单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6201 - 6220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6201 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling of individual bacteria by MATQ-seq
2025-Apr-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01157-5
PMID:40204970
|
研究论文 | 开发了一种基于MATQ-seq的细菌单细胞转录组测序方法 | 将真核生物MATQ-seq方法成功应用于细菌单细胞转录组分析，细胞保留率高达95%，显著优于现有方法 | NA | 建立高效可靠的细菌单细胞转录组测序方法 | 细菌单细胞，以鼠伤寒沙门氏菌为模型生物 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序，rRNA去除，随机引物法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | MATQ-seq | 整合流式细胞分选、随机引物和rRNA去除的细菌单细胞转录组测序平台 |
| 6202 | 2025-10-06 |
Severe inflammation and lineage skewing are associated with poor engraftment of engineered hematopoietic stem cells in patients with sickle cell disease
2025-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58321-4
PMID:40169559
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研究论文 | 本研究报道了针对镰状细胞病患者使用慢病毒载体DREPAGLOBE进行基因治疗的I/II期临床试验结果 | 首次通过单细胞转录组分析揭示HSCs中炎症特征与移植效果不佳的关联 | 样本量有限，随访时间相对较短（18-36个月） | 评估基于DREPAGLOBE的基因治疗在镰状细胞病患者中的安全性和有效性 | 镰状细胞病患者 | 基因治疗 | 镰状细胞病 | 慢病毒载体基因治疗，单细胞转录组分析 | NA | 临床数据，单细胞转录组数据 | I/II期临床试验患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6203 | 2025-10-06 |
LINC02363: a potential biomarker for early diagnosis and treatment of sepsis
2025-Mar-15, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00702-x
PMID:40089725
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定LINC02363作为脓毒症早期诊断和治疗的潜在生物标志物 | 首次发现LINC02363在脓毒症中显著上调，并通过多组学分析验证其作为新型生物标志物的潜力 | 样本来源单一，需要更大规模的多中心研究验证 | 识别在脓毒症中起关键作用的lncRNAs，为脓毒症诊断和治疗提供潜在生物标志物 | 脓毒症患者转录组数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞测序, qPCR, WGCNA, GSEA | NA | 基因表达数据 | 从中国国家基因库获取的脓毒症患者转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 6204 | 2025-10-06 |
Integrating Metabolic RNA Labeling-Based Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics for Spatiotemporal Transcriptomic Analysis
2025-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401297
PMID:39390840
|
研究论文 | 本研究通过整合代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学，实现了胶质母细胞瘤的时空转录组分析 | 首次将时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学整合，提出时空分析新范式，揭示了胶质母细胞瘤中EZH2介导间质转化的新机制 | 技术整合复杂度较高，可能受限于两种技术的分辨率和灵敏度差异 | 开发时空转录组分析方法，解析胶质母细胞瘤中基因调控网络和细胞间通讯机制 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的细胞群体 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢RNA标记时间分辨单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | Well-TEMP-seq | 代谢RNA标记时间分辨Well-TEMP-seq |
| 6205 | 2025-10-06 |
Chronic intermittent fasting impairs β cell maturation and function in adolescent mice
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115225
PMID:39827461
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研究论文 | 本研究探讨了间歇性禁食对不同年龄小鼠β细胞功能的影响，发现长期禁食会损害年轻小鼠的β细胞成熟与功能 | 首次通过单细胞RNA测序揭示长期间歇性禁食对年轻个体β细胞成熟和功能的不利影响，并发现与1型糖尿病的相似模式 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，需要更多临床研究验证 | 探究间歇性禁食对不同年龄个体代谢和β细胞功能的影响 | 老年、中年和年轻小鼠，以及人类胰岛 | 代谢研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多年龄段小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6206 | 2025-10-06 |
Early precursor-derived pituitary gland tissue-resident macrophages play a pivotal role in modulating hormonal balance
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115227
PMID:39841599
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研究论文 | 通过单细胞转录组学等技术揭示了垂体驻留巨噬细胞的异质性及其通过细胞外ATP介导的信号调节激素平衡的机制 | 首次系统表征垂体驻留巨噬细胞的异质性和空间特异性，发现其全部起源于早期卵黄囊祖细胞并通过自我更新维持 | 未明确巨噬细胞调节激素平衡的具体分子通路细节 | 探究垂体驻留巨噬细胞的特征及其在调节激素平衡中的作用 | 小鼠垂体驻留巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 成像技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6207 | 2025-10-06 |
The spatial landscape of cancer hallmarks reveals patterns of tumor ecological dynamics and drug sensitivity
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115229
PMID:39864059
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析63个原发未治疗肿瘤，揭示了癌症标志物在肿瘤生态系统中的空间分布模式及其与治疗敏感性的关系 | 首次系统性地描绘了癌症标志物在肿瘤空间中的分布格局，发现了肿瘤亚克隆间基因组距离与标志物活性的相关性，以及克隆-标志物特化现象 | 样本量相对有限（63个肿瘤），仅涵盖10种癌症类型，空间分辨率可能受技术限制 | 探索肿瘤生态系统中癌症标志物的空间分布规律及其与治疗敏感性的关联 | 63个原发未治疗肿瘤样本（来自10种癌症类型）和33名膀胱癌患者（来自DUTRENEO试验） | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 63个原发肿瘤样本（10种癌症类型）+33名膀胱癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6208 | 2025-10-06 |
A single-cell and spatial wheat root atlas with cross-species annotations delineates conserved tissue-specific marker genes and regulators
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115240
PMID:39893633
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研究论文 | 本研究构建了小麦根尖分生组织的单细胞和空间转录组图谱，通过跨物种注释方法识别了保守的组织特异性标记基因和调控因子 | 开发了基于同源性的跨物种注释方法，结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证，解决了非模式植物物种细胞类型注释的难题 | 主要依赖公开数据集进行跨物种注释，可能受到物种间基因表达差异的影响 | 建立小麦根尖分生组织的细胞类型注释系统，识别保守的组织特异性标记基因和调控网络 | 土壤生长的小麦根系，以及小麦、水稻、玉米和拟南芥的公开数据集 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6209 | 2025-10-06 |
Cxcl9 modulates aging associated microvascular metabolic and angiogenic dysfunctions in subcutaneous adipose tissue
2025-Feb-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09970-y
PMID:39934436
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Cxcl9是调控衰老相关微血管代谢和血管生成功能障碍的关键因子 | 首次揭示Cxcl9通过抑制G蛋白偶联受体信号通路导致衰老内皮细胞能量代谢受损和血管生成减少的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究衰老对微血管内皮细胞的影响及其分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织中的微血管内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 光片免疫荧光显微镜, 代谢通量平衡分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 老年小鼠皮下脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6210 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics analysis reveals dynamic changes and prognostic signature in tumor microenvironment of PDAC
2025-Feb-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86950-8
PMID:39894886
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胰腺导管腺癌肿瘤微环境的动态变化并建立预后模型 | 定义了新的Treg和耗竭T细胞标志基因TNFRSF4，建立了基于14个基因的预后模型，并鉴定了三种潜在治疗药物 | 使用已发表数据集，样本量相对有限（31个样本） | 阐明PDAC进展过程中肿瘤微环境的动态变化并开发预后模型 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤微环境中的细胞 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据 | 31个PDAC样本（8个I期，9个II期，6个III期，8个IV期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6211 | 2025-10-06 |
Exploring the level of metabolic reprogramming and the role of prognostic factor SF3A3 in hepatocellular carcinoma through integrated single-cell landscape analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0323559
PMID:40424306
|
研究论文 | 通过整合单细胞景观分析探索肝细胞癌中代谢重编程水平及预后因子SF3A3的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示HCC代谢重编程异质性，发现SF3A3作为新型诊断和独立预后生物标志物 | 使用公共数据库数据，缺乏实验验证样本 | 研究肝细胞癌代谢重编程异质性并识别新的治疗靶点 | 肝细胞癌细胞及肿瘤微环境中的单核吞噬细胞、上皮细胞、内皮细胞、NK/T细胞、B细胞等 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，拷贝数变异分析，基因本体富集分析，伪时序分析 | 诊断模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6212 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers associated with inflammatory response in Parkinson's disease by bioinformatics and machine learning
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320257
PMID:40435035
|
研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法筛选与帕金森病炎症反应相关的生物标志物基因 | 结合LASSO、SVM-RFE和随机森林三种机器学习算法筛选生物标志物，并进行了单细胞转录组数据分析 | NA | 筛选与帕金森病炎症反应相关的生物标志物基因 | 帕金森病患者相关基因表达数据 | 机器学习 | 帕金森病 | 生物信息学分析，机器学习 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 6213 | 2025-10-06 |
Intercellular communication between FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in prostate cancer via multi-omics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560998
PMID:40438108
|
研究论文 | 通过多组学技术揭示前列腺癌中FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的细胞通讯机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序系统揭示FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在前列腺癌中的特异性相互作用网络 | 样本量相对有限（23个前列腺样本），需要更大规模验证 | 探索前列腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯机制，寻找新的治疗靶点 | 前列腺癌肿瘤微环境中的FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 23个前列腺样本的23,519个单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6214 | 2025-10-06 |
Unraveling the immune evasion mechanisms in the tumor microenvironment of head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597202
PMID:40438103
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综述 | 系统阐述头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中免疫逃逸机制及其治疗策略 | 提出HNSCC免疫逃逸的'三位一体'调控网络新框架，包含代谢重编程、基质细胞驱动和表观遗传重塑三大机制，并首次提出'谱系可塑性驱动免疫适应'新范式 | 对特定免疫逃逸通路理解仍不完整，缺乏个性化治疗策略 | 解析HNSCC肿瘤微环境中的免疫逃逸机制并探索免疫治疗新策略 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 6215 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating immune cell signature score reveals prognostic biomarkers and therapeutic targets for colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583327
PMID:40438100
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研究论文 | 本研究通过整合结直肠癌转录组数据构建了肿瘤浸润免疫细胞特征评分模型，用于预后预测和免疫治疗反应评估 | 开发了基于五个关键TIIC-RNA的预后模型，在TCGA-CRC和外部验证数据集中表现优于22个现有预后模型 | 需要进一步评估TIIC特征评分的临床实用性，并在不同人群和治疗环境中验证其相关性 | 探索肿瘤浸润免疫细胞相关基因在结直肠癌中的预后价值，发现新的生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，机器学习 | 随机生存森林，LASSO回归，Cox比例风险回归 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | TCGA-CRC数据集和外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 6216 | 2025-10-06 |
Construction of a stromal cell-related prognostic signature based on a 101-combination machine learning framework for predicting prognosis and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1544348
PMID:40438115
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研究论文 | 基于101种机器学习组合框架构建基质细胞相关预后特征，用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫治疗反应 | 首次整合10种机器学习算法和101种模型组合，开发基于myCAF、VSMC和周细胞标记基因的预后特征 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 识别基质细胞标记基因并开发预后特征，预测TNBC生存结局和免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者和细胞系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化，RNA干扰，CCK-8检测，凋亡检测，伤口愈合检测 | 101种机器学习组合框架 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和独立验证队列GSE91061 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6217 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome conservation in a multispecies comparative analysis of fresh and cryopreserved insulinoma cell lines
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00025-4
PMID:40438246
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对多种胰岛素瘤细胞系进行跨物种比较分析，并评估冷冻保存对单细胞转录组的影响 | 首次在胰岛素瘤中进行跨物种单细胞转录组比较分析，并系统评估冷冻保存对胰岛素瘤细胞转录组的影响 | 研究仅使用细胞系而非原代肿瘤组织，可能无法完全反映体内肿瘤的复杂性 | 理解胰岛素瘤的单细胞转录组景观，评估冷冻保存对转录组的影响 | 犬类和人类胰岛素瘤细胞系（canINS, CM, INS-1和MIN6） | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 四种胰岛素瘤细胞系的新鲜和冷冻保存样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6218 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis of canine insulinoma reveals distinct sub-populations of insulin-expressing cancer cells
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00026-3
PMID:40438247
|
研究论文 | 首次对犬胰岛素瘤进行单细胞转录组分析，揭示胰岛素表达癌细胞的不同亚群 | 首次在任何物种中对自然发生的胰岛素瘤进行单细胞RNA测序分析，发现了两个转录特征不同的胰岛素表达肿瘤细胞亚群 | 研究规模较小，仅包含两只犬的三个肿瘤样本 | 绘制犬胰岛素瘤的单细胞转录组图谱，探索肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征 | 犬胰岛素瘤组织样本，包括两个原发肿瘤和一个转移灶 | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5,532个细胞，来自两只拳师犬的两个胰岛素瘤和一个转移灶 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6219 | 2025-10-06 |
Biomarker identification associated with M2 tumor-associated macrophage infiltration in glioblastoma
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1545608
PMID:40438577
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据，识别与胶质母细胞瘤中M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析识别M2 TAM相关基因，并构建胶质母细胞瘤预后特征模型 | 研究样本量未明确说明，需要外部验证确认模型的普适性 | 识别胶质母细胞瘤中与M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, WGCNA, Cox回归, LASSO回归 | 预后特征模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6220 | 2025-10-06 |
Dominant immune tolerance in the intestinal tract imposed by RelB-dependent migratory dendritic cells regulates protective type 2 immunity
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53112-9
PMID:39443450
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研究论文 | 本研究揭示了肠道树突状细胞中RelB表达通过调控DC-Treg细胞相互作用建立免疫耐受机制 | 首次发现RelB在肠道隐窝斑和孤立淋巴滤泡相关树突状细胞分化中的关键作用，并阐明其通过CCL22调控DC-Treg细胞相互作用的机制 | 研究主要关注肠道特定区域的树突状细胞，其他免疫细胞类型和组织部位的作用尚未完全探索 | 探究RelB在肠道树突状细胞介导的免疫耐受和2型免疫应答调控中的作用机制 | 小鼠肠道树突状细胞、调节性T细胞和Heligmosomoides polygyrus bakeri寄生虫感染模型 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |