单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 6301 - 6320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6301 | 2024-11-30 |
Spatiotemporal analysis of lung immune dynamics in lethal Coccidioides posadasii infection
2024-Nov-29, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02562-24
PMID:39611685
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研究论文 | 研究了致命性Coccidioides posadasii感染期间肺部免疫动态的时空分析 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描述了致命性感染期间肺部免疫反应的特征，并识别出可能介导组织重塑和纤维化的单核细胞来源的巨噬细胞 | 研究仅限于致命性感染的情况，未涵盖所有感染类型 | 深入了解致命性Coccidioides posadasii感染期间的免疫反应，并寻找新的治疗靶点 | 致命性Coccidioides posadasii感染期间的肺部免疫动态 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 6302 | 2024-11-30 |
Single Cell Data Enables Dissecting Cell Types Present in Bulk Transcriptome Data
2024-Nov-29, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2024.0152
PMID:39611952
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研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序数据分析和解卷积方法，从批量转录组数据中估计细胞类型比例的流程 | 提出了一种新的流程，利用单细胞RNA测序数据对批量转录组数据进行解卷积，以估计细胞类型比例 | 仅在iPSC衍生的肾脏和脑类器官数据上进行了验证，尚未在其他组织类器官中进行测试 | 开发一种方法，利用单细胞RNA测序数据从批量转录组数据中解析细胞类型 | iPSC衍生的肾脏和脑类器官的批量转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个肾脏单细胞RNA测序数据集和一个脑单细胞RNA测序数据集 |
| 6303 | 2024-11-30 |
Dissecting the effect of genetic variants on atherosclerosis: integrating bulk and single-cell transcriptomics
2024-Nov-28, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae489
PMID:39607792
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6304 | 2024-11-30 |
Unveiling FADS3 as a novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma through comprehensive RNA and single-cell sequencing
2024-Nov-27, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.010
PMID:39609202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6305 | 2024-11-30 |
GDNF family receptor alpha-like (GFRAL) expression is restricted to the caudal brainstem
2024-Nov-26, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102070
PMID:39608751
|
研究论文 | 研究探讨了GDNF家族受体α样蛋白（GFRAL）在中枢神经系统和外周组织中的表达情况 | 通过高灵敏度和选择性技术，首次全面展示了GFRAL在脑干以外的其他脑区和外周组织中的表达情况 | 研究主要集中在小鼠和人类组织样本上，未涉及其他物种 | 探究GFRAL在外周组织和脑干以外脑区的表达情况 | GFRAL在不同组织中的表达细胞 | 神经科学 | NA | 单分子原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从小鼠和人类组织中收集了12种不同组织的样本 |
| 6306 | 2024-11-30 |
RNA timestamps identify the age of single molecules in RNA sequencing
2021-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0704-z
PMID:33077959
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA时间戳的方法，用于通过RNA编辑推断RNA测序数据中单个RNA的年龄 | 提出了RNA时间戳方法，通过RNA编辑推断RNA的年龄，并能够推断多个过去的转录事件的时间 | NA | 开发一种新的方法来推断RNA测序数据中单个RNA的年龄，并结合时间信息进行单细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据中的单个RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6307 | 2024-11-29 |
Genes and Pathways Underpinning Klinefelter Syndrome at Bulk and Single-Cell Levels
2024-Dec, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10689-6
PMID:38374521
|
研究论文 | 研究探讨了Klinefelter综合征（KS）在批量和单细胞水平上的关键基因和通路 | 首次在单细胞水平上评估了KS患者不同细胞类型之间的细胞间通讯，并发现了关键基因和通路 | 研究依赖于现有的公开数据集，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 揭示Klinefelter综合征的发病机制中的关键基因和通路 | Klinefelter综合征患者的批量和单细胞转录组数据 | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了三个批量和一个单细胞转录组数据集，包括KS和对照样本 |
| 6308 | 2024-11-29 |
Identifying an AML Prognostic Model Using 10 Marker Genes from Single-Cell Transcriptome and Bulk Transcriptome Analysis
2024-Dec, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10678-9
PMID:38347290
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研究论文 | 研究探讨了FANC核心复合物在骨髓衰竭中的作用，并通过单细胞和批量转录组分析确定了与核仁稳态相关的基因，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）预后的模型 | 通过单细胞和批量转录组分析，揭示了FA患者与健康个体在细胞间通信上的显著差异，并开发了一种具有高预测精度的AML预后模型 | NA | 探讨FANC核心复合物在骨髓衰竭中的作用，并开发AML预后模型 | FA患者的造血干细胞和AML预后 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞转录组测序和批量转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | FA患者和健康个体的造血干细胞 |
| 6309 | 2024-11-29 |
m6A Modification of Profilin-1 in Vascular Smooth Muscle Cells Drives Phenotype Switching and Neointimal Hyperplasia via Activation of the p-ANXA2/STAT3 Pathway
2024-Dec, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321399
PMID:39508106
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研究论文 | 研究探讨了PFN1在血管平滑肌细胞中的m6A修饰如何通过激活p-ANXA2/STAT3通路驱动表型转换和新内膜增生 | 首次揭示了PFN1的m6A修饰在血管平滑肌细胞中的重要作用，并阐明了其通过激活p-ANXA2/STAT3通路促进表型转换和新内膜增生的机制 | NA | 探讨PFN1在血管平滑肌细胞中的作用及其在支架内再狭窄中的机制 | 血管平滑肌细胞、支架内再狭窄患者及多种实验模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括狭窄的大鼠颈动脉、支架植入的猪冠状动脉、支架内再狭窄患者、PFN1SMC-IKO小鼠和PFN1过表达小鼠等多种样本 |
| 6310 | 2024-11-29 |
Time-resolved single-cell transcriptomic sequencing
2024-Nov-27, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc05700g
PMID:39568874
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综述 | 综述了时间分辨单细胞转录组测序方法及其应用 | 介绍了将“时间锚点”引入单细胞RNA测序库以记录动态表达模式的方法 | 现有的计算方法基于假设，未能反映实际状态 | 探讨时间分辨单细胞转录组测序技术的发展和应用 | 单细胞RNA测序技术及其在不同时间点的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6311 | 2024-11-29 |
Single-cell RNA sequencing reveals key regulators and differentiation trajectory of iPSC-derived cardiomyocytes
2024-11-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79488-8
PMID:39587160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人诱导多能干细胞（iPSC）向心肌细胞分化的动态基因调控网络和关键调控因子 | 首次在单细胞分辨率下揭示了iPSC向心肌细胞分化的关键调控基因和分化轨迹 | 研究仅基于两个iPSC细胞系，可能存在样本多样性不足的问题 | 揭示心肌细胞分化过程中的动态基因调控网络和关键调控因子 | 人诱导多能干细胞（iPSC）及其分化为心肌细胞的过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32,365个细胞，来自4个分化阶段的两个iPSC细胞系 |
| 6312 | 2024-11-29 |
A comprehensive analysis of gene expression and the immune landscape in gastric cancer through single-cell and multi-omics approaches
2024-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01591-z
PMID:39585511
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法全面分析了胃癌中的基因表达和免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胃癌微环境的细胞景观和基因表达谱，并发现了与肿瘤微环境相关的性别偏倚基因功能 | NA | 探讨胃癌微环境中不同细胞类型和基因表达谱的分布，揭示潜在的分子机制 | 胃癌样本中的基因表达和免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 6313 | 2024-11-29 |
Inhalation of itraconazole mitigates bleomycin-induced lung fibrosis via regulating SPP1 and C3 signaling pathway pivotal in the interaction between phagocytic macrophages and diseased fibroblasts
2024-Nov-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05895-0
PMID:39587675
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研究论文 | 研究通过吸入伊曲康唑减轻博来霉素诱导的肺纤维化，并探讨其通过调节SPP1和C3信号通路在吞噬性巨噬细胞与病变成纤维细胞相互作用中的作用 | 开发了一种吸入型伊曲康唑制剂，显著提高了药物在肺组织中的积累，从而增强了治疗效果 | 研究仅在动物模型中进行，尚未进行临床试验 | 探索吸入伊曲康唑对肺纤维化的治疗效果及其分子机制 | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 6314 | 2024-11-29 |
Integration of single-cell sequencing and drug sensitivity profiling reveals an 11-gene prognostic model for liver cancer
2024-Nov-25, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00698-2
PMID:39587687
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和药物敏感性分析，构建了一个11基因的肝癌预后模型 | 首次基于单细胞测序数据构建了肝癌的11基因预后模型，并结合药物敏感性分析识别了高风险患者的潜在治疗药物 | 研究仅使用了TCGA-LIHC数据集和GDSC数据库中的15个肝癌细胞系，样本量有限 | 旨在通过单细胞测序和药物敏感性分析，构建肝癌的预后模型并识别潜在治疗药物 | 肝癌患者的预后和治疗 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 370名肝癌患者和15个肝癌细胞系 |
| 6315 | 2024-11-29 |
Stiffness-dependent LOX regulation via HIF-1 drives extracellular matrix modifications in psoriasis
2024-Nov-25, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.10.611
PMID:39603411
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研究论文 | 研究探讨了银屑病中机械力调节对疾病进展的影响，特别是通过HIF-1介导的LOX调控对细胞外基质（ECM）的重组作用 | 发现了HIF-1在机械敏感性皮肤成纤维细胞中对LOX蛋白调控的新机制，并揭示了机械力在银屑病发病机制中的潜在作用 | 研究主要集中在体外实验和scRNA-seq分析，缺乏体内实验验证 | 探讨机械力调节在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者的皮肤成纤维细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 银屑病 | 多光子二次谐波生成显微镜、scRNA-seq | NA | 图像、基因表达数据 | 银屑病患者皮肤样本及体外培养的皮肤成纤维细胞 |
| 6316 | 2024-11-29 |
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-Nov-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54581-8
PMID:39580490
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于研究金黄色葡萄球菌在生物膜生长和免疫细胞暴露后的转录多样性 | 开发了BaSSSh-seq方法，能够捕捉生物膜中广泛的转录异质性，并识别从浮游生长到生物膜生长的基因轨迹 | NA | 研究细菌生物膜的转录异质性和对免疫压力的不同反应 | 金黄色葡萄球菌的生物膜和浮游生长状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6317 | 2024-11-29 |
Integrated single-cell transcriptome and TCR profiles of hepatocellular carcinoma highlight the convergence on interferon signaling during immunotherapy
2024-Nov-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010534
PMID:39581706
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研究论文 | 研究分析了肝细胞癌患者在接受免疫检查点抑制剂联合治疗前后的单细胞转录组和T细胞受体谱，揭示了干扰素信号在免疫治疗响应中的关键作用 | 首次全面分析了肝细胞癌患者在接受免疫检查点抑制剂联合治疗前后的单细胞转录组和T细胞受体谱，揭示了干扰素信号在免疫治疗响应中的普遍收敛现象 | 研究样本量较小，仅包括7名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨免疫检查点抑制剂联合治疗对肝细胞癌患者免疫微环境的影响，寻找预测治疗响应的生物标志物 | 肝细胞癌患者的单细胞转录组和T细胞受体谱 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个腹水样本，来自7名患者 |
| 6318 | 2024-11-29 |
Understanding isoform expression by pairing long-read sequencing with single-cell and spatial transcriptomics
2024-Nov-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279640.124
PMID:39567235
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综述 | 本文综述了单细胞和空间长读长测序技术的发展及其在理解RNA异构体表达中的应用 | 结合长读长测序与单细胞和空间转录组学技术，以更好地表征异构体表达 | 这些技术在实施和数据解释方面存在挑战，且我们对RNA异构体生物学角色的理解仍然有限 | 探讨长读长测序技术在单细胞和空间转录组学中的应用，以及其在理解RNA异构体在发育和病理中的作用 | RNA异构体的表达及其在生物学中的作用 | NA | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6319 | 2024-11-29 |
Identification of Spatial Specific Lipid Metabolic Signatures in Long-Standing Diabetic Kidney Disease
2024-Nov-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14110641
PMID:39590877
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序和空间多组学数据，分析了长期糖尿病肾病中的脂质代谢特征 | 首次在长期糖尿病肾病样本中识别出两种受损细胞类型（iTAL和iPT），并发现其脂质代谢和生物合成活动的变化 | 研究主要基于Kidney Precision Medicine Project的数据，样本量和多样性可能有限 | 探讨长期糖尿病肾病中的脂质代谢特征及其与细胞损伤的关系 | 长期糖尿病肾病样本中的脂质代谢和细胞损伤 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | RNA测序数据、空间代谢组学数据 | 长期糖尿病肾病样本，具体数量未明确提及 |
| 6320 | 2024-11-29 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617088
PMID:39416029
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Vispro的端到端自动化图像处理工具，专门用于10x Visium空间转录组数据的图像分析 | Vispro通过集成四个关键模块（基准标记检测、基准标记移除和图像恢复、组织区域检测以及不连续组织区域分割），解决了空间转录组数据中图像分析的挑战 | NA | 开发一种能够提高10x Visium空间转录组数据图像分析质量的工具 | 10x Visium空间转录组数据的图像 | 数字病理学 | NA | 图像处理 | NA | 图像 | NA |