞转录组学和谱系追踪,揭示MITF活性缺失导致黑素细胞干细胞在胚胎发育过程中出现异常早期扩张及新的转录细胞状态 | 未明确说明研究的局限性 | 探究MITF在胚胎发育中保护黑素细胞干细胞及其成体色素生成潜能的作用机制 | 斑马鱼黑素细胞干细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据、活体成像数据 | 斑马鱼胚胎及幼体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2026-05-15 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the spatiotemporal trajectory of the small peptide TAP4 in delaying postharvest fruit senescence
2026-Apr-07, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101846
PMID:41947460
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示小肽TAP4延缓采后果实衰老的时空轨迹 | 首次鉴定出胰蛋白酶自溶肽中活性最强的TAP4,并利用单细胞转录组分析揭示其通过调控内果皮细胞分化轨迹和激活特定转录因子(如HuWRKY21-1)来延缓果实衰老的新机制 | 未提及 | 探究胰蛋白酶自溶肽TAP4延缓火龙果采后衰老的分子机制 | 火龙果果实,特别是内果皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,病毒诱导基因沉默(VIGS) | NA | 基因表达数据,序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 625 | 2026-05-15 |
Self-regulating hydrogel for diabetic wound healing: From animal models to a pilot clinical study
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed4981
PMID:41920988
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研究论文 | 开发了一种自调节水凝胶GPP@ZnBG,用于糖尿病伤口愈合,并在动物模型和初步临床研究中验证其效果 | 提出了一种自pH调控的离子顺序释放策略,水凝胶能响应糖尿病伤口的高糖和氧化应激环境,先释放锌离子抗菌,后释放锌、钙、硅酸盐离子促进血管生成和组织修复 | 初步临床研究规模较小,且未报告长期随访数据,水凝胶的长期安全性和有效性需进一步验证 | 开发一种能自我调节的伤口敷料,通过响应糖尿病伤口微环境来释放治疗性离子,以促进感染控制和组织再生 | 糖尿病小鼠伤口模型和糖尿病患者的慢性伤口 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠(未指定数量)和初步临床研究中的患者(未指定数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 626 | 2026-05-15 |
Targeting TPO/MPL Signaling to Mitigate JAK2V617F-driven Cardiac Microvascular Disease
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715884
PMID:41959476
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研究论文 | 本文探讨靶向TPO/MPL信号通路减轻JAK2V617F驱动的心脏微血管疾病 | 首次发现MPL在内皮细胞中表达并介导JAK2V617F相关心血管并发症,且抗MPL抗体能改善心脏病理 | 研究主要基于小鼠模型,人类体内的验证及长期疗效仍需进一步探索 | 阐明JAK2V617F突变血细胞通过TPO/MPL信号导致心脏微血管功能障碍的机制 | JAK2V617F突变血细胞和野生型内皮的嵌合小鼠模型 | 机器学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、骨髓移植、组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 嵌合小鼠(数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 627 | 2026-05-15 |
Senescence-associated gene pathways are differentially expressed in equine aging-related osteoarthritis
2026-Apr-01, American journal of veterinary research
IF:1.3Q2
DOI:10.2460/ajvr.25.09.0343
PMID:41468690
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研究论文 | 本研究分析了马骨关节炎中关节和白细胞衰老相关基因的差异表达 | 首次利用单细胞RNA测序和mRNA测序数据,系统地比较了马骨关节炎局部(关节)和全身(外周血单核细胞)的衰老基因表达谱 | 未提及具体限制,但样本量较小,且缺乏功能验证实验 | 探究衰老相关基因在马骨关节炎中的表达模式,为开发针对衰老细胞的治疗策略提供依据 | 马关节滑液细胞和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 65个样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-05-15 |
Goblet of fire: how Chlamydia ignites region-specific colitis by hijacking goblet cells
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI204928
PMID:41919496
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评论 | 本文通过TNF驱动的小鼠模型和单细胞RNA测序数据,揭示了沙眼衣原体通过劫持杯状细胞并激活IDO1/犬尿氨酸通路,促进结肠近端区域特异性炎症的机制 | 首次证明沙眼衣原体作为必要且充分的驱动因子,通过上调杯状细胞中IDO1表达,促进区域限制性肠道炎症,并发现该机制仅发生于近端结肠而非末端回肠 | 研究仅基于小鼠模型和有限的人类数据,需要进一步验证IDO1/犬尿氨酸通路在其他克罗恩病患者群体中的普适性 | 阐明细菌共生体驱动肠道区域特异性炎症的分子机制 | 克罗恩病患者的升结肠区域和TNF驱动的小鼠小肠克罗恩病模型 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者升结肠的单细胞RNA测序数据集(具体样本量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2026-05-15 |
CD8 TRM-like T cells expressing perforin and IFN-γ define a pediatric activated T-cell acute liver failure endotype
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000926
PMID:41921202
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研究论文 | 该研究通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序,鉴定了儿童急性肝衰竭的两种不同内型,其中一种与表达穿孔素和IFN-γ的CD8 TRM样T细胞相关 | 首次定义了儿童活化T细胞急性肝衰竭的两种不同内型,并揭示了高穿孔素内型中独特的循环CD8+IFNγ+Trm样细胞群与单核细胞增殖和激活的关联 | 该研究未提及具体限制,但可能包括样本量有限、缺乏长期随访数据等潜在局限性 | 表征儿童活化T细胞急性肝衰竭的免疫病理学特征,并评估T细胞导向治疗的效用以改善无移植生存率 | 儿童活化T细胞急性肝衰竭患者、健康儿童以及因其他原因导致急性肝衰竭的儿童 | 机器学习,数字病理学 | 儿科疾病,肝病 | 多参数流式细胞术,3'单细胞RNA测序,Olink炎症I 384蛋白检测 | NA | NA | TRIUMPH临床研究中的儿童活化T细胞急性肝衰竭患者、健康儿童及其他原因导致急性肝衰竭的儿童 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 3'单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 630 | 2026-05-15 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-Mar-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
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研究论文 | 提出基于掩蔽信息瓶颈的scMIB框架,用于单细胞RNA测序数据聚类中的鲁棒表示学习 | 首次将掩蔽去噪策略与信息瓶颈目标相结合,通过掩蔽一致性学习机制捕获稳定的基因级模式,有效抑制噪声和冗余信息 | 未提及具体限制,可能在于对超参数敏感或需进一步验证在大规模数据集的扩展性 | 开发一种鲁棒的低维表示学习方法,以改善scRNA-seq数据聚类性能并减轻噪声和稀疏性的影响 | 多个公开scRNA-seq数据集中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | RNA-seq | scMIB | 基因表达数据 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2026-05-15 |
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Mar-26, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001053
PMID:41885952
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响 | 结合断层成像、共聚焦成像和单细胞RNA测序,全面表征低蛋白饮食对肾脏发育过程中细胞和分子过程的影响 | 研究未明确低蛋白饮食影响肾祖细胞承诺的具体分子机制,且样本来源可能仅限于小鼠模型 | 探究母体低蛋白饮食如何影响胎儿肾脏的细胞和分子发育过程,导致肾单位数量减少 | 胎儿肾脏组织及肾祖细胞 | 数字病理学 | 高血压、慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | 小鼠肾脏样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 632 | 2026-05-15 |
A single-cell atlas of Toxoplasma sexual development in the feline intestinal tract
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.31.685900
PMID:41929010
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研究论文 | 通过猫肠道的单细胞转录组学图谱,揭示了弓形虫在猫肠道内进行有性发育的基因调控机制 | 首次利用单细胞转录组学构建猫肠道内弓形虫有性发育的细胞图谱,并通过CRISPR-Cas9 Perturb-seq鉴定AP2X6为大配子母细胞发育的关键调节因子 | 未提及具体局限性 | 探究弓形虫在猫肠道中进行有性发育的基因调控网络 | 从猫肠道分离的弓形虫细胞,包括稀有细胞群体如配子细胞 | 单细胞转录组学 | 弓形虫病 | 单细胞转录组学、CRISPR-Cas9 Perturb-seq、荧光报告株、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个实验共15,068个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2026-05-15 |
A Novel Sequencing Method for Quantification of ZIKV RNA in Individual Cells
2026-Mar-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5645
PMID:41924239
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研究论文 | 详细介绍了一种用于单个细胞中ZIKV RNA定量分析的新型测序方法 | 开发了ZIKV靶向单细胞RNA测序工作流程,整合病毒富集与宿主转录组数据,在单细胞水平实现ZIKV RNA定量 | NA | 开发一种在单细胞水平定量分析寨卡病毒RNA的新方法 | 新生小鼠全脑组织中的细胞 | 单细胞测序 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠的全脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2026-05-15 |
Integrated single-cell and spatial analysis reveals context-dependent myeloid-T cell interactions in response to immune checkpoint blockade in head and neck cancer
2026-Mar-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2300
PMID:41837744
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研究论文 | 利用单细胞和空间组学技术,系统评估头颈部鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗中髓系细胞与T细胞的上下文依赖性相互作用 | 整合Visium空间转录组学和CosMx SMI单细胞空间组学,结合64重蛋白和1000基因RNA检测面板,揭示ICB响应中髓系-T细胞相互作用的空间和细胞类型特异性 | 未明确说明 | 系统评估头颈部鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗中肿瘤浸润免疫细胞的细胞间相互作用 | 23名ICB治疗患者的522,399个单细胞,以及8名患者的空间转录组数据 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学,单细胞空间组学,RNA-seq | NA | 单细胞RNA和蛋白,空间RNA,公开单细胞和bulk RNA-seq | 23名患者单细胞数据,8名患者空间转录组数据 | 10x Genomics,NanoString | 空间转录组学,单细胞空间组学 | 10x Visium,CosMx SMI | Visium基于点的空间转录组学,CosMx SMI单细胞空间组学使用64重蛋白面板和1000基因RNA面板 |
| 635 | 2026-05-15 |
Plasma Proteome-Driven Identification of Druggable Immune Regulators of Alopecia Areata, Validated by Transcriptome and Single-Cell Mapping
2026-Mar-11, Skin appendage disorders
IF:1.4Q3
DOI:10.1159/000551293
PMID:42130663
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研究论文 | 通过血浆蛋白质组驱动识别斑秃的可药物免疫调节因子,并经转录组和单细胞图谱验证 | 创新地建立了蛋白质组锚定的多组学框架,整合遗传工具、病变转录组学和单细胞免疫图谱,系统识别斑秃的可药物上游免疫调节因子,并首次将CD28作为具有良好安全性的可操作靶点 | 未提供具体限制信息 | 识别斑秃中可药物的上游免疫调节因子,并评估其安全性和治疗潜力 | 斑秃患者血浆蛋白质、病变组织转录组和头皮单细胞免疫图谱 | 机器学习 | 斑秃 | 蛋白质组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA数据 | 未提供具体样本数量,涉及UKB-PPP和deCODE两个大型蛋白质组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-05-15 |
Population Analysis and Immunologic Landscape of Melanoma in People Living with HIV
2026-Mar-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3148
PMID:41504629
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研究论文 | 分析HIV感染者黑色素瘤的人群特征与免疫微环境 | 首次结合大规模人群数据与空间免疫转录组学及多重免疫荧光技术,揭示HIV感染者黑色素瘤特有的免疫抑制微环境特征及治疗延迟现象 | 空间转录组样本量较小(11例),且仅涉及72种免疫相关基因,可能遗漏关键免疫通路信息 | 阐明HIV感染者黑色素瘤的临床与免疫特征差异 | HIV阳性黑色素瘤患者与HIV阴性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤, HIV感染 | 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 电子健康记录, 空间转录组数据, 多重免疫荧光图像 | 1,087例HIV阳性及394,437例HIV阴性黑色素瘤患者;空间转录组n=11,多重免疫荧光n=29 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间免疫转录组学分析72种免疫相关基因,多重免疫荧光检测免疫细胞亚群 |
| 637 | 2026-05-15 |
The Histone Methyltransferase KMT2D Is a Critical Mediator of Lineage Plasticity and Therapeutic Response in Castration-Resistant Prostate Cancer
2026-Mar-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2053
PMID:41379538
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶KMT2D在去势抵抗性前列腺癌中通过调控染色质状态和转录因子招募,维持不同CRPC亚型身份并影响治疗反应的关键角色 | 首次发现KMT2D在AR依赖性和AR低表达的CRPC-SCL亚型中均发挥关键作用,通过调控AP-1和FOXA1转录因子维持混合谱系细胞状态 | 具体局限性未在摘要中提及 | 阐明控制CRPC不同细胞状态维持的表观遗传机制,为有效联合治疗策略铺路 | CRPC细胞系、患者来源类器官及患者样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学、染色质分析 | NA | 单细胞转录组数据、染色质数据 | CRPC细胞系、患者来源类器官及患者样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 638 | 2026-05-15 |
The transcriptional landscape of developing human trisomy 21 lungs
2026-Mar-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0217OC
PMID:40997082
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研究论文 | 通过对唐氏综合征(T21)胎儿肺组织进行单细胞RNA测序,揭示了T21肺发育早期的转录组变化 | 首次在单细胞水平描绘了唐氏综合征胎儿肺组织在产前阶段的分子变化图谱,发现了上皮细胞过早分化和间充质细胞中细胞外基质分子广泛诱导等新现象 | 仅使用了有限样本量(T21=5,非T21=4),可能无法完全代表个体差异 | 阐明唐氏综合征患者肺部并发症的产前发生机制及分子基础 | 唐氏综合征(T21)胎儿和正常(非T21)胎儿的肺组织 | 单细胞转录组学 | 唐氏综合征(21三体综合征) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5个T21胎儿肺样本和4个非T21胎儿肺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 639 | 2026-05-15 |
Transient activation of potent progenitor cells is required for spinal cord regeneration
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703854
PMID:41924399
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞测序,揭示了斑马鱼脊髓再生过程中一种短暂激活的多能祖细胞的作用及分子调控机制 | 首次鉴定出Bach1转录因子作为双重激活和抑制因子,调控祖细胞在损伤后的短暂激活与再生完成后的静息恢复,并揭示了脊髓祖细胞的分子异质性和谱系偏向性 | 研究主要基于斑马鱼模型,其结果向哺乳动物或人类脊髓损伤治疗的转化潜力尚需进一步验证 | 阐明斑马鱼脊髓再生中关键祖细胞的分子身份、细胞贡献及其静息恢复的调控机制 | 成体斑马鱼脊髓损伤后的神经祖细胞 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼脊髓组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 640 | 2026-05-15 |
IL-5 CAR-T cell therapy induces effective remission in hypereosinophilic disorders
2026-02-13, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01782-x
PMID:41689037
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研究论文 | 本研究开发了针对IL-5Rα+嗜酸性粒细胞增多症的首创IL-5 CAR-T细胞疗法,并证明了其在难治性HES和CEL中的治疗潜力 | 首次开发以人IL-5为配体靶向域的CAR-T疗法,能够清除所有发育阶段的嗜酸性粒细胞及其前体细胞,弥补了现有靶向IL-5/IL-5Rα单抗疗法持久性不足的缺陷 | 目前仅在临床前模型(小鼠模型和患者样本体外实验)验证,尚缺乏临床试验数据验证安全性和有效性 | 探索CAR-T细胞疗法治疗难治性嗜酸性粒细胞增多症(HES和CEL)的可行性与疗效 | 嗜酸性粒细胞增多症患者及健康人的外周血和骨髓样本、嗜酸性粒细胞白血病小鼠模型 | 机器学习 | 嗜酸性粒细胞增多症、慢性嗜酸性粒细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) | 健康人和嗜酸性粒细胞增多症患者的外周血和骨髓样本(具体数量未明确提及),以及小鼠模型(数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |