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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6221 | 2025-10-06 |
Intercellular communication between FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in prostate cancer via multi-omics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560998
PMID:40438108
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研究论文 | 通过多组学技术揭示前列腺癌中FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的细胞通讯机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序系统揭示FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在前列腺癌中的特异性相互作用网络 | 样本量相对有限(23个前列腺样本),需要更大规模验证 | 探索前列腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯机制,寻找新的治疗靶点 | 前列腺癌肿瘤微环境中的FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 23个前列腺样本的23,519个单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
6222 | 2025-10-06 |
Unraveling the immune evasion mechanisms in the tumor microenvironment of head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597202
PMID:40438103
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综述 | 系统阐述头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中免疫逃逸机制及其治疗策略 | 提出HNSCC免疫逃逸的'三位一体'调控网络新框架,包含代谢重编程、基质细胞驱动和表观遗传重塑三大机制,并首次提出'谱系可塑性驱动免疫适应'新范式 | 对特定免疫逃逸通路理解仍不完整,缺乏个性化治疗策略 | 解析HNSCC肿瘤微环境中的免疫逃逸机制并探索免疫治疗新策略 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
6223 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating immune cell signature score reveals prognostic biomarkers and therapeutic targets for colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583327
PMID:40438100
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研究论文 | 本研究通过整合结直肠癌转录组数据构建了肿瘤浸润免疫细胞特征评分模型,用于预后预测和免疫治疗反应评估 | 开发了基于五个关键TIIC-RNA的预后模型,在TCGA-CRC和外部验证数据集中表现优于22个现有预后模型 | 需要进一步评估TIIC特征评分的临床实用性,并在不同人群和治疗环境中验证其相关性 | 探索肿瘤浸润免疫细胞相关基因在结直肠癌中的预后价值,发现新的生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,机器学习 | 随机生存森林,LASSO回归,Cox比例风险回归 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA-CRC数据集和外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
6224 | 2025-10-06 |
Construction of a stromal cell-related prognostic signature based on a 101-combination machine learning framework for predicting prognosis and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1544348
PMID:40438115
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研究论文 | 基于101种机器学习组合框架构建基质细胞相关预后特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫治疗反应 | 首次整合10种机器学习算法和101种模型组合,开发基于myCAF、VSMC和周细胞标记基因的预后特征 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 识别基质细胞标记基因并开发预后特征,预测TNBC生存结局和免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者和细胞系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,RNA干扰,CCK-8检测,凋亡检测,伤口愈合检测 | 101种机器学习组合框架 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和独立验证队列GSE91061 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6225 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome conservation in a multispecies comparative analysis of fresh and cryopreserved insulinoma cell lines
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00025-4
PMID:40438246
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对多种胰岛素瘤细胞系进行跨物种比较分析,并评估冷冻保存对单细胞转录组的影响 | 首次在胰岛素瘤中进行跨物种单细胞转录组比较分析,并系统评估冷冻保存对胰岛素瘤细胞转录组的影响 | 研究仅使用细胞系而非原代肿瘤组织,可能无法完全反映体内肿瘤的复杂性 | 理解胰岛素瘤的单细胞转录组景观,评估冷冻保存对转录组的影响 | 犬类和人类胰岛素瘤细胞系(canINS, CM, INS-1和MIN6) | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 四种胰岛素瘤细胞系的新鲜和冷冻保存样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6226 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis of canine insulinoma reveals distinct sub-populations of insulin-expressing cancer cells
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00026-3
PMID:40438247
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研究论文 | 首次对犬胰岛素瘤进行单细胞转录组分析,揭示胰岛素表达癌细胞的不同亚群 | 首次在任何物种中对自然发生的胰岛素瘤进行单细胞RNA测序分析,发现了两个转录特征不同的胰岛素表达肿瘤细胞亚群 | 研究规模较小,仅包含两只犬的三个肿瘤样本 | 绘制犬胰岛素瘤的单细胞转录组图谱,探索肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征 | 犬胰岛素瘤组织样本,包括两个原发肿瘤和一个转移灶 | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5,532个细胞,来自两只拳师犬的两个胰岛素瘤和一个转移灶 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6227 | 2025-10-06 |
Biomarker identification associated with M2 tumor-associated macrophage infiltration in glioblastoma
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1545608
PMID:40438577
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据,识别与胶质母细胞瘤中M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析识别M2 TAM相关基因,并构建胶质母细胞瘤预后特征模型 | 研究样本量未明确说明,需要外部验证确认模型的普适性 | 识别胶质母细胞瘤中与M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, WGCNA, Cox回归, LASSO回归 | 预后特征模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
6228 | 2025-10-06 |
Dominant immune tolerance in the intestinal tract imposed by RelB-dependent migratory dendritic cells regulates protective type 2 immunity
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53112-9
PMID:39443450
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研究论文 | 本研究揭示了肠道树突状细胞中RelB表达通过调控DC-Treg细胞相互作用建立免疫耐受机制 | 首次发现RelB在肠道隐窝斑和孤立淋巴滤泡相关树突状细胞分化中的关键作用,并阐明其通过CCL22调控DC-Treg细胞相互作用的机制 | 研究主要关注肠道特定区域的树突状细胞,其他免疫细胞类型和组织部位的作用尚未完全探索 | 探究RelB在肠道树突状细胞介导的免疫耐受和2型免疫应答调控中的作用机制 | 小鼠肠道树突状细胞、调节性T细胞和Heligmosomoides polygyrus bakeri寄生虫感染模型 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6229 | 2025-10-06 |
Overloading And unpacKing (OAK) - droplet-based combinatorial indexing for ultra-high throughput single-cell multiomic profiling
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53227-z
PMID:39443484
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研究论文 | 介绍了一种名为OAK的超高通量单细胞多组学分析方法 | 结合液滴微流控和组合索引技术,通过过载和拆包策略提高条形码和试剂利用率 | 未明确说明技术局限,但暗示现有方法存在效率问题 | 开发超高通量单细胞多组学分析技术 | 支气管上皮细胞、视网膜组织、黑色素瘤细胞 | 单细胞测序技术 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 单细胞多组学数据 | 超过40万个黑色素瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴条形码系统结合组合索引 |
6230 | 2025-10-06 |
IL-1β-induced epithelial cell and fibroblast transdifferentiation promotes neutrophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53307-0
PMID:39438439
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现IL-1β诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞转分化促进慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的中性粒细胞募集 | 首次鉴定出IL-1信号诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞两个细胞亚群,并阐明它们通过释放不同趋化因子促进中性粒细胞募集的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证需要进一步扩展 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的细胞机制和干预策略 | 人类鼻黏膜组织(下鼻甲、中鼻甲和鼻息肉)和LPS诱导的小鼠CRSwNP模型 | 单细胞生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自CRSwNP患者的人类鼻黏膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6231 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52977-0
PMID:39438438
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫特征 | 首次通过单细胞RNA测序结合T细胞受体测序,系统解析了食管鳞癌新辅助免疫化疗响应者与非响应者的肿瘤微环境差异,发现CXCL13+CD8+ Tex细胞可作为治疗响应的预测标志物 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证发现 | 探究食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫学机制 | 接受新辅助免疫化疗的食管鳞癌患者组织样本 | 数字病理 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管鳞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6232 | 2025-10-06 |
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-10-17, Viruses
DOI:10.3390/v16101623
PMID:39459954
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研究论文 | 开发了一种用于检测、分选和单细胞RNA测序分析丙型肝炎病毒特异性T细胞的激活诱导标记检测方法 | 建立了不依赖MHC多聚体的高灵敏度抗原特异性T细胞检测方法,并首次应用于HCV特异性T细胞的单细胞RNA测序分析 | 仅在一个研究对象中进行了验证,需要更大规模的队列研究来确认方法的普适性 | 开发能够识别和分离HCV特异性T细胞用于单细胞转录组分析的新方法 | 丙型肝炎病毒特异性CD4和CD8 T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析,流式细胞分选 | NA | 单细胞基因表达数据,TCR序列数据 | 一个研究对象(包含1023个AIM CD4 T细胞克隆型和160个AIM CD8 T细胞克隆型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6233 | 2025-10-06 |
Putting proteins in context
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
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研究论文 | 介绍了一种名为PINNACLE的几何深度学习方法,通过整合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组数据生成蛋白质的上下文表征 | 首次将蛋白质相互作用与多器官单细胞转录组数据结合,利用几何深度学习方法生成具有生物环境背景的蛋白质表征 | NA | 解决蛋白质表征缺乏生物环境背景的问题 | 蛋白质及其相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 几何深度学习 | 蛋白质相互作用数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6234 | 2025-10-06 |
Unraveling the Prefrontal Cortex-Basolateral Amygdala Pathway's Role on Schizophrenia's Cognitive Impairments: A Multimodal Study in Patients and Mouse Models
2024-07-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae063
PMID:38811350
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研究论文 | 通过多模态方法研究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症认知障碍中的作用 | 首次结合临床患者和动物模型,综合运用光遗传学、单细胞RNA测序和神经影像学技术揭示mPFC-BLA通路在精神分裂症认知障碍中的关键作用,并发现血液外泌体mRNA作为非侵入性生物标志物的潜力 | 研究样本量未明确说明,动物模型可能无法完全模拟人类精神分裂症的复杂性 | 探究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症相关认知障碍中的作用机制 | 精神分裂症患者和甲基氧化甲醇乙酸酯诱导的小鼠模型 | 神经科学 | 精神分裂症 | 临床量表、磁共振成像、单细胞RNA测序、光遗传学、立体定位注射 | 小鼠疾病模型 | 影像数据、基因表达数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6235 | 2025-10-06 |
Smooth muscle cells in atherosclerosis: clones but not carbon copies
2021, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2021.02.002
PMID:34617064
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综述 | 总结血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的克隆扩增和表型多样性研究进展 | 揭示动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞通过有限数量克隆扩增形成表型多样性的新机制 | 单细胞转录组技术在确定平滑肌细胞功能方面可能存在可靠性问题,需要结合功能研究验证 | 阐明平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的投资机制和表型可塑性 | 血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 命运图谱技术,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6236 | 2025-10-06 |
The influence of age on cellular senescence in injured versus healthy muscle and its implications on rotator cuff injuries
2025-Jun, Journal of shoulder and elbow surgery
IF:2.9Q1
DOI:10.1016/j.jse.2025.02.008
PMID:40057173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年龄对肩袖损伤肌肉细胞衰老的影响 | 首次在肩袖肌肉组织中鉴定出六种主要细胞群体,并发现老年患者FAP细胞中衰老标志物ATF3表达显著升高 | 样本量有限,计算分析结果需要进一步实验验证 | 探讨年龄对肩袖损伤肌肉细胞衰老的影响机制 | 年轻和老年肩袖手术患者的肌肉组织样本 | 单细胞组学 | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 年轻和老年患者肩袖肌肉样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6237 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis identified and confirmed TNF-α as a key initiator of the inflammatory response following spinal cord injury
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143866
PMID:40319972
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了锌离子通过调控TNF-α信号通路减轻脊髓损伤后免疫炎症反应的机制 | 首次整合转录组学、代谢组学和单细胞RNA测序技术系统阐明锌离子通过抑制TNF-α信号通路调控脊髓损伤后免疫炎症反应的分子机制 | 锌离子调控TNF-α信号通路的具体上游机制尚未完全阐明 | 探究锌离子调控脊髓损伤后免疫炎症反应的分子机制 | 脊髓损伤模型中的免疫细胞,特别是小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 转录组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 基因表达数据, 代谢物数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6238 | 2025-10-06 |
Lipopolysaccharide alters cell communication at the maternal-fetal interface revealed by single-cell RNA-sequencing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143939
PMID:40328399
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究脂多糖诱导的炎症对母胎界面细胞通讯的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示LPS通过改变细胞比例和细胞间通讯导致母胎界面信号通路紊乱 | 未明确说明样本数量和实验重复次数 | 研究LPS诱导的炎症对母胎界面细胞组成、细胞间相互作用和关键信号通路的影响 | 母胎界面组织细胞 | 单细胞测序分析 | 胚胎植入失败和复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6239 | 2025-10-06 |
Fibroblast reprogramming in the dura mater of NTG-induced migraine-related chronic hypersensitivity model drives monocyte infiltration via Angptl1-dependent stromal signaling
2025-May-26, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02058-4
PMID:40419944
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了硝酸甘油诱导的偏头痛模型中硬脑膜成纤维细胞重编程通过Angptl1信号驱动单细胞浸润的机制 | 首次在偏头痛慢性超敏模型中鉴定出促炎性成纤维细胞亚群扩张及其通过Angptl1介导的基质-免疫细胞串扰机制 | 需要人类样本验证,动物模型可能无法完全模拟人类偏头痛病理 | 解析偏头痛慢性超敏的硬脑膜基质-免疫细胞相互作用机制 | 硝酸甘油诱导的偏头痛模型小鼠的硬脑膜组织 | 单细胞组学 | 偏头痛 | 单细胞RNA测序, GWAS整合分析, 细胞间相互作用网络分析, 转录调控分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组关联数据 | 偏头痛模型小鼠硬脑膜组织(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6240 | 2025-10-06 |
Revealing a novel Decorin-expressing tumor stromal subset in hepatocellular carcinoma via integrative analysis single-cell RNA sequencing
2025-May-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03811-0
PMID:40420150
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据,揭示了肝细胞癌中表达Decorin的新型肿瘤基质亚群及其临床意义 | 首次在肝细胞癌中发现高表达DCN及相关硫酸软骨素合成酶的独特肿瘤基质亚群,并建立了六基因DCN相关特征作为预后标志物 | DCN在肝癌微环境中的具体作用机制仍需进一步验证 | 探究Decorin在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用和潜在治疗价值 | 肝细胞癌组织、肿瘤微环境中的基质细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |