单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 40969 篇文献，本页显示第 6181 - 6200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6181 | 2026-04-09 |
Transcriptional signature of induced neurons differentiates virologically suppressed people with HIV from people without HIV
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190445
PMID:41324907
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研究论文 | 本研究利用诱导神经元模型，揭示了HIV感染者与未感染者之间的转录组差异，并识别出与神经认知损伤相关的基因特征 | 首次使用诱导神经元模型来模拟HIV感染者的神经元生物学和损伤，并发现IFI27上调及FOXL2NB-FOXL2-LINC01391表达降低与神经认知损伤相关 | 样本量较小（仅6名HIV感染者和7名未感染者），且研究基于体外诱导神经元模型，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探索HIV感染者神经认知损伤的潜在机制 | HIV感染者和未感染者的诱导神经元 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 诱导神经元模型 | 转录组数据 | 6名HIV感染者和7名未感染者的皮肤成纤维细胞衍生的诱导神经元 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6182 | 2026-04-09 |
Repeated Dextran Sulfate Sodium Exposure Elicits Distinct Immune Responses Reflecting Human Ulcerative Colitis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101714
PMID:41453640
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研究论文 | 本研究通过比较单次与重复DSS暴露诱导的小鼠结肠炎模型，评估其与人类溃疡性结肠炎的免疫反应相似性 | 首次系统比较了急性与重复DSS暴露模型在免疫细胞转录程序、微生物组变化及与人类疾病对齐程度方面的差异 | 研究基于小鼠模型，其免疫反应与人类疾病存在物种差异；未涉及长期重复暴露（超过两个周期）的影响 | 评估重复DSS暴露模型是否更好地模拟人类溃疡性结肠炎的免疫特征 | DSS诱导的小鼠结肠炎模型（单次vs重复暴露） | 单细胞组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA分析, 流式细胞术, 组织病理学 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 流式细胞数据, 组织学图像 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 6183 | 2026-04-09 |
Innovative approaches targeting innate immune cells to promote organ transplant tolerance
2026, Frontiers in transplantation
DOI:10.3389/frtra.2026.1776806
PMID:41737588
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综述 | 本文综述了通过靶向先天免疫细胞以促进器官移植耐受的创新策略 | 提出利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示的先天免疫细胞异质性，开发选择性调节先天免疫反应而不损害整体免疫力的精准疗法，包括靶向髓系抑制检查点、调节代谢重编程、使用CRISPR/Cas9基因编辑以及过继转移调节性细胞 | NA | 探讨在最小化全身免疫抑制的同时实现长期同种异体移植物存活的策略 | 先天免疫细胞（包括中性粒细胞、单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞、髓源性抑制细胞、先天淋巴样细胞、自然杀伤细胞和γδ T细胞） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6184 | 2026-04-09 |
Selective Activation of Na V 1.3 Restores Lymphatic Contractility in Age and Injury
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694435
PMID:41446152
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研究论文 | 本文研究了NaV 1.3通道在成年淋巴肌肉中的选择性表达及其在恢复老龄和辐射损伤中淋巴收缩功能的作用 | 首次发现NaV 1.3在成年淋巴肌肉中特异性表达，并证明其选择性激活可恢复老龄和损伤后的淋巴泵功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，且Tf2在辐射损伤中的恢复效果仅为部分 | 探索NaV 1.3在淋巴肌肉生理中的作用，并测试其激活是否可改善老龄和辐射损伤中的淋巴泵功能 | 小鼠和人类淋巴管、淋巴肌肉细胞 | 生物医学研究 | 淋巴功能障碍 | 单细胞RNA测序、免疫染色、体内荧光淋巴造影、生物发光测定 | NA | 基因表达数据、图像数据、生理测量数据 | 年轻、老龄和辐射损伤小鼠，以及人类淋巴管样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6185 | 2026-04-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70278
PMID:41116748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，揭示了老年小鼠白色脂肪组织中Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累及其细胞毒性和炎症潜力 | 首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞，并证明其具有细胞毒性和促炎功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证；样本量相对有限 | 比较生理衰老与高脂饮食诱导肥胖对白色脂肪组织免疫细胞组成的影响，以识别不同的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 来自年轻正常饮食、年轻高脂饮食和老年正常饮食小鼠的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6186 | 2026-04-09 |
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.005
PMID:40578362
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RECODR的计算流程，通过结合单细胞RNA测序谱的共表达图网络和图嵌入方法，测量癌症治疗期间基因共表达上下文的变化，以识别耐药机制并设计有效联合治疗方案 | RECODR首次将基因共表达上下文变化（而非仅表达水平）作为核心指标，结合图网络和图嵌入技术，揭示了传统计算方法无法检测的耐药机制 | 方法主要基于单细胞RNA测序数据，可能未涵盖其他分子层面的耐药机制，且临床验证仍需进一步扩展 | 开发计算工具以预测和缓解癌症治疗耐药性，通过分析基因共表达上下文变化来设计有效联合治疗方案 | 癌症治疗耐药机制，聚焦于脉络丛癌、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌的肿瘤样本 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图网络和图嵌入方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6187 | 2026-04-09 |
Axon targeting of transcriptionally distinct pioneer neurons is regulated by retinoic acid signaling
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61044-1
PMID:40593691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼后侧线感觉神经元中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的异质性，并发现视黄酸信号下调对先驱神经元轴突正确靶向至关重要 | 首次通过单细胞RNA测序证明先驱神经元与跟随神经元是转录上不同的群体，并揭示视黄酸信号在调节先驱神经元轴突靶向中的关键作用 | 研究仅基于斑马鱼后侧线感觉神经元模型，结果在其他神经系统或物种中的普适性有待验证 | 探究神经系统发育过程中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的差异及其调控机制 | 斑马鱼后侧线感觉神经元，包括先驱神经元和跟随神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6188 | 2026-04-09 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白在宿主防御利什曼原虫感染中的作用，通过平衡骨髓细胞中的iNOS/Arg-1表达来促进寄生虫控制 | 首次揭示了GBPs在皮肤利什曼病中的关键作用，通过调节iNOS和Arg-1的表达平衡来影响寄生虫生长环境，独立于GBPs的寄生虫定位 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证；体外实验可能无法完全模拟体内复杂免疫环境 | 探究GBPs在皮肤利什曼病免疫防御机制中的具体作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠的骨髓来源巨噬细胞和单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6189 | 2026-04-09 |
Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study
2025-04-18, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67880
PMID:40323789
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综述 | 本文通过文献计量学和可视化方法，系统分析了2010年至2023年间癌症单细胞测序领域的研究趋势、合作网络和知识传播 | 首次对癌症单细胞测序领域进行了大规模、跨时间维度的文献计量学与可视化分析，揭示了该领域的全球研究格局、核心贡献者及前沿方向 | 分析基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关出版物；文献计量方法主要反映数量与关联，对研究质量的深度评估有限 | 阐明癌症单细胞测序领域的研究趋势、国际合作网络及知识传播路径 | 2010年至2023年间Web of Science核心合集中收录的癌症单细胞测序相关学术出版物 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献元数据 | 5,680篇出版物，涉及34,074位作者、3,129个机构、75个国家/地区及788种学术期刊 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6190 | 2026-04-09 |
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70019
PMID:40126913
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综述 | 本文回顾了基因组技术在周围神经病变研究中的演变，并分析了整合多组学技术以揭示其分子机制、发现新生物标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性地追溯了从传统遗传分析到NGS、长读长/单细胞测序等新兴多组学技术在周围神经病变研究中的应用演变，并强调了多组学整合对推动该领域发展的革命性作用 | 本文为综述文章，未报告原始研究数据，且指出了将多组学技术标准化用于临床所面临的挑战和问题 | 回顾基因组技术在周围神经病变研究中的发展历程，并探讨整合多组学方法以提升诊断、预后评估和个性化治疗策略的潜力 | 周围神经病变及其相关的分子机制 | 自然语言处理 | 周围神经病变 | 下一代测序、长读长测序、单细胞测序、RNA测序、蛋白质组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6191 | 2026-04-09 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-03-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
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研究论文 | 本文介绍了一种高效分离人输卵管上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能在4-6小时内从新鲜输卵管中分离出高纯度上皮细胞单细胞悬液的新方法，减少了基质细胞污染 | 未明确说明该方法在疾病研究中的具体应用效果或长期培养的稳定性 | 建立一种高效分离人输卵管上皮细胞的方法，以支持单细胞分析等下游研究 | 人输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞悬液 | 未指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6192 | 2026-04-09 |
Derivation of a Human Brain Organoid with Microglia Development
2025-01-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67491
PMID:39895643
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研究论文 | 本文开发了一种包含小胶质细胞发育的人类大脑类器官模型，用于研究早期神经免疫相互作用 | 通过将iPSC分化的高度纯化造血祖细胞整合到胚胎体中，成功构建了同时包含小胶质细胞和神经元的大脑类器官，克服了现有方法在细胞数量和质量上的不一致问题 | 未明确说明类器官中微胶质细胞与神经元相互作用的长期稳定性及模型在模拟特定神经疾病方面的验证程度 | 建立包含微胶质细胞的人类大脑类器官模型，以研究早期神经免疫相互作用及神经炎症疾病 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的造血祖细胞和大脑类器官 | 数字病理学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA-seq）、免疫染色 | 3D类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6193 | 2026-04-09 |
Integrative Protocol for Generation of iPSC-Derived 3D Human Hepatic Organoids
2024-12-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67070
PMID:39714036
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研究论文 | 本文描述了一种利用人诱导多能干细胞生成三维人源肝类器官的优化方案 | 提出了一种从hiPSC到三维肝类器官的简化、标准化流程，并整合了适用于单细胞RNA测序的优化解离策略 | 方案耗时较长（46-50天），且未在多种疾病模型或大规模药物筛选中验证其普适性 | 建立稳定的人源肝细胞三维培养体系，用于肝脏发育研究、疾病建模、药物开发和移植潜力探索 | 人诱导多能干细胞衍生的三维肝类器官 | 干细胞与类器官技术 | 肝脏疾病 | 免疫荧光、定量RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6194 | 2026-04-09 |
PRDM16 determines specification of ventricular cardiomyocytes by suppressing alternative cell fates
2024-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402719
PMID:39304345
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子PRDM16在心脏发育中通过抑制替代细胞命运来指定心室心肌细胞身份的关键作用 | 首次揭示PRDM16通过抑制心室传导系统和心房命运的主调控因子活性，促进心室工作心肌细胞身份，并利用单细胞RNA+ATAC测序技术验证其在二元细胞命运决定中的功能 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中直接验证；PRDM16表达在出生后下降，其长期影响需进一步探究 | 探究PRDM16在心脏发育中对心室心肌细胞身份决定的作用机制 | 小鼠心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6195 | 2026-04-09 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
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研究论文 | 本文探讨了PFKFB3表达β细胞在2型糖尿病中的功能失调与长寿机制，揭示了其通过能量节约和正上位性相互作用来维持生存的机制 | 首次将PFKFB3表达β细胞与“失败者”细胞特征联系起来，并揭示了PFKFB3通过正上位性相互作用促进功能失调β细胞在糖尿病中长寿的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，人类样本数量可能不足，且机制验证主要在动物模型中进行 | 研究PFKFB3如何掩盖功能失调β细胞的竞争特性，并探索其在2型糖尿病中的作用机制 | 人类和小鼠的PFKFB3阳性β细胞，特别是2型糖尿病中的“失败者”β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | 来自nPOD的2型糖尿病胰腺样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 6196 | 2026-04-09 |
Upregulation of multiple key molecules is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma by bulk and single-cell RNA-seq
2024-11-12, Aging
DOI:10.18632/aging.206151
PMID:39537209
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研究论文 | 本研究通过bulk和单细胞RNA-seq分析，构建了一个基于多个关键基因的肝细胞癌预后预测模型 | 结合三种R包进行差异分析以提高稳健性，并利用单细胞测序揭示关键基因在免疫细胞中的表达模式 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏外部验证队列，且未进行功能实验验证基因机制 | 构建肝细胞癌的预后预测模型并探索关键基因与免疫浸润的关系 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归, Cox分析 | RNA表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6197 | 2026-04-09 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-10-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析前体T细胞急性淋巴细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 通过单细胞测序识别Pre-T ALL中的关键免疫细胞亚群，特别是干细胞T细胞，并揭示其通过转录因子KLF2和FOS以及配体-受体对参与疾病发展的机制 | 数据来源于公共数据库，可能受样本来源和测序质量的限制，且未进行实验验证 | 探究Pre-T ALL中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病进展中的角色 | 前体T细胞急性淋巴细胞白血病患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | AUCell, Monocle, inferCNV, CellphoneDB | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6198 | 2026-04-09 |
Revealing a cancer-associated fibroblast-based risk signature for pancreatic adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA-seq analysis
2024-09-26, Aging
DOI:10.18632/aging.206043
PMID:39332020
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA-seq分析，揭示了胰腺腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAF）的风险特征，并构建了一个七基因风险特征用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次探索了基于CAF的风险特征在胰腺腺癌中的预后意义，并构建了一个结合年龄和CAF特征的列线图模型，用于准确预测患者预后和免疫治疗反应 | 研究依赖于公开数据库数据，可能受样本异质性和数据质量限制，且风险特征在临床验证前需进一步外部验证 | 探索癌症相关成纤维细胞（CAF）在胰腺腺癌中的预后价值，并构建预测模型 | 胰腺腺癌（PAAD）患者样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），微阵列分析 | LASSO回归，Cox回归，列线图模型 | RNA-seq数据，微阵列数据 | 来自GSE155698（单细胞数据）、TCGA-PAAD队列和GEO数据库的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 6199 | 2026-04-09 |
The cell rejuvenation atlas: leveraging network biology to identify master regulators of rejuvenation strategies
2024-09-09, Aging
DOI:10.18632/aging.206105
PMID:39264584
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SINGULAR的细胞年轻化图谱，通过单细胞RNA-seq和网络生物学方法，系统分析了多种年轻化策略在多个器官中的分子机制 | 首次构建了统一的细胞年轻化图谱，利用网络生物学在单细胞分辨率下比较不同年轻化策略，并识别出调控年轻化反应的关键主调节因子 | 未在摘要中明确提及具体限制，但可能涉及数据覆盖范围或实验验证的局限性 | 旨在揭示年轻化策略的分子机制，以设计更全面的细胞年轻化干预措施 | 多种年轻化策略（如热量限制和部分重编程）在多个器官中的细胞 | 网络生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6200 | 2026-04-09 |
A broken network of susceptibility genes in the monocytes of Crohn's disease patients
2024-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302394
PMID:38925865
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和两个独立的单细胞转录组数据集，探索了克罗恩病患者和健康对照中232个易感基因的表达网络 | 揭示了易感基因在人类肠道单核细胞中特异性严格表达，并首次在单细胞水平上展示了健康对照中易感基因网络的完整性及其在克罗恩病患者中的破坏 | 研究依赖于两个独立数据集，样本量可能有限，且未详细探讨环境因素如何具体影响基因网络 | 研究克罗恩病中大量易感基因的表达机制及其网络状态 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道单核细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 两个独立数据集，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |