单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
601	2025-05-23	Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.176596 PMID:40232854	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究人类闭塞性细支气管炎综合征（BOS）的发病机制，揭示免疫细胞和基质细胞在其中的共同作用	首次在CLAD-BOS和cGVHD-BOS两种形式的BOS中发现CD8+组织驻留记忆T细胞（TRM）的扩增群体，并识别出与巨噬细胞趋化和增殖相关的基因和通路	样本量较小（4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者和3例对照）	理解闭塞性细支气管炎综合征（BOS）的疾病机制	人类肺移植后的慢性肺同种异体移植功能障碍BOS（CLAD-BOS）和异基因造血干细胞移植后的慢性移植物抗宿主病BOS（cGVHD-BOS）	生物医学研究	闭塞性细支气管炎综合征	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者和3例对照
602	2025-05-23	Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.185618 PMID:40232859	research paper	本研究鉴定并比较了系统性硬化症（SSc）皮肤中迁移性和非迁移性成纤维细胞的特性及其在疾病不同阶段的作用	首次分离并描述了SSc皮肤中的非迁移性‘常驻’成纤维细胞群体，揭示了其在疾病不同阶段的独特致病特征和治疗靶点潜力	研究主要基于体外实验和有限的样本分析，需要进一步在体实验验证这些发现	探究系统性硬化症皮肤中不同成纤维细胞群体的致病机制及其在疾病进展中的作用	系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞	digital pathology	systemic sclerosis	bulk and single-cell RNA-seq, multichannel immunofluorescence	NA	RNA-seq data, immunofluorescence images	来自系统性硬化症患者皮肤活检的成纤维细胞样本
603	2025-05-23	Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias 2025-May-22, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.287091 PMID:40400458	研究论文	研究骨髓基质细胞中双分N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）表达如何通过TGF-β1调控髓系白血病中的巨噬细胞极化	揭示了骨髓基质细胞中特定糖链（减少的双分GlcNAc）通过TGFβ1分泌促进M2极化巨噬细胞亚型的机制，并发现这一过程提高了PD-L1表达，从而损害CD8+ T细胞功能	NA	探讨骨髓基质细胞中糖链修饰对髓系白血病肿瘤微环境中巨噬细胞极化的影响	骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	髓系白血病（AML和MDS）	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	NA
604	2025-05-23	Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.191059 PMID:40401523	review	本文综述了心肺血管系统中内皮细胞（ECs）在健康和疾病状态下的免疫调节功能及其转录特征	揭示了心肺血管系统中内皮细胞亚群的多样性及其在免疫调节中的特殊作用，强调了ECs在疾病发病机制中的关键角色和作为未来治疗靶点的潜力	NA	探讨心肺血管系统中内皮细胞在免疫调节中的作用及其在健康和疾病状态下的转录特征	心肺血管系统中的内皮细胞（ECs）	生物医学	心肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
605	2025-05-23	A conserved epilepsy-associated gene co-expression module identifies increased metabolic rate as a shared pathomechanism 2025-May-22, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052307 PMID:40401642	研究论文	通过果蝇全脑单细胞RNA测序，研究癫痫相关基因共表达网络，揭示代谢率增加作为癫痫的共同病理机制	利用果蝇单细胞表达数据和行为验证人类基因共表达网络，首次将代谢率增加与癫痫易感性联系起来	研究结果主要基于果蝇模型，需要在人类样本中进一步验证	揭示癫痫的分子机制，特别是代谢与癫痫易感性的关系	果蝇和人类癫痫相关基因	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	果蝇基因敲低模型	RNA测序数据	26个基因的果蝇全脑单细胞RNA测序数据
606	2025-05-23	Single-cell sequencing on PBMCs from HA & HB patients with inhibitors reveals different immune responses to FVIII & FIX 2025-May-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799 PMID:40402102	研究论文	通过单细胞测序技术研究血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫反应	首次在单细胞水平上比较了HA和HB患者对FVIII和FIX的免疫反应差异，揭示了淋巴细胞亚群组成和功能状态的差异	样本量较小（5例HA和5例HB患者），可能影响结果的普遍性	探索HA和HB患者对FVIII和FIX的不同免疫反应机制	血友病A和血友病B患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞测序	血友病	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	5例HA患者和5例HB患者的PBMCs，共75,051个细胞
607	2025-05-23	Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm 2025-May-22, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11883-025-01302-1 PMID:40402405	review	综述了髓系细胞在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的关键作用及其治疗潜力	单细胞RNA测序揭示了AAA中髓系细胞的多样性，并阐明了不同髓系细胞亚群在疾病中的作用机制	临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战	探讨髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用及治疗靶向潜力	腹主动脉瘤中的髓系细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
608	2025-05-23	Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse 2025-May-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192 PMID:40397797	研究论文	该研究探讨了TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨初始治疗反应及后续复发的潜在机制	整合了靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学分析，揭示了白血病与免疫细胞群之间的动态变化	样本量有限，且为单中心研究	阐明TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制	骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者	血液肿瘤学	骨髓增生异常综合征/急性髓系白血病	靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序、单细胞转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	II期临床试验中的系列患者样本
609	2025-05-23	Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology 2025-May-21, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70220 PMID:40398874	综述	本文探讨了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的未开发潜力及其当前应用	强调了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的创新应用，包括多组学、谱系追踪、分子记录和高通量遗传与化学扰动表型分析等新兴技术	植物特有的技术挑战和资源限制，如细胞壁复杂性和抗体资源有限，以及需要更完整的参考图谱和计算工具	探索单细胞和空间组学技术在植物生物学中的应用潜力，推动植物科学的发展	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录、高通量遗传与化学扰动表型分析	NA	分子和细胞数据	多个模型植物物种的综合细胞图谱
610	2025-05-23	Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke 2025-May-21, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01523-6 PMID:40399534	研究论文	研究发现PPM1D基因的功能获得性突变可以减轻缺血性脑损伤，并验证了其药物稳定剂T2755作为缺血性中风的有前景疗法	首次发现PPM1D基因的功能获得性突变与缺血性中风患者的临床表型改善相关，并揭示了PPM1D通过PPARα途径保护内皮细胞功能的机制	研究中仅发现8例携带PPM1D突变的患者，样本量较小	探索缺血性中风的遗传基础及潜在治疗靶点	10,241名缺血性中风患者和Ppm1d缺陷小鼠	遗传学	缺血性中风	全基因组测序、空间转录组学、蛋白质组学分析	Ppm1d缺陷小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	10,241名缺血性中风患者（其中8例携带PPM1D突变）和Ppm1d缺陷小鼠
611	2025-05-23	Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage 2025-May-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08986-0 PMID:40399682	research paper	该研究通过多代单细胞追踪技术，结合内源性标记蛋白和定制计算工具，探讨了致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称和表型异质性	使用双CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传的内源性DNA损伤，结合单细胞转录组学揭示了致癌事件如何触发多倍体化的多种途径	研究仅追踪了最多四代的细胞谱系树，可能无法完全反映长期细胞异质性的发展过程	解析细胞异质性的来源及其在多代细胞中的传递机制	异步生长的细胞及其多代谱系	基因组学	癌症	双CRISPR基因组编辑、单细胞转录组学、迭代染色	NA	基因组数据、转录组数据	异步生长的细胞谱系树（最多四代）
612	2025-05-23	A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation 2025-May-21, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-025-02649-1 PMID:40399693	research paper	介绍了一种名为CloneSelect的多界遗传条形码系统，用于从复杂细胞群中精确分离目标克隆	开发了一种通过CRISPR碱基编辑触发目标克隆表达报告基因的新方法，实现了对特定表型或基因型克隆的精确分离	未提及具体的技术限制或应用范围限制	开发一种能够从复杂细胞群中精确分离目标克隆的技术	人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞	基因编辑技术	NA	CRISPR base editing, single-cell RNA sequencing	NA	基因序列数据	多种细胞类型（人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞）
613	2025-05-23	Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs 2025-May-20, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01984-24 PMID:40183583	研究论文	本研究通过在小鼠体内连续传代H3N2犬流感病毒，建立了致死性感染模型，并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒对狗和小鼠的致病性	首次揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变在H3N2犬流感病毒中对哺乳动物适应性的协同作用，并通过单细胞RNA测序阐明了其逃避宿主抗病毒反应的机制	研究主要集中在小鼠和狗模型，对人类潜在风险的研究仍需进一步验证	阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制	H3N2犬流感病毒及其在小鼠和狗中的感染模型	病毒学	流感	单细胞RNA测序、病毒连续传代	动物感染模型	基因序列数据、病毒滴度数据	小鼠和狗的肺组织样本
614	2025-05-23	scRNA-seq reveals an immune microenvironment and JUN-mediated NK cell exhaustion in relapsed T-ALL 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102098 PMID:40306275	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示了复发T-ALL患者的骨髓免疫微环境及JUN介导的NK细胞耗竭	首次在复发T-ALL患者中鉴定出JUN是NK细胞耗竭的关键因子，并验证了JUN抑制剂对白血病细胞的杀伤作用及对NK细胞功能的改善	研究样本量未明确说明，且机制研究主要基于细胞系和动物模型，需进一步临床验证	探究T-ALL复发的免疫微环境特征及潜在治疗靶点	复发T-ALL患者的骨髓免疫细胞（包括HSCs、GMPs、CD4 T、CD8 T、NK细胞等）	单细胞转录组学	T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	CDX（细胞源性肿瘤异种移植）、PDX（患者源性肿瘤异种移植）、NOTCH1突变小鼠模型	单细胞转录组数据	NA
615	2025-05-23	Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095 PMID:40315846	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学，全面分析了儿童高级别胶质瘤(pHGG)的免疫景观，揭示了治疗压力下的细胞状态变化	首次在儿童高级别胶质瘤中系统比较了不同年龄组和治疗方案下的免疫微环境差异，并发现了与成人不同的髓系亚群比例	样本量相对有限，且未涉及长期治疗反应的动态监测	探究儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其对治疗的反应	儿童弥漫性高级别胶质瘤(HGG)和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞	肿瘤免疫学	儿童高级别胶质瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学	NA	转录组数据	未明确说明具体样本数量，但包含匹配的多种细胞类型
616	2025-05-23	Low T cell diversity associates with poor outcome in bladder cancer: A comprehensive longitudinal analysis of the T cell receptor repertoire 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102101 PMID:40315845	research paper	该研究探讨了膀胱癌患者T细胞受体（TCR）多样性与临床结果的关系	首次全面分析了膀胱癌患者TCR多样性的纵向变化及其与治疗结果的关联	研究样本量有限，且未探讨TCR多样性影响生存的具体机制	评估TCR多样性作为膀胱癌预后生物标志物的潜力	膀胱癌患者的T细胞受体库	肿瘤免疫学	膀胱癌	单细胞测序	NA	测序数据	未明确说明数量的膀胱癌患者样本
617	2025-05-23	Targeting mitochondrial complex I of CD177+ neutrophils alleviates lung ischemia-reperfusion injury 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102140 PMID:40398393	research paper	研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析CD177+中性粒细胞在肺缺血再灌注损伤中的作用，并探索其作为早期生物标志物和治疗靶点的潜力	首次发现CD177+中性粒细胞在肺缺血再灌注损伤中的关键作用，并验证线粒体复合物I抑制剂IACS-010759的治疗效果	研究主要基于动物模型，临床转化效果需进一步验证	探索肺缺血再灌注损伤中中性粒细胞亚型的作用机制及治疗策略	CD177+中性粒细胞	生物医学	肺缺血再灌注损伤	单细胞RNA测序, 空间转录组学	小鼠IRI模型, 大鼠左肺移植模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
618	2025-05-23	Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones 2025-May-19, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040 PMID:40250431	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术探索了鸟类光感受器与其他脊椎动物光感受器的进化关系	揭示了鸟类双锥细胞（DC-P和DC-A）分别起源于祖先的红锥细胞和蓝锥细胞，并通过CRISPR介导的基因敲除验证了这一假设	研究仅在新孵化的鸡视网膜中进行，可能无法完全代表所有鸟类或其他脊椎动物的情况	探索鸟类光感受器与其他脊椎动物光感受器的进化关系	鸟类视网膜中的光感受器细胞	进化生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR介导的基因敲除	NA	RNA测序数据	新孵化的鸡视网膜细胞
619	2025-05-23	Mucinous breast cancer organoids: an in vitro research model 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02586-0 PMID:40388071	research paper	该研究建立了源自患者的黏液性乳腺癌类器官模型，用于临床药物筛选和科学研究	首次报道了黏液性乳腺癌类器官模型，并验证了其在早期传代中与原组织相似的特性	研究仅基于一名患者的样本，样本量有限	开发一种可靠的体外模型以解决纯黏液性乳腺癌的异质性问题	纯黏液性乳腺癌患者的手术肿瘤样本	digital pathology	breast cancer	single-cell RNA-Seq, histological staining, drug testing	organoid model	RNA sequencing data, histological images	1名64岁中国女性患者的肿瘤样本
620	2025-05-23	Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment 2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011548 PMID:40389372	research paper	该研究探讨了脑肿瘤引流淋巴结中免疫调节性树突状细胞的作用及其通过OX40激动剂治疗的潜在靶向性	揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞（DC-c）独特的免疫调节功能，并发现OX40信号通路在调节这些细胞功能中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其治疗潜力	小鼠模型中的胶质瘤和淋巴瘤	免疫学	脑肿瘤	高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序	小鼠模型	细胞和分子数据	NA