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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6241 - 6260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6241 | 2025-10-06 |
Targeting of the IL-33/Wnt axis restricts breast cancer stemness and metastasis
2025-May-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03260-9
PMID:40414980
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研究论文 | 本研究揭示了IL-33通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进乳腺癌干细胞特性和转移的新机制 | 首次阐明IL-33通过自分泌方式经Wnt通路调控乳腺癌干细胞特性，并提出AAV介导的ST2沉默新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究IL-33/Wnt轴在乳腺癌干细胞特性和转移中的作用机制 | 乳腺癌细胞系(4T1, MDA-MB-231)和转基因小鼠模型(MMTV-PyMT) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序, 腺相关病毒(AAV)基因沉默 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多种乳腺癌细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6242 | 2025-10-06 |
The antioxidant stress effect of granulin precursor in vitiligo
2025-May-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03486-7
PMID:40415096
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研究论文 | 本研究探讨了颗粒体蛋白前体通过颗粒体蛋白-sortilin 1配体-受体相互作用在白癜风中对黑素细胞氧化应激的保护作用 | 首次发现颗粒体蛋白-sortilin 1配体-受体作为黑素细胞与其他皮肤细胞通讯的关键桥梁，并阐明其在白癜风中通过激活抗氧化系统保护黑素细胞的机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证；相互作用抑制剂的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究细胞间信号传导在黑素细胞丢失中的作用机制 | 白癜风患者皮肤细胞，特别是黑素细胞 | 皮肤病学 | 白癜风 | 单细胞测序，微阵列数据分析，体外实验 | NA | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6243 | 2025-10-06 |
Targeting PIK3CB/YAP1 improves the sensitivity of paclitaxel by suppressing aging in head and neck squamous tumor cells
2025-May-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03818-7
PMID:40413541
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研究论文 | 本研究探讨PIK3CB/YAP1通路通过抑制衰老增强头颈部鳞状细胞癌对紫杉醇化疗敏感性的机制 | 首次揭示PIK3CB通过YAP1通路调控肿瘤细胞衰老并影响化疗敏感性的机制，并验证navitoclax与紫杉醇联合治疗的协同效应 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证 | 探索提高头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性的新策略 | 头颈部鳞状细胞癌细胞 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、细胞增殖检测、DNA复制分析、集落形成实验、单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | 公共数据库（GEO、TCGA、HPA）数据及实验细胞系 | NA | 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 批量转录组学 | NA | NA |
| 6244 | 2025-10-06 |
Identification of key genes and diagnostic biomarkers for peripheral atherosclerosis: A multi-omics approach
2025-May-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042437
PMID:40419934
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别外周动脉粥样硬化的关键基因和诊断生物标志物 | 整合基因组学、转录组学和孟德尔随机化分析，首次系统鉴定6个PAS关键基因并构建高精度诊断模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 识别外周动脉粥样硬化的分子生物标志物并阐明其发病机制 | 外周动脉粥样硬化患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,孟德尔随机化分析 | 诊断列线图模型 | 基因表达数据 | 2个GEO数据集(GSE28829,GSE100927)和独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组关联研究,表达数量性状位点分析 | NA | NA |
| 6245 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Biomarkers of Ovarian High-Grade Serous Carcinoma: A Preliminary Study Using Spatial Transcriptome Analysis and Multispectral Imaging
2025-05-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14100681
PMID:40422184
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研究论文 | 本研究利用空间转录组分析和多光谱成像技术识别卵巢高级别浆液性癌的预后生物标志物 | 首次结合GeoMx平台的空间转录组学和多光谱免疫荧光技术分析HGSC的肿瘤微环境空间特征 | 初步研究，样本量有限 | 识别与卵巢高级别浆液性癌疾病进展相关的生物标志物 | 卵巢高级别浆液性癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 多光谱免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 多光谱图像 | NA | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx平台 |
| 6246 | 2025-10-06 |
m2ST: dual multi-scale graph clustering for spatially resolved transcriptomics
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf221
PMID:40272889
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研究论文 | 提出一种名为m2ST的双重多尺度图聚类方法，用于空间转录组数据的空间域注释 | 采用多尺度掩码图自编码器提取不同尺度表示，引入随机掩码机制和缩放余弦误差损失函数，开发专门的多尺度聚类框架整合尺度共性和特异性信息 | 论文未明确说明方法的具体局限性 | 提高空间转录组数据空间聚类的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图神经网络，掩码图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6247 | 2025-10-06 |
A 3D Self-Assembly Platform Integrating Decellularized Matrix Recapitulates In Vivo Tumor Phenotypes and Heterogeneity
2025-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1954
PMID:39888317
|
研究论文 | 开发了一种无水凝胶自组装平台MatriSpheres，用于模拟体内肿瘤表型和异质性 | 创建了无需水凝胶的自组装平台，使用脱细胞基质主动构建肿瘤微环境，在形态和分子水平上更好地模拟临床结直肠癌 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞与细胞外基质的相互作用 | 小鼠和人类结直肠癌细胞 | 组织工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | 3D细胞培养模型 | 基因表达数据，细胞因子数据，形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6248 | 2025-10-06 |
Improving Spatial Transcriptomics with Membrane-Based Boundary Definition and Enhanced Single-Cell Resolution
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401056
PMID:39871658
|
研究论文 | 提出了一种基于细胞膜标记的空间转录组学新方法，通过遗传编码荧光蛋白精确定义细胞边界 | 首次使用细胞膜标记而非传统的核染色或数学推断方法来定义细胞边界，显著提高了基因捕获数量和细胞类型识别精度 | NA | 改进空间转录组学技术的细胞边界定义和单细胞分辨率 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，荧光图像 | 小鼠和蝾螈的多个器官组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | 基于细胞膜标记的空间转录组学方法 |
| 6249 | 2025-10-06 |
Exploring the co-morbid relationship between Alzheimer's disease and lung cancer in the 5xFAD transgenic mouse model
2025-May, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12527
PMID:39930922
|
研究论文 | 本研究通过建立5xFAD转基因小鼠共病模型，探索阿尔茨海默病对肺癌发展的抑制作用机制 | 首次在5xFAD转基因小鼠模型中建立AD与肺癌共病模型，揭示铁稳态失衡和免疫细胞浸润在AD抑制肺癌进展中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 阐明阿尔茨海默病抑制肺癌发展的分子机制 | 5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病,肺癌 | 单细胞测序,组织病理学分析,分子病理学分析 | 动物模型 | 测序数据,图像数据 | 5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6250 | 2025-10-06 |
Transcriptional Heterogeneity and Differential Response of Rod Photoreceptor Pathway Uncovered by Single-Cell RNA Sequencing of the Aging Mouse Retina
2025-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70001
PMID:39954235
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究衰老小鼠视网膜中转录异质性和视杆细胞通路的差异响应 | 首次在衰老视网膜中发现视杆细胞和双极细胞存在转录异质的亚群，并揭示这些亚群在视网膜不同区域的分布特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 探索视网膜衰老过程中转录失调的动态变化及其对视觉功能的影响 | 衰老小鼠视网膜中的不同细胞类型 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性视力损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3、12、18和24月龄小鼠视网膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 优化的单细胞RNA测序实验方案 |
| 6251 | 2025-10-06 |
Single Cell Inference of Cancer Drug Response Using Pathway-Based Transformer Network
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400991
PMID:39962810
|
研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度学习模型scPDS，用于从单细胞RNA测序数据预测癌症药物敏感性 | 通过通路激活转换将大规模细胞系数据中的药物反应知识迁移到单细胞数据分析，提高了预测准确性和计算效率 | 未明确说明模型在其它癌症类型或药物中的泛化能力 | 预测癌症药物反应以支持个性化治疗 | 乳腺癌细胞和患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6252 | 2025-10-06 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2025-May-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027884
PMID:40014797
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研究论文 | 本研究揭示了成人肺脏中存在功能性造血祖细胞，并证明了其增殖和移植潜力 | 首次在成人肺脏中发现具有独特基因特征的造血祖细胞群，这些细胞在免疫、巨核细胞/血小板和红细胞相关通路上表现出更强的基线激活 | 研究主要基于小鼠移植实验，需要进一步验证这些细胞在人体内的实际功能 | 探索成人肺脏中造血祖细胞的存在和功能特征 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | 空间转录组学 | 造血系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间定位数据 | 成人肺组织样本和干细胞移植血液样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6253 | 2025-10-06 |
STAT3-orchestrated gene expression signatures and tumor microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma uncovered by single-cell sequencing
2025-05, Biochimica et biophysica acta. General subjects
DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130791
PMID:40068710
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了食管鳞状细胞癌中STAT3调控的基因表达特征和肿瘤微环境 | 整合bulk-seq和单细胞转录组数据，首次发现STAT3作为ESCC核心调控因子并负调控LHPP表达 | NA | 探索食管鳞状细胞癌的分子机制和细胞动力学 | 食管鳞状细胞癌临床样本组织和细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6254 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing exposes mast cell-derived CD52's anti-tumor action in breast cancer through the IL-6/JAK/STAT3 axis
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142879
PMID:40194575
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示肥大细胞来源的CD52通过IL-6/JAK/STAT3轴抑制乳腺癌进展的机制 | 首次发现肥大细胞来源的CD52具有抗肿瘤作用，并阐明其通过IL-6/JAK/STAT3信号通路发挥作用 | NA | 探索三阴性乳腺癌免疫治疗无效患者的预后因素和生存结局 | 三阴性乳腺癌患者和乳腺癌细胞 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6255 | 2025-10-06 |
CHOIR improves significance-based detection of cell types and states from single-cell data
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02148-8
PMID:40195561
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研究论文 | 提出CHOIR方法，通过随机森林分类器和置换测试在层次聚类树中统计确定代表不同细胞群体的聚类 | 首次将随机森林分类器和统计推断测试结合应用于单细胞数据聚类分析，解决了传统聚类工具缺乏统计显著性检验的问题 | NA | 开发一种能够统计显著地检测单细胞数据中细胞类型和状态的新方法 | 单细胞数据中的细胞类型和状态 | 单细胞分析 | NA | 随机森林, 置换测试, 层次聚类 | 随机森林 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序, 空间转录组, 多组学数据 | 230个模拟数据集和5个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6256 | 2025-10-06 |
Deep scSTAR: leveraging deep learning for the extraction and enhancement of phenotype-associated features from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf160
PMID:40315434
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研究论文 | 介绍了一种基于深度学习的工具Deep scSTAR，用于从单细胞RNA测序和空间转录组数据中提取和增强表型相关特征 | 开发了首个基于深度学习的工具，能够从单细胞和空间转录组数据中特异性提取表型相关特征，克服了噪声、批次效应和无关生物信号的干扰 | NA | 解决从单细胞测序数据中提取有意义的表型相关特征的挑战 | 非小细胞肺癌、肾细胞癌和肝细胞癌中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌,肾癌,肝癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 6257 | 2025-10-06 |
An overview of computational methods in single-cell transcriptomic cell type annotation
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf207
PMID:40347979
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综述 | 系统梳理单细胞转录组数据细胞类型注释的计算方法，并对不同策略进行比较和分类 | 重点关注数据不平衡导致的罕见细胞类型长尾分布问题，探讨深度学习在开放世界框架下识别新细胞类型的潜力 | NA | 系统评述单细胞转录组细胞类型注释的计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6258 | 2025-10-06 |
Decoupled GNNs based on multi-view contrastive learning for scRNA-seq data clustering
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf198
PMID:40366859
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研究论文 | 提出一种基于多视图对比学习的解耦图神经网络方法，用于单细胞RNA测序数据聚类 | 采用解耦图神经网络处理细胞间依赖关系，结合多视图对比学习提高特征表示的一致性和区分性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中的高维度和复杂性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 多层感知机(MLP), 对比学习 | 基因表达数据 | 9个真实单细胞RNA测序数据集，来自不同生物体和组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6259 | 2025-10-06 |
Transcriptomic signatures of host immune responses in aphthous ulcers, the earliest lesions of Crohn's disease, suggest that bacterial uptake, rather than global dysbiosis, is the initiating factor
2025-05, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70031
PMID:40386941
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研究论文 | 通过转录组分析比较克罗恩病最早病变阿弗他溃疡与正常组织的基因表达差异 | 首次揭示阿弗他溃疡中存在上皮应激、抗菌防御和单核细胞招募等特征，表明细菌摄取而非菌群失调是疾病始动因素 | 样本量有限，未明确具体细菌种类和摄取机制 | 探究克罗恩病最早阶段的发病机制 | 克罗恩病患者的阿弗他溃疡、派尔斑块、炎症黏膜和正常黏膜 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 网络分析 | NA | 基因表达数据 | 患者和对照组的黏膜组织样本 | NA | 总RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6260 | 2025-10-06 |
SOX4 as a Key Oncogene Driving Tumor Invasion in Retinoblastoma
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.24
PMID:40402518
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研究论文 | 本研究探讨SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及其致癌通路机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示SOX4在MKI67+光感受器减少细胞中特异性高表达，并证实其通过Wnt/β-catenin和cyclin D1信号通路驱动肿瘤侵袭 | 研究样本量有限，机制研究主要基于细胞系和动物模型，需要更多临床样本验证 | 探索SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及分子机制 | 人视网膜组织、眼内和眼外视网膜母细胞瘤样本、RB细胞系(Y79, WERI-RB1)及异种移植模型 | 癌症生物学 | 视网膜母细胞瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, siRNA敲除, CCK-8, EdU, 克隆形成, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 人视网膜组织、RB组织样本及两种RB细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |