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当前共找到 40356 篇文献，本页显示第 6181 - 6200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 6181 | 2026-03-16 |
Multi-omics analysis of NET+ TAN explains the immunosuppressive TME and prognosis value of malignant clinical characteristics in TNBC
2026-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102692
PMID:41671779
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了NET阳性肿瘤相关中性粒细胞在TNBC中的功能特征及其对免疫抑制性肿瘤微环境的影响 | 首次结合单细胞RNA测序、批量mRNA测序和表观遗传学数据，全面解析NET+ TAN在TNBC中的作用，并识别出一个六基因面板作为可靠的预后生物标志物 | 研究主要依赖于公共数据库数据，缺乏前瞻性临床验证，且样本来源可能受限于数据库的异质性 | 探究NET+ TAN在TNBC免疫抑制微环境形成中的作用及其预后价值 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的NET阳性肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序, 表观遗传学测序 | NA | RNA测序数据, 微阵列数据, 表观遗传学数据 | 来自TCGA、METABRIC和GEO数据库的多个独立队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6182 | 2026-03-16 |
FOSL1 promotes homologous recombination repair and camptothecin resistance via TCOF1-mediated ribosome biogenesis in non-small cell lung cancer
2026-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102701
PMID:41687404
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研究论文 | 本研究揭示了FOSL1通过TCOF1介导的核糖体生物合成促进非小细胞肺癌中同源重组修复和喜树碱耐药的新机制 | 首次发现FOSL1-TCOF1-核糖体轴在调节喜树碱耐药中的作用，并证明通过抑制核糖体生物合成可增强化疗效果 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，临床样本验证有限，且机制探索集中于HR修复途径 | 识别非小细胞肺癌中喜树碱反应的关键转录调控因子并阐明其分子机制 | 非小细胞肺癌细胞系及异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、功能获得与缺失实验、分子与报告基因检测 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量，使用NSCLC细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6183 | 2026-03-16 |
SELE is associated with reduced breast cancer susceptibility: Evidence from Mendelian randomization and single-cell transcriptome
2026-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102713
PMID:41722201
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞转录组学方法，探讨循环蛋白与乳腺癌风险的遗传关联，识别出SELE等蛋白作为潜在生物标志物 | 采用多组学整合方法（包括孟德尔随机化、单细胞RNA测序和分子对接模拟）验证循环蛋白与乳腺癌风险的因果关系，增强了因果推断的稳健性 | 研究主要基于遗传预测和观察性数据，需要进一步的临床实验验证 | 识别乳腺癌早期诊断的新型蛋白生物标志物，并探讨其致病机制 | 循环蛋白与乳腺癌风险及亚型的遗传关联 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、全基因组关联研究、分子对接模拟 | NA | 遗传数据、转录组数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6184 | 2026-03-16 |
Single-cell analysis of TIGD genes in hepatocellular carcinoma: Prognostic value and functional characterization
2026-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102722
PMID:41775084
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探讨了TIGD基因家族在肝细胞癌中的表达、临床意义及与肿瘤干细胞特性的关联 | 首次在单细胞水平系统研究TIGD基因家族在肝细胞癌中的表达模式，揭示了TIGD5+上皮细胞亚群在肿瘤微环境中的独特功能表型和细胞间通讯增强 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证；单细胞数据样本来源有限 | 评估TIGD基因家族在肝细胞癌中的预后价值和功能特征 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox回归分析, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库肝细胞癌样本及GSE242889单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6185 | 2026-03-16 |
NCOA4-Mediated Ferritinophagy Induces Ferroptosis and Enriches Ferritin-Containing EVs via Ferritin Phase Separation to Promote Mechanical Ventilation-Induced Pulmonary Fibrosis
2026-Apr, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.043
PMID:40738474
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研究论文 | 本研究揭示了机械通气通过诱导NCOA4介导的铁蛋白自噬和铁死亡，并促进含铁蛋白的细胞外囊泡释放，从而驱动肺纤维化的机制 | 首次阐明了机械应力下NCOA4驱动的铁蛋白相分离促进铁蛋白自噬的机制，并发现了含铁蛋白的细胞外囊泡在肺泡上皮细胞与成纤维细胞间通讯中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，其结论在人体中的适用性有待验证 | 探究机械通气诱导肺纤维化（MVPF）的分子机制，特别是铁蛋白自噬、铁死亡及细胞外囊泡在其中的作用 | 小鼠肺组织、肺泡上皮细胞（AECs）、成纤维细胞 | 生物医学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、荧光漂白恢复分析、超速离心、免疫印迹 | NA | 基因表达数据、细胞成像数据、蛋白质数据 | 小鼠MVPF模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6186 | 2026-03-16 |
Single-cell RNA-seq of in vitro-cultured medullary thymic epithelial cells reveals a preserved differentiation trajectory under Aire deficiency
2026-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag038
PMID:41831309
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了体外培养的野生型和Aire缺陷型小鼠髓质胸腺上皮细胞，揭示了Aire缺失下mTEC分化轨迹得以保留但转录多样性和功能减弱 | 首次在体外培养体系中结合单细胞RNA测序与拟时序分析，系统揭示了Aire作为转录放大器和成熟促进剂而非分化启动因子的新功能 | 研究基于体外培养模型，可能无法完全模拟体内胸腺微环境的复杂性；仅使用了部分功能缺失的Aire突变模型 | 阐明自身免疫调节因子Aire在髓质胸腺上皮细胞转录组驱动分化轨迹中的作用机制 | 体外培养的小鼠髓质胸腺上皮细胞（野生型与Aire突变型）及共培养的CD4+胸腺细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠mTEC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6187 | 2026-03-16 |
Disrupting USP14-mediated PARP1 dynamics reinstates MIC-A/B-driven antigen-independent CD8+ T cell killing in glioma
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3800
PMID:41824572
|
研究论文 | 本研究揭示了USP14通过去泛素化稳定PARP1，进而抑制MIC-A/B表达，导致胶质瘤中CD8+ T细胞功能耗竭的机制，并证明抑制USP14可恢复抗原非依赖性的T细胞杀伤功能 | 首次发现USP14通过K63连接的去泛素化稳定PARP1，调控NFIL3与MIC-A/B启动子的结合，从而抑制肿瘤细胞表面MIC-A/B表达，并证明靶向USP14可协同PD1阻断增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠胶质瘤模型，临床样本验证部分相对有限，USP14抑制剂的体内安全性和特异性需进一步评估 | 探究胶质瘤中MIC-A/B表达下调的机制，并寻找恢复CD8+ T细胞抗原非依赖性杀伤功能的免疫治疗新策略 | 小鼠胶质瘤模型、临床胶质瘤标本、CD8+ T细胞、肿瘤细胞表面的MIC-A/B配体 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、去泛素化酶筛选、蛋白质组学、共免疫沉淀、染色质免疫沉淀、免疫荧光、泛素化分析、颅内肿瘤模型 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质相互作用数据、临床组织样本数据 | 未明确说明具体样本数量，包括小鼠模型和临床胶质瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6188 | 2026-03-16 |
IL-31 Blockade Elevates TARC by Lifting LAMP3+ CD1c+ Mature Dendritic Cells from CGRP-CALCRL Neuroimmune Suppression in Atopic Dermatitis
2026-Mar-12, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.044
PMID:41831623
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研究论文 | 本研究探讨了IL-31受体A阻断在特应性皮炎中如何通过解除CGRP-CALCRL神经免疫抑制，导致LAMP3+ CD1c+成熟树突状细胞释放TARC的机制 | 揭示了IL-31依赖的CGRP-CALCRL神经免疫刹车机制，该机制抑制树突状细胞成熟和TARC产生，IL-31RA阻断可解除这一抑制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证有限，且CAEs发生机制仍需进一步探索 | 阐明IL-31受体A阻断后TARC升高的系统变化和潜在机制 | 特应性皮炎患者、小鼠MC903模型、人类树突状细胞、人类背根神经节 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 血清蛋白质组学、单细胞RNA测序、功能测定、配体-受体推断分析 | MC903小鼠模型 | 血清蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、原位验证数据 | 特应性皮炎患者（具体数量未明确）、小鼠模型、人类树突状细胞和背根神经节样本 | Olink | 血清蛋白质组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6189 | 2026-03-16 |
Conjugated bile acids facilitate cholangiocyte senescence to promote cholestatic liver diseases via STING signaling
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.020
PMID:41831676
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研究论文 | 本研究揭示了结合胆汁酸通过STING信号通路促进胆管细胞衰老，从而加剧胆汁淤积性肝病的机制 | 首次发现结合胆汁酸通过线粒体损伤和氧化DNA泄漏激活STING信号，诱导胆管细胞衰老和SASP，进而驱动巨噬细胞活化和炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，需要进一步验证在人类中的直接治疗应用 | 探究结合胆汁酸和STING信号在胆汁淤积性肝病进展中的作用 | 原发性胆汁性胆管炎（PBC）和原发性硬化性胆管炎（PSC）患者样本、Abcb4-/-小鼠及胆管结扎（BDL）小鼠模型 | 单细胞组学与分子病理学 | 胆汁淤积性肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq）、生化分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、生化数据 | PBC和PSC患者临床样本、Abcb4-/-小鼠模型、BDL小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6190 | 2026-03-16 |
Single-cell eQTL mapping reveals cell-type-specific genetic regulation in lung cancer
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101100
PMID:41386230
|
研究论文 | 本研究构建了迄今最大规模的人类肺组织单细胞eQTL图谱，揭示了肺癌遗传易感性的细胞类型特异性调控机制 | 首次通过大规模单细胞RNA测序构建肺组织单细胞eQTL图谱，发现超过60%的sc-eQTLs具有细胞类型特异性，且近半数已确立的非小细胞肺癌易感位点表现出细胞类型特异性多效性遗传调控 | 研究基于222名捐赠者样本，虽然规模较大，但仍需更多样本来验证罕见细胞类型中的eQTLs，且功能验证实验有限 | 阐明肺癌遗传易感性的细胞类型特异性基因调控机制 | 人类肺组织中的17种细胞类型 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 222名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 6191 | 2026-03-16 |
Untangling biological complexity: A deep learning approach to separating multiple signals in single-cell data
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101188
PMID:41819074
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellUntangler的深度学习模型，用于在单细胞RNA测序数据中捕获和过滤多个生物信号 | 开发了基于深度学习的CellUntangler模型，能够分离单细胞数据中的多个生物信号，提高了信号解析的准确性 | NA | 开发一种深度学习方法来分离单细胞RNA测序数据中的多个生物信号 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6192 | 2026-03-16 |
Dual regulation of CXCR6+CD8+ T cells modulates cytotoxic and exhaustion-associated programs during prostate cancer progression
2026-Mar-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014276
PMID:41819547
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研究论文 | 本研究揭示了CXCR6+CD8+ T细胞在前列腺癌进展中的双重调控机制及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次在前列腺癌中系统阐明了CXCR6+CD8+ T细胞的转录特征、调控网络和临床意义，发现了IL-10-STAT3-FOXO1-KLF2轴对CXCR6表达的抑制机制，并提出了靶向该轴联合抗PD-1治疗的协同策略 | 研究样本量相对有限（9例患者），主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证 | 探究CXCR6+CD8+ T细胞在前列腺癌中的身份特征、调控机制及治疗潜力 | 前列腺癌患者组织样本、小鼠模型、骨髓嵌合体及体外T细胞 | 单细胞组学与免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、多色免疫荧光、流式细胞术、bulk RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、流式数据、测序数据 | 90,651个细胞（来自9例患者）及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6193 | 2026-03-16 |
Targeting endosomal trafficking-mediated antigen escape to resensitize myeloma to CAR-T therapy
2026-Mar-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014040
PMID:41802812
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研究论文 | 本研究揭示了多发性骨髓瘤中一种由RRM2驱动的、以前未被表征的抗原逃逸机制，并通过重新利用药物奥沙米特来恢复MICA/B表面表达，从而增强NKG2D CAR-T细胞的疗效 | 首次发现并表征了RRM2作为一种非经典运输调节器，通过激活RAB7A促进MICA/B向溶酶体降解，并同时阻断RAB11介导的回收，从而介导抗原逃逸；提出了通过亚毒性剂量的临床批准药物奥沙米特逆转此过程，以重新敏化肿瘤的联合治疗策略 | 研究主要基于临床前模型（如诱导多能干细胞衍生的骨髓瘤类器官和播散性异种移植模型），其结论在人体中的有效性和安全性仍需临床试验验证 | 阐明CAR-T治疗后肿瘤抗原逃逸的内在机制，并开发策略以重新敏化多发性骨髓瘤，增强CAR-T细胞免疫疗法的疗效 | 多发性骨髓瘤细胞、NKG2D CAR-T细胞、诱导多能干细胞衍生的骨髓瘤类器官、小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学、细胞治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、实时成像、共免疫沉淀、GTP下拉实验、共聚焦显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、实时成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6194 | 2026-03-16 |
Rejuvenation of THY1+ nucleus pulposus-derived stem cells promotes intervertebral disc regeneration through FGF10-FGFR1-CREB pathway and mitochondrial fission
2026-Mar-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.008
PMID:41812707
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研究论文 | 本研究揭示了THY1+ NPSCs在椎间盘再生中的关键作用，以及FGF10通过FGF10-FGFR1-CREB通路和线粒体分裂逆转细胞衰老的机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出THY1+ NPSCs作为椎间盘退变中的关键再生细胞群，并发现FGF10作为关键再生因子通过抑制CREB磷酸化和线粒体分裂来逆转细胞衰老 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化仍需进一步验证；机制研究虽深入，但其他潜在通路或因子可能未被完全探索 | 阐明NPSCs的再生驱动因素及其抗衰老机制，为椎间盘退变提供潜在治疗策略 | 椎间盘退变患者的临床样本、THY1+ NPSCs细胞、体外衰老模型及体内动物模型 | 单细胞组学与再生医学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、多重荧光染色 | NA | RNA测序数据、荧光成像数据 | 临床IVDD样本（具体数量未明确）、体外及体内模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6195 | 2026-03-16 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2026-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
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研究论文 | 本文提出了一种名为STORIES的新方法，利用最优传输扩展来学习空间感知的细胞命运潜力，以从空间转录组学数据中推断细胞命运轨迹 | 该方法通过扩展最优传输框架，首次将空间信息整合到梯度流学习中，以分析空间分辨的转录组数据，相比现有方法具有更优的空间一致性 | 未明确提及具体局限性，但暗示现有梯度流学习方法在处理空间转录组数据时面临挑战，可能涉及计算复杂性或数据整合问题 | 从多个时间点的空间转录组学数据中推断细胞命运轨迹，以研究动态生物过程如发育中的空间组织机制 | 空间转录组学数据，具体应用于蝾螈神经再生和小鼠胶质细胞生成过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输扩展的神经网络 | 空间转录组学数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 6196 | 2026-03-16 |
Unraveling the VEGF-ETS1 axis: a transcriptomic and single-cell analysis of angiogenesis in endometriosis
2026-Mar, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03781-2
PMID:41543773
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据分析，揭示了VEGF-ETS1轴在子宫内膜异位症病理血管生成中的核心驱动作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别ETS1作为子宫内膜异位症中内皮细胞的关键转录调节因子，并阐明其通过放大VEGF信号通路促进血管生成的机制 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏体内功能验证实验，且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究子宫内膜异位症中病理血管重塑的转录机制，识别关键调控因子和治疗靶点 | 子宫内膜异位症患者的病变组织，特别是卵巢子宫内膜异位囊肿，以及其中的内皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，bulk转录组分析，功能富集分析，伪时间分析 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 三个独立转录组数据集和两个验证队列，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6197 | 2026-03-16 |
PDE4B deficiency aids macrophage differentiation and contributes to Cryptococcus neoformans brain infection
2026-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014040
PMID:41805786
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研究论文 | 本研究揭示了磷酸二酯酶4B（PDE4B）在调控巨噬细胞功能编程中的作用，并支持巨噬细胞介导的新型隐球菌脑部感染机制 | 首次通过单细胞RNA测序在隐球菌脑膜炎小鼠模型中鉴定出PDE4B是调控感染相关巨噬细胞功能的关键候选调节因子，并阐明了其通过cAMP/PKA信号通路影响巨噬细胞迁移和穿越血脑屏障能力的机制 | 研究主要在动物模型和体外实验中进行，其结论在人类患者中的直接适用性尚需进一步验证 | 探究隐球菌脑膜炎中巨噬细胞作为“特洛伊木马”介导新型隐球菌入侵大脑的分子机制 | 新型隐球菌感染的小鼠模型及其脑部浸润的免疫细胞，特别是巨噬细胞 | 数字病理学 | 隐球菌脑膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6198 | 2026-03-16 |
Non-Coding Regulatory Variants in Autoimmune Disease: Biological Mechanisms, Immune Context, and Integrative Multi-Omics Interpretation
2026-Feb-28, Biology
DOI:10.3390/biology15050407
PMID:41823835
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综述 | 本文综述了如何通过整合功能基因组学、单细胞分析、空间转录组学和多组学数据，解释自身免疫病中非编码调控变异的生物学机制和免疫背景 | 提出了从静态变异注释转向动态、情境感知的分析框架，强调在特定免疫细胞状态、激活轨迹或组织微环境中解读风险变异的上下文依赖性效应 | NA | 解释自身免疫病中非编码调控变异的生物学机制，并整合多组学数据进行功能解读 | 自身免疫病（如系统性红斑狼疮和类风湿关节炎）中的非编码调控变异 | 自然语言处理 | 自身免疫病 | 功能基因组学、单细胞分析、空间转录组学、多组学整合 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6199 | 2026-03-16 |
Integrative transcriptomic and machine learning framework reveals candidate genes and potential mechanisms of aflatoxin B1 exposure in breast cancer
2026-Feb-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39844-2
PMID:41688730
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和机器学习框架，揭示了黄曲霉毒素B1暴露在乳腺癌中的候选基因和潜在机制 | 采用多组学评估（包括转录组分析、共表达网络建模、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间和单细胞转录组学）结合机器学习管道，识别了AFB1暴露与乳腺癌相关的关键基因和生物标志物 | 未明确提及样本大小或实验验证细节，可能依赖于计算分析，需要进一步实验验证机制 | 研究黄曲霉毒素B1如何影响乳腺癌肿瘤生物学，揭示其致癌潜力的分子途径 | 乳腺癌相关基因和生物标志物，特别是AFB1暴露下的转录组变化 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组分析、共表达网络建模（WGCNA）、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间转录组学、单细胞转录组学 | glmBoost, StepGLM, SHAP | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6200 | 2026-03-16 |
ShinySC: An R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2026-Feb, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2025.100885
PMID:40609640
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研究论文 | 本文介绍了一个名为ShinySC的基于R/Shiny的桌面应用程序，旨在通过直观的图形界面简化单细胞RNA测序数据的全面分析 | 开发了一个统一的、用户友好的、可扩展的平台，支持多种数据格式，集成了多种自动细胞类型注释方法（包括基于参考、基于标记和基于GPT的方法），并允许并排比较和手动标签细化 | 分析性能受标准桌面系统硬件限制（例如，在64GB RAM的系统中，对包含多达200,000个细胞的数据集表现稳健），分析时长取决于具体任务和注释方法 | 为没有编程专业知识的临床医生和研究人员提供一个易于访问的单细胞RNA测序数据分析平台 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 演示分析使用了PBMC和干扰素刺激数据集，基准测试表明可处理多达200,000个细胞的数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 支持10x Genomics、BD Rhapsody等多种单细胞测序平台的数据格式 |