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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6261 | 2026-03-14 |
Protoplast-Based Functional Genomics and Genome Editing: Progress, Challenges and Applications
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70375
PMID:41521468
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综述 | 本文综述了基于原生质体的功能基因组学和基因组编辑技术的进展、挑战与应用 | 系统分析了1050篇已发表文献,并整合了单细胞转录组学等前沿技术,强调了原生质体再生在作物改良中的新应用价值 | NA | 探讨原生质体系统作为研究植物环境感知与响应、以及作物改良平台的功能与应用 | 植物原生质体系统,涵盖模式物种和经济作物 | 功能基因组学 | NA | 原生质体分离与递送、单细胞转录组学、CRISPR/Cas RNP编辑、原生质体融合 | NA | 文献数据、转录组数据 | 基于1050篇已发表文章的分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6262 | 2026-03-14 |
Identification and validation of hub genes associated with neutrophil immunosuppression during Sepsis
2026-Apr, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2026.105083
PMID:41740292
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,识别并验证了与脓毒症期间中性粒细胞免疫抑制相关的枢纽基因 | 结合WGCNA、单细胞RNA测序和体内CLP模型,首次系统性地识别了NFKBIZ、TNFAIP2和CTSS作为脓毒症中性粒细胞免疫抑制的潜在调控因子 | 研究主要基于小鼠CLP模型和体外共培养实验,人类样本验证有限,且机制探索有待深入 | 识别和验证调控脓毒症中性粒细胞免疫抑制的枢纽基因,以揭示潜在的治疗靶点 | 中性粒细胞(来自人类外周血和小鼠CLP模型) | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络构建, Western blot, qPCR | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 使用GEO数据库中的两个数据集(GSE64457, GSE180387)和单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6263 | 2026-03-14 |
Celastrol disrupts the inflammatory feedback loop driven by Tenascin-C⁺ fibroblast subtype in psoriasis: Insights from single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157988
PMID:41763138
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示了Celastrol通过破坏TNC⁺成纤维细胞驱动的炎症反馈环路来缓解银屑病的机制 | 首次提出并验证了TNC⁺成纤维细胞在银屑病中驱动炎症反馈环路的作用,并阐明了Celastrol通过多靶点调控破坏该环路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类银屑病中的直接适用性尚需进一步验证 | 探索Celastrol如何调控银屑病中的细胞间相互作用网络 | 银屑病小鼠模型(IMQ诱导)及NIH-3T3成纤维细胞系 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、图像数据 | 三组小鼠(健康对照、IMQ诱导模型、Celastrol治疗组)的单细胞转录组数据,以及BALB/c小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6264 | 2026-03-14 |
Modified Shenlingbaizhu decoction suppresses colon cancer via enhancing memory-like Tfh differentiation and B cell responses
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158001
PMID:41763139
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研究论文 | 本研究探讨了加味参苓白术散通过增强记忆样滤泡辅助性T细胞和B细胞反应来抑制结肠癌的机制 | 揭示了加味参苓白术散通过CCL20依赖性方式促进肿瘤相关聚集物形成,从而增强Tfh细胞与B细胞协作的新免疫治疗机制 | 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性仍需进一步验证 | 探索加味参苓白术散是否调控肿瘤微环境中的抗肿瘤免疫反应 | 微卫星稳定型结肠腺癌小鼠模型 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术分析、免疫荧光、酶联免疫吸附测定、高效液相色谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像、血清IgG浓度数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6265 | 2026-03-14 |
Expression of Bruton's Tyrosine Kinase Reflects Immune Cells Infiltration and Cell Proliferation in Breast Cancer
2026-Apr, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2708
PMID:41822319
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析,探讨了布鲁顿酪氨酸激酶(BTK)在乳腺癌中的表达与免疫细胞浸润及细胞增殖的关系 | 首次在多个人类乳腺癌队列中系统评估BTK表达与肿瘤微环境、免疫浸润及治疗反应的关联,并利用单细胞测序数据定位BTK表达细胞群 | BTK表达与生存结局或新辅助化疗/免疫治疗反应缺乏一致关联,其临床预测价值有限 | 评估BTK表达在乳腺癌中的临床相关性,作为进展和/或治疗反应的预测因子 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析,基因集富集分析(GSEA),xCell反卷积,单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | 5,240例乳腺癌样本(来自TCGA、METABRIC、SCAN-B队列),10个新辅助化疗数据集,I-SPY2试验队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6266 | 2026-03-14 |
Transcriptome profiling of peripheral blood for inflammatory subtype classification and diagnostic model construction in asthma
2026-Mar-13, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2026.2633354
PMID:41732097
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研究论文 | 本研究利用外周血转录组学数据识别哮喘的炎症亚型,并通过多层次验证推导候选生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合WGCNA和共识聚类方法识别哮喘炎症亚型,并通过单细胞水平映射和qRT-PCR验证关键基因 | 研究主要基于公开数据集,且qRT-PCR验证仅在LPS刺激的THP-1衍生巨噬细胞样模型中进行,未涉及临床样本验证 | 识别哮喘的炎症亚型并构建诊断模型 | 哮喘患者的外周血转录组数据 | 自然语言处理 | 哮喘 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | LASSO回归, SVM-RFE | 转录组数据 | 基于公开数据集GSE69683和GSE172495,具体样本数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6267 | 2026-03-14 |
Cytoskeletal remodeling promotes tunneling nanotube formation and drives cardiac resident cell mitochondrial transfer in sepsis
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz3266
PMID:41811940
|
研究论文 | 本研究揭示了脓毒症中隧道纳米管(TNTs)作为促进线粒体转移的动态纳米结构,及其在心脏重塑中的关键作用 | 首次发现Drp1驱动的细胞骨架重塑调控TNT形成,并阐明其在脓毒症心脏细胞间线粒体转移中的核心机制 | 研究主要基于小鼠CLP模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 | 探究脓毒症诱导心脏功能障碍的纳米尺度细胞间通讯机制 | 小鼠心脏内皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞及其亚群 | 细胞生物学与纳米医学 | 脓毒症相关心脏功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CLP模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6268 | 2026-03-14 |
miR-203 facilitates timely cell fate transitions via epigenetic modulation during early embryogenesis
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr1776
PMID:41811946
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了miR-203在小鼠早期胚胎植入前发育中作为关键调节因子,通过表观遗传调控促进细胞命运及时转变 | 首次在严格体内方法中识别miR-203为早期哺乳动物胚胎发生中发育过渡的关键调节因子,并揭示其通过靶向组蛋白乙酰化酶如EP300来调控表观遗传重编程 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他哺乳动物中的普适性尚未验证,且机制探索可能仅部分解释了miR-203的作用 | 探究microRNAs在早期哺乳动物胚胎发生中如何调节最早的发育过渡,特别是细胞命运获取和谱系分离 | 小鼠早期胚胎,特别是植入前胚胎,以及相关的基因工程小鼠模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,表观遗传分析 | NA | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定样本数量,但涉及基因工程小鼠模型和早期胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6269 | 2026-03-14 |
A global screen for magnetically induced neuronal activity in the pigeon brain
2026-Mar-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea6425
PMID:41264677
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研究论文 | 本研究通过全脑活动图谱、组织透明化和光片显微镜技术,揭示了鸽子大脑中由磁场刺激激活的神经元群体及其分子机制 | 首次在全脑范围内无偏倚地识别了鸽子大脑中受磁场激活的神经元群体,并发现半规管嵴中存在表达电磁感应检测分子机制的特化II型毛细胞 | 研究主要聚焦于鸽子模型,其发现是否适用于其他磁感应动物仍需进一步验证 | 探究动物感知地球磁场的神经环路和分子机制 | 鸽子大脑神经元群体及半规管嵴毛细胞 | 神经生物学 | NA | 全脑活动图谱、组织透明化、光片显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6270 | 2026-03-14 |
Single-cell activation screen identifies hepatic maturation regulators with zonal resolution
2026-Mar-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.10.014
PMID:41270741
|
研究论文 | 本研究通过单细胞激活筛选,识别了具有区域分辨率的肝脏成熟调控因子 | 利用dCas9激活筛选结合单细胞转录组学,在原发性小鼠胚胎肝细胞中系统评估了晚期转录调控因子的效应,并发现Nr1i3和Nfix在肝脏区域化代谢基因表达中的关键作用 | 研究基于小鼠胚胎肝细胞,结果在人类或其他物种中的普适性需进一步验证,且体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 | 旨在识别调控胚胎肝细胞成熟的关键转录因子,以改善体外衍生肝细胞的功能性 | 原发性小鼠胚胎肝细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学,dCas9激活筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6271 | 2026-03-14 |
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2026-Mar-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100832
PMID:41811178
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研究论文 | 本研究利用多样性远交小鼠的单细胞转录组数据,构建细胞类型特异性网络,以解析人类骨密度全基因组关联研究中的基因功能 | 首次结合单细胞转录组数据和细胞状态轨迹分析,识别出21个网络驱动基因,这些基因可能通过间充质细胞分化调控骨密度,为骨质疏松症提供新的遗传靶点 | 研究基于小鼠模型数据,其结论在人类中的直接适用性需进一步验证,且样本来源和数量可能限制网络分析的普适性 | 解析骨密度全基因组关联研究中的因果基因及其在细胞类型特异性网络中的功能,以优先筛选骨质疏松症的潜在遗传靶点 | 多样性远交小鼠的骨髓来源基质细胞在成骨条件下培养的样本 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | 网络分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6272 | 2026-03-14 |
Integrative spatial profiling pipeline for determining TME architectures in archival clinical specimens using CmTSA superplex technology
2026-Mar-10, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-026-00874-9
PMID:41807362
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研究论文 | 本文开发了一种结合HOC-FD技术和CmTSA超多重技术的空间分析平台,用于在FFPE组织样本中同时标记30-60个生物标志物,并利用计算机视觉流程和RNN分析定义肿瘤微环境中的功能性生态位 | 开发了混合光化学荧光淬灭技术,整合了自发荧光淬灭和循环多重酪胺信号放大,实现了在FFPE组织中高信噪比的多重标记;结合深度学习细胞分割和RNN分析,系统性地定义和验证了功能性生态位的空间特征 | 未明确提及样本量限制或技术适用范围的具体局限性 | 克服空间转录组学和空间蛋白质组学在临床样本中的限制,开发一个集成平台以可视化和量化肿瘤微环境中的多细胞功能性状态 | 人类结肠癌和宫颈癌的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 结肠癌, 宫颈癌 | 循环多重酪胺信号放大, 混合光化学荧光淬灭, 深度学习, 半径约束邻域网络分析 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | CmTSA平台 | 整合HOC-FD技术和CmTSA超多重技术,用于FFPE组织的高通量处理 |
| 6273 | 2026-03-14 |
Phenotypically similar but functionally distinct NK cell populations within the human maternal-fetal interface
2026-Mar-10, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag001
PMID:41808348
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研究论文 | 本研究探讨了人类足月妊娠中母胎界面NK细胞的功能差异,揭示了在解剖学相邻组织中存在功能不同的组织驻留NK细胞群体 | 首次在健康足月妊娠中,通过高参数流式细胞术和单细胞测序,发现母胎界面中表型相似但功能不同的NK细胞群体,特别是在细胞因子激活响应方面存在显著差异 | 研究主要关注足月妊娠,未涵盖妊娠早期或病理状态下的NK细胞功能变化,且样本量有限 | 探究人类足月妊娠中母胎界面NK细胞是否维持效应功能及其功能特性 | 从人类足月妊娠的蜕膜-胎盘界面和蜕膜组织中分离的NK细胞 | 免疫学 | NA | 高参数流式细胞术,单细胞测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及足月妊娠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6274 | 2026-03-14 |
Genetic Regulation of Wnt/PCP Components Through Fgf10/Fgfr2/Sox9 Module in Tear Duct Development
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.30
PMID:41823500
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和分子生物学技术,揭示了Fgf10/Fgfr2/Sox9模块在泪管发育中通过调控Wnt/PCP通路成分的遗传机制 | 首次发现了Fgf信号通路与Wnt/PCP通路在泪管形成中的直接遗传联系,并确定Sox9作为Prickle1基因的转录激活因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;未全面评估所有Wnt/PCP成分在泪管发育中的作用 | 阐明泪管发育的发育生物学和分子遗传学机制,特别是Fgf与Wnt/PCP通路的遗传互作 | 小鼠泪管发育过程及相关基因突变模型(Fgf10、Fgfr2、Sox9、Prickle1突变鼠) | 发育生物学 | 先天性鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序,CUT&Tag分析,免疫组化,原位杂交,荧光素酶报告基因检测,电泳迁移率变动分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质-DNA互作数据,组织切片图像 | 未明确说明具体样本数量,涉及多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6275 | 2026-03-14 |
stVCR: spatiotemporal dynamics of single cells
2026-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03010-3
PMID:41820580
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研究论文 | 提出了一种名为stVCR的生成式深度学习框架,用于从单细胞分辨率的时间序列空间转录组学快照中重建连续的细胞分化、增殖、迁移和空间对齐 | 首次开发了能够端到端重建单细胞时空动态的生成式深度学习框架,整合了非平衡设置下的动态最优传输、对刚性变换不变的密度匹配以及保留空间结构的生物学先验 | 未明确说明模型对数据规模或噪声水平的敏感性,也未讨论计算资源需求 | 研究单细胞在物理空间随时间变化的动态过程,包括分化、增殖和迁移 | 单细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 生成式深度学习框架 | 时间序列空间转录组学数据 | 模拟和真实数据集(包括蝾螈大脑再生和果蝇胚胎发育数据) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6276 | 2026-03-14 |
Dermatofibrosarcoma protuberans: A clinical review of diagnosis and management
2026-Feb-23, Journal of the American Academy of Dermatology
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.jaad.2026.02.072
PMID:41740895
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综述 | 本文综述了隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)的诊断与临床管理策略 | 强调了Mohs显微外科手术作为首选治疗、分子靶点(如EGFR、PD-L1、PRAME)的识别,以及单细胞RNA测序和类器官模型在理解肿瘤微环境中的进展 | 未提及具体研究样本量或数据限制,且基于现有文献综述,可能缺乏原创性实验数据 | 回顾DFSP的诊断方法和治疗策略,以改善临床管理 | 隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)患者及其肿瘤生物学 | 数字病理学 | 皮肤软组织肉瘤 | 组织病理学评估、CD34染色、磁共振成像、计算机断层扫描、分子分析、单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、影像数据、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6277 | 2026-03-14 |
Distinct and cooperative roles of host and tumor Osteopontin in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.19.706899
PMID:41756888
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研究论文 | 本研究通过遗传敲除小鼠模型和空间转录组学技术,揭示了宿主和肿瘤来源的骨桥蛋白在结直肠癌肝转移中的不同作用机制 | 首次使用宿主和肿瘤双区室特异性OPN敲除模型,结合空间转录组学,明确了OPN在肿瘤微环境中对免疫细胞的区室化调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证仍需进一步开展 | 阐明宿主和肿瘤来源的骨桥蛋白在结直肠癌肝转移中的具体作用机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型及患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学,遗传敲除模型 | 2x2遗传敲除小鼠模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6278 | 2026-03-14 |
Distinct cochlear cell types associated with genetic susceptibility to sensory and metabolic hearing loss in older adults from the CLSA
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.17.706270
PMID:41757007
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研究论文 | 本研究整合人类全基因组关联研究数据与小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据,揭示了老年性听力损失不同亚型(感觉性和代谢性)与特定耳蜗细胞类型(毛细胞和螺旋神经节神经元)的遗传关联 | 首次使用单细胞疾病相关性评分工具整合跨物种数据,揭示了老年性听力损失不同亚型在特定耳蜗细胞类型中的遗传表达异质性,并发现年龄分层下的表达模式差异 | 研究基于小鼠模型数据推断人类疾病机制,可能存在物种差异;单细胞RNA测序数据仅反映转录组水平,未验证蛋白功能 | 探究老年性听力损失不同亚型(感觉性和代谢性)的遗传基础与特定耳蜗细胞类型的关联 | 人类全基因组关联研究数据与小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组关联数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6279 | 2026-03-14 |
Epigenetically activated MIR100HG regulates UPF1-mediated oxidative stress to promote pulmonary vascular immune microenvironment remodeling
2026-Feb-16, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA MIR100HG通过调控UPF1介导的氧化应激,促进肺动脉高压中肺血管免疫微环境重塑的分子机制 | 首次系统鉴定了染色质重塑相关的lncRNA MIR100HG,并阐明了其通过MIR100HG/UPF1/NRF2信号轴调控氧化应激和免疫微环境的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证有限,且具体信号通路在人体中的适用性需进一步验证 | 阐明表观遗传修饰在肺动脉高压氧化应激依赖的发病机制中的作用,并识别关键调控网络 | 肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)、巨噬细胞及肺血管免疫微环境 | 表观遗传学与分子生物学 | 肺动脉高压 | ChIP-sequencing、质谱分析、RNA-pulldown、RNA免疫沉淀(RIP)、单细胞测序数据分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6280 | 2026-03-14 |
Integrative single-cell transcriptomic and multi-dimensional bioinformatic analysis reveals proliferation-associated gene expression signatures and cellular heterogeneity in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04660-7
PMID:41689757
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序和多维生物信息学分析,揭示了肝细胞癌中与增殖相关的基因表达特征和显著的细胞异质性 | 整合单细胞RNA测序与多维生物信息学分析,系统揭示了肝细胞癌中与增殖相关的基因表达模式和细胞异质性,并识别出STMN1和RRM2作为关键的增殖重编程标志物和潜在治疗靶点 | 研究主要基于细胞系数据,需要在临床样本和体内模型中进一步验证其发现 | 理解肝细胞癌肿瘤微环境中的复杂基因表达景观和细胞组成,以识别新的生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌细胞系(MHCC97H、HepG2、Huh7)和正常肝细胞系(LO2) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、实时定量PCR、多维生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 约30个样本(包括细胞系) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |