单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37547 篇文献,本页显示第 6201 - 6220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6201 2025-12-02
Plasminogen activator inhibitor 1 promotes aortic aging-like pathophysiology in humans and mice
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过人类遗传学分析和基因工程小鼠模型,揭示了纤溶酶原激活物抑制剂1(PAI-1)在促进主动脉衰老样病理生理中的作用及其机制 首次结合人类功能缺失性SERPINE1变异体的保护效应与对应基因工程小鼠模型,系统阐明PAI-1通过调控细胞外基质和血管平滑肌细胞可塑性影响血管衰老的机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于遗传变异分析,需进一步在人群中进行干预性验证 探究PAI-1在心血管衰老过程中的作用机制及作为治疗靶点的潜力 携带SERPINE1功能缺失变异的人类个体、Serpine1TA700/+基因工程小鼠、PAI-1过表达小鼠 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞转录组测序 基因工程小鼠模型 遗传学数据、生理学测量数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及基因工程小鼠品系比较 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6202 2025-12-02
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及M2极化的驱动因素,发现BCAT1表达与M2巨噬细胞浸润正相关,并可能通过促进M2极化形成免疫抑制微环境,影响免疫治疗效果 利用单细胞测序数据识别BCAT1作为驱动巨噬细胞M2极化的关键基因,并通过体外和体内实验验证其在肺腺癌免疫抑制微环境中的作用 研究基于特定数据集GSE207422,样本来源和规模可能限制结论的普适性;BCAT1的具体作用机制仍需进一步探索 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性及M2极化的分子驱动因素,以改善免疫治疗反应 肺腺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6203 2025-12-02
Multi-omics nominates VDAC2 as a candidate protective locus in sepsis-associated cholesterol dysregulation
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学与机器学习方法,探索脓毒症中胆固醇代谢失调,并鉴定VDAC2作为潜在的保护性基因位点 整合转录组、单细胞RNA测序数据及101种机器学习算法构建诊断与预后模型,首次通过多组学方法将VDAC2确定为脓毒症胆固醇代谢失调中的候选保护性位点 研究基于公共数据库的回顾性数据,需进一步实验验证VDAC2的功能机制 探索脓毒症中胆固醇代谢失调的分子机制,并识别新的治疗靶点 脓毒症患者的基因表达数据 机器学习 脓毒症 转录组测序, 单细胞RNA测序 机器学习算法, 非负矩阵分解, 诊断模型, 预后模型 基因表达数据 从GEO数据库获取的脓毒症转录组及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6204 2025-12-02
Ccn1 Mediates Pyroptosis and Purine Metabolism Pattern Shifts in a High-Uric Acid Microenvironment After Spinal Cord Injury
2025-Dec-01, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过空间代谢组学、Bulk-RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了脊髓损伤后高尿酸微环境的存在,并发现Ccn1在该微环境中介导细胞焦亡和嘌呤代谢模式转变 首次利用空间代谢组学鉴定脊髓损伤后高尿酸微环境,并阐明Ccn1在调控细胞焦亡和嘌呤代谢中的关键作用 研究主要基于大鼠模型和PC12细胞系,人类临床相关性需进一步验证 探究脊髓损伤后微环境的代谢变化及Ccn1在其中的功能机制 SD大鼠脊髓组织和PC12细胞系 数字病理学 脊髓损伤 空间代谢组学, Bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 代谢组数据, RNA测序数据 体外实验每组n=6, 体内实验每组n=6 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
6205 2025-12-02
Biological multi-omics approaches to next-generation biomarkers in immune-related disorders and malignancies: An overview
2025-Dec-01, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
综述 本文概述了在癌症和自身免疫性疾病中,利用多组学整合和人工智能驱动的下一代生物标志物的研究进展 强调多组学数据集与人工智能/机器学习的结合,以揭示动态分子特征,并利用单细胞和空间分析来揭示细胞异质性和组织背景 挑战包括检测标准化、患者间变异性和监管障碍 探讨下一代生物标志物在癌症和自身免疫性疾病中的精准诊断和个性化治疗应用 癌症和自身免疫性疾病 自然语言处理 肺癌 NA NA NA NA NA NA NA NA
6206 2025-12-02
High INHBB Expression Shapes an Immunosuppressive Tumor Microenvironment and Predicts Poor Prognosis in Colorectal Carcinoma
2025-Dec-01, Digestive diseases and sciences IF:2.5Q2
研究论文 本研究评估了INHBB在结直肠癌中的表达,发现其高表达与肿瘤侵袭性、预后不良及免疫抑制性肿瘤微环境相关 首次在结直肠癌中系统评估INHBB的表达模式及其与临床病理参数、免疫细胞浸润和预后的关联,揭示了INHBB在塑造免疫抑制性肿瘤微环境中的潜在作用 INHBB高表达在多变量模型中并非独立的预后因素,且研究样本量有限(248例),需进一步验证 探究INHBB在结直肠癌中的临床和免疫学意义 结直肠癌患者肿瘤组织 数字病理学 结直肠癌 RNA原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA 图像、文本 248例结直肠癌病例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6207 2025-12-02
Targeting hexokinase 2 to induce breast cancer cell senescence
2025-Nov-30, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 本研究探讨了靶向己糖激酶2(HK2)诱导乳腺癌细胞衰老的潜力,并分析了衰老过程中HK2/HK1表达比例的变化 首次揭示HK2/HK1表达比例变化可作为乳腺癌细胞衰老的新标志物,并证明HK2基因敲低能直接诱导细胞衰老 研究主要基于细胞系和原发性小鼠乳腺癌细胞,临床样本验证有限;未深入探讨HK2/HK1比例变化的具体分子机制 探究靶向HK2是否能诱导癌细胞衰老,以及衰老癌细胞代谢变化是否与HK2状态相关 乳腺癌细胞系、原发性小鼠乳腺癌细胞、乳腺癌患者单细胞RNA测序数据 癌症生物学 乳腺癌 免疫印迹、免疫荧光分析、单细胞RNA测序 NA 蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,涉及细胞系、原发性小鼠细胞和患者活检数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6208 2025-12-02
Intraperitoneal translocation of gut microbiota induces NETosis and promotes endometriosis
2025-Nov-30, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物通过腹腔易位触发腹膜中性粒细胞胞外陷阱形成,从而促进子宫内膜异位症发展的致病机制 首次发现肠道来源的假单胞菌易位至腹腔,通过LPS诱导MME阳性中性粒细胞亚群发生NETosis,直接捕获子宫内膜细胞并驱动病灶发展 研究主要基于小鼠模型和临床样本的关联分析,人类中的直接因果证据仍需进一步验证 阐明肠道微生物群通过腹膜中性粒细胞激活导致子宫内膜异位症的致病通路 临床腹膜液免疫细胞、异源和同源小鼠模型、患者队列的微生物溯源分析 单细胞组学与疾病机制研究 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序、微生物溯源分析、粪便微生物移植、GFP标记细菌示踪 NA 单细胞转录组数据、微生物组数据、实验验证数据 患者队列及小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6209 2025-12-02
Fibroblasts promote the progression of benign prostatic hyperplasia through colony-stimulating factor 1 receptor-mediated RTK signaling in prostatic epithelial cells
2025-Nov-28, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了成纤维细胞通过CSF1R介导的RTK信号通路促进良性前列腺增生(BPH)进展的机制 首次确定了成纤维细胞/CSF1R/RTK信号轴在BPH发病机制中的关键作用,并验证了RTK抑制剂(如舒尼替尼)作为BPH治疗策略的潜力 研究主要基于细胞系、类器官和小鼠模型,临床样本验证相对有限,且舒尼替尼的长期疗效和安全性需进一步评估 探究RTK信号通路在良性前列腺增生(BPH)发病机制中的作用,并寻找潜在治疗靶点 前列腺上皮细胞、成纤维细胞、BPH细胞系、类器官模型、雄激素诱导的BPH小鼠模型以及接受舒尼替尼治疗的BPH患者 数字病理学 前列腺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及BPH组织、细胞系、类器官、小鼠模型及患者临床数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6210 2025-12-02
Cathepsin L as a dual-target to mitigate muscle wasting while enhancing anti-tumor efficacy of anti-PD-L1
2025-Nov-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了抗PD-L1疗法在增强抗肿瘤效果的同时如何加剧肌肉消耗,并发现组织蛋白酶L(CTSL)作为双重靶点可同时抑制肿瘤进展和CD8 T细胞介导的肌肉消耗 首次通过单细胞RNA测序识别出导致肌肉消耗的组织驻留记忆样CD49a CD8 T细胞,并确定CTSL为双重靶点,能解耦抗肿瘤疗效与肌肉特异性免疫相关不良事件 研究仅在雄性荷瘤小鼠模型中进行,未涉及雌性动物或人类临床数据,且CTSL抑制的具体分子机制(如通过BNIP3下调)需进一步验证 旨在解决免疫检查点抑制剂(如抗PD-L1)在抗肿瘤治疗中引发的肌肉消耗副作用,寻找能同时维持疗效并减轻不良反应的双重靶点 荷瘤雄性小鼠模型中的肌肉组织和肿瘤组织,以及相关的CD8 T细胞 NA 癌症 单细胞RNA测序,整合转录组分析 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6211 2025-12-02
One section, two worlds: single-cell integration of MALDI-MSI and spatial transcriptomics on the same single tissue section
2025-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究提出了一种在同一组织切片上整合高分辨率MALDI-MSI与Xenium空间转录组学的工作流程,实现了单细胞水平代谢与转录组特征的空间对应分析 首次在同一组织切片上实现像素级对齐的MALDI-MSI与空间转录组学整合,避免了连续切片错位问题,实现了细胞功能与生化状态的精确关联 MALDI-MSI处理后每个细胞的转录本数量下降约30%,可能影响部分基因检测灵敏度 开发空间多组学整合方法以在单细胞分辨率下理解组织复杂性 小鼠脑组织和人类胶质母细胞瘤组织 空间多组学 胶质母细胞瘤 MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像),空间转录组学 NA 质谱成像数据,空间转录组数据 小鼠脑组织和人类胶质母细胞瘤组织(具体样本数量未明确说明) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组学平台
6212 2025-12-02
Classifying the tumor immune microenvironment in cervical cancer based on nuclear cytoplasmic consistent genes
2025-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究基于核质一致性基因对宫颈癌的肿瘤免疫微环境进行分类,探索其在分子分型、预后评估和治疗反应预测中的潜力 首次利用核质一致性基因对宫颈癌进行风险分层,并验证其在多种上皮源性恶性肿瘤中的分类能力和预后相关性,同时评估了其在预测化疗和免疫治疗反应中的临床效用 研究主要基于TCGA等公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证,且样本量相对有限 探索核质一致性基因在宫颈癌及其他上皮源性恶性肿瘤中的分子机制和临床意义,为精准医疗提供新的生物标志物和治疗靶点 宫颈癌患者及其他上皮源性恶性肿瘤患者 数字病理学 宫颈癌 单细胞测序, 单核RNA测序, Cox回归分析, 单样本基因集富集分析 NA 基因表达数据 TCGA-CESC队列及其他14种TCGA上皮源性恶性肿瘤队列 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
6213 2025-11-30
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction and rewired interaction networks in the peripheral blood of active tuberculosis patients
2025-Nov-28, BMC immunology IF:2.9Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6214 2025-12-02
Neuroectoderm-derived iris muscle characterization at the single-cell resolution in native human iris and a pluripotent stem cell eye model
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了成人原生虹膜组织与人类多能干细胞衍生的虹膜平滑肌,揭示了虹膜肌肉的转录特征及其在神经外胚层发育中的特异性 首次在单细胞分辨率下表征人类原生虹膜与干细胞眼模型中神经外胚层衍生的虹膜肌肉,并建立了虹膜肌肉基因签名 研究主要基于体外干细胞模型,可能无法完全模拟体内虹膜发育的复杂微环境 探究神经外胚层衍生的虹膜肌肉在人类发育中的转录基础及其疾病相关性 成人原生虹膜组织与人类多能干细胞衍生的虹膜平滑肌 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6215 2025-12-02
Multimodal single cell analyses reveal gene networks of planarian stem cell differentiation
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和染色质可及性数据,揭示了涡虫干细胞分化的基因调控网络 整合单细胞转录组学和染色质可及性数据,以计算方式推断基因调控网络,无需传统扰动实验,提高了可扩展性 未明确提及具体限制,但基于方法推断,可能依赖于计算预测的准确性,需要实验验证 研究涡虫干细胞分化的基因调控网络,以揭示细胞类型身份的控制机制 涡虫干细胞及其分化细胞类型,包括肌肉、神经元、分泌细胞、肠道吞噬细胞、杯状细胞和实质细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学,染色质可及性分析 NA 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
6216 2025-12-02
Senescent SPP1+ macrophages remodel the tumor microenvironment and promote the progression of early-stage lung adenocarcinoma featured with mixed ground glass nodule
2025-Nov-27, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了衰老的SPP1+巨噬细胞在混合磨玻璃结节型早期肺腺癌的肿瘤微环境重塑和恶性进展中的关键作用 首次利用单细胞RNA测序结合多色免疫组化和流式细胞术,系统阐明了SPP1+巨噬细胞(特别是单核来源巨噬细胞)在混合磨玻璃结节恶性转化中的核心作用,并提出了靶向SPP1巨噬细胞的治疗新策略 研究主要基于观察性数据和体外/体内实验,尚未在临床治疗中验证SPP1抑制策略的有效性 探究混合磨玻璃结节向早期肺腺癌恶性转化的分子机制,特别是巨噬细胞在肿瘤微环境重塑中的作用 早期肺腺癌患者的混合磨玻璃结节组织、正常肺组织、肿瘤细胞系和异种移植瘤模型 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序, 多色免疫组化, 流式细胞术, 体外实验, 体内实验 异种移植瘤模型 单细胞转录组数据, 组织图像数据, 流式细胞数据, 临床预后数据 未明确样本数量,但包含正常肺组织、磨玻璃区域和实性区域的多组样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6217 2025-12-02
Exploring the mechanisms of protective effect of high-energy X-ray FLASH radiotherapy on intestine through multi omics analysis
2025-Nov-27, Radiation oncology (London, England)
研究论文 本研究通过多组学分析探讨高能X射线FLASH放疗对肠道的保护机制 首次结合宏基因组学、非靶向代谢组学和单细胞测序技术,系统揭示FLASH放疗通过重塑菌群-代谢物轴、减轻炎症反应和增强干细胞保护等多方面机制实现对肠道的保护作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;观察时间点限于照射后72小时,缺乏长期效应数据 探究高能X射线FLASH放疗对肠道的保护作用机制 CT26和MC38同源结肠癌小鼠模型及健康C57BL/6雌鼠的肠道组织和内容物 数字病理学 结肠癌 宏基因组分析, 非靶向代谢组学, 单细胞测序 NA 基因组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 CT26和MC38小鼠肿瘤模型及健康C57BL/6雌鼠的肠道样本 NA 宏基因组测序, 代谢组学分析, 单细胞RNA-seq NA NA
6218 2025-12-02
Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics at single-molecule resolution
2025-Nov-26, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文开发了一种名为RAEFISH的基于图像的空间转录组学方法,实现了全基因组覆盖和单分子分辨率,用于完整组织中的转录本空间分析 RAEFISH技术结合了反向锁式扩增子编码荧光原位杂交,提供了全基因组覆盖和单分子分辨率,克服了现有空间转录组学工具在转录组覆盖或空间分辨率上的限制 NA 开发一种高覆盖、高分辨率的空间转录组学技术,以无偏、无假设的方式在单细胞和组织切片中进行转录组分析 人类和小鼠组织中的转录本,包括天然和工程RNA,如引导RNA(gRNA) 空间转录组学 NA 反向锁式扩增子编码荧光原位杂交(RAEFISH),基于图像的CRISPR筛选 NA 图像数据 涉及23,000个人类基因或22,000个小鼠基因的转录本分析 NA 空间转录组学,单分子分辨率成像 NA RAEFISH技术配置,用于完整组织中的全基因组空间转录组分析
6219 2025-12-02
Putative muscle stem cells promote Xenopus tail regeneration by modifying macrophage function via c1qtnf3
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析蝌蚪尾部再生过程中的侧群细胞,鉴定出假定的肌肉干细胞,并发现其通过表达c1qtnf3调控巨噬细胞功能以促进尾部再生 首次在蝌蚪尾部再生模型中揭示假定的肌肉干细胞通过c1qtnf3表达调控巨噬细胞功能的新机制 研究基于F0代CRISPR/Cas9嵌合体进行基因敲低,可能存在脱靶效应;未完全解析c1qtnf3调控巨噬细胞的具体分子通路 探究蝌蚪尾部再生过程中组织干细胞的行为动态及其调控机制 非洲爪蟾蝌蚪尾部再生模型中的侧群细胞及假定的肌肉干细胞 发育生物学 组织再生 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因敲低, 轨迹推断分析 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6220 2025-12-02
Multiomics and Single-Cell Insights Reveal a Lysophosphatidic Acid-Mediated Resistant Mechanism to Third-generation EGFR-TKI in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过多组学和单细胞分析揭示了非小细胞肺癌中第三代EGFR-TKI耐药的新机制,涉及溶血磷脂酸介导的信号通路和代谢重编程 首次整合血浆代谢组学、多组学分析和单细胞RNA测序,系统揭示了LPA介导的第三代EGFR-TKI耐药机制,并提出了靶向LPA信号通路的新治疗策略 研究主要基于细胞系和患者样本的回顾性分析,缺乏前瞻性临床试验验证靶向LPA通路的治疗效果 探究第三代EGFR-TKI在非小细胞肺癌中的耐药代谢机制 非小细胞肺癌患者血浆样本、耐药细胞系、单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺癌 血浆代谢组学分析、单细胞RNA测序、多组学分析、功能实验 代谢物预测模型 代谢组数据、单细胞RNA测序数据、多组学数据 216份纵向血浆样本(来自186名患者)、215名患者的单细胞RNA测序数据、耐药细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部