单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6341 - 6360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6341 | 2025-10-06 |
Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110529
PMID:39161957
|
研究论文 | 通过多模态分析方法揭示肿瘤微环境异质性及其与免疫活性和免疫逃逸的关联 | 开发了名为iHet的肿瘤微环境异质性特征，该特征在不同癌症中具有保守性，并能预测免疫治疗效果 | 研究主要基于转录组学数据，可能未涵盖肿瘤微环境的所有分子层面 | 解析肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗的影响 | 肺癌肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 系统生物学方法，单细胞转录组测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 6342 | 2025-10-06 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
|
研究论文 | 开发了PURE-seq技术用于稀有细胞测序，并应用于小鼠造血衰老研究 | 开发了PURE-seq技术，能够直接从FACS分选细胞进行测序，有效捕获稀有细胞（百万分之一的稀有度） | 未明确说明技术验证的样本规模和应用范围限制 | 研究造血衰老过程中长寿命造血干细胞及其转录组特征 | 小鼠长寿命造血干细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数十个细胞（百万分之一稀有度） | NA | 单细胞RNA-seq | PURE-seq | PIP-seq for Rare-cell Enrichment and Sequencing，支持直接从FACS加载细胞 |
| 6343 | 2025-10-06 |
High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01883-0
PMID:38956378
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术解析人类自然杀伤细胞的异质性 | 首次在健康人血液中鉴定出三个主要NK细胞亚群及其六个亚组，揭示了NK细胞的两种不同发育起源 | 样本来源仅限于健康个体和部分肿瘤组织，未涵盖其他疾病状态 | 系统解析人类自然杀伤细胞的异质性和功能特征 | 人类自然杀伤细胞 | 单细胞生物学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白数据 | 健康人血液、肺组织、扁桃体、上皮内淋巴细胞及22种肿瘤类型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6344 | 2025-10-06 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on SARS-CoV-2 Disease, Viral Dynamics, and Antiviral Immune Response in a Nonhuman Primate Model of Coinfection
2024-07-21, Viruses
DOI:10.3390/v16071173
PMID:39066335
|
研究论文 | 本研究通过SIV感染的非人灵长类动物模型，探讨免疫缺陷对SARS-CoV-2感染过程及免疫应答的影响 | 首次在可控环境下直接验证HIV相关免疫缺陷对COVID-19疾病进程和病毒持久性的影响 | 样本量较小（仅2只SIV感染动物），属于初步研究 | 研究免疫缺陷状态下SARS-CoV-2的疾病表现、病毒动力学和抗病毒免疫应答 | SIV慢性感染的猪尾猕猴和SIV未感染的对照猕猴 | 免疫学 | HIV/AIDS, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床观察数据 | 2只SIV慢性感染猪尾猕猴，另设SIV未感染对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6345 | 2025-10-06 |
Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen
2024-Jul-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92679
PMID:38979889
|
研究论文 | 本研究探讨CD47和血小板反应蛋白-1对小鼠脾脏髓外红细胞生成的差异调控机制 | 首次揭示CD47缺失通过促进脾脏Ter119-CD34-祖细胞增殖增强髓外红细胞生成，而血小板反应蛋白-1缺失则通过延缓衰老红细胞清除抑制该过程 | 研究仅使用小鼠模型，未验证人类相关机制 | 阐明CD47和血小板反应蛋白-1信号通路在调控成年小鼠脾脏髓外红细胞生成中的作用机制 | CD47或血小板反应蛋白-1基因敲除小鼠的脾脏细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | 基因敲除小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6346 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals lasting immunological consequences of influenza infection and respiratory immunization in the pig lung
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011910
PMID:39024231
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究猪肺部流感感染和呼吸道免疫后的持久免疫学变化 | 首次在猪模型中结合scRNA-seq和流式细胞术系统分析流感感染和呼吸道免疫后肺泡灌洗液中免疫细胞的持久变化，并发现IL-1β可减少功能性Treg细胞 | 研究仅观察感染后21天的免疫变化，缺乏更长时间点的追踪数据 | 探究流感感染和呼吸道免疫在猪肺部的持久免疫学影响 | 猪肺泡灌洗液中的白细胞亚群 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 猪肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6347 | 2025-10-06 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024-06, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:39215134
|
研究论文 | 通过构建基因调控网络识别并验证血管平滑肌细胞增殖的关键调控因子 | 首次结合单细胞转录组和表观遗传分析揭示VSMC增殖的调控机制，发现RUNX1和TIMP1-CD74轴等新调控因子 | 研究主要基于计算分析和体外验证，需要进一步体内实验确认临床转化潜力 | 阐明血管疾病中血管平滑肌细胞增殖的分子调控机制 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,表观遗传分析 | 基因调控网络,计算机扰动分析 | 单细胞RNA测序数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6348 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1399319
PMID:39045456
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析杜氏肌营养不良症患者纤维脂肪前体细胞的功能状态差异 | 首次在人类样本中揭示DMD患者FAP细胞存在不同功能亚群及其特异性基因表达特征 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明杜氏肌营养不良症中FAP细胞的分子调控机制和功能状态 | 健康对照和DMD患者的纤维脂肪前体细胞 | 单细胞转录组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，qPCR验证 | Seurat分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确总样本数，验证阶段包含9个额外样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
| 6349 | 2025-10-06 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析揭示嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 首次结合单细胞基因表达和染色质可及性分析，发现处于静息状态但表观遗传预激活的嗅觉干细胞亚群 | 研究聚焦于嗅觉上皮特定再生过程，结论在其他神经再生系统中的普适性需进一步验证 | 解析损伤诱导再生过程中嗅觉上皮干细胞命运决定的分子机制 | 谱系追踪的单个嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | 神经再生 | 单细胞测序，染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6350 | 2025-10-06 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02193-4
PMID:38565973
|
研究论文 | 提出了一种利用基因-基因协变结构表示细胞邻域特征的空间分析方法 | 引入了协变环境(COVET)表示法和基于最优传输的距离度量，开发了环境变分推断(ENVI)模型 | NA | 解决高分辨率空间分析技术中细胞邻域特征表示的关键挑战 | 细胞邻域或生态位 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 数百万细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6351 | 2025-10-06 |
Efficient and accurate detection of viral sequences at single-cell resolution reveals putative novel viruses perturbing host gene expression
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.11.571168
PMID:38168363
|
研究论文 | 开发了一种基于高度保守氨基酸域的高效准确检测病毒序列的方法，可在单细胞分辨率下识别新型病毒及其对宿主基因表达的影响 | 提出不依赖参考基因组的病毒检测方法，能够在单细胞水平同时分析病毒存在和宿主基因表达，首次实现超过10万种RNA病毒的检测覆盖 | 方法主要针对RNA病毒，对其他类型病毒的检测能力可能有限，且目前仅在恒河猴PBMC数据中得到验证 | 开发高效准确的病毒检测方法，研究病毒感染对宿主基因表达的影响 | 病毒序列和宿主基因表达 | 生物信息学 | 病毒感染 | 高通量测序，单细胞转录组学 | 基于保守氨基酸域的检测算法 | 转录组测序数据 | 恒河猴外周血单个核细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6352 | 2025-10-06 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学构建人类胚胎肢体发育的时空细胞图谱 | 首次在人类胚胎肢体发育中鉴定出多个新细胞群体，发现肌肉发育的两个不同阶段波次，并揭示关键转录抑制因子MSC | 研究主要基于转录组数据，功能验证实验相对有限 | 深入解析人类胚胎肢体发育的细胞多样性和时空动态变化 | 人类和小鼠胚胎肢体组织 | 空间转录组学 | 先天性肢体畸形 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个人类胚胎肢体样本和小鼠胚胎肢体样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 使用VisiumStitcher整合多个解剖连续的空间转录组样本 |
| 6353 | 2025-10-06 |
Overcoming barriers to single-cell RNA sequencing adoption in low- and middle-income countries
2024-Oct, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01564-4
PMID:38565638
|
观点文章 | 探讨在中低收入国家推广单细胞RNA测序技术面临的障碍及解决方案 | 首次系统分析单细胞测序技术在中低收入国家应用面临的独特挑战，并提出促进全球平等参与的协作框架 | 未提供具体实施案例或定量数据分析 | 促进单细胞测序技术在全球范围内的公平应用和祖先多样性包容 | 中低收入国家的研究人员和捐赠者群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 6354 | 2025-10-06 |
Exponential family measurement error models for single-cell CRISPR screens
2024-Oct-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxae010
PMID:38649751
|
研究论文 | 提出GLM-EIV方法解决单细胞CRISPR筛选数据分析中的统计挑战 | 将经典变量误差模型扩展至指数族分布，可处理响应变量和噪声预测变量受相同混杂变量影响的情况 | 未明确说明方法在特定数据类型或规模下的适用性限制 | 开发单细胞CRISPR筛选数据的统计分析方法 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | GLM-EIV（基于广义线性模型的变量误差模型） | 基因表达数据 | 两个大规模单细胞CRISPR筛选数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6355 | 2025-10-06 |
Genetic Implication of Prenatal GABAergic and Cholinergic Neuron Development in Susceptibility to Schizophrenia
2024-08-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae083
PMID:38869145
|
研究论文 | 本研究通过整合精神分裂症全基因组关联研究和人类神经节隆起单细胞测序数据，探讨了产前GABA能及胆碱能神经元发育在精神分裂症遗传易感性中的作用 | 首次结合GWAS数据与人类神经节隆起单细胞转录组和染色质可及性数据，系统揭示了精神分裂症遗传风险在特定发育神经元群体中的富集模式 | 研究主要基于相关性分析，需要进一步功能实验验证 | 探究神经节隆起神经元发育在介导精神分裂症遗传风险中的潜在作用 | 人类胎儿神经节隆起的发育神经元群体 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 全基因组关联分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 6356 | 2025-10-06 |
Adaptation to ex vivo culture reduces human hematopoietic stem cell activity independently of the cell cycle
2024-08-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021426
PMID:38805639
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析揭示了人类长期造血干细胞在体外培养中功能丧失的机制 | 发现HSC功能丧失发生在细胞周期进展之前，且与细胞周期无关，并证明通过抑制JAK/STAT信号可改善HSC功能 | 研究主要关注早期培养阶段（6-24小时），长期培养效应需进一步研究 | 探究人类长期造血干细胞在体外培养中功能丧失的动力学和机制 | 人类长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 功能分析, 细胞周期阻滞 | NA | 单细胞转录组数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6357 | 2025-10-06 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
|
研究论文 | 本研究通过患者来源的肠道类器官生物库，发现克罗恩病中肠道上皮MHC-I表观遗传失调的新机制 | 首次在克罗恩病中鉴定出肠道上皮MHC-I的表观遗传调控机制，并开发了疾病预后的表观遗传分子标志物 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 研究肠道上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 168名患者（克罗恩病72人，溃疡性结肠炎23人，健康对照73人）的肠道黏膜活检样本 | 表观遗传学 | 克罗恩病 | DNA甲基化分析，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，基因编辑，类器官-淋巴细胞共培养 | 机器学习 | 表观基因组数据，转录组数据 | 312个肠道上皮类器官，来自168名患者 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6358 | 2025-10-06 |
Endothelial Heterogeneity in the Response to Autophagy Drives Small Vessel Muscularization in Pulmonary Hypertension
2024-Aug-06, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了自噬激活通过诱导肺动脉内皮细胞增殖和微血管内皮细胞凋亡，驱动肺动脉高压中小血管肌化的机制 | 首次阐明不同内皮细胞亚群对缺氧的自噬反应差异是导致血管重塑的关键机制，并证明自噬介导的微血管内皮细胞被肺动脉内皮细胞替代是远端血管肌化的直接原因 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类样本中的验证仍需进一步扩展 | 探究肺动脉高压中内皮细胞异质性对血管重塑的影响机制 | 小鼠、大鼠和人类的内皮细胞及肺组织 | 细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 药理学抑制 | 动物模型, 体外细胞培养 | 基因表达数据, 组织切片图像 | 多种物种的内皮细胞和肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6359 | 2025-10-06 |
Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications
2024-Aug, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09929-5
PMID:38775849
|
研究论文 | 开发可扩展的3D培养方案生成稳定的人多能干细胞来源心脏微血管样内皮细胞 | 建立基于3D搅拌釜生物反应器的可扩展分化方案，通过高浓度VEGF-A处理获得表型稳定的心脏特异性微血管样内皮细胞 | 未提及临床前或临床应用验证数据 | 开发适用于心脏微血管疾病研究和组织工程应用的稳健细胞模型 | 人多能干细胞来源的内皮细胞和周细胞样细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉微血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，3D细胞培养 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6360 | 2025-10-06 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.07.597992
PMID:38915654
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定前列腺增生组织中富含脂质的巨噬细胞亚群及其与前列腺体积增大的关联 | 首次在前列腺增生组织中鉴定出TREM2+和MARCO+巨噬细胞亚群，这些脂质代谢重编程的巨噬细胞不遵循传统M1/M2分类 | 需要进一步研究评估靶向这些细胞对前列腺增生的治疗价值 | 探究巨噬细胞亚群在前列腺增生发病机制中的作用 | 人类良性前列腺增生组织中的CD45+白细胞 | 单细胞测序分析 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 20例人类前列腺组织（10例大前列腺>90克，10例小前列腺<40克） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |