单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6341 - 6360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6341 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals lasting immunological consequences of influenza infection and respiratory immunization in the pig lung
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011910
PMID:39024231
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究猪肺部流感感染和呼吸道免疫后的持久免疫学变化 | 首次在猪模型中结合scRNA-seq和流式细胞术系统分析流感感染和呼吸道免疫后肺泡灌洗液中免疫细胞的持久变化，并发现IL-1β可减少功能性Treg细胞 | 研究仅观察感染后21天的免疫变化，缺乏更长时间点的追踪数据 | 探究流感感染和呼吸道免疫在猪肺部的持久免疫学影响 | 猪肺泡灌洗液中的白细胞亚群 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 猪肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6342 | 2025-10-06 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024-06, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:39215134
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研究论文 | 通过构建基因调控网络识别并验证血管平滑肌细胞增殖的关键调控因子 | 首次结合单细胞转录组和表观遗传分析揭示VSMC增殖的调控机制，发现RUNX1和TIMP1-CD74轴等新调控因子 | 研究主要基于计算分析和体外验证，需要进一步体内实验确认临床转化潜力 | 阐明血管疾病中血管平滑肌细胞增殖的分子调控机制 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,表观遗传分析 | 基因调控网络,计算机扰动分析 | 单细胞RNA测序数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6343 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1399319
PMID:39045456
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析杜氏肌营养不良症患者纤维脂肪前体细胞的功能状态差异 | 首次在人类样本中揭示DMD患者FAP细胞存在不同功能亚群及其特异性基因表达特征 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明杜氏肌营养不良症中FAP细胞的分子调控机制和功能状态 | 健康对照和DMD患者的纤维脂肪前体细胞 | 单细胞转录组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，qPCR验证 | Seurat分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确总样本数，验证阶段包含9个额外样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
| 6344 | 2025-10-06 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析揭示嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 首次结合单细胞基因表达和染色质可及性分析，发现处于静息状态但表观遗传预激活的嗅觉干细胞亚群 | 研究聚焦于嗅觉上皮特定再生过程，结论在其他神经再生系统中的普适性需进一步验证 | 解析损伤诱导再生过程中嗅觉上皮干细胞命运决定的分子机制 | 谱系追踪的单个嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | 神经再生 | 单细胞测序，染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6345 | 2025-10-06 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02193-4
PMID:38565973
|
研究论文 | 提出了一种利用基因-基因协变结构表示细胞邻域特征的空间分析方法 | 引入了协变环境(COVET)表示法和基于最优传输的距离度量，开发了环境变分推断(ENVI)模型 | NA | 解决高分辨率空间分析技术中细胞邻域特征表示的关键挑战 | 细胞邻域或生态位 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 数百万细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6346 | 2025-10-06 |
Efficient and accurate detection of viral sequences at single-cell resolution reveals putative novel viruses perturbing host gene expression
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.11.571168
PMID:38168363
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研究论文 | 开发了一种基于高度保守氨基酸域的高效准确检测病毒序列的方法，可在单细胞分辨率下识别新型病毒及其对宿主基因表达的影响 | 提出不依赖参考基因组的病毒检测方法，能够在单细胞水平同时分析病毒存在和宿主基因表达，首次实现超过10万种RNA病毒的检测覆盖 | 方法主要针对RNA病毒，对其他类型病毒的检测能力可能有限，且目前仅在恒河猴PBMC数据中得到验证 | 开发高效准确的病毒检测方法，研究病毒感染对宿主基因表达的影响 | 病毒序列和宿主基因表达 | 生物信息学 | 病毒感染 | 高通量测序，单细胞转录组学 | 基于保守氨基酸域的检测算法 | 转录组测序数据 | 恒河猴外周血单个核细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6347 | 2025-10-06 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学构建人类胚胎肢体发育的时空细胞图谱 | 首次在人类胚胎肢体发育中鉴定出多个新细胞群体，发现肌肉发育的两个不同阶段波次，并揭示关键转录抑制因子MSC | 研究主要基于转录组数据，功能验证实验相对有限 | 深入解析人类胚胎肢体发育的细胞多样性和时空动态变化 | 人类和小鼠胚胎肢体组织 | 空间转录组学 | 先天性肢体畸形 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个人类胚胎肢体样本和小鼠胚胎肢体样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 使用VisiumStitcher整合多个解剖连续的空间转录组样本 |
| 6348 | 2025-10-06 |
Overcoming barriers to single-cell RNA sequencing adoption in low- and middle-income countries
2024-Oct, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01564-4
PMID:38565638
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观点文章 | 探讨在中低收入国家推广单细胞RNA测序技术面临的障碍及解决方案 | 首次系统分析单细胞测序技术在中低收入国家应用面临的独特挑战，并提出促进全球平等参与的协作框架 | 未提供具体实施案例或定量数据分析 | 促进单细胞测序技术在全球范围内的公平应用和祖先多样性包容 | 中低收入国家的研究人员和捐赠者群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 6349 | 2025-10-06 |
Exponential family measurement error models for single-cell CRISPR screens
2024-Oct-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxae010
PMID:38649751
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研究论文 | 提出GLM-EIV方法解决单细胞CRISPR筛选数据分析中的统计挑战 | 将经典变量误差模型扩展至指数族分布，可处理响应变量和噪声预测变量受相同混杂变量影响的情况 | 未明确说明方法在特定数据类型或规模下的适用性限制 | 开发单细胞CRISPR筛选数据的统计分析方法 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | GLM-EIV（基于广义线性模型的变量误差模型） | 基因表达数据 | 两个大规模单细胞CRISPR筛选数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6350 | 2025-10-06 |
Genetic Implication of Prenatal GABAergic and Cholinergic Neuron Development in Susceptibility to Schizophrenia
2024-08-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae083
PMID:38869145
|
研究论文 | 本研究通过整合精神分裂症全基因组关联研究和人类神经节隆起单细胞测序数据，探讨了产前GABA能及胆碱能神经元发育在精神分裂症遗传易感性中的作用 | 首次结合GWAS数据与人类神经节隆起单细胞转录组和染色质可及性数据，系统揭示了精神分裂症遗传风险在特定发育神经元群体中的富集模式 | 研究主要基于相关性分析，需要进一步功能实验验证 | 探究神经节隆起神经元发育在介导精神分裂症遗传风险中的潜在作用 | 人类胎儿神经节隆起的发育神经元群体 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 全基因组关联分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 6351 | 2025-10-06 |
Adaptation to ex vivo culture reduces human hematopoietic stem cell activity independently of the cell cycle
2024-08-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021426
PMID:38805639
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析揭示了人类长期造血干细胞在体外培养中功能丧失的机制 | 发现HSC功能丧失发生在细胞周期进展之前，且与细胞周期无关，并证明通过抑制JAK/STAT信号可改善HSC功能 | 研究主要关注早期培养阶段（6-24小时），长期培养效应需进一步研究 | 探究人类长期造血干细胞在体外培养中功能丧失的动力学和机制 | 人类长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 功能分析, 细胞周期阻滞 | NA | 单细胞转录组数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6352 | 2025-10-06 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
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研究论文 | 本研究通过患者来源的肠道类器官生物库，发现克罗恩病中肠道上皮MHC-I表观遗传失调的新机制 | 首次在克罗恩病中鉴定出肠道上皮MHC-I的表观遗传调控机制，并开发了疾病预后的表观遗传分子标志物 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 研究肠道上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 168名患者（克罗恩病72人，溃疡性结肠炎23人，健康对照73人）的肠道黏膜活检样本 | 表观遗传学 | 克罗恩病 | DNA甲基化分析，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，基因编辑，类器官-淋巴细胞共培养 | 机器学习 | 表观基因组数据，转录组数据 | 312个肠道上皮类器官，来自168名患者 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6353 | 2025-10-06 |
Endothelial Heterogeneity in the Response to Autophagy Drives Small Vessel Muscularization in Pulmonary Hypertension
2024-Aug-06, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了自噬激活通过诱导肺动脉内皮细胞增殖和微血管内皮细胞凋亡，驱动肺动脉高压中小血管肌化的机制 | 首次阐明不同内皮细胞亚群对缺氧的自噬反应差异是导致血管重塑的关键机制，并证明自噬介导的微血管内皮细胞被肺动脉内皮细胞替代是远端血管肌化的直接原因 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类样本中的验证仍需进一步扩展 | 探究肺动脉高压中内皮细胞异质性对血管重塑的影响机制 | 小鼠、大鼠和人类的内皮细胞及肺组织 | 细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 药理学抑制 | 动物模型, 体外细胞培养 | 基因表达数据, 组织切片图像 | 多种物种的内皮细胞和肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6354 | 2025-10-06 |
Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications
2024-Aug, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09929-5
PMID:38775849
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研究论文 | 开发可扩展的3D培养方案生成稳定的人多能干细胞来源心脏微血管样内皮细胞 | 建立基于3D搅拌釜生物反应器的可扩展分化方案，通过高浓度VEGF-A处理获得表型稳定的心脏特异性微血管样内皮细胞 | 未提及临床前或临床应用验证数据 | 开发适用于心脏微血管疾病研究和组织工程应用的稳健细胞模型 | 人多能干细胞来源的内皮细胞和周细胞样细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉微血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，3D细胞培养 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6355 | 2025-10-06 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.07.597992
PMID:38915654
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定前列腺增生组织中富含脂质的巨噬细胞亚群及其与前列腺体积增大的关联 | 首次在前列腺增生组织中鉴定出TREM2+和MARCO+巨噬细胞亚群，这些脂质代谢重编程的巨噬细胞不遵循传统M1/M2分类 | 需要进一步研究评估靶向这些细胞对前列腺增生的治疗价值 | 探究巨噬细胞亚群在前列腺增生发病机制中的作用 | 人类良性前列腺增生组织中的CD45+白细胞 | 单细胞测序分析 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 20例人类前列腺组织（10例大前列腺>90克，10例小前列腺<40克） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6356 | 2025-10-06 |
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.03.03.23286485
PMID:37961528
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研究论文 | 本研究通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的特征和免疫聚集体的细胞组成 | 首次在儿童AML中发现近三分之一病例存在免疫浸润骨髓，并识别了包含CD8 T细胞、记忆B细胞、浆细胞和M1样巨噬细胞的免疫聚集热点 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 解析儿童AML骨髓免疫微环境的组成、表型和空间结构 | 儿童急性髓系白血病患者骨髓样本和非白血病对照样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 儿童AML病例和非白血病对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6357 | 2025-10-06 |
Accelerated dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data with fastglmpca
2024-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586420
PMID:38585920
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研究论文 | 本文提出了一种名为快速GLM-PCA的新算法，用于加速单细胞RNA测序数据的降维处理 | 开发了交替泊松回归(APR)算法，相比现有算法能产生更高质量的拟合结果且计算时间更短 | 仅在两个已发表的单细胞RNA-seq数据集上进行了验证，需要更多数据集验证通用性 | 解决单细胞RNA测序数据降维中的计算效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GLM-PCA, 交替泊松回归(APR) | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6358 | 2025-10-06 |
γδ T cell profiling in a cohort of preterm infants reveals elevated frequencies of CD83+ γδ T cells in sepsis
2024-Jul-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231987
PMID:38753245
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研究论文 | 本研究通过纵向队列分析揭示了早产儿γδ T细胞在新生儿败血症中的动态变化和表型特征 | 首次在新生儿败血症中发现HLA-DRhiCD83+ γδ T细胞亚群，并揭示其抗原呈递相关基因表达特征 | 样本仅限于早产儿队列，未包含更大规模的验证队列 | 探究早产儿γδ T细胞在新生儿败血症中的免疫学特征和功能 | 早产儿队列中的γδ T细胞 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 二代测序,流式细胞术,单细胞转录组学,功能实验 | NA | 基因组数据,蛋白质表达数据,单细胞转录组数据 | 早产儿纵向队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6359 | 2025-10-06 |
Identifying proteomic risk factors for overall, aggressive, and early onset prostate cancer using Mendelian Randomisation and tumour spatial transcriptomics
2024-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105168
PMID:38878676
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和肿瘤空间转录组学识别与总体、侵袭性和早发性前列腺癌相关的蛋白质组风险因素 | 首次整合孟德尔随机化、共定位分析和空间转录组学方法系统鉴定前列腺癌风险相关蛋白，并验证其与肿瘤侵袭性的关联 | 研究主要基于遗传预测的蛋白水平，未直接测量循环蛋白浓度；部分发现需要在更多种族群体中验证 | 识别前列腺癌风险相关的循环蛋白，揭示生物学通路并发现新的癌症预防靶点 | 前列腺癌患者（总体、侵袭性和早发性疾病） | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化, 共定位分析, 空间转录组学, GWAS | NA | 遗传数据, 转录组数据 | 2002种遗传预测的循环蛋白水平，两个独立癌症GWAS数据集（欧洲和非洲 ancestry） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6360 | 2025-10-06 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-07, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13892
PMID:38829682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现早发性阿尔茨海默病患者外周血中干扰素响应性T细胞显著扩增 | 首次在早发性阿尔茨海默病患者中发现抗病毒样ISAGhi T细胞的显著扩增和干扰素信号通路基因表达上调 | 样本量较小，需要进一步研究验证这些细胞在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 研究早发性阿尔茨海默病的免疫特征变化 | 早发性阿尔茨海默病患者和临床正常对照者的外周血单核细胞及CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 微滴数字PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 16例个体进行scRNA-seq分析，19例个体进行CD4 T细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |