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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6301 | 2025-10-06 |
Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2024-Dec-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07308-w
PMID:39622943
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研究论文 | 通过左心房单细胞转录组学揭示双调蛋白作为心房颤动的替代标志物 | 首次在单细胞水平揭示左心房中单核-巨噬细胞的异质性及其通过EGF信号与成纤维细胞的相互作用,并发现AREG在房颤患者中特异性上调 | 样本来源有限,需要更大规模研究验证AREG作为生物标志物的临床价值 | 识别心房颤动患者的单核-巨噬细胞异质性、细胞间相互作用及功能性生物标志物 | 左心房组织样本及患者血清样本 | 单细胞转录组学 | 心房颤动 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | Cell-Chat分析 | 单细胞转录组数据, 血清生物标志物数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
6302 | 2025-10-06 |
Mechanism of multifunctional adaptor protein SHARPIN regulating myocardial fibrosis and how SNP mutation affect the prognosis of myocardial infarction
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167467
PMID:39159699
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研究论文 | 本研究揭示了SHARPIN蛋白在心肌纤维化中的分子机制及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | 首次阐明SHARPIN在心肌纤维化中的具体作用机制,并发现rs117299156 SNP突变与心肌梗死患者卒中风险的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究SHARPIN蛋白调控心肌纤维化的分子机制及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | 小鼠心脏成纤维细胞、人类心脏组织、心肌梗死患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序、转录组分析、腺病毒shRNA感染 | NA | 基因表达数据、临床数据 | SHARPIN+/-和野生型小鼠模型、人类心脏组织样本、心肌梗死患者队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
6303 | 2025-10-06 |
UBAP2 contributes to radioresistance by enhancing homologous recombination through SLC27A5 ubiquitination in hepatocellular carcinoma
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167481
PMID:39186963
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研究论文 | 本研究揭示了UBAP2通过泛素-蛋白酶体途径降解SLC27A5增强同源重组,从而导致肝细胞癌放射抵抗的机制 | 首次发现UBAP2通过调控SLC27A5稳定性影响同源重组过程,提出UBAP2/SLC27A5轴作为肝细胞癌放射增敏新靶点 | 研究主要基于体外和动物实验,需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌放射抵抗的分子机制 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | tSNE评分模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 人类HCC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6304 | 2025-10-06 |
CD36-mediated accumulation of MDSCs exerts abscopal immunosuppressive responses in hepatocellular carcinoma after insufficient microwave ablation
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167493
PMID:39233261
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肝癌微波消融后远端未消融肿瘤中CD8+T细胞减少和MDSCs积累的免疫抑制机制 | 首次发现CD36介导的MDSCs积累在微波消融后发挥远端免疫抑制作用,并证实CD36抑制剂可逆转此免疫抑制 | 仅纳入2例初治患者样本,样本量较小;动物模型仍需进一步验证 | 阐明肝癌不完全微波消融后远端未消融肿瘤的免疫微环境变化 | 肝癌患者肿瘤组织样本和双侧肝癌小鼠模型 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,流式细胞术,多色免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,RNA测序数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 2例初治肝癌患者(各含2个病灶),双侧肝癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |
6305 | 2025-10-06 |
Optimization of hybridization chain reaction for imaging single RNA molecules in Drosophila larvae
2024-Dec, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2409968
PMID:39351922
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研究论文 | 本文开发了一种优化的杂交链式反应(HCR)方法,用于果蝇幼虫中单个RNA分子的成像检测 | 开发了优化的HCR探针设计流程,仅需五对探针即可实现高特异性和灵敏度的RNA可视化,并支持多重检测 | 主要适用于中等通量的多基因筛选项目,可能不适用于需要极高通量的应用场景 | 优化RNA原位杂交技术,降低实验成本和时间 | 果蝇幼虫中的单个RNA分子 | 分子生物学成像 | NA | 杂交链式反应(HCR),单细胞RNA测序 | NA | 图像数据 | NA | NA | RNA原位杂交,单细胞RNA测序 | NA | NA |
6306 | 2025-10-06 |
Machine learning based analysis of single-cell data reveals evidence of subject-specific single-cell gene expression profiles in acute myeloid leukaemia patients and healthy controls
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2024.195062
PMID:39366464
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据和机器学习分析急性髓系白血病患者与健康对照的个体特异性基因表达谱 | 发现祖细胞可用于高精度(>70%)个体水平分类,揭示患者异质性的分子决定因素 | 使用公开可用数据,样本来源和数量可能有限 | 通过单细胞数据分析探索AML患者与健康对照的基因表达差异 | 急性髓系白血病患者和健康对照的单核细胞、树突细胞和祖细胞群体 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6307 | 2025-10-06 |
Single-cell Sequencing of Circulating Human Plasmablasts during Staphylococcus aureus Bacteremia
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300858
PMID:39451041
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析金黄色葡萄球菌菌血症患者循环浆母细胞的抗体反应,并鉴定出四种功能性单克隆抗体 | 首次结合单细胞转录组和免疫球蛋白基因测序,从患者浆母细胞中鉴定出针对金黄色葡萄球菌表面的新型单克隆抗体,其中三种具有交叉反应性 | 样本量相对较小(17名患者),仅分析了循环浆母细胞而未研究其他B细胞亚群 | 研究金黄色葡萄球菌菌血症期间人类循环浆母细胞的抗体反应特征 | 金黄色葡萄球菌菌血症患者的循环浆母细胞 | 单细胞测序 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序,免疫球蛋白可变区基因测序 | NA | 单细胞基因表达数据,免疫球蛋白序列数据 | 17名金黄色葡萄球菌菌血症患者的外周血样本,超过400个浆母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6308 | 2025-10-06 |
An organotypic atlas of human vascular cells
2024-Dec, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03376-x
PMID:39566559
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研究论文 | 通过整合19个人体器官的单细胞转录组数据,构建了人类血管细胞的器官特异性图谱 | 首次在跨器官尺度系统定义了42种血管细胞状态,揭示了动脉内皮轴从大血管到小血管的血管型过渡特征 | 研究基于62名捐赠者的数据,样本来源和数量仍有限 | 探索人类血管系统中不同血管床的功能差异及其分子决定因素 | 人类血管系统中的内皮细胞和周细胞 | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约67,000个细胞(来自62名捐赠者,19个器官和组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6309 | 2025-10-06 |
Spatially resolved single-cell atlas unveils a distinct cellular signature of fatal lung COVID-19 in a Malawian population
2024-Dec, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03354-3
PMID:39567718
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研究论文 | 通过空间分辨单细胞图谱揭示马拉维人群中致命性肺部COVID-19的独特细胞特征 | 首次在非洲人群中建立致命性COVID-19的空间分辨单细胞图谱,揭示了与欧美亚洲人群不同的干扰素γ驱动的肺驻留巨噬细胞反应机制 | 样本量较小(COVID-19组n=9,对照组n=7),仅限马拉维单一地区人群 | 研究非洲人群中COVID-19肺部疾病的细胞机制和病理生物学特征 | 马拉维成年人的肺组织、血液和鼻腔细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序,高维成像,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 16例马拉维成年人(9例COVID-19,7例对照) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
6310 | 2025-10-06 |
Phospholipid Scramblase 1 (PLSCR1) Regulates Interferon-Lambda Receptor 1 (IFN-λR1) and IFN-λ Signaling in Influenza A Virus (IAV) Infection
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624469
PMID:39605457
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研究论文 | 本研究探讨磷脂爬行酶1在甲型流感病毒感染中通过调控干扰素-λ受体1和干扰素-λ信号通路发挥抗病毒作用的分子机制 | 首次揭示PLSCR1通过调控IFN-λR1表达和蛋白相互作用调节IFN-λ信号通路,阐明了其在纤毛上皮细胞中的特异性抗流感功能 | PLSCR1表达区室和酶活性相关的具体抗流感机制尚未完全阐明,组织水平研究使用的动物模型有限 | 阐明PLSCR1在甲型流感病毒感染中的抗病毒机制及其与干扰素-λ信号通路的关系 | 基因敲除小鼠、纤毛上皮细胞特异性过表达小鼠、上皮细胞 | 分子生物学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 基因敲除小鼠模型和特异性过表达小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6311 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探索了鼠诺如病毒在人肠道细胞系中的感染机制和宿主反应 | 建立了表达鼠诺如病毒受体的人肠道细胞系,首次在单细胞分辨率下分析了鼠诺如病毒感染的人细胞宿主反应 | 研究使用的是鼠诺如病毒而非人诺如病毒,且仅在工程化细胞系中进行 | 探索诺如病毒复制的宿主细胞需求及感染机制 | 表达鼠CD300lf受体的人肠道细胞系(mCD300lf-hCaco2)和鼠诺如病毒(MNV) | 单细胞生物学 | 急性胃肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6312 | 2025-10-06 |
PTEN Loss Shapes Macrophage Dynamics in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3890
PMID:39186679
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研究论文 | 本研究揭示PTEN缺失通过IL33诱导HMOX1高表达巨噬细胞促进高级别浆液性卵巢癌进展的机制 | 首次发现PTEN缺失通过IL33诱导HMOX1hi巨噬细胞形成,并证明靶向该巨噬细胞可抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索PTEN缺失对高级别浆液性卵巢癌免疫微环境的影响及治疗靶点 | 小鼠模型和人类高级别浆液性卵巢癌样本 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | 小鼠模型和人类HGSC肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6313 | 2025-10-06 |
SpottedPy quantifies relationships between spatial transcriptomic hotspots and uncovers environmental cues of epithelial-mesenchymal plasticity in breast cancer
2024-Nov-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03428-y
PMID:39529126
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研究论文 | 开发了SpottedPy Python软件包用于识别肿瘤热点并分析癌症生态系统中的空间相互作用 | 开发了首个专门用于识别空间转录组热点和映射空间相互作用的Python工具包 | 未提及具体样本量和验证数据集 | 探索乳腺癌中上皮-间质可塑性的空间关系和环境线索 | 乳腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6314 | 2025-10-06 |
Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03146-9
PMID:39095597
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研究论文 | 本研究建立了首个沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型,评估了其安全性和有效性 | 首次建立沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型,并提供了人类CL病变中免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的全面图谱 | 样本量较小(14名参与者),CL病变和活检程序导致的瘢痕形成明显 | 开发皮肤利什曼病疫苗并建立有效的临床前评估模型 | 健康人类参与者暴露于感染利什曼原虫的沙蝇 | 传染病学 | 皮肤利什曼病 | 空间转录组学,免疫组织化学 | 受控人类感染模型 | 临床数据,分子数据,影像数据 | 14名参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6315 | 2024-10-25 |
Spatial Transcriptomics: A New Frontier in Atherosclerosis Research?
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321652
PMID:39441914
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6316 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics unveils skin cell specific antifungal immune responses and IL-1Ra- IL-1R immune evasion strategies of emerging fungal pathogen Candida auris
2024-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012699
PMID:39536069
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新兴真菌病原体耳念珠菌在皮肤感染中的细胞特异性免疫反应及其IL-1Ra-IL-1R免疫逃逸策略 | 首次利用单细胞转录组学解析耳念珠菌皮肤感染的细胞特异性免疫反应,并发现其通过上调IL-1RN基因表达和独特细胞壁甘露聚糖外层逃逸宿主防御的新机制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明耳念珠菌在皮肤组织中持续定植的宿主免疫调节因素 | 耳念珠菌感染的小鼠皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6317 | 2025-10-06 |
Single-cell integration reveals metaplasia in inflammatory gut diseases
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07571-1
PMID:39567783
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研究论文 | 通过整合25个单细胞RNA测序数据集构建了包含160万个细胞的胃肠道细胞图谱,揭示了炎症性肠道疾病中上皮细胞化生的新机制 | 开发了自动化质量控制方法scAutoQC,构建了首个跨越整个健康胃肠道的大规模单细胞参考图谱,发现了肠道炎症疾病中干细胞来源的上皮细胞化生现象 | 研究主要基于已有数据集整合,可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统解析胃肠道在健康和疾病状态下的细胞组成和状态变化 | 人类胃肠道组织和细胞 | 单细胞基因组学 | 炎症性肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 385个样本来自189名健康对照,总计约160万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6318 | 2025-10-06 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07944-6
PMID:39567784
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研究论文 | 通过建立胸腺皮质-髓质轴形态学框架,绘制了人类胸腺空间细胞图谱并解析T细胞发育过程 | 建立了定量形态学框架(皮质-髓质轴)并应用于多模态单细胞数据,首次在胎儿发育早期系统描绘胸腺空间组织结构 | 研究主要聚焦于产前和早期产后阶段,未涵盖胸腺完全发育成熟后的完整过程 | 解析人类胸腺微解剖结构及其在T细胞发育过程中的作用机制 | 人类胎儿和早期产后胸腺组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 高分辨率多重成像, 单细胞多组学分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞多组学数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
6319 | 2025-10-06 |
A multi-omic atlas of human embryonic skeletal development
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08189-z
PMID:39567793
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研究论文 | 构建了人类胚胎骨骼发育的多组学图谱,揭示了骨骼形成过程中的细胞状态和调控机制 | 首次通过配对转录组和表观遗传分析结合空间转录组学,建立了人类胚胎骨骼发育的多组学图谱,并开发了ISS-Patcher和SNP2Cell两种新工具 | 研究时间窗口仅限于受孕后5-11周,样本数量有限 | 解析人类胚胎骨骼发育过程中的细胞命运决定机制 | 人类胚胎骨骼组织 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | 轨迹分析, 调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 约336,000个细胞核 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
6320 | 2025-10-06 |
Multi-site Ultrasound-guided Fine Needle Aspiration to Study Cells and Soluble Factors From Human Lymph Nodes
2024-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70063
PMID:39579041
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研究论文 | 介绍应用超声引导细针穿刺技术从人类淋巴结采集样本的方法 | 采用多部位超声引导细针穿刺技术同时获取淋巴结免疫细胞和无细胞材料 | NA | 开发人类淋巴结采样技术以研究免疫反应和神经免疫疾病 | 人类头颈部宫颈淋巴结 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 超声引导细针穿刺, 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | 细胞样本, 无细胞上清液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |