单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
601	2025-07-21	Subtypes of tumor-associated neutrophils and their roles in cancer immunotherapy 2025-Aug, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104763 PMID:40334802	综述	本文总结了肿瘤相关中性粒细胞（TANs）在癌症免疫治疗中的亚型及其作用	通过单细胞测序技术揭示了TANs的广泛亚型，并探讨了促肿瘤和抗肿瘤亚群之间的区别与共性	目前缺乏全面的TANs分类系统	探讨TANs在癌症免疫治疗中的亚型及其功能	肿瘤相关中性粒细胞（TANs）	肿瘤免疫学	癌症	单细胞测序	NA	NA	NA
602	2025-07-21	Piezo1 regulates fibrocartilage stem cell in cartilage growth and osteoarthritis 2025-Aug, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.joca.2025.04.013 PMID:40345612	研究论文	探讨Piezo1在软骨生长和骨关节炎中对纤维软骨干细胞（FCSC）的调控作用	首次揭示Piezo1作为机械敏感离子通道在颞下颌关节（TMJ）软骨发育和骨关节炎中的关键作用，并证明其在病理条件下的保护性功能	研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用有限，且未深入探讨Piezo1的具体分子机制	研究Piezo1在颞下颌关节软骨发育和骨关节炎中的作用及其潜在治疗价值	人类颞下颌关节样本和小鼠模型	骨科学	骨关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除（CKO）、组织学和免疫组织化学分析	Gli1-CreERT2; Piezo1fl/fl 条件性敲除小鼠	基因表达数据、组织学图像	人类TMJ样本和小鼠模型（具体数量未明确说明）
603	2025-07-21	Macrophage heterogeneity in autoimmune diseases 2025-Aug, Cellular immunology IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.cellimm.2025.104993 PMID:40516246	综述	本文全面探讨了不同自身免疫疾病中巨噬细胞的异质性，并总结了针对巨噬细胞的潜在治疗靶点	利用单细胞RNA测序技术揭示了巨噬细胞的显著异质性，为探索疾病分子机制提供了新视角	自身免疫疾病的病因仍不明确，且巨噬细胞异质性的研究尚处于初级阶段	推进自身免疫疾病的精准治疗及相关研究	巨噬细胞	生命科学	自身免疫疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	NA
604	2025-07-21	Idiopathic Subglottic Stenosis and the Epithelial Interface of Host and Environment 2025-Aug-01, Journal of the American College of Surgeons IF:3.8Q1 DOI:10.1097/XCS.0000000000001340 PMID:39902917	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，对特发性声门下狭窄(iSGS)患者的近端气道瘢痕组织进行了无偏见的细胞亚群表征和分子表型分析	首次揭示了iSGS患者气道上皮中基底祖细胞耗竭及上皮细胞间质转化的现象，并证实了细菌移位在疾病发生中的关键作用	疾病罕见性和患者地理分布广泛可能限制了样本的代表性	阐明特发性声门下狭窄(iSGS)的发病机制	iSGS患者的近端气道瘢痕组织	呼吸病学	特发性声门下狭窄	单细胞RNA测序	动物模型	RNA测序数据	国际iSGS患者队列
605	2025-07-21	Timp2-modified gelatinhydroxyphenylpropionic acid hydrogels reverse enhanced scleral recovery and suppress myopia development in mice 2025-Aug, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101942 PMID:40677403	research paper	研究了一种通过Timp2修饰的巩膜干细胞（SSC）嵌入明胶-羟基苯丙酸（Gtn-HPA）水凝胶的新型治疗策略，用于抑制形觉剥夺性近视（FDM）的发展	首次将Timp2修饰的SSC与Gtn-HPA水凝胶结合，用于促进巩膜恢复并抑制近视发展	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证其效果	开发一种新型治疗策略以抑制形觉剥夺性近视的发展	形觉剥夺性近视（FDM）小鼠模型及人类巩膜成纤维细胞（HSF）	生物医学工程	近视	转录组测序、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、细胞行为数据	小鼠模型及人类巩膜成纤维细胞
606	2025-07-21	Single-cell analysis of mature hepatocytes reveals an IRF1-driven restriction of HDV infection 2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101429 PMID:40677689	研究论文	通过单细胞RNA测序分析成熟肝细胞，发现IRF1在限制HDV感染中起关键作用	首次在单细胞水平上揭示了IRF1作为HDV感染的限制因子，并阐明了其抗病毒机制	研究主要基于体外培养的肝细胞样细胞(HLCs)，可能与体内真实情况存在差异	探究成熟肝细胞中限制HDV感染的分子机制	干细胞衍生的肝细胞样细胞(HLCs)和肝癌细胞系	分子生物学	肝炎	单细胞RNA测序(scRNAseq)	NA	RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，使用对照和HDV感染的HLCs进行分析
607	2025-07-21	Single-cell transcriptome atlas and genome-wide Mendelian randomization reveal chemokine involvement in diverse immune cells in type 2 diabetes 2025-Jul-20, International journal of obesity (2005) DOI:10.1038/s41366-025-01846-x PMID:40684027	研究论文	该研究通过单细胞转录组图谱和全基因组孟德尔随机化分析，揭示了趋化因子在2型糖尿病(T2D)多种免疫细胞中的参与	首次结合孟德尔随机化、小鼠模型验证和单细胞RNA测序技术，系统性地研究了趋化因子在T2D免疫病理中的作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类患者中进行验证	阐明趋化因子在2型糖尿病免疫发病机制中的因果作用	2型糖尿病相关的免疫细胞和趋化因子	生物医学	2型糖尿病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化(MR), 全基因组关联研究(GWAS)	链脲佐菌素诱导的小鼠T2D模型	基因组数据, 转录组数据	外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞测序数据
608	2025-07-21	Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis 2025-Jul-20, Neurological research IF:1.7Q4 DOI:10.1080/01616412.2025.2532039 PMID:40684330	研究论文	本研究通过孟德尔随机化方法系统识别和验证与脑静脉血栓形成(CVT)易感性相关的可药物基因	整合大规模eQTL数据集与GWAS汇总统计，采用多种MR方法识别CVT相关基因，并进行功能注释和药物预测	研究基于遗传推断，需要进一步的机制和临床验证	识别CVT的潜在生物标志物和治疗靶点	脑静脉血栓形成(CVT)患者	遗传学	脑静脉血栓形成	孟德尔随机化(MR)、表达数量性状位点(eQTL)分析、单细胞RNA测序、分子对接	两样本MR(TSMR)、基于汇总数据的MR(SMR)、贝叶斯共定位	基因组数据、表达数据	整合eQTLGen(外周血)和PsychENCODE(脑组织)两个大规模eQTL数据集，以及FinnGen的CVT GWAS汇总统计
609	2025-07-21	Single-Cell Sequencing Reveals Circadian Sensitivity of Noise-Induced Hearing Loss Mediated by Macrophage-Driven NLRP3 Inflammasome Activation 2025-Jul-20, Neuroscience bulletin IF:5.9Q1 DOI:10.1007/s12264-025-01440-1 PMID:40684422	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序揭示了噪声性听力损失(NIHL)的昼夜节律敏感性由巨噬细胞驱动的NLRP3炎症小体激活介导的机制	首次在单细胞水平上揭示巨噬细胞和NLRP3炎症小体在噪声性听力损失昼夜节律敏感性中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究噪声性听力损失昼夜节律敏感性的分子机制	小鼠耳蜗细胞	听觉生物学	噪声性听力损失	单细胞RNA测序，多重免疫组化	小鼠噪声暴露模型	单细胞转录组数据	97,043个耳蜗细胞
610	2025-07-21	Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia 2025-Jul-19, Journal of assisted reproduction and genetics IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10815-025-03584-5 PMID:40681857	研究论文	开发一种基于单细胞RNA测序的定量方法，用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力	利用单细胞RNA测序技术开发了一个生精评分系统，并鉴定了与生精潜力相关的关键基因作为生物标志物	样本量较小（18名iNOA患者），需要进一步验证在更大样本中的适用性	评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力，为个性化治疗提供依据	特发性非梗阻性无精子症患者	生殖医学	男性不育症	单细胞RNA测序, RT-qPCR	模糊聚类, 基因表达趋势分析	基因表达数据	18名iNOA患者（近4000个单细胞），另18名患者用于验证
611	2025-07-21	Genetic Loci Associated With Periodontitis: The FinnGen Study Based on National Health Registers 2025-Jul-19, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14193 PMID:40682483	research paper	该研究通过全基因组关联研究（GWAS）在FinnGen队列中探索了与牙周炎相关的遗传位点	发现了6个新的常见遗传位点与牙周炎相关，并揭示了HLA区域的遗传变异与牙周炎的独立关联	研究基于芬兰人群，可能限制了结果的普遍性	探索牙周炎的遗传因素	近25万名芬兰个体	遗传学	牙周炎	GWAS, 单细胞RNA测序	NA	遗传数据, 临床记录	近25万名芬兰个体
612	2025-07-21	IQGAP1 participates in bone marrow-derived macrophage recruitment and involves in liver inflammation/fibrosis 2025-Jul-19, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany) DOI:10.1007/s00109-025-02573-6 PMID:40682669	研究论文	本研究探讨了IQGAP1在骨髓源性巨噬细胞(BMDM)迁移及肝脏炎症/纤维化中的作用	揭示了IQGAP1在S1P诱导的BMDM迁移和肝脏炎症/纤维化中的关键作用，并发现S1P/S1PR通过上调HuR表达调控IQGAP1表达的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	阐明IQGAP1在肝脏炎症和纤维化中的作用机制	骨髓源性巨噬细胞(BMDM)和肝脏组织	分子生物学	肝脏疾病	免疫荧光、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、Boyden chamber迁移实验	小鼠肝纤维化模型(CCl4、BDL、MCDHF饮食诱导)	基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞迁移数据	未明确说明具体样本数量，使用多种小鼠肝纤维化模型
613	2025-07-21	A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses 2025-Jul-19, Molecular biology reports IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11033-025-10836-1 PMID:40682700	综述	本文系统综述了2017年至2024年间在水稻中进行的单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究，重点关注水稻对环境胁迫的响应	填补了水稻单细胞RNA测序应用全面综述的空白，突出了转录组技术的最新进展	仅涵盖2017至2024年间的研究，可能未包括最新进展	探讨scRNA-seq技术在水稻研究中的应用及其对作物改良策略的贡献	水稻（Oryza sativa）的不同组织（根、叶、花和种子）及其对环境胁迫的响应	植物分子生物学	NA	scRNA-seq, ATCT-seq, snRNA-seq, Stereo-seq	NA	转录组数据	NA
614	2025-07-21	scIMGCN: an Automatic Single-Cell Type Annotation Method Based on Interpretable Graph Convolutional Network 2025-Jul-19, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00738-y PMID:40682757	研究论文	提出了一种基于可解释图卷积网络的自动单细胞类型注释方法scIMGCN，用于提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释准确性和可解释性	结合网络增强技术、改进的Transformer模块和基于Kolmogorov-Arnold网络的GCN变体，显著提高了注释准确性和模型可解释性	未提及具体的数据集限制或计算资源需求	开发一种高精度、可解释的单细胞RNA测序数据细胞类型自动注释方法	单细胞RNA测序数据中的细胞类型	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	图卷积网络(GCN), Transformer, Kolmogorov-Arnold网络(KAN)	单细胞RNA测序数据	十个真实数据集
615	2025-07-21	cDC1s Promote Atherosclerosis via Local Immunity and Are Targetable for Therapy 2025-Jul-18, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325792 PMID:40444360	研究论文	本研究揭示了传统1型树突状细胞（cDC1s）通过局部免疫促进动脉粥样硬化，并可作为治疗靶点	首次明确了cDC1s在动脉粥样硬化中的促炎作用机制，并开发了靶向cDC1s的纳米颗粒免疫疗法	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证	阐明cDC1s在动脉粥样硬化发展中的作用机制并探索靶向治疗策略	Ldlr-/-小鼠模型和cDC1s细胞	免疫学	心血管疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、纳米颗粒靶向递送技术	小鼠疾病模型	基因表达数据、流式细胞数据	多组Ldlr-/-小鼠实验组（具体数量未明确说明）
616	2025-07-21	Integrating bulk and single cell sequencing data to identify prognostic biomarkers and drug candidates in HBV associated hepatocellular carcinoma 2025-Jul-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-10876-4 PMID:40676059	研究论文	本研究通过整合大量和单细胞测序数据，识别了HBV相关肝细胞癌的预后生物标志物和潜在药物候选	结合PPI分析和机器学习，识别了SPP1、GHR和ESR1作为潜在药物靶点，并通过scRNA-seq分析揭示了SPP1在血管相关肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其对免疫微环境的影响	研究样本量相对较小（53个关键基因），且未进行实验验证	探索HBV相关肝细胞癌的发病机制及潜在治疗靶点	HBV相关肝细胞癌患者	生物信息学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、机器学习、分子对接	RSF（随机生存森林）、逐步Cox回归	测序数据	53个免疫相关关键基因，101个机器学习模型
617	2025-07-21	Identification of a fibroblast-derived gene signature reveals prognostic and therapeutic insights in pancreatic cancer 2025-Jul-18, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-025-01801-0 PMID:40676405	研究论文	本研究基于成纤维细胞特异性基因特征开发了一个预后模型，并识别了可能作为治疗靶点的关键基因	开发了一个包含14个关键基因的成纤维细胞相关预后特征，能有效预测胰腺癌患者的预后和对治疗的响应	NA	开发胰腺导管腺癌(PDAC)的预后模型并识别潜在治疗靶点	胰腺导管腺癌(PDAC)患者	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, LASSO Cox回归	预后模型	基因表达数据	多个队列的PDAC和邻近正常组织样本
618	2025-07-21	Integrated multidimensional bioinformatics analysis of the molecular mechanisms of ulcerative colitis-associated colorectal cancer and MMP1 as a potential therapeutic target 2025-Jul-18, Cancer gene therapy IF:4.8Q1 DOI:10.1038/s41417-025-00917-5 PMID:40681672	研究论文	通过整合多维生物信息学分析，研究溃疡性结肠炎相关结直肠癌的分子机制，并确定MMP1作为潜在治疗靶点	首次通过整合多组学分析揭示MMP1在溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的保护作用及其免疫调节机制，并预测ilomastat作为潜在MMP1抑制剂	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	探究溃疡性结肠炎相关结直肠癌的分子机制并寻找潜在治疗靶点	溃疡性结肠炎(UC)和结直肠癌(CRC)患者数据	生物信息学	结直肠癌	孟德尔随机化分析(MR)、差异基因表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、基因集富集分析、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据	来自GEO、TCGA和GWAS数据库的数据
619	2025-07-21	Unveiling the role of TAM-derived extracellular vesicles in glioma progression through Treg polarization and immune suppression 2025-Jul-18, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03497-8 PMID:40681801	研究论文	本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）来源的细胞外囊泡（EVs）通过调节调节性T细胞（Tregs）分化在胶质瘤进展中的作用	首次发现TAM EVs通过下调BPI蛋白促进Treg分化，进而增强免疫抑制并促进胶质瘤生长	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证	阐明TAM EVs在胶质瘤微环境中调节Treg分化和免疫抑制的机制	胶质瘤微环境中的TAMs、Tregs及其分泌的EVs	肿瘤免疫学	胶质瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠胶质瘤模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量（使用小鼠模型）
620	2025-07-21	Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus 2025-Jul-18, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-05201-z PMID:40681826	research paper	本研究探讨了妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响，特别是调节食欲和能量平衡的神经元群的形成	揭示了妊娠期蛋白质限制通过减少必需氨基酸可用性，选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元的分化，同时不影响NPY前体细胞的分化	需要进一步研究其他发育窗口期以优化高风险妊娠的饮食建议	探究妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育及代谢编程的影响	妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑	developmental biology	metabolic disorders	single-cell RNA-seq, EdU-labeling, immunohistochemistry, RNAscope, methylation analysis	rat isocaloric protein restriction model	RNA-seq data, immunohistochemistry images, methylation data	妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织