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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6241 - 6260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6241 | 2025-10-06 |
Exploring the co-morbid relationship between Alzheimer's disease and lung cancer in the 5xFAD transgenic mouse model
2025-May, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12527
PMID:39930922
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研究论文 | 本研究通过建立5xFAD转基因小鼠共病模型，探索阿尔茨海默病对肺癌发展的抑制作用机制 | 首次在5xFAD转基因小鼠模型中建立AD与肺癌共病模型，揭示铁稳态失衡和免疫细胞浸润在AD抑制肺癌进展中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 阐明阿尔茨海默病抑制肺癌发展的分子机制 | 5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病,肺癌 | 单细胞测序,组织病理学分析,分子病理学分析 | 动物模型 | 测序数据,图像数据 | 5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6242 | 2025-10-06 |
Transcriptional Heterogeneity and Differential Response of Rod Photoreceptor Pathway Uncovered by Single-Cell RNA Sequencing of the Aging Mouse Retina
2025-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70001
PMID:39954235
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究衰老小鼠视网膜中转录异质性和视杆细胞通路的差异响应 | 首次在衰老视网膜中发现视杆细胞和双极细胞存在转录异质的亚群，并揭示这些亚群在视网膜不同区域的分布特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 探索视网膜衰老过程中转录失调的动态变化及其对视觉功能的影响 | 衰老小鼠视网膜中的不同细胞类型 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性视力损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3、12、18和24月龄小鼠视网膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 优化的单细胞RNA测序实验方案 |
| 6243 | 2025-10-06 |
Single Cell Inference of Cancer Drug Response Using Pathway-Based Transformer Network
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400991
PMID:39962810
|
研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度学习模型scPDS，用于从单细胞RNA测序数据预测癌症药物敏感性 | 通过通路激活转换将大规模细胞系数据中的药物反应知识迁移到单细胞数据分析，提高了预测准确性和计算效率 | 未明确说明模型在其它癌症类型或药物中的泛化能力 | 预测癌症药物反应以支持个性化治疗 | 乳腺癌细胞和患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6244 | 2025-10-06 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2025-May-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027884
PMID:40014797
|
研究论文 | 本研究揭示了成人肺脏中存在功能性造血祖细胞，并证明了其增殖和移植潜力 | 首次在成人肺脏中发现具有独特基因特征的造血祖细胞群，这些细胞在免疫、巨核细胞/血小板和红细胞相关通路上表现出更强的基线激活 | 研究主要基于小鼠移植实验，需要进一步验证这些细胞在人体内的实际功能 | 探索成人肺脏中造血祖细胞的存在和功能特征 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | 空间转录组学 | 造血系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间定位数据 | 成人肺组织样本和干细胞移植血液样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6245 | 2025-10-06 |
STAT3-orchestrated gene expression signatures and tumor microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma uncovered by single-cell sequencing
2025-05, Biochimica et biophysica acta. General subjects
DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130791
PMID:40068710
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了食管鳞状细胞癌中STAT3调控的基因表达特征和肿瘤微环境 | 整合bulk-seq和单细胞转录组数据，首次发现STAT3作为ESCC核心调控因子并负调控LHPP表达 | NA | 探索食管鳞状细胞癌的分子机制和细胞动力学 | 食管鳞状细胞癌临床样本组织和细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6246 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing exposes mast cell-derived CD52's anti-tumor action in breast cancer through the IL-6/JAK/STAT3 axis
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142879
PMID:40194575
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示肥大细胞来源的CD52通过IL-6/JAK/STAT3轴抑制乳腺癌进展的机制 | 首次发现肥大细胞来源的CD52具有抗肿瘤作用，并阐明其通过IL-6/JAK/STAT3信号通路发挥作用 | NA | 探索三阴性乳腺癌免疫治疗无效患者的预后因素和生存结局 | 三阴性乳腺癌患者和乳腺癌细胞 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6247 | 2025-10-06 |
CHOIR improves significance-based detection of cell types and states from single-cell data
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02148-8
PMID:40195561
|
研究论文 | 提出CHOIR方法，通过随机森林分类器和置换测试在层次聚类树中统计确定代表不同细胞群体的聚类 | 首次将随机森林分类器和统计推断测试结合应用于单细胞数据聚类分析，解决了传统聚类工具缺乏统计显著性检验的问题 | NA | 开发一种能够统计显著地检测单细胞数据中细胞类型和状态的新方法 | 单细胞数据中的细胞类型和状态 | 单细胞分析 | NA | 随机森林, 置换测试, 层次聚类 | 随机森林 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序, 空间转录组, 多组学数据 | 230个模拟数据集和5个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6248 | 2025-10-06 |
Deep scSTAR: leveraging deep learning for the extraction and enhancement of phenotype-associated features from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf160
PMID:40315434
|
研究论文 | 介绍了一种基于深度学习的工具Deep scSTAR，用于从单细胞RNA测序和空间转录组数据中提取和增强表型相关特征 | 开发了首个基于深度学习的工具，能够从单细胞和空间转录组数据中特异性提取表型相关特征，克服了噪声、批次效应和无关生物信号的干扰 | NA | 解决从单细胞测序数据中提取有意义的表型相关特征的挑战 | 非小细胞肺癌、肾细胞癌和肝细胞癌中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌,肾癌,肝癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 6249 | 2025-10-06 |
An overview of computational methods in single-cell transcriptomic cell type annotation
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf207
PMID:40347979
|
综述 | 系统梳理单细胞转录组数据细胞类型注释的计算方法，并对不同策略进行比较和分类 | 重点关注数据不平衡导致的罕见细胞类型长尾分布问题，探讨深度学习在开放世界框架下识别新细胞类型的潜力 | NA | 系统评述单细胞转录组细胞类型注释的计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6250 | 2025-10-06 |
Decoupled GNNs based on multi-view contrastive learning for scRNA-seq data clustering
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf198
PMID:40366859
|
研究论文 | 提出一种基于多视图对比学习的解耦图神经网络方法，用于单细胞RNA测序数据聚类 | 采用解耦图神经网络处理细胞间依赖关系，结合多视图对比学习提高特征表示的一致性和区分性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中的高维度和复杂性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 多层感知机(MLP), 对比学习 | 基因表达数据 | 9个真实单细胞RNA测序数据集，来自不同生物体和组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6251 | 2025-10-06 |
Transcriptomic signatures of host immune responses in aphthous ulcers, the earliest lesions of Crohn's disease, suggest that bacterial uptake, rather than global dysbiosis, is the initiating factor
2025-05, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70031
PMID:40386941
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研究论文 | 通过转录组分析比较克罗恩病最早病变阿弗他溃疡与正常组织的基因表达差异 | 首次揭示阿弗他溃疡中存在上皮应激、抗菌防御和单核细胞招募等特征，表明细菌摄取而非菌群失调是疾病始动因素 | 样本量有限，未明确具体细菌种类和摄取机制 | 探究克罗恩病最早阶段的发病机制 | 克罗恩病患者的阿弗他溃疡、派尔斑块、炎症黏膜和正常黏膜 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 网络分析 | NA | 基因表达数据 | 患者和对照组的黏膜组织样本 | NA | 总RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6252 | 2025-10-06 |
SOX4 as a Key Oncogene Driving Tumor Invasion in Retinoblastoma
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.24
PMID:40402518
|
研究论文 | 本研究探讨SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及其致癌通路机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示SOX4在MKI67+光感受器减少细胞中特异性高表达，并证实其通过Wnt/β-catenin和cyclin D1信号通路驱动肿瘤侵袭 | 研究样本量有限，机制研究主要基于细胞系和动物模型，需要更多临床样本验证 | 探索SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及分子机制 | 人视网膜组织、眼内和眼外视网膜母细胞瘤样本、RB细胞系(Y79, WERI-RB1)及异种移植模型 | 癌症生物学 | 视网膜母细胞瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, siRNA敲除, CCK-8, EdU, 克隆形成, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 人视网膜组织、RB组织样本及两种RB细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6253 | 2025-10-06 |
Distinct Transcriptomic Profiles of Cultured Anterior and Posterior Populations of Human Infant Scleral Fibroblasts: Including Dopamine Receptors
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.29
PMID:40402520
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了婴儿巩膜成纤维细胞前部和后部亚群具有不同的转录组特征，包括多巴胺受体的差异表达 | 首次对婴儿巩膜成纤维细胞进行全面的转录组分析，揭示了其异质性，并发现多巴胺受体在巩膜重塑中的调控作用 | 研究样本年龄范围有限（3个月至2岁），且为体外培养细胞，可能无法完全反映体内情况 | 阐明巩膜成纤维细胞的异质性及其在多巴胺信号调控巩膜重塑中的作用机制 | 婴儿巩膜成纤维细胞（前部、赤道部和后部区域） | 单细胞转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 来自婴儿巩膜前部、赤道部和后部区域的培养成纤维细胞（3个月至2岁年龄） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台 | NA |
| 6254 | 2025-10-06 |
UCS: A Unified Approach to Cell Segmentation for Subcellular Spatial Transcriptomics
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400975
PMID:39763408
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研究论文 | 提出一种统一细胞分割方法UCS，专门用于处理来自不同平台的亚细胞空间转录组学数据 | 首次提出统一方法处理多平台SST数据，通过整合细胞核分割和转录数据实现高精度细胞分割 | 未提及方法在特定组织类型或数据质量较差情况下的性能表现 | 开发适用于多平台亚细胞空间转录组学数据的细胞分割方法 | 亚细胞空间转录组学数据中的细胞分割 | 空间转录组学 | NA | 深度学习 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | 10x Genomics, NanoString, Vizgen, BGI | 空间转录组学 | 10X Xenium, NanoString CosMx, MERSCOPE, Stereo-seq | 亚细胞空间转录组学平台 |
| 6255 | 2025-10-06 |
Feedback regulation of VISTA and Treg by TNF-α controls T cell responses in drug allergy
2025-May, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16393
PMID:39526799
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和功能分析揭示了TNF-α通过调控VISTA和Treg细胞在药物过敏中控制T细胞应答的反馈机制 | 首次发现TNF-α通过抑制VISTA表达破坏药物特异性T细胞耐受性，并阐明了不同阶段T细胞应答的反馈调控机制 | 研究样本量有限，免疫病理机制仍存在复杂性 | 阐明严重皮肤不良反应(SCARs)的免疫发病机制并优化治疗方案 | 严重皮肤不良反应(SCARs)患者 | 免疫学 | 药物过敏 | 单细胞测序, 体外功能分析, 临床分析 | NA | 单细胞测序数据, 临床数据 | SCARs患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6256 | 2025-10-06 |
Multi-view clustering for single-cell RNA-seq data based on graph fusion
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf193
PMID:40413869
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研究论文 | 提出基于图融合的多视图聚类算法scMCGF，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 首次将多视图学习与图融合方法结合用于单细胞RNA测序数据聚类，通过整合线性/非线性特征和通路水平信息提升聚类性能 | 未明确说明计算复杂度和对大规模数据的适用性 | 开发更准确和鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多视图聚类、图融合算法 | 基因表达数据 | 13个真实数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6257 | 2025-10-06 |
Scleraxis-expressing progenitor cells are critical for the maturation of the annulus fibrosus and demonstrate therapeutic potential
2025-May, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.04.009
PMID:40421145
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出纤维环中表达Scleraxis的祖细胞群，并证明其对纤维环成熟和修复具有关键作用 | 首次通过单细胞转录组学鉴定出纤维环特异性祖细胞群，并证明Scleraxis可作为该祖细胞的特异性标记物 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用仍需进一步验证 | 探究纤维环祖细胞的身份特征及其在纤维环成熟和损伤修复中的作用 | 小鼠椎间盘组织中的纤维环祖细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，干细胞实验，细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠椎间盘组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6258 | 2025-10-06 |
Endothelial Changes at Different Stages After Ischemic Stroke Contribute to the Regulation of Immune Cell Infiltration
2025-May, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70456
PMID:40421577
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了缺血性中风后不同阶段内皮细胞的功能变化如何调节免疫细胞浸润模式 | 首次在单细胞水平系统揭示缺血性中风后不同阶段静脉内皮细胞的功能异质性及其对免疫细胞浸润的时序性调控机制 | 研究仅使用小鼠MCAO模型，需要人类样本验证；样本量相对有限 | 探究缺血性中风后不同阶段内皮细胞功能变化对免疫细胞浸润的调控机制 | 小鼠外周免疫细胞和内皮细胞 | 单细胞生物学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，图像数据 | 假手术组和MCAO小鼠在术后3天和14天的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6259 | 2025-10-06 |
Exploring the impact of the liver-intestine-brain axis on brain function in non-alcoholic fatty liver disease
2025-May, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.101077
PMID:40433559
|
研究论文 | 本研究探讨非酒精性脂肪肝病通过肝-肠-脑轴影响脑功能的分子机制及潜在治疗策略 | 首次揭示脱氧胆酸通过抑制Hpgd基因激活JAK2/STAT3通路导致小胶质细胞炎症激活的分子机制 | NA | 阐明NAFLD通过肝-肠-脑轴导致脑功能障碍的分子机制 | NAFLD患者、NAFLD小鼠模型、小胶质细胞 | 生物医学 | 非酒精性脂肪肝病 | 16S rRNA测序,非靶向代谢组学(LC-MS),单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据,代谢组数据,单细胞转录组数据 | NAFLD患者和健康个体的粪便样本,NAFLD小鼠模型 | NA | 16S rRNA测序,代谢组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6260 | 2025-10-06 |
Suppression of NOX2-Derived Reactive Oxygen Species (ROS) Reduces Epithelial-to-MesEnchymal Transition Through Blocking SiO2-Regulated JNK Activation
2025-Apr-30, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13050365
PMID:40423444
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研究论文 | 本研究揭示了二氧化硅暴露通过NOX2-ROS-JNK信号通路正反馈循环促进肺上皮细胞上皮-间质转化的分子机制 | 首次发现JNK与NOX2信号通路在二氧化硅诱导的肺纤维化中存在正反馈循环关系 | 研究主要基于细胞和动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究二氧化硅诱导肺纤维化中NOX2与JNK信号通路的相互作用机制 | 人类上皮细胞和矽肺诱导小鼠 | 分子生物学 | 矽肺 | 单细胞测序，体内实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |