单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6321 - 6340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6321 | 2025-10-06 |
OrganogenesisDB: A Comprehensive Database Exploring the Cell-Type Identities and Gene Expression Dynamics during Organogenesis
2024-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301758
PMID:38967205
|
研究论文 | 开发了一个名为OrganogenesisDB的综合数据库，用于探索器官发生过程中的细胞类型鉴定和基因表达动态 | 首个专门针对器官发生过程的综合数据库，整合了超过140万个细胞的单细胞RNA测序数据和3324个细胞标记物 | NA | 解析细胞谱系决定和揭示器官发生的潜在机制 | 人类和小鼠器官发育过程中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过140万个细胞，来自49个已发表数据集，涵盖9个人类器官和4个小鼠器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6322 | 2025-10-06 |
Single Nucleus Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Gliomas
2024-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301801
PMID:38958078
|
研究论文 | 开发了自动化snRandom-seq平台用于福尔马林固定石蜡包埋胶质瘤样本的单核总RNA测序分析 | 开发了针对FFPE样本优化的高通量单核总RNA测序平台，整合自动化单核分离和液滴条形码系统 | 样本数量相对有限（17个FFPE样本），主要聚焦于胶质瘤 | 探索胶质瘤的分子多样性和肿瘤进化过程 | 各种胶质瘤亚型的FFPE样本，包括罕见临床样本和匹配的原发-复发胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 脑癌/胶质瘤 | 单核总RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 116,492个单核来自17个FFPE样本 | NA | 单细胞RNA测序 | snRandom-seq | 自动化单核总RNA测序平台，整合自动化单核分离和液滴条形码系统，基于随机引物的scRNA-seq化学方法 |
| 6323 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies aberrant glomerular angiogenic signalling in the early stages of WT1 kidney disease
2024-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6339
PMID:39177649
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了WT1肾病早期阶段肾小球血管生成信号传导的异常机制 | 揭示了WT1肾病早期阶段肾小球血管生成信号异常的新机制，并发现肾上腺髓质素作为一种促血管生成因子在早期损伤中的上调 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究WT1肾病早期发病机制及细胞间通讯异常 | WT1基因突变小鼠模型及人类WT1肾小球病变活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | WT1突变小鼠模型及人类活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6324 | 2025-10-06 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics of paediatric ovary: Molecular insights into the dysregulated signalling pathways underlying premature ovarian insufficiency in classic galactosemia
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70043
PMID:39440457
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析经典半乳糖血症患儿卵巢组织，揭示早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次构建了经典半乳糖血症患儿卵巢的单核转录组图谱和空间转录组景观，揭示了PTEN/PI3K/AKT信号通路失调、内质网应激和DNA损伤等新机制 | 研究样本量有限，仅针对青春期前女孩，未验证治疗干预效果 | 探究经典半乳糖血症患者早发性卵巢功能不全的分子机制 | 经典半乳糖血症患儿的卵巢组织活检样本 | 数字病理学 | 卵巢功能不全 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | 青春期前女孩卵巢组织活检（含CG患者和对照） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6325 | 2025-10-06 |
The pericardium forms as a distinct structure during heart formation
2024-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613484
PMID:39345600
|
研究论文 | 本研究通过活体成像、谱系追踪和单细胞转录组学揭示了心包膜在斑马鱼心脏形成过程中作为独立结构的发育起源 | 首次发现心包膜起源于侧板中胚层中独立于经典心区的特定前部间皮祖细胞，并揭示了其与心肌细胞谱系分离的发育过程 | 研究主要基于斑马鱼模型，哺乳动物中的验证仍需进一步研究 | 探究心包膜的发育起源及其在心脏形态发生中的作用 | 斑马鱼胚胎、新生大鼠 | 发育生物学 | 小儿扩张型心肌病 | 活体成像、谱系追踪、单细胞转录组学、机器学习细胞追踪、原子力显微镜 | 机器学习 | 图像、转录组数据 | 斑马鱼胚胎模型和新生大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6326 | 2025-10-06 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612751
PMID:39314376
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术验证骨髓微环境中不同空间区室对炎症的反应机制 | 首次系统验证了结合scRNA-seq和流式细胞术的方法，可重复识别小鼠骨髓中7个关键中央骨髓和骨内膜群体，并揭示了I型干扰素反应特异性影响中央骨髓间充质基质细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类骨髓微环境的验证仍需进一步研究 | 探究骨髓微环境空间区室化在炎症和肿瘤反应中的重要性 | 小鼠骨髓中的造血干细胞和祖细胞（HSPC）及基质细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 多品系小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6327 | 2025-10-06 |
Light and dopamine impact two circadian neurons to promote morning wakefulness
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.056
PMID:39142287
|
研究论文 | 本研究揭示了果蝇中两个表达ITP的昼夜节律神经元如何通过光和多巴胺信号调控早晨觉醒行为 | 首次发现两个ITP LN神经元具有早晨功能，并阐明光通过上调Dop1R1受体增强多巴胺信号促进早晨觉醒的机制 | 研究仅针对果蝇模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究果蝇昼夜节律神经元调控早晨觉醒行为的分子机制 | 果蝇的昼夜节律神经元，特别是两个表达离子运输肽(ITP)的侧神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞测序，CRISPR-Cas9基因编辑，体外活体成像，cAMP检测 | NA | 基因表达数据，行为数据，成像数据 | 果蝇神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6328 | 2025-10-06 |
Analyzing embryo dormancy at single-cell resolution reveals dynamic transcriptional responses and activation of integrin-Yap/Taz prosurvival signaling
2024-Sep-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.06.015
PMID:39047740
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠胚胎滞育过程，揭示转录动态变化及整合素-Yap/Taz促生存信号通路的激活机制 | 首次在单细胞分辨率下分子定义胚胎滞育状态，发现休眠多能细胞通过整合素受体感知微环境并通过Yap/Taz信号维持存活的新机制 | 研究仅使用小鼠胚胎模型，未验证其他哺乳动物物种 | 解析胚胎滞育的分子调控机制 | 小鼠胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6329 | 2025-10-06 |
A conserved cell-type gradient across the human mediodorsal and paraventricular thalamus
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.611112
PMID:39282422
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组学揭示人类丘脑背内侧核和室旁核中保守的兴奋性神经元梯度 | 发现跨物种保守的兴奋性神经元梯度，揭示人类MD区域相较于小鼠的扩张特征，并建立特定神经元亚群与精神疾病遗传风险的关联 | NA | 解析丘脑背内侧核及相邻中线核团的细胞组成及其与精神疾病的关联 | 人类和小鼠的丘脑背内侧核及室旁核区域 | 空间转录组学 | 精神疾病 | 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6330 | 2025-10-06 |
Proteomic signatures improve risk prediction for common and rare diseases
2024-Sep, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03142-z
PMID:39039249
|
研究论文 | 本研究通过整合约3000种血浆蛋白质与临床信息，开发了针对218种常见和罕见疾病的稀疏预测模型 | 首次在大规模人群（41,931人）中系统评估血浆蛋白质组学对多种疾病风险预测的价值，并证明仅需5-20个蛋白质的稀疏模型优于传统临床预测模型 | 研究主要基于英国生物银行数据，需要在其他人群中进一步验证模型泛化能力 | 评估血浆蛋白质组学在常见和罕见疾病风险预测中的临床效用 | 41,931名英国生物银行参与者，涵盖218种常见和罕见疾病（81-6,038病例） | 生物医学信息学 | 多种疾病（包括多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、运动神经元疾病等） | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | 稀疏预测模型 | 蛋白质组数据，临床信息，单细胞RNA测序数据 | 41,931名个体，涵盖218种疾病 | NA | 蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6331 | 2025-10-06 |
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07797-z
PMID:39112713
|
研究论文 | 本研究通过建立RAS剂量递增模型，揭示了致癌RAS剂量驱动的非线性表型连续谱及其在肿瘤发生中的作用 | 首次系统性地展示了致癌RAS剂量如何驱动从衰老到肿瘤起始的非线性表型连续谱 | 研究主要聚焦于肝细胞模型，其他细胞类型和组织中的表现仍需进一步验证 | 探究致癌RAS剂量对细胞衰老状态和肿瘤发生的影响 | 肝细胞和肝癌发生过程 | 癌症生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6332 | 2025-10-06 |
Morphine-responsive neurons that regulate mechanical antinociception
2024-08-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.ado6593
PMID:39208104
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术识别并操控了小鼠延髓头端腹内侧区中对吗啡有反应的神经元，揭示了调控机械性伤害感受的特定神经回路 | 首次识别出延髓头端腹内侧区中特定兴奋性投射神经元集群，这些神经元通过脑源性神经营养因子/原肌球蛋白受体激酶B依赖机制调控吗啡诱导的机械性镇痛作用 | 研究仅限于小鼠模型中的机械性伤害感受，未涉及其他类型疼痛或物种 | 阐明阿片类药物镇痛的神经解剖学基础 | 小鼠延髓头端腹内侧区神经元 | 神经科学 | 疼痛管理 | 单细胞转录组学，神经元操控技术 | NA | 基因表达数据，行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6333 | 2025-10-06 |
Type I Interferonopathy among Non-Elderly Female Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19
2024-08-28, Viruses
DOI:10.3390/v16091369
PMID:39339845
|
研究论文 | 本研究通过分析非老年女性COVID-19急性后遗症患者的单细胞转录组数据，揭示了与I型干扰素信号异常激活相关的CD14STAT2单核细胞亚群特征 | 首次在非老年女性PASC患者中发现特征性CD14STAT2单核细胞亚群，并证实其与STAT2/IRF9转录因子活性和I型干扰素信号通路异常激活相关 | 研究基于公共数据库的回顾性数据分析，样本来源和数量有限，需要进一步实验验证 | 探索非老年女性COVID-19急性后遗症患者的免疫机制 | 非老年女性PASC患者、急性SARS-CoV-2感染患者及健康对照的外周血样本 | 生物信息学 | COVID-19后遗症 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的非老年女性患者和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6334 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture
2024-Aug-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95628
PMID:39190022
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了曼氏血吸虫毛蚴幼虫阶段的全细胞图谱，揭示了其细胞类型组成、发育路径和组织结构 | 首次在单细胞水平上解析了血吸虫毛蚴幼虫的细胞组成，发现神经元是最多样化的体细胞类型，并识别出两个具有性别偏倚转录特征的主要干细胞群 | 研究仅聚焦于毛蚴这一特定发育阶段，未涵盖血吸虫完整生命周期 | 在细胞和分子水平上理解曼氏血吸虫毛蚴幼虫的生物学特性 | 曼氏血吸虫毛蚴幼虫 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序，原位杂交 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 约365个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6335 | 2025-10-06 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-associated platelet bias are evolutionarily conserved
2024-08-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk3469
PMID:39178276
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序揭示了人类造血干细胞的功能和转录谱系偏好，并发现血小板偏向性HSC随年龄增长而增加 | 首次在人类造血干细胞中证实了功能性和转录性谱系偏好的存在，并揭示了血小板偏向性HSC在衰老过程中的进化保守性 | 研究基于异种移植模型，可能无法完全模拟人体内环境；样本来源有限 | 探究人类造血干细胞的异质性和年龄相关的血小板偏向性 | 成年人类骨髓造血干细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，分子条形码技术，异种移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老骨髓来源的人类造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高通量单细胞RNA测序 |
| 6336 | 2025-10-06 |
Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110529
PMID:39161957
|
研究论文 | 通过多模态分析方法揭示肿瘤微环境异质性及其与免疫活性和免疫逃逸的关联 | 开发了名为iHet的肿瘤微环境异质性特征，该特征在不同癌症中具有保守性，并能预测免疫治疗效果 | 研究主要基于转录组学数据，可能未涵盖肿瘤微环境的所有分子层面 | 解析肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗的影响 | 肺癌肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 系统生物学方法，单细胞转录组测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 6337 | 2025-10-06 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
|
研究论文 | 开发了PURE-seq技术用于稀有细胞测序，并应用于小鼠造血衰老研究 | 开发了PURE-seq技术，能够直接从FACS分选细胞进行测序，有效捕获稀有细胞（百万分之一的稀有度） | 未明确说明技术验证的样本规模和应用范围限制 | 研究造血衰老过程中长寿命造血干细胞及其转录组特征 | 小鼠长寿命造血干细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数十个细胞（百万分之一稀有度） | NA | 单细胞RNA-seq | PURE-seq | PIP-seq for Rare-cell Enrichment and Sequencing，支持直接从FACS加载细胞 |
| 6338 | 2025-10-06 |
High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01883-0
PMID:38956378
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术解析人类自然杀伤细胞的异质性 | 首次在健康人血液中鉴定出三个主要NK细胞亚群及其六个亚组，揭示了NK细胞的两种不同发育起源 | 样本来源仅限于健康个体和部分肿瘤组织，未涵盖其他疾病状态 | 系统解析人类自然杀伤细胞的异质性和功能特征 | 人类自然杀伤细胞 | 单细胞生物学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白数据 | 健康人血液、肺组织、扁桃体、上皮内淋巴细胞及22种肿瘤类型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6339 | 2025-10-06 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on SARS-CoV-2 Disease, Viral Dynamics, and Antiviral Immune Response in a Nonhuman Primate Model of Coinfection
2024-07-21, Viruses
DOI:10.3390/v16071173
PMID:39066335
|
研究论文 | 本研究通过SIV感染的非人灵长类动物模型，探讨免疫缺陷对SARS-CoV-2感染过程及免疫应答的影响 | 首次在可控环境下直接验证HIV相关免疫缺陷对COVID-19疾病进程和病毒持久性的影响 | 样本量较小（仅2只SIV感染动物），属于初步研究 | 研究免疫缺陷状态下SARS-CoV-2的疾病表现、病毒动力学和抗病毒免疫应答 | SIV慢性感染的猪尾猕猴和SIV未感染的对照猕猴 | 免疫学 | HIV/AIDS, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床观察数据 | 2只SIV慢性感染猪尾猕猴，另设SIV未感染对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6340 | 2025-10-06 |
Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen
2024-Jul-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92679
PMID:38979889
|
研究论文 | 本研究探讨CD47和血小板反应蛋白-1对小鼠脾脏髓外红细胞生成的差异调控机制 | 首次揭示CD47缺失通过促进脾脏Ter119-CD34-祖细胞增殖增强髓外红细胞生成，而血小板反应蛋白-1缺失则通过延缓衰老红细胞清除抑制该过程 | 研究仅使用小鼠模型，未验证人类相关机制 | 阐明CD47和血小板反应蛋白-1信号通路在调控成年小鼠脾脏髓外红细胞生成中的作用机制 | CD47或血小板反应蛋白-1基因敲除小鼠的脾脏细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | 基因敲除小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |