单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-04-24 |
The Predictive Value of Neutrophil Extracellular Trap-Related Risk Score in Prognosis and Immune Microenvironment of Colorectal Cancer Patients
2025-Apr, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01135-4
PMID:38580851
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research paper | 该研究构建了一个基于中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）相关基因的风险评分模型，用于预测结直肠癌（CRC）患者的预后和免疫微环境特征 | 首次在CRC中构建NET相关风险评分模型，并揭示其与患者预后、疾病分期及免疫微环境的相关性 | 研究基于回顾性数据库分析，需要前瞻性临床研究验证 | 开发结直肠癌预后预测工具并探索免疫微环境特征 | 结直肠癌患者 | digital pathology | colorectal cancer | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA-CRC数据库及GEO验证数据集中的结直肠癌样本 |
| 602 | 2024-12-30 |
Correction to: Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae694
PMID:39731783
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2025-04-24 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed Functional Conjunctival Keratinocytes Loss via TGF-β-Wnt/β-Catenin Signaling in Sjögren's Syndrome Related Dry Eye
2025-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.4.43
PMID:40238113
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究Sjögren综合征相关干眼病中结膜角质形成细胞的功能丧失及其机制 | 揭示了TGF-β-Wnt/β-catenin信号轴在Sjögren综合征相关干眼病中调控功能性角质形成细胞丧失的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明Sjögren综合征相关干眼病中结膜的功能变化及其分子机制 | Sjögren综合征小鼠模型的结膜组织 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、T细胞受体测序（TCR sequencing）、Western blot、免疫荧光、多重免疫组化（mIHC）、流式细胞术 | 小鼠模型 | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | Sjögren综合征小鼠模型的结膜组织 |
| 604 | 2025-04-24 |
Exploring Multi-Target Therapeutic Strategies for Glioblastoma via Endogenous Network Modeling
2025-Apr-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26073283
PMID:40244148
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研究论文 | 本研究通过系统生物学视角，基于内源网络的动态分析，探索了多靶点治疗胶质母细胞瘤的策略 | 利用内源网络建模和单细胞RNA测序数据验证，识别出多种潜在有效的多靶点组合，强调了多靶点干预策略在癌症治疗中的必要性 | 临床实验和实施多靶点组合治疗存在困难，研究尚未进行实际临床验证 | 探索胶质母细胞瘤的多靶点治疗策略 | 胶质母细胞瘤 | 系统生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 内源网络模型 | RNA测序数据 | NA |
| 605 | 2025-04-24 |
Molecular Mechanisms of Propofol-Induced Cognitive Impairment: Suppression of Critical Hippocampal Pathways
2025-Apr, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70070
PMID:40265596
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研究论文 | 本研究探讨了丙泊酚通过抑制海马区关键信号通路导致认知功能障碍的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序和高通量转录组分析揭示丙泊酚抑制HTR1A/GRIA2/PIK3R1信号通路的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性有待进一步验证 | 阐明丙泊酚引起术后认知功能障碍的分子机制 | 丙泊酚对海马区神经重塑的影响 | 神经科学 | 术后认知功能障碍 | scRNA-seq, 高通量转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） |
| 606 | 2025-04-24 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Heterogeneity of Hepatic Natural Killer Cells and Identifies the Cytotoxic Natural Killer Subset in Schistosomiasis Mice
2025-Mar-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26073211
PMID:40244063
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research paper | 该研究通过单细胞测序技术揭示了血吸虫病小鼠肝脏自然杀伤细胞（NK细胞）的异质性，并鉴定出具有细胞毒性的NK细胞亚群 | 首次利用单细胞测序技术系统解析了血吸虫病模型中肝脏NK细胞的异质性，并发现Thy1NK亚群可作为抗肝纤维化的靶细胞 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体样本中验证 | 探究血吸虫病肝脏纤维化过程中NK细胞的异质性及其功能亚群 | 血吸虫病小鼠模型中的肝脏NK细胞 | digital pathology | schistosomiasis | single-cell sequencing, RT-qPCR | NA | single-cell RNA sequencing data | 未感染小鼠和感染4周/6周小鼠的肝脏NK细胞 |
| 607 | 2025-04-24 |
Identification of a Cancer Stem Cell-Related Gene Signature in Hepatocellular Carcinoma Based on Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Analysis
2025-Mar-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26072933
PMID:40243557
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研究论文 | 本研究通过结合TCGA和ICGC的临床数据集以及bulk RNA测序数据，利用GSE156625单细胞RNA测序数据集，探索了肝癌中癌症干细胞（CSCs）生物标志物的预后意义 | 开发了一个基于九个特定BCSCs的预后风险模型，揭示了高风险患者总体生存率较低，并描述了肿瘤微环境中免疫细胞的组成及基因表达水平和突变率的显著差异 | 需要进一步的实验验证这些CSCs在疾病进展中的作用 | 探索肝癌中癌症干细胞（CSCs）生物标志物的预后意义 | 肝癌（LIHC）患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和bulk RNA测序 | 预后风险模型 | RNA测序数据 | TCGA和ICGC的临床数据集及GSE156625单细胞RNA测序数据集 |
| 608 | 2025-04-24 |
IL-24 promotes atopic dermatitis-like inflammation through driving MRSA-induced allergic responses
2025-Mar-08, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae030
PMID:38752989
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research paper | 研究发现IL-24通过驱动MRSA诱导的过敏反应促进特应性皮炎样炎症 | 首次揭示IL-24在MRSA诱导的特应性皮炎发展中的关键作用及其机制 | 研究主要基于动物模型，需要进一步在人类患者中验证 | 探究MRSA在特应性皮炎发病机制中的作用 | 角质形成细胞和特应性皮炎动物模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA |
| 609 | 2025-03-08 |
Erratum for the Research Article "Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria" by A. Sarfatis et al
2025-Mar-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx0881
PMID:40048545
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2025-04-24 |
Recent Innovations and Technical Advances in High-Throughput Parallel Single-Cell Whole-Genome Sequencing Methods
2025-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400789
PMID:38979872
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综述 | 本文综述了高通量平行单细胞全基因组测序方法的最新技术进展 | 总结了高通量单细胞全基因组测序在策略设计、数据效率、平行处理平台等方面的技术进步 | 总成本限制 | 探讨高通量单细胞全基因组测序方法的技术进步及其应用 | 人类基因组 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞全基因组测序(scWGS) | NA | 基因组数据 | NA |
| 611 | 2025-04-24 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
|
研究论文 | 本文更新并扩展了先前关于心脏神经生物学分子和细胞基础的白皮书，重点关注心脏自主神经发育、新的细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 探讨了患者特异性干细胞在研究心脏交感神经损伤中的应用，以及新型成像技术和空间转录组学在治疗心脏自主神经功能障碍中的潜在作用 | 文中提到了一些未解决的问题和争议领域 | 研究心脏疾病的分子和细胞神经心脏病学基础 | 心脏自主神经系统、细胞内通路和神经可塑性 | 神经心脏病学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、新型成像技术 | NA | 分子和细胞数据 | NA |
| 612 | 2025-04-24 |
Discrete placental gene expression signatures accompany diabetic disease classifications during pregnancy
2025-Mar, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.05.014
PMID:38763341
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序技术，揭示了妊娠期糖尿病亚型与胎盘基因表达特征的关联 | 结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，首次在胎盘细胞亚群和组织微环境中识别出糖尿病亚型特异的基因表达特征 | 样本量相对有限，且未考虑其他可能影响基因表达的因素 | 探究不同类型糖尿病（GDMA1、GDMA2和T2DM）妊娠期胎盘基因表达的差异特征 | 妊娠期糖尿病患者的胎盘组织 | 基因组学 | 妊娠期糖尿病 | bulk RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组学、RT-qPCR | 机器学习模型（未明确具体类型） | 基因表达数据 | 初始队列54例（bulk RNA-seq），验证队列122例（RT-qPCR） |
| 613 | 2025-04-24 |
Deciphering programmed cell death mechanisms in osteosarcoma for prognostic modeling
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24269
PMID:38622876
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研究论文 | 该研究探讨了程序性细胞死亡（PCD）基因在骨肉瘤（OS）中的作用，并利用先进的生物信息学方法开发了一个预后模型 | 通过单细胞测序数据和大样本测序数据结合，识别了PCD相关基因的表达和通路评分，并开发了一个基于五个关键基因的预后模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 研究PCD基因在骨肉瘤中的作用并开发预后模型 | 骨肉瘤（OS）患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序、ssGSEA、LASSO算法 | 预后模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TARGET数据库的测序数据 |
| 614 | 2025-04-24 |
Platelet-mediated circulating tumor cell evasion from natural killer cell killing through immune checkpoint CD155-TIGIT
2025-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000934
PMID:38779918
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研究论文 | 该研究揭示了循环肿瘤细胞（CTCs）如何通过与血小板结合上调CD155-TIGIT免疫检查点逃避免疫监视的机制 | 首次发现CTC-血小板聚集通过CD155-TIGIT通路逃逸NK细胞杀伤的机制，并证明靶向该通路可恢复免疫监视功能 | 研究主要聚焦于肝癌患者样本，对其他癌症类型的普适性需要进一步验证 | 探究循环肿瘤细胞在血液传播过程中逃避免疫监视的分子机制 | 循环肿瘤细胞（CTCs）与血小板的相互作用 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、体外/体内功能实验 | NA | 基因表达数据、临床生存数据 | 多种癌症类型的血液样本（含肝癌患者队列） |
| 615 | 2025-04-24 |
Bidirectional epigenetic editing reveals hierarchies in gene regulation
2025-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02213-3
PMID:38760566
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研究论文 | 开发了一种名为CRISPRai的双向表观遗传编辑系统，用于研究非编码元件和遗传互作 | CRISPRai系统首次实现了在同一细胞中同时对两个位点进行激活和抑制扰动，结合单细胞RNA测序技术，能够研究混合单细胞群体中的扰动效应 | NA | 研究基因调控层次结构和非编码疾病相关变异的机制 | 造血谱系转录因子SPI1和GATA1的遗传互作，以及IL2基因在Jurkat T细胞、原代T细胞和CAR T细胞中的调控机制 | 基因编辑 | NA | CRISPRa/CRISPRi, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Jurkat T细胞、原代T细胞和CAR T细胞 |
| 616 | 2025-04-24 |
Integrative analysis of the bladder cancer from a cell cycle NCAM1 perspective at both single cell and bulk resolution
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24260
PMID:38581187
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research paper | 该研究通过单细胞和批量分辨率分析膀胱癌（BLCA）的细胞周期相关基因，特别是NCAM1，以探索其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次从细胞周期NCAM1的角度整合分析膀胱癌，并发现NCAM1在BLCA细胞增殖中的抑制作用 | 临床预后评估有限，且研究主要基于转录组和scRNA-seq数据，缺乏更广泛的临床验证 | 探索膀胱癌的细胞周期相关基因作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 膀胱癌（BLCA）患者和细胞系 | digital pathology | bladder cancer | scRNA-seq, RT-qPCR, CCK-8细胞活力测定 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-BLCA和GSE190888队列的数据，具体样本数量未明确说明 |
| 617 | 2025-04-24 |
Kurarinone regulates Th17/Treg balance and ameliorates autoimmune uveitis via Rac1 inhibition
2025-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.03.013
PMID:38522752
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研究论文 | 研究苦参酮通过抑制Rac1调节Th17/Treg平衡并改善自身免疫性葡萄膜炎的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术构建苦参酮治疗实验性自身免疫性葡萄膜炎的高分辨率免疫调控图谱，并揭示其通过抑制Rac1和Id2/Pim1轴调节Th17/Treg平衡的新机制 | 研究主要基于动物模型，人体临床试验数据有限 | 探究苦参酮对自身免疫性葡萄膜炎的治疗作用及其免疫调节机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型和葡萄膜炎患者外周血单个核细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，siRNA干扰，选择性抑制剂 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)动物模型 | 基因表达数据，细胞表型数据 | 未明确说明具体样本量，涉及EAU小鼠模型和人类PBMCs |
| 618 | 2025-04-24 |
Single-cell transcriptomic sequencing identifies subcutaneous patient-derived xenograft recapitulated medulloblastoma
2025-Mar, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12399
PMID:38477441
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序比较了皮下患者来源异种移植(sPDX)、颅内患者来源异种移植(iPDX)和基因工程小鼠模型(GEMM)在单细胞水平上对髓母细胞瘤(MB)的再现能力 | 首次在单细胞水平比较MB实验模型，为不同研究目的提供模型选择依据 | 样本量较小(6例患者)，仅针对SHH和G3亚型MB | 比较不同MB模型在单细胞水平再现原发肿瘤的能力 | 髓母细胞瘤患者样本(sPDX/iPDX/GEMM模型) | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq反卷积分析 | sPDX/iPDX/GEMM | RNA测序数据 | 6例患者样本(各建2种PDX模型)+3个GEMM模型 |
| 619 | 2025-04-24 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-02-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40036846
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研究论文 | 介绍了一个名为TcEVdb的数据库，用于从单细胞转录组数据中探索T细胞来源的小细胞外囊泡（TcEVs）的表达和聚类 | 首次构建了一个全面的TcEV数据库，整合了来自多个项目和样本的单细胞RNA测序数据，提供了TcEV的分泌活动指数、聚类可视化、差异表达基因和通路富集分析等功能 | 数据库的构建依赖于现有的单细胞RNA测序数据，可能受到数据质量和覆盖范围的限制 | 探索T细胞来源的小细胞外囊泡（TcEVs）的异质性及其在免疫调节和肿瘤微环境中的作用 | T细胞来源的小细胞外囊泡（TcEVs） | 生物信息学 | 多种疾病（包括弥漫性大B细胞淋巴瘤等23种疾病条件） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 来自21个项目的221个样本中的277,265个EV液滴，涵盖51种T细胞类型、9种组织来源和23种疾病条件 |
| 620 | 2025-04-24 |
Instrumental variable estimation for compositional treatments
2025-02-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89204-9
PMID:39934389
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研究论文 | 本文提出了一种在工具变量设置下处理成分数据的因果估计方法 | 首次在工具变量框架下考虑成分数据的因果解释，并开发了考虑成分样本空间特殊结构的多元方法 | 在合成和真实微生物组数据上的比较分析显示了该方法的优势和局限性 | 为成分数据提供有效的因果效应估计框架 | 成分数据(如生态学中的物种丰度、单细胞测序数据中的细胞类型组成、微生物组研究中的扩增子丰度数据) | 统计学 | NA | 统计数据分析与回归技术 | NA | 成分数据 | 合成数据和真实微生物组数据 |