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当前共找到 38991 篇文献,本页显示第 601 - 620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
601 2026-04-28
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过人类神经网络模型揭示ALS和FTLD中NPTX2的病理作用 首次利用iCoMoNSCs衍生的长寿命功能性神经网络iNets模拟TDP-43蛋白病,并鉴定出NTPX2作为TDP-43关键调控靶点,阐明其在神经毒性中的直接作用 未提及明确的局限性 研究TDP-43病理在神经退行性疾病中的出现机制及后果 诱导多能干细胞衍生的神经干细胞及其分化形成的神经网络 自然语言处理 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶变性 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 患者样本(肌萎缩侧索硬化症和额颞叶变性患者) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
602 2026-04-28
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 循环髓系来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中的作用 首次揭示外周髓系细胞特异性蛋白酶MMP8在应激易感性和抑郁症中通过直接浸润脑区影响细胞外空间和神经生理的机制 未明确MMP8从外周进入脑实质的具体分子途径,且研究主要基于小鼠模型,人类数据仅涉及血清水平检测 探究外周免疫系统改变如何通过特定分子影响中枢神经系统功能和压力相关行为 人类重度抑郁症患者血清样本及慢性社交挫败应激小鼠模型 机器学习 抑郁症 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质组学数据 人类患者血清样本与小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于免疫细胞高维表型分析
603 2026-04-28
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用NSC-seq分子时钟记录哺乳动物发育和癌前病变的细胞事件时序 首次开发并验证了一种多用途单细胞CRISPR平台NSC-seq,将分子时钟与细胞状态和谱系信息相结合,实现了对细胞事件时序和克隆性的精准记录 未提及具体局限性,但可能包括对CRISPR编辑效率的依赖性以及人类癌前样本分析中的样本代表性 开发一种能够记录细胞事件时序和克隆性的分子时钟方法,并应用于哺乳动物发育和癌前病变的研究 小鼠胚胎、小鼠腺瘤、人结肠癌前病变 数字病理学 结肠癌前病变 NSC-seq(单细胞CRISPR平台)、单细胞多组学分析 分子时钟模型 单细胞RNA测序数据、克隆分析数据 116个单细胞RNA测序数据集和418个人类息肉 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 10x Chromium NSC-seq平台
604 2026-04-28
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 该论文通过转基因雪貂模型定义了肺部离子细胞的多样性和功能 首次在鼬科动物中建立条件性遗传模型,揭示人类与小鼠间进化保守的肺部离子细胞功能及亚型 NA 阐明肺部离子细胞在气道中的生物学功能及其在囊性纤维化中的作用 转基因雪貂模型(FOXI1-Cre::ROSA-TG, FOXI1-KO, FOXI1-Cre::CFTR)及囊性纤维化雪貂 自然语言处理 囊性纤维化 单细胞转录组学、谱系追踪、条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据、谱系追踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
605 2026-04-28
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 开发LRT框架,整合单细胞RNA测序与单细胞T细胞受体测序数据,研究克隆分化异质性 首次提出综合计算框架LRT,整合scRNA-seq和scTCR-seq数据,揭示克隆分化轨迹异质性,弥补单一方法在T细胞克隆分析中的不足 研究未涉及其他免疫细胞类型或更大范围的数据验证 探索克隆分化轨迹异质性,提供综合分析方法 CD8+ T细胞和CD4+ T细胞(急性淋巴性脉络丛脑膜炎病毒感染样本) 机器学习 感染性疾病 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 NA 基因表达数据, TCR序列数据 CD8+ T细胞和CD4+ T细胞样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 NA NA
606 2026-04-28
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 开发了一种无监督的细胞功能注释方法UNIFAN,用于单细胞RNA测序数据 UNIFAN是一种同时进行聚类和注释的神经网络方法,利用已知基因集来确定聚类,显著优于传统聚类方法 可能依赖已知基因集的完整性和准确性,未提及在未知细胞类型或复杂组织中的性能 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型分配的准确性和可解释性 人类和小鼠的scRNA-seq数据集,来自多个不同器官 机器学习 NA 单细胞RNA测序 神经网络 基因表达数据 人类和小鼠scRNA-seq数据集,具体样本数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
607 2026-04-27
Efferocytosis-related biomarkers and immune infiltration in pancreatic ductal adenocarcinoma based on single-cell sequencing and machine learning: a comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 基于单细胞测序和机器学习整合生物信息学分析与实验验证,揭示胞葬作用相关生物标志物在胰腺导管腺癌中的免疫浸润特征 首次通过单细胞转录组学与机器学习结合,系统解析胰腺导管腺癌中巨噬细胞胞葬作用的异质性,并构建包含六基因(CD36、ITGAV、PANX1、PPARG、S100A4、THBS1)的风险预测模型 研究主要依赖公开数据集,样本量有限且缺乏多中心独立外部验证;THBS1基因功能验证仅在体外进行,未涉及体内动物模型或临床前瞻性队列验证 探索胞葬作用相关基因在胰腺导管腺癌中的表达模式、预后预测价值及肿瘤微环境重塑机制 胰腺导管腺癌患者组织样本及细胞系(如用于THBS1敲降实验的PDAC细胞) 机器学习, 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, RNA-seq, 实时荧光定量PCR, 蛋白质印迹法 Cox回归, LASSO回归 基因表达数据, 单细胞转录组数据 TCGA-PDAC和GTEx数据集(具体样本数未明确)、GEO数据集(如单细胞数据集)、6基因模型构建基于训练组及验证组(样本量未具体说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
608 2026-04-27
In silico virtual knockout identifies PXDNL as a fibroblast-specific driver of sarcopenia and GABA as a potential modulator
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过虚拟基因敲除和单细胞RNA测序分析,确定PXDNL是肌肉减少症成纤维细胞特异的驱动因子,并发现GABA作为潜在调节剂 首次利用计算机模拟虚拟基因敲除与多组学数据结合,识别出成纤维细胞特异的肌肉减少症驱动基因PXDNL,并验证了GABA作为可重靶向药物的治疗潜力 研究主要基于计算机模拟和体外实验,缺乏体内动物模型验证,且样本量相对较小 识别肌肉减少症的因果机制和可转化的治疗靶点 肌肉减少症中成纤维细胞特异基因PXDNL及其调控的细胞外基质基因 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序, 虚拟基因敲除, 分子对接 WGCNA, scTenifoldKnk, plsRglm 基因表达数据 238份活检样本(来自5个GEO队列)和10份单细胞样本(12,847个细胞) NA 单细胞RNA测序 NA NA
609 2026-04-27
Single-Cell Nanodroplet Processing Proteomics Pipeline for Analysis of Human-Derived Microglia
2026-May, Proteomics IF:3.4Q2
研究论文 提出一种基于纳升液滴处理的单细胞蛋白质组学流程,用于分析人源小胶质细胞 首次实现从人脑死后组织来源的小胶质细胞中进行单细胞蛋白质组学分析,无需标记,鉴定蛋白数量与单细胞RNA测序相当 该研究仅为初步验证,样本量有限,且未进行大规模亚型分类或疾病相关分析 开发一种可用于大规模蛋白质组学的小胶质细胞亚型分类方法,以研究其在神经退行性疾病中的作用 人脑死后皮层来源的小胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病、神经退行性疾病 单细胞质谱蛋白质组学、荧光激活细胞分选、纳升液滴处理 NA 蛋白质组数据 单个小胶质细胞,平均鉴定1039种蛋白质 NA 单细胞蛋白质组学 NA 基于荧光激活细胞分选和纳升液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学流程
610 2026-04-27
A machine learning-driven framework integrating cell death and senescence signatures for multi-target drug design and immunotherapy optimization in ovarian cancer
2026-Apr-26, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用机器学习整合细胞死亡与衰老特征,建立多靶点药物设计和免疫治疗优化的预测框架,并在卵巢癌中验证 首次将非凋亡性细胞死亡与衰老通路整合为一个可预测的机器学习模型(CDSLS),并结合多组学分析和人工智能靶向药物设计,为卵巢癌多靶点治疗和免疫治疗优化提供新策略 部分关键基因的功能验证仅限于RB1,其他潜在靶点未深入探索;模型在临床转化前需更多独立大规模队列验证 构建基于机器学习的多靶点药物设计与免疫治疗优化框架,用于卵巢癌精准治疗 卵巢癌患者样本(n=1858)及免疫治疗数据集 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序、多组学分析、人工智能靶向化合物预测 机器学习模型(CDSLS) 基因表达数据、单细胞转录组数据 1858例卵巢癌患者样本(多队列汇总)及免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
611 2026-04-27
Guidelines for single cell RNA sequencing analysis of eosinophils
2026-Apr-25, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 针对嗜酸性粒细胞单细胞RNA测序分析提供优化指南,整合多数据集进行跨平台比较,提出专用分析策略 首次系统整合嗜酸性粒细胞scRNA-seq数据集并跨平台分析,提出嗜酸性粒细胞专用标记基因面板和内含子包含比对策略 主要基于公开数据集分析,可能未涵盖所有平台和组织类型;嗜酸性粒细胞固有转录组稀疏性仍难以完全克服 建立嗜酸性粒细胞scRNA-seq分析优化框架,提升细胞回收、注释和生物学解释的可靠性 嗜酸性粒细胞单细胞RNA测序数据,涵盖多个平台、组织和物种的公开数据集及实验室内部数据 单细胞转录组学 嗜酸性粒细胞相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了多个实验室的公开嗜酸性粒细胞scRNA-seq数据集 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 包含10x Chromium单细胞系统和Illumina NovaSeq测序平台
612 2026-04-27
Identification of synovial lymphatic system in the temporomandibular joint and their roles in arthritis and pain
2026-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 鉴定颞下颌关节中的滑膜淋巴系统及其在关节炎和疼痛中的作用 首次在颞下颌关节中发现滑膜淋巴系统,并揭示其功能障碍驱动关节炎和疼痛的机制 主要基于小鼠模型,人类组织样本有限,可能需进一步验证临床相关性 研究颞下颌关节中淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 颞下颌关节滑膜淋巴系统 数字病理学 颞下颌关节炎 单细胞RNA测序, 组织透明化, 三维体积成像, 功能遗传学 NA 基因表达数据, 成像数据 使用了遗传报告小鼠和人类组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
613 2026-04-27
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量DNA测序,揭示了乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的异质性,并鉴定了GABRB3和NRXN1作为脑转移潜能的候选调节因子 首次在单细胞分辨率下系统描绘了乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境,发现循环TAMs和组织驻留TAMs分别呈现M1样和M2样表型,并鉴定了与脑转移相关的神经相关肿瘤细胞亚型和反复突变 样本量较小(7例患者进行单细胞测序,47例进行批量DNA测序),且功能验证仅在异种移植模型中进行,需进一步在更大队列和临床研究中验证 探索乳腺癌脑转移的分子机制,特别是肿瘤免疫微环境和转移性肿瘤细胞的异质性 乳腺癌脑转移患者 单细胞生物学 乳腺癌脑转移 单细胞RNA测序、批量DNA测序 NA 单细胞转录组数据、DNA突变数据 7例患者(scRNA-seq)和47例患者(批量DNA测序) NA 单细胞RNA-seq, 批量DNA-seq NA NA
614 2026-04-27
PW1+ cells give rise to cardiac adipocytes during development and myofibroblasts following injury
2026-Apr-25, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用遗传谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示了PW1+细胞在心脏发育过程中分化为脂肪细胞,并在心肌梗死后分化为肌成纤维细胞的双重潜能 首次证明PW1+细胞在心脏中具有干细胞特性,可分别贡献于心脏脂肪细胞和肌成纤维细胞的形成,为心脏脂肪生成和纤维化机制提供了新见解 尚未明确PW1+细胞分化的具体分子调控机制,以及其在其他心脏病理条件下的作用 探究PW1+细胞在心脏中的干细胞特性及其在发育和损伤后的分化潜能 小鼠心脏中的PW1+细胞 数字病理学 心血管疾病 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 成年小鼠心脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
615 2026-04-27
Integrator subunit IntS11 orchestrates the temporal dynamics of neural lineage progression in Drosophila
2026-Apr-25, Cell & bioscience
研究文章 利用果蝇模型揭示Integrator亚基IntS11通过转录调控细胞周期基因和维持长3'UTR异构体来协调神经谱系进展的时间动态 首次发现IntS11作为神经谱系进展的阶段特异性调控因子,通过转录控制细胞周期基因维持神经母细胞增殖,并通过维持长3'UTR异构体稳定分化程序 未提及具体局限性,可能包括需要进一步在哺乳动物模型中验证 探究IntS11在神经谱系进展中的具体调控功能 果蝇神经母细胞及其后代细胞 数字病理学 神经发育疾病 单细胞RNA测序,ChIP-qPCR,FUCCI分析,活体成像,MARCM NA 基因表达数据 果蝇幼虫脑样本,具体数量未在摘要中给出 NA 单细胞RNA测序 NA NA
616 2026-04-27
Pathway-level somatic mutation burden reflects diffuse genomic accumulation rather than selective transcriptional disruption in ovarian serous carcinoma: Evidence from bulk, spatial, and multi-region genomic analyses
2026-Apr-24, Gynecologic oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过分析批量、空间和多区域基因组数据,探讨卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷与转录通路活性的关系,发现TMB增加反映弥散性基因组积累而非选择性转录通路破坏 首次在多尺度基因组数据(批量、空间、多区域)中系统验证TMB与转录通路活性的关系,并揭示染色质重塑通路在TMB增加和上皮细胞区隔中优先突变 研究统计效能有限,无法检测到TMB与通路活性的微小关联;仅基于单一癌症类型进行分析 明确卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷增加是否驱动选择性转录通路破坏或反映弥散性基因组积累 卵巢浆液性癌患者的肿瘤样本(包括CPTAC-GDC队列84例、Gray Foundation空间转录组队列43例、MSK SPECTRUM多区域基因组队列42例) 机器学习 卵巢浆液性癌 空间转录组学, 全外显子组测序 NA 基因表达数据, 突变数据, 空间转录组数据 共169例患者(CPTAC-GDC 84例、Gray Foundation 43例、MSK SPECTRUM 42例) NanoString, Illumina 空间转录组学, 批量RNA测序 GeoMx Digital Spatial Profiler, NovaSeq GeoMx空间转录组平台用于原位基因表达分析,Illumina NovaSeq用于全外显子组测序
617 2026-04-27
Generation of a prop1 knockin zebrafish enables single-cell transcriptomics of early pituitary development
2026-Apr-24, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 通过构建prop1敲入斑马鱼品系,利用单细胞转录组学研究早期垂体发育 首次生成了prop1敲入斑马鱼报告基因品系,并构建了首个斑马鱼早期垂体发育单细胞图谱 未提及明显的局限性 研究脊椎动物早期垂体发育的细胞和分子机制 斑马鱼和小鼠的早期垂体发育 数字病理学 未指定 单细胞RNA测序、活体成像 NA 单细胞转录组数据、图像 斑马鱼品系及胚胎样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
618 2026-04-27
Type I interferon drives T cell responses to amyloid beta in the central nervous system
2026-Apr-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了APP23转基因小鼠模型中中枢神经系统淀粉样蛋白病理进展过程中,T细胞从依赖于微胶质细胞转变为介导神经炎症的免疫微环境动态变化,并发现I型干扰素驱动CD8+ T细胞对β-淀粉样蛋白的应答 首次在单细胞水平揭示淀粉样蛋白病理晚期T细胞显著增加及其围绕Aβ斑块的聚集现象,鉴定出表达干扰素刺激基因的CD8+ T细胞亚群,并阐明其通过CXCL10-CXCR3轴招募非ISG T细胞的机制 主要基于小鼠模型,人类样本验证范围有限;未深入探讨T细胞亚群的功能异质性及长期效应 研究中枢神经系统淀粉样蛋白病理中适应性免疫系统(特别是T细胞)的动态变化及其调控机制 APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理组织样本(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
619 2026-04-27
Intragraft clonal expansion of cytotoxic CD8+ and CD4+ T cells in antibody-mediated kidney transplant rejection
2026-Apr-23, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 通过多组学分析揭示了抗体介导的肾移植排斥反应中细胞毒性CD8+和CD4+ T细胞的克隆扩增现象 首次在抗体介导的排斥反应中系统证实CD4+和CD8+细胞毒性T细胞的克隆扩增,挑战了传统AMR与TCMR的二元分类框架 样本量有限(仅16例单细胞测序),且未涉及功能验证实验 探索抗体介导的肾移植排斥反应中T细胞的克隆性和空间组织特征 肾移植活检组织中的CD4+和CD8+ T细胞 数字病理学 肾移植排斥反应 RNA-seq, 单细胞RNA/TCR测序, 多重免疫染色 NA 转录组数据, 单细胞测序数据, 空间蛋白组数据 192例批量转录组、16例单细胞RNA/TCR测序、18例和75例多重免疫染色 NA 单细胞RNA-seq NA NA
620 2026-04-27
Endothelial Adgrl2 Expression and Alternative Splicing Controls the Cerebrovasculature
2026-Apr-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 该文研究内皮细胞Adgrl2的表达和可变剪接对脑血管系统的调控作用 发现Adgrl2在内皮细胞和神经元中通过细胞类型特异性的可变剪接产生不同异构体,赋予其区分调控神经回路组装和脑血管稳态的功能 仅在老鼠模型中验证,缺少人类数据支持;未深入探讨可变剪接的具体分子机制 探究Adgrl2在内皮细胞中的功能及其可变剪接对脑血管完整性的影响 小鼠(雌雄均包括)的内皮细胞和神经元 计算机视觉 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠内皮细胞和神经元样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
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