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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6281 - 6300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6281 | 2025-10-06 |
Spatial integration of multi-omics data from serial sections using the novel Multi-Omics Imaging Integration Toolset
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf035
PMID:40366868
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研究论文 | 开发了一种用于整合空间多组学数据的Python框架工具集 | 提出了名为GreedyFHist的非刚性配准算法，用于处理连续切片的配准问题 | 仅在新鲜冷冻连续切片上进行了验证，未涉及其他类型样本 | 开发空间多组学数据整合工具以更好地理解癌症生物学 | 前列腺组织样本 | 空间组学数据分析 | 前列腺癌 | 质谱成像, 空间转录组学 | 非刚性配准算法 | 图像, 空间组学数据 | 244张新鲜冷冻连续切片图像 | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 6282 | 2025-10-06 |
Whole-exome sequencing association study reveals genetic effects on tumor microenvironment components in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182768
PMID:39744943
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研究论文 | 通过全外显子组测序关联研究揭示鼻咽癌肿瘤微环境成分的遗传效应 | 发现了3个与鼻咽癌易感性相关的遗传变异，开发了优化的复合多基因风险评分模型，首次揭示多基因风险通过EBV感染状态介导，并阐明遗传变异通过调控EBV生命周期和内皮细胞功能影响鼻咽癌发病机制 | NA | 探索鼻咽癌的遗传基础及其与肿瘤微环境成分的相互作用 | 鼻咽癌患者 | 基因组学 | 鼻咽癌 | 全外显子组测序，单细胞RNA测序，多组学分析 | 复合多基因风险评分模型 | 基因组数据，转录组数据 | 6,969例鼻咽癌病例和7,100例对照（全外显子组测序），356例批量转录组数据，56例单细胞RNA测序数据 | NA | 全外显子组测序，单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 6283 | 2025-10-06 |
Further evidence of biallelic NAV3 variants associated with recessive neurodevelopmental disorder with dysmorphism, developmental delay, intellectual disability, and behavioral abnormalities
2025-Jan, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-024-02718-6
PMID:39708122
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研究论文 | 本研究通过外显子组测序在三个近亲结婚家系中发现了NAV3基因的双等位基因变异与神经发育障碍的关联 | 首次在三个独立近亲家系中鉴定出NAV3基因的三种新型双等位蛋白截断变异，进一步证实了NAV3与神经发育障碍的因果关系 | 研究样本量较小（仅5名患者），且所有家系均为近亲结婚背景，可能限制了变异的普遍性验证 | 验证NAV3基因双等位变异与常染色体隐性神经发育障碍的关联 | 来自三个无关近亲家系的五名神经发育障碍患者 | 医学遗传学 | 神经发育障碍 | 外显子组测序，单细胞测序数据分析 | NA | 基因组测序数据，单细胞表达数据 | 5名患者（来自3个家系） | NA | 外显子组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6284 | 2025-10-06 |
Potential Role of CD99 Signaling Pathway in Schwann Cell Dysfunction in Diabetic Foot Ulcers Based on Single-Cell Transcriptome Analysis
2025, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/9935400
PMID:40420926
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探究CD99信号通路在糖尿病足溃疡雪旺细胞功能障碍中的潜在作用 | 首次发现CD99信号通路在糖尿病足溃疡非愈合组中上调，并在小鼠伤口模型中验证了CD99在脱髓鞘区域的高表达 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探究糖尿病足溃疡中雪旺细胞功能障碍的分子机制 | 糖尿病足溃疡患者的足部皮肤样本和小鼠伤口模型 | 单细胞转录组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | CellChat包，轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 涵盖非糖尿病患者、无DFU糖尿病患者、DFU愈合者和DFU非愈合者的足部皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6285 | 2025-10-06 |
Exploring shared pathogenic mechanisms and biomarkers in hepatic fibrosis and inflammatory bowel disease through bioinformatics and machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1533246
PMID:40421012
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研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法探索肝纤维化和炎症性肠病的共同致病机制和生物标志物 | 首次整合多种生物信息学方法和机器学习算法系统识别HF和IBD的共享诊断生物标志物 | 研究基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索肝纤维化和炎症性肠病的共同致病机制和诊断生物标志物 | 肝纤维化和炎症性肠病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肝纤维化, 炎症性肠病 | 生物信息学分析, 机器学习, 单细胞测序 | 逻辑回归, WGCNA, CIBERSORT | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6286 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of endothelial cells in atherosclerosis: identifying C1 CXCL12+ ECs as key proliferative drivers for immunological precision therapeutics in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569988
PMID:40421026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了动脉粥样硬化中内皮细胞的单细胞图谱，识别出C1 CXCL12+ ECs作为关键增殖驱动亚群 | 首次在单细胞水平系统描绘动脉粥样硬化内皮细胞异质性，发现C1 CXCL12+ ECs亚群在疾病进展中的关键作用及其调控机制 | 研究主要基于单细胞转录组数据，功能验证仍需更多体内实验支持 | 解析动脉粥样硬化中内皮细胞的异质性及其在疾病进展中的作用机制 | 动脉粥样硬化模型中的内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6287 | 2025-10-06 |
Investigation of the Significance of Blood Signatures on Sepsis-Induced Acute Lung Injury in Sepsis Within 24 Hours
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5684300
PMID:40421173
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习方法探讨了脓毒症患者外周血生物标志物对脓毒症诱导的急性肺损伤的影响 | 首次结合多种机器学习算法识别C3AR1和SLPI作为脓毒症关键生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证SLPI在脓毒症早期免疫器官细胞中的表达升高 | 研究主要基于公共数据库数据，样本来源有限，需要进一步临床验证 | 研究脓毒症发病24小时内血液生物标志物对脓毒症诱导急性肺损伤的意义 | 脓毒症患者和脓毒症诱导的急性肺损伤动物模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两个GEO数据集(GSE54514和GSE95233) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6288 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and machine learning unveil ferroptosis features in tumor-associated macrophages: Prognostic model and therapeutic strategies for lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1598756
PMID:40421217
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的铁死亡特征，并构建了预后风险模型 | 首次基于巨噬细胞铁死亡相关基因构建肺腺癌预后模型，揭示了高风险组的免疫微环境特征和药物敏感性差异 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证；样本量相对有限 | 筛选巨噬细胞中铁死亡相关关键基因，构建肺腺癌预后风险模型 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，Western blot | LASSO, SVM, XGBoost, Cox回归 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD、GSE131907和GSE13213数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6289 | 2025-10-06 |
Deciphering Intercellular Communication of the Immune Landscape within Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Microenvironment at Single-Cell Resolution
2025 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000545663
PMID:40421435
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了常染色体显性多囊肾病微环境中免疫细胞间的复杂通讯网络 | 首次在单细胞分辨率下系统解析ADPKD微环境中免疫细胞互作网络，发现M2样巨噬细胞亚群通过IL-10信号促进囊肿细胞增殖的新机制 | 样本量较小（7例ADPKD和3例健康对照），需更大规模研究验证发现 | 解析ADPKD肾脏微环境中关键细胞类型及其相互作用机制 | ADPKD患者和健康人的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | CellChat, VISION, pySCENIC, Monocle V3 | 单细胞转录组数据 | 7例ADPKD患者和3例健康人肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6290 | 2025-10-06 |
Ligand-receptor dynamics in heterophily-aware graph neural networks for enhanced cell type prediction from single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1547231
PMID:40421418
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研究论文 | 本研究探索了异质性感知图神经网络在单细胞RNA测序数据分析中的应用，通过整合配体-受体动态信息提升细胞类型预测准确性 | 通过提取配体-受体关联并构建具有不同边同质性比例的细胞-细胞关联网络，增强了细胞通讯通路的生物学相关性和准确性，特别关注异质性数据处理方法 | 研究仅基于六个数据集进行验证，需要更多样化的数据集来进一步验证方法的普适性 | 提升单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据和细胞-细胞相互作用网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络, GraphSAGE, 图注意力网络, MixHop, 门控双核GNN | 基因表达数据, 配体-受体相互作用数据 | 六个不同的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6291 | 2025-10-06 |
Identification of PRKCQ-AS1 as a Keratinocyte-Derived Exosomal lncRNA That Promotes Th17 Differentiation and IL-17 secretion in Psoriasis Through Bioinformatics, Machine Learning Algorithms, and Cell Experiments
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S521553
PMID:40433053
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研究论文 | 本研究通过生物信息学、机器学习算法和细胞实验，鉴定出角质形成细胞来源的外泌体lncRNA PRKCQ-AS1可通过激活STAT3信号通路促进Th17细胞分化和IL-17分泌，从而参与银屑病发病机制 | 首次鉴定PRKCQ-AS1作为角质形成细胞来源的外泌体lncRNA在银屑病中的作用机制，并通过多种机器学习算法和实验验证其功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索调控银屑病Th17/IL-17轴的关键外泌体ncRNA及其作用机制 | 银屑病相关的ncRNA、Th17细胞、角质形成细胞、CD4+T细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组关联研究、机器学习算法、免疫荧光、qRT-PCR、Western blot | 加权基因共表达网络分析、五种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据、GWAS数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序数据集、大规模单细胞RNA测序数据 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6292 | 2025-10-06 |
Reversing VTN deficiency inhibits the progression of pancreatic cancer and enhances sensitivity to anti-PD1 immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1578870
PMID:40433359
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研究论文 | 本研究揭示细胞外基质蛋白玻连蛋白(VTN)在胰腺癌中的双重功能：抑制肿瘤进展并增强抗PD1免疫疗法敏感性 | 首次系统阐明VTN在胰腺癌中的双重调控作用，发现其既能抑制肿瘤恶性表型又能调节免疫治疗反应 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探索VTN作为胰腺癌预后生物标志物和免疫治疗增敏靶点的潜力 | 胰腺癌细胞系、小鼠皮下肿瘤模型、公共数据库临床样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、功能实验、机制研究 | 同基因小鼠皮下肿瘤模型 | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6293 | 2025-10-06 |
Glypican-3 regulated epithelial mesenchymal transformation-related genes in osteosarcoma: based on comprehensive tumor microenvironment profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566061
PMID:40433364
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研究论文 | 本研究通过综合分析骨肉瘤肿瘤微环境，揭示了Glypican-3调控上皮间质转化相关基因的作用机制 | 首次基于EMT相关基因构建骨肉瘤预后模型，并结合单细胞RNA测序技术验证模型基因在细胞亚群中的表达特征 | 研究样本量有限，功能验证仅在MG-63细胞系中进行，需要更多临床样本验证 | 探索EMT在骨肉瘤发生发展和免疫治疗反应中的作用机制 | 骨肉瘤患者样本和MG-63细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，LASSO算法，基因敲除 | 预后预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个骨肉瘤转录组数据集和验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6294 | 2025-10-06 |
Investigating the molecular mechanisms associated with ulcerative colitis through the application of single-cell combined spatial transcriptome sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534768
PMID:40433374
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研究论文 | 通过单细胞联合空间转录组测序研究溃疡性结肠炎的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组技术系统分析UC相关单核细胞亚型，并鉴定出GNG5和TIMP1两个关键调控基因 | 研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异，需要进一步的功能验证实验 | 阐明溃疡性结肠炎的发病分子机制 | 溃疡性结肠炎患者样本和DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, Western blotting | LASSO, SVM | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6295 | 2025-10-06 |
CD4+T and CD8+T cells profile in lung inflammation and fibrosis: targets and potential therapeutic drugs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562892
PMID:40433386
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综述 | 本文总结了CD4+T细胞和CD8+T细胞在肺纤维化中的作用及其潜在治疗靶点 | 通过调节T淋巴细胞不同亚群比例及相关信号通路为延缓肺纤维化进程提供新的治疗视角 | 主要基于现有研究总结，缺乏原始实验数据验证 | 探讨T淋巴细胞亚群在肺纤维化中的作用机制和潜在治疗策略 | 肺纤维化患者和矽肺病小鼠模型中的T淋巴细胞 | 免疫学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6296 | 2025-10-06 |
CDT1 is a Potential Therapeutic Target for the Progression of NAFLD to HCC and the Exacerbation of Cancer
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了NAFLD向HCC进展过程中的关键基因CDT1，并验证其作为潜在治疗靶点 | 首次通过机器学习模型结合单细胞测序分析确定CDT1是NAFLD向HCC进展中最关键的基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 识别NAFLD向HCC进展的潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和肝细胞癌(HCC)患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 二代测序, 单细胞测序, 机器学习 | Cox比例风险模型, Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的大样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 伪时序分析 | NA | NA |
| 6297 | 2025-10-06 |
Reprogramming of epidermal keratinocytes by PITX1 transforms the cutaneous cellular landscape and promotes wound healing
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182844
PMID:39480496
|
研究论文 | 本研究通过在小鼠皮肤表皮中异位表达PITX1转录因子，揭示了其促进伤口愈合的机制 | 首次发现PITX1能将皮肤角质细胞重编程为类口腔角质细胞状态，并改变细胞间通讯模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证 | 探究PITX1在角质细胞身份确定、细胞间相互作用和伤口愈合能力中的作用 | 小鼠皮肤和口腔（颊）黏膜组织 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6298 | 2025-10-06 |
Flotillin-2 dampens T cell antigen sensitivity and functionality
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182328
PMID:39499901
|
研究论文 | 本研究揭示Flotillin-2蛋白通过调节T细胞受体纳米簇形成来抑制T细胞对抗原的敏感性和功能 | 首次发现Flotillin-2通过调控T细胞受体表面纳米簇形成来调节T细胞抗原敏感性阈值 | 机制研究尚未完全阐明Flotillin-2调节T细胞受体簇集的具体分子途径 | 探究Flotillin-2在T细胞抗原敏感性调节中的作用机制 | T细胞、Flotillin-2缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 癌症、慢性感染 | 单细胞RNA测序、超分辨率显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | Flotillin-2缺陷小鼠T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6299 | 2025-10-06 |
Estimating and correcting index hopping misassignments in single-cell RNA-seq data
2024-Dec-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619353
PMID:39484535
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研究论文 | 本研究开发了一种估计和校正单细胞RNA测序数据中索引跳跃错误分配的方法 | 通过差异表达分析识别特征基因来量化索引跳跃错误率，并提出了简单的计算校正方法 | 方法依赖于存在具有不同表达谱的细胞类型，且校正效果可能因数据集而异 | 估计和校正单细胞RNA测序中的索引跳跃错误分配问题 | 小鼠皮肤细胞的混合群体 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1152个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 板式单细胞RNA测序 |
| 6300 | 2025-10-06 |
scTrends: A living review of commercial single-cell and spatial 'omic technologies
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100723
PMID:39667347
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综述 | 本文提供了关于商业单细胞和空间组学技术的动态综述，涵盖关键技术方法和行业趋势 | 采用动态综述形式持续跟踪快速发展的技术领域，系统梳理从成熟到新兴的商业平台 | NA | 为生物医学研究和药物开发领域提供单细胞与空间组学技术的商业化与应用导航 | 商业单细胞和空间组学技术平台 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微流控, 板式方法, 组合索引, 下一代测序, 成像技术 | NA | NA |