单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 6281 - 6300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6281 | 2024-11-17 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
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研究论文 | 本研究通过回顾性药物基因组学研究，探讨了银屑病治疗中药物反应相关的潜在遗传途径 | 揭示了两个与治疗反应相关的新的遗传标记，并强调了KLK7在肿瘤坏死因子信号传导中的作用 | 研究基于回顾性数据，样本量有限，且未涵盖所有可能的治疗选项 | 利用回顾性数据进行药物基因组学研究，探索银屑病治疗中药物反应的潜在遗传途径 | 1942名银屑病患者及其治疗反应 | 药物基因组学 | 银屑病 | 线性回归分析 | NA | 基因型数据 | 1942名银屑病患者 |
| 6282 | 2024-11-17 |
Ezh2-dependent methylation in oral epithelia promotes secondary palatogenesis
2023-11-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2216
PMID:37435868
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研究论文 | 研究Ezh2依赖的甲基化在口腔上皮中对次级腭发育的影响 | 首次揭示了Ezh2在口腔上皮中的甲基化对次级腭发育的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨Ezh2依赖的甲基化在次级腭发育中的上皮作用 | 小鼠胚胎的口腔上皮 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、RT-qPCR | NA | RNA | 小鼠胚胎的口腔上皮样本 |
| 6283 | 2024-11-17 |
ScRNAPip: A systematic and dynamic pipeline for single-cell RNA sequencing analysis
2023-Nov, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.132
PMID:38868218
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研究论文 | 本文开发了一个可重复的计算工作流程，用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出了一个系统化和动态的单细胞RNA测序分析管道ScRNAPip | NA | 为研究人员提供一个全面的教程，帮助他们构建和优化自己的分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开数据集进行演示 |
| 6284 | 2024-11-17 |
Recording morphogen signals reveals origins of gastruloid symmetry breaking
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543474
PMID:37333235
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研究论文 | 研究使用合成基因电路追踪早期细胞内信号如何预测干细胞类胚体中细胞的未来前后位置 | 首次揭示了Wnt信号从均匀状态演变为极化状态的关键6小时时间窗口，并发现早期TGF信号的异质性预测了前后位置并调节Wnt信号 | NA | 探究干细胞类胚体如何打破对称性以可重复地定义单一前后轴 | 干细胞类胚体中的前后轴形成机制 | 发育生物学 | NA | 合成基因电路、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 信号数据、细胞位置数据 | NA |
| 6285 | 2024-11-17 |
CIMLA: Interpretable AI for inference of differential causal networks
2023-Apr-25, ArXiv
PMID:37163135
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIMLA的新工具，用于发现条件依赖的因果关系变化，并展示了其在基因调控网络中的应用 | CIMLA工具在发现条件依赖的因果关系变化方面比现有方法更稳健和准确 | NA | 发现高维数据中的因果关系 | 基因调控网络在不同生物条件下的差异 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 高维数据 | NA |
| 6286 | 2024-11-17 |
Integrated identification of growth pattern and taxon of bacterium in gut microbiota via confocal fluorescence imaging-oriented single-cell sequencing
2022-Sep, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12041
PMID:38818223
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研究论文 | 本文提出了一种结合荧光探针标记、共聚焦成像和单细胞测序的综合策略，用于识别小鼠肠道微生物群中细菌的生长模式和分类 | 本文的创新点在于将荧光探针标记、共聚焦成像和单细胞测序相结合，实现了对肠道细菌生长模式和分类的集成识别 | 本文的局限性在于仅在小鼠肠道微生物群中进行了验证，尚未在其他复杂细菌系统中进行广泛应用 | 本文的研究目的是开发一种高通量的方法，用于直接研究肠道微生物群中细菌的体内活动和过程 | 本文的研究对象是小鼠肠道微生物群中的细菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 小鼠肠道细菌 |
| 6287 | 2024-11-17 |
The rise of single-cell proteomics
2021-Apr, Analytical science advances
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/ansa.202000152
PMID:38716457
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研究论文 | 本文讨论了单细胞蛋白质组学的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文介绍了单细胞蛋白质组学领域的最新技术进展，包括样品制备流程和质谱仪器的改进，能够从单个细胞中定量超过1000种蛋白质 | 目前单细胞蛋白质组学研究的数据通量和可靠性仍需进一步提高 | 旨在通过生成单个细胞的蛋白质表达谱，补充转录组和基因组数据，以更好地理解细胞功能和身份 | 单细胞蛋白质组学技术及其在生物学研究中的应用 | 蛋白质组学 | NA | 质谱(MS) | NA | 蛋白质表达谱 | 数千个细胞 |
| 6288 | 2024-11-17 |
Single-Cell Transcriptional Archetypes of Airway Inflammation in Cystic Fibrosis
2020-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202004-0991OC
PMID:32603604
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研究论文 | 本文首次对囊性纤维化患者的痰液进行了单细胞转录组分析，定义了气道免疫功能障碍的转录特征 | 首次对囊性纤维化患者的痰液进行单细胞转录组分析，并定义了基于表达的细胞功能和成熟度特征，称为转录原型 | 样本量较小，仅包括9名囊性纤维化患者和5名健康对照者 | 研究囊性纤维化患者气道免疫功能障碍的转录特征及其在疾病发病机制中的作用 | 囊性纤维化患者的痰液细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9名囊性纤维化患者和5名健康对照者的痰液细胞 |
| 6289 | 2024-11-15 |
A pancreatic cancer organoid incorporating macrophages reveals the correlation between the diversity of tumor-associated macrophages and cancer cell survival
2025-Mar, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文通过构建包含巨噬细胞的胰腺癌类器官模型，研究了肿瘤相关巨噬细胞多样性与癌细胞存活之间的关联 | 首次在胰腺癌类器官模型中引入巨噬细胞，揭示了肿瘤相关巨噬细胞的多样性及其在血管生成和癌细胞存活中的作用 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内实验验证 | 探讨胰腺导管腺癌微环境中巨噬细胞多样性与癌细胞存活的关系 | 胰腺导管腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包含五个肿瘤相关巨噬细胞亚群的胰腺癌类器官模型 |
| 6290 | 2024-11-15 |
Analysis of the pluripotent and germline marker gene expression, and the state of X chromosome reactivation of primordial germ cells in pig gonads
2025-Jan-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 研究分析了猪性腺原始生殖细胞（PGCs）的多能性和性染色体再激活状态 | 首次揭示了猪性腺PGCs的异质性，并鉴定了GDF3作为其特异性表面标记 | NA | 评估猪性腺PGCs的多能性状态、特定基因表达模式和性染色体再激活 | 猪性腺原始生殖细胞（PGCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6291 | 2024-11-15 |
Integration of transcriptomics and spatial biology analyses reveals Galactomyces ferment filtrate promotes epidermal interconnectivity via induction of keratinocyte differentiation, proliferation and cellular bioenergetics
2024-Dec, International journal of cosmetic science
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/ics.12991
PMID:38924095
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研究论文 | 研究评估了Galactomyces Ferment Filtrate（GFF）对表皮分化和氧化应激反应的影响 | 首次通过转录组学和空间生物学分析揭示了GFF促进表皮细胞间连通性，并通过诱导角质形成细胞分化、增殖和细胞生物能量来实现 | NA | 评估GFF对表皮分化和氧化应激反应的影响 | 角质形成细胞和体外皮肤组织 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个供体的角质形成细胞和体外皮肤组织 |
| 6292 | 2024-11-15 |
Single-cell integrated transcriptomics reveals the role of keratinocytes in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-024-00842-7
PMID:38421592
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，全面分析了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞水平特征，揭示了角质形成细胞在HNSCC发展中的潜在作用 | 通过hdWGCNA共表达网络分析，识别了与HNSCC进展相关的基因模块，并构建了一个基于特定基因的预测模型，展示了其在多个数据集中的稳健预测性能 | 需要进一步研究来验证和扩展这些发现，以最终改善HNSCC患者的治疗效果 | 理解HNSCC的分子机制，识别预后标志物和治疗靶点，以提高患者治疗效果 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个数据集 |
| 6293 | 2024-11-15 |
Prediction of clinical prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma through the combination of multiple cell death pathways
2024-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12235
PMID:39192561
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研究论文 | 研究通过结合多种细胞死亡途径预测肝细胞癌的临床预后和药物敏感性 | 开发了一种基于细胞死亡指数（CDI）的预测模型，结合了多种细胞死亡途径和临床信息，用于预测肝细胞癌的预后和药物敏感性 | 研究依赖于现有数据集，可能存在数据偏差；模型在不同数据集上的验证结果可能存在差异 | 开发一种预测肝细胞癌临床预后和药物敏感性的模型 | 肝细胞癌患者的临床预后和药物敏感性 | 机器学习 | 肝癌 | 机器学习算法 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据、基因组数据和临床信息 | 使用了来自TCGA-LIHC、GSE14520、GSE45436和GSE166635数据集的数据 |
| 6294 | 2024-11-15 |
Elucidating ferroptosis mechanisms in heart failure through transcriptomics, single-cell sequencing, and experimental validation
2024-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111416
PMID:39293745
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研究论文 | 本研究通过转录组学、单细胞测序和实验验证，阐明了铁死亡在心力衰竭中的机制 | 首次通过转录组学和单细胞测序技术，识别并验证了与心力衰竭相关的铁死亡基因，揭示了这些基因在不同细胞类型中的差异表达模式 | 研究主要基于公共数据集和实验模型，需要进一步的临床验证 | 阐明铁死亡在心力衰竭中的机制，并识别潜在的治疗靶点 | 心力衰竭相关的铁死亡基因及其在不同细胞类型中的表达模式 | 基因组学 | 心血管疾病 | 转录组学、单细胞测序、LASSO回归、SVM-RFE机器学习 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 心力衰竭细胞和小鼠模型 |
| 6295 | 2024-11-15 |
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445
PMID:39366532
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研究论文 | 本文探讨了SNRPB2在泛癌中的作用，并通过实验验证了其在肝细胞癌中的影响 | 首次系统研究了SNRPB2在多种癌症中的表达及其与预后和免疫微环境的关系，并通过实验验证了其对肝癌细胞增殖和迁移的影响 | 需要进一步研究SNRPB2的潜在机制和临床治疗潜力 | 探讨SNRPB2在癌症中的作用及其作为预后标志物和免疫治疗候选者的潜力 | SNRPB2在多种癌症中的表达及其对肝癌细胞增殖和迁移的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 基因表达分析、基因组和表观基因组分析、基因集富集分析、免疫细胞浸润评估 | NA | 基因表达数据、基因组数据、表观基因组数据 | 来自多个公共数据库的数据，包括TCGA、CPTAC和GEO |
| 6296 | 2024-11-15 |
Identification and Verification of Key Genes in Colorectal Cancer Liver Metastases Through Analysis of Single-Cell Sequencing Data and TCGA Data
2024-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16194-9
PMID:39382748
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和TCGA数据分析，识别和验证结直肠癌肝转移中的关键基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据和TCGA数据结合，识别出结直肠癌肝转移中的关键基因，并进行了实验验证 | 研究主要基于现有数据库和实验验证，未涉及大规模临床试验 | 识别结直肠癌肝转移中的关键基因，为治疗提供潜在靶点 | 结直肠癌肝转移样本和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17个结直肠癌肝转移样本 |
| 6297 | 2024-11-15 |
Deciphering the cellular landscape and potential targets of nasopharyngeal and oral cancers using single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12236
PMID:39205595
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术研究鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞多样性及其相互作用，并发现MHC-II高表达的上皮细胞亚群与良好的预后和CD4 T细胞浸润相关 | 研究仅限于鼻咽癌和口腔癌，未涉及其他类型的癌症 | 揭示鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点 | 鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6298 | 2024-11-15 |
Targeted inhibition of CHKα and mTOR in models of pancreatic ductal adenocarcinoma: A novel regimen for metastasis
2024-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217280
PMID:39343354
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研究论文 | 本文研究了胰腺导管腺癌（PDAC）中CHKα和mTOR的靶向抑制，提出了一种新的抗转移治疗方案 | 设计了一种新的CHKα抑制剂CHKI-03，并验证了其在多个临床前模型中抑制转移的有效性 | NA | 探索胰腺导管腺癌转移的机制，并开发新的治疗方案 | 胰腺导管腺癌的转移机制及CHKα和mTOR的靶向抑制 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和代谢组学分析 | NA | RNA | 多个临床前模型 |
| 6299 | 2024-11-15 |
Spatial transcriptomics reveals profound subclonal heterogeneity and T-cell dysfunction in extramedullary myeloma
2024-Nov-14, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024590
PMID:39172759
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研究论文 | 本文应用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤的髓外病变中的三维肿瘤细胞和微环境结构 | 揭示了髓外病变中的显著亚克隆异质性和T细胞功能障碍，并发现了GPRC5D和TNFRSF17的空间表达差异 | 样本量较小，仅分析了14个髓外病变活检样本 | 探讨多发性骨髓瘤髓外病变中的肿瘤细胞和微环境的三维结构及其异质性 | 多发性骨髓瘤的髓外病变及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个髓外病变活检样本，其中2个样本使用tomo-seq技术，12个样本使用10x Visium技术，3个样本使用单细胞RNA测序技术 |
| 6300 | 2024-11-15 |
TLR8 agonist selgantolimod regulates Kupffer cell differentiation status and impairs HBV entry into hepatocytes via an IL-6-dependent mechanism
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331396
PMID:38697771
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研究论文 | 研究TLR8激动剂selgantolimod对库普弗细胞分化状态的调节及其通过IL-6依赖机制抑制HBV进入肝细胞的作用 | 首次详细描述了selgantolimod在肝微环境中引起的转录组变化和细胞间通讯事件，并展示了其对HBV进入的抑制作用 | 研究主要基于体外实验和转录组数据，缺乏体内实验验证 | 研究selgantolimod在肝微环境中的作用机制，特别是其对库普弗细胞和HBV感染的影响 | 库普弗细胞、肝细胞、HBV感染 | NA | 肝炎 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开的单细胞RNA测序数据和体外实验样本 |