单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
601	2025-06-09	Stromal Cell Isolation from Hematopoietic Organs 2024-01-26, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/66231 PMID:38345255	研究论文	本文介绍了从造血器官中分离高质量基质细胞的分步协议，适用于生成高质量单细胞多组学数据集	提供了针对小鼠和人类胸腺以及小鼠骨骼和骨髓的基质细胞分离协议，讨论了样本消化、造血谱系耗竭、FACS分析/分选等因素对单细胞测序兼容性的影响	未提及具体样本量或实验重复次数	开发从造血器官中分离高质量基质细胞的标准化方法	小鼠和人类胸腺、小鼠骨骼和骨髓中的基质细胞	单细胞测序	NA	单细胞测序、FACS分析/分选	NA	单细胞多组学数据	NA
602	2025-06-09	Feasibility of whole RNA sequencing from single-cell mRNA amplification 2013, Genetics research international DOI:10.1155/2013/724124 PMID:24455282	research paper	探讨单细胞RNA测序技术在基因组医学中的可行性	展示了单细胞RNA测序技术在检测基因剪接和高通量基因表达分析中的能力，相比差异显示技术能检测到更多的基因	灵敏度为76%，特异性为55%，且存在部分基因表达缺失（2/8基因）	评估单细胞RNA测序技术在基因组医学中的应用潜力	单细胞RNA测序技术及其在肿瘤和遗传疾病诊断中的应用	基因组学	肿瘤和遗传疾病	RNA-seq	NA	RNA序列数据	NA
603	2025-06-08	Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness 2025-Jun-06, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656 PMID:40304034	research paper	研究探讨了习惯性运动如何通过调节神经免疫相互作用来减轻主动脉硬化	揭示了运动通过调节交感神经与免疫细胞的相互作用减轻主动脉硬化的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究运动对主动脉硬化中神经免疫相互作用的调节作用	C57BL/6小鼠	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞RNA测序，免疫组化，基因敲除	小鼠模型	基因表达数据，免疫组化数据	未明确说明具体数量，使用C57BL/6小鼠进行实验
604	2025-06-08	Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance 2025-Jun-06, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284 PMID:40478933	研究论文	通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的滑液免疫景观，揭示了治疗抵抗性患者中免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调的现象	首次在治疗抵抗性银屑病关节炎患者中发现免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调，并通过体内外实验验证了选择性免疫蛋白酶体抑制剂的治疗效果	样本量相对较小（41例PsA患者和9例OA对照），且研究结果需要在更大规模队列中验证	探索银屑病关节炎治疗抵抗性的免疫学机制并寻找新的治疗靶点	银屑病关节炎患者和骨关节炎对照患者的滑液免疫细胞	免疫学	银屑病关节炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照
605	2025-06-08	RORγt is crucial for gut homeostasis by regulating the expression of HB-EGF rather than IL-22 in activated ILC3s 2025-Jun-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115793 PMID:40478733	research paper	该研究探讨了RORγt在调节ILC3s中HB-EGF表达而非IL-22表达中的关键作用，及其对肠道稳态的影响	通过单细胞RNA测序分析揭示了RORγt在ILC3激活中的基本参与，并发现RORγt缺失后ILC3仍能维持肠道健康	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	阐明RORγt在ILC3s中的具体作用及其对肠道稳态的影响	ILC3s及其产生的HB-EGF和IL-22	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序，Il22Rosa26Rorc小鼠模型	NA	基因表达数据	NA
606	2025-06-08	Widespread and cell-type-specific transcriptomic reorganization following mild traumatic brain injury 2025-Jun-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115795 PMID:40478731	研究论文	该研究通过小鼠模型和空间转录组学技术，探讨了轻度创伤性脑损伤（TBI）后大脑的广泛和细胞类型特异性转录组重组	使用CHIMERA TBI模型和空间转录组学技术，首次在亚急性期系统地识别了TBI的跨脑区和细胞类型特异性转录组特征	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全反映人类TBI的复杂性	理解轻度创伤性脑损伤（TBI）如何改变大脑的转录组	小鼠大脑	神经科学	创伤性脑损伤	空间转录组学	CHIMERA TBI模型	转录组数据	多只小鼠
607	2025-06-08	Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer 2025-Jun-04, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210 PMID:39688341	研究论文	该研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗如何通过诱导I型干扰素和CD8+ T细胞依赖的免疫反应，增强胰腺癌对免疫治疗的敏感性	揭示了奥拉帕尼增强放疗诱导的I型干扰素介导的免疫信号和适应性免疫反应的新机制，为胰腺癌免疫治疗提供了新策略	研究主要基于免疫健全模型，临床转化效果需进一步验证	探究奥拉帕尼联合放疗对胰腺癌免疫治疗的增敏作用及其机制	胰腺导管腺癌(PDAC)	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	单细胞RNA测序、免疫组化(IHC)、流式细胞术	NA	基因表达数据、免疫细胞表型数据	免疫健全小鼠模型（具体数量未明确说明）
608	2025-06-08	The high efficacy of claudin18.2-targeted CAR-T cell therapy in advanced pancreatic cancer with an antibody-dependent safety strategy 2025-Jun-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.012 PMID:39797399	研究论文	本研究报道了利用表达tEGFR的claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的高效性，并探索了抗体依赖性安全策略控制副作用的可行性	首次展示了claudin18.2靶向CAR-T细胞在胰腺癌中的显著抗肿瘤活性，并创新性地采用抗体依赖性安全开关策略控制脱靶毒性	样本量较小（仅3例患者），且观察到对正常胃黏膜的脱靶毒性	评估claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的疗效和安全性	3例晚期胰腺癌患者	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	CAR-T细胞治疗、单细胞转录组测序、T细胞受体测序	NA	临床数据、测序数据	3例晚期胰腺癌患者
609	2025-06-08	Activity-dependent development of the body's touch receptors 2025-Jun-04, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.015 PMID:40381613	research paper	研究发现神经元活动在体感神经元发育中的作用，特别是Piezo2和Na1.6通道对机械感受器终末器官形成的影响	揭示了机械刺激引发的神经元活动在早期生命中对机械感受器终末器官成熟的关键作用	研究主要关注Piezo2和Na1.6通道，可能还有其他未被发现的机制参与这一过程	探究神经元活动在体感神经元发育中的作用	体感神经元和机械感受器终末器官	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
610	2025-06-08	CTSE inhibits anti-tumor T cell response by promoting des-γ-carboxy prothrombin releasing in hepatocellular carcinoma 2025-Jun-04, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07753-3 PMID:40467555	研究论文	本研究探讨了CTSE在肝细胞癌中通过促进DCP释放抑制抗肿瘤T细胞反应的机制	揭示了CTSE高表达的癌细胞通过上调泛醌信号通路促进DCP合成和释放，进而抑制T细胞免疫反应的新机制	研究主要基于公共数据库的单细胞测序数据和体外实验，临床样本验证不足	探究肝细胞癌中癌细胞与免疫细胞相互作用的调控机制	肝细胞癌细胞和T细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
611	2025-06-08	SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy 2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701 PMID:39976545	研究论文	本文揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用，促使其从膜上移位，从而增强突变p53和KRAS的致癌协同作用	首次发现SMURF2通过PPLP基序介导GAP17-1的膜移位机制，阐明了突变p53和KRAS协同致癌的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大	探究突变p53和KRAS协同致癌的分子机制	胰腺癌细胞系、小鼠模型及临床样本	肿瘤分子生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、组织微阵列	iKras; iKras, p53, and p48-Cre; Kras小鼠模型	基因表达数据、组织病理数据	多个胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型、临床前和临床样本
612	2025-06-08	Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI182790 PMID:40067358	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观	首次使用单细胞RNA测序技术全面分析了B细胞耗竭治疗后多发性硬化症患者中枢和外周免疫细胞的变化	研究样本量有限，且未探讨这些免疫变化与临床症状改善的直接关系	探究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制	多发性硬化症患者在接受B细胞耗竭治疗前后的免疫细胞	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	转录组数据	未明确说明样本数量，但涉及脑脊液和外周血样本
613	2025-06-08	Enhancer Extrachromosomal Circular DNA ANKRD28 Elicits Drug Resistance via POU2F2-Mediated Transcriptional Network in Multiple Myeloma 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415695 PMID:40167268	研究论文	本研究揭示了非编码区eccDNA ANKRD28通过POU2F2介导的转录网络在多发性骨髓瘤中引发药物抵抗的机制	首次发现非编码区eccDNA作为增强子在多发性骨髓瘤药物抵抗中的作用，并揭示了POU2F2介导的转录网络机制	研究主要基于体外和动物模型，临床样本量有限	探索多发性骨髓瘤药物抵抗的分子机制	多发性骨髓瘤患者血清样本和VRd耐药细胞系	表观遗传学	多发性骨髓瘤	H3K27ac ChIP-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&Tag, CRISPR/Cas9	NA	基因组数据、转录组数据、表观遗传数据	多发性骨髓瘤患者血清样本和VRd耐药细胞系
614	2025-06-08	Glycolysis-Derived Lactate Induces ACSL4 Expression and Lactylation to Activate Ferroptosis during Intervertebral Disc Degeneration 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416149 PMID:40171826	研究论文	本研究揭示了糖酵解衍生的乳酸通过诱导ACSL4表达和乳酰化激活铁死亡在椎间盘退变中的作用机制	首次发现乳酸通过促进Histon H3K18乳酰化转录ACSL4，并增加ACSL4在K412位点的乳酰化，从而激活铁死亡	研究主要基于动物实验，尚未在人体临床试验中验证	探究椎间盘退变过程中髓核细胞的代谢变化及乳酸的作用机制	髓核细胞(NPCs)	细胞生物学	椎间盘退变	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒9(AAV9)基因沉默	NA	基因表达数据	NA
615	2025-06-08	Inhibiting the Histone Demethylase Kdm4a Restrains Cardiac Fibrosis After Myocardial Infarction by Promoting Autophagy in Premature Senescent Fibroblasts 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414830 PMID:40231733	research paper	研究探讨了组蛋白去甲基化酶Kdm4a在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其机制	首次揭示了Kdm4a通过调控Trim44表达促进自噬，进而影响心肌梗死后心脏纤维化的新机制	研究未涉及Kdm4a对心室破裂的影响	探究心肌梗死后心脏纤维化的调控机制	早衰成纤维细胞(PSFs)	心血管疾病	心肌梗死	scRNA-seq, ChIP-seq, ChIP-PCR	NA	基因表达数据	NA
616	2025-06-08	Exploring the Latent Information in Spatial Transcriptomics Data via Multi-View Graph Convolutional Network Based on Implicit Contrastive Learning 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413545 PMID:40304359	研究论文	本文提出了一种名为STMIGCL的新框架，通过多视图图卷积网络和隐式对比学习来探索空间转录组数据中的潜在信息，以提高空间域识别的准确性	引入了多视图图卷积网络和隐式对比学习方法，结合注意力机制自适应整合不同视图，显著提升了空间域识别的精度	未明确提及具体局限性	提高空间转录组数据中空间域识别的准确性，增强对组织微环境和生物过程的理解	空间转录组数据	生物信息学	NA	多视图图卷积网络、隐式对比学习、注意力机制	GCN（图卷积网络）	空间转录组数据	未明确提及样本数量
617	2025-06-08	MRAS: Master Regulator Analysis of Alternative Splicing 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414493 PMID:40323145	研究论文	介绍了一种名为MRAS的计算方法，用于识别在剪接调控网络中起核心作用的关键剪接因子	提出MRAS方法，能够高效识别调控层次顶端的剪接因子，这些因子的异常表达会导致剪接紊乱并驱动表型变异性	未明确说明方法在特定肿瘤类型或数据规模下的局限性	研究剪接调控网络中的关键调控因子及其在疾病表型中的作用	剪接因子及其在肿瘤发生、发展、转移和治疗抵抗中的作用	生物信息学	肿瘤	单细胞RNA测序	计算模型	RNA-seq数据	NA
618	2025-06-08	Immune-epithelial-stromal networks define the cellular ecosystem of the small intestine in celiac disease 2025-Jun, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-025-02146-2 PMID:40328997	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和空间转录组学技术，揭示了乳糜泻（CD）中小肠免疫-上皮-基质网络的细胞生态系统	首次在CD中展示了上皮细胞向祖细胞状态的转变、干扰素驱动的转录反应，以及黏膜T细胞的数值和功能变化，并通过空间转录组学定义了传统组织学评分未捕获的转录生态位	样本量相对较小（35名参与者进行单细胞转录组学，20名进行空间转录组学），且研究结果可能受到活检样本来源的限制	阐明乳糜泻中小肠免疫-上皮-基质相互作用的细胞和分子机制	乳糜泻患者的肠道活检样本	单细胞转录组学	乳糜泻	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学	NA	转录组数据	35名参与者（单细胞转录组学），20名参与者（空间转录组学）
619	2025-06-08	A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma 2025-Jun, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-025-02161-3 PMID:40399607	研究论文	应用单细胞空间转录组学揭示健康和哮喘状态下气道壁的细胞生态系统及其相互作用	首次通过单细胞空间转录组学技术揭示了气道壁在健康和哮喘状态下的空间细胞景观，发现了促炎细胞生态系统的存在及其独特的空间分布	研究样本可能不足以代表所有哮喘亚型，且未探讨长期治疗对这些细胞生态系统的影响	揭示气道壁在健康和哮喘状态下的细胞空间分布及其相互作用机制	健康和哮喘患者的气道壁组织	单细胞生物学	哮喘	单细胞空间转录组学	NA	空间转录组数据	健康和哮喘患者的气道壁组织样本（具体数量未提及）
620	2025-06-08	Efficacy and biomarker analysis of neoadjuvant disitamab vedotin (RC48-ADC) combined immunotherapy in patients with muscle-invasive bladder cancer: A multi-center real-world study 2025-Jun, iMeta IF:23.7Q1 DOI:10.1002/imt2.70033 PMID:40469503	研究论文	本研究评估了RC48-ADC联合免疫治疗在肌肉浸润性膀胱癌患者中的疗效，并通过单细胞RNA测序探索了潜在的预测生物标志物	首次在真实世界研究中评估RC48-ADC联合免疫治疗对MIBC患者的疗效，并通过单细胞RNA测序发现C3亚群中HER2和HSPA1A的联合检测可作为疗效预测策略	样本量相对有限，特别是单细胞RNA测序仅分析了11个样本	评估RC48-ADC联合免疫治疗的疗效并探索预测生物标志物	肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)患者	肿瘤学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	临床数据和单细胞RNA测序数据	102名患者(整体研究) + 11个样本(单细胞RNA测序)