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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-06-07 |
P2Y12 receptor in trigeminal ganglion contributes to CFA-induced mechanical allodynia in mice
2026-May-22, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究探讨P2Y12受体在三叉神经节中对完全弗氏佐剂诱导的小鼠机械性异常疼痛的作用 | 首次揭示P2Y12受体通过调控三叉神经节内卫星胶质细胞和巨噬细胞的神经免疫反应参与口面部炎性疼痛,为靶向外周镇痛提供新方向 | 仅在小鼠模型中验证,未涉及人类样本;机制研究主要集中于细胞和分子层面,缺乏对下游信号通路的全面解析 | 探究P2Y12受体在三叉神经节中是否参与调控口面部炎性疼痛及其外周作用机制 | 小鼠口面部炎性疼痛模型(CFA注射)及三叉神经节内的卫星胶质细胞和巨噬细胞 | 神经科学 | 口面部炎性疼痛 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、体内药物抑制、体外细胞刺激 | NA | 基因表达、图像(免疫组化/免疫荧光)、行为学数据(机械性异常疼痛) | 小鼠样本(具体数量未提及,涉及多组实验) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 602 | 2026-06-07 |
Urinary single-cell transcriptomics in kidney transplantation: Elucidation of donor-recipient cellular dynamics and fibrogenic stress
2026-May-14, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.05.007
PMID:42134416
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研究论文 | 通过尿液单细胞转录组学揭示肾移植中供体-受体细胞动态与纤维化应激机制 | 首次建立高质量尿液单细胞RNA测序工作流程,并通过基因型反卷积准确区分供体与受体细胞来源,为非侵入性监测肾移植排斥和纤维化提供新方法 | 样本量较小(仅12名受者),且未指定 | 探索尿液单细胞RNA测序在肾移植中捕获细胞动态和纤维化应激的可行性 | 12名不同临床状态的肾移植受者尿液样本 | 数字病理学 | 肾移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名肾移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 603 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics demonstrate that Taohe Chengqi decoction alleviates sepsis-associated acute lung injury by modulating immunometabolism
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121283
PMID:41619860
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析,揭示桃核承气汤通过调节免疫代谢缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次整合单细胞转录组学和代谢组学方法,系统阐明桃核承气汤通过调节糖酵解通路改善肺泡-毛细血管屏障、重塑免疫微环境治疗脓毒症相关急性肺损伤的免疫代谢机制 | 研究仅基于单批次桃核承气汤,需要多批次验证以确保结果的可重复性和临床相关性 | 探索桃核承气汤治疗脓毒症相关急性肺损伤的免疫代谢机制 | 桃核承气汤及脂多糖诱导的脓毒症相关急性肺损伤小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肺损伤 | 非靶向代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 代谢组学数据, 单细胞转录组数据 | 脂多糖诱导的脓毒症相关急性肺损伤小鼠模型(具体样本量未提供) | NA | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 604 | 2026-06-07 |
TENT5A Maintains MYC mRNA Stability to Enhance Osteosarcoma Stemness
2026-May-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4635
PMID:41616089
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研究论文 | 本文发现TENT5A通过维持MYC mRNA稳定性增强骨肉瘤干细胞特性,并揭示其作为潜在治疗靶点的作用机制 | 首次鉴定非经典RNA结合poly(A)聚合酶TENT5A通过PAP/OAS1结构域直接结合MYC mRNA并延长poly(A)尾,从而稳定MYC转录本,解释骨肉瘤中MYC拷贝数增加与转录活性不一致的现象 | 未明确TENT5A在其他肿瘤中是否发挥类似作用,且临床前模型向临床转化的可行性有待进一步验证 | 探究骨肉瘤中MYC持续激活的转录后调控机制,并寻找可干预的分子靶点 | 骨肉瘤细胞系、原位异种移植模型及患者来源类器官 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 多组学分析、单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 包含骨肉瘤患者样本及多种体外和体内模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 605 | 2026-06-07 |
scHILL: deciphering individual-level immune cell heterogeneity with single-cell RNA sequencing data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag286
PMID:42248580
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研究论文 | 提出一个集成掩码自编码器和多层感知器的框架,用于从单细胞RNA测序数据中解析个体水平的免疫细胞异质性 | 通过数据增强预训练的掩码自编码器实现自监督特征学习,结合多层感知器生成个体水平的评分以量化细胞和基因的功能重要性,有效解决了小样本量挑战 | 未提及具体限制 | 开发一个通用框架,从单细胞RNA测序数据中表征个体水平的免疫细胞异质性,推动个性化医疗 | 患有感染性疾病、自身免疫性疾病和癌症个体的免疫细胞 | 机器学习 | 感染性疾病、自身免疫性疾病、癌症 | 单细胞RNA测序 | 掩码自编码器、多层感知器 | 单细胞基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 606 | 2026-06-07 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-Targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
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研究论文 | 循环肿瘤细胞预测靶向DLL3的双特异性抗体Tarlatamab的疗效反应 | 首次利用单细胞RNA测序分析小细胞肺癌活检组织中DLL3表达的异质性,并通过循环肿瘤细胞区分患者为DLL3阳性或DLL3低表达,前瞻性队列中CTC的DLL3表达预测Tarlatamab临床获益具有高灵敏度和特异性 | 样本量较小(20例患者),未提及长期随访数据,耐药机制分析仅限于部分病例 | 评估循环肿瘤细胞上DLL3表达作为小细胞肺癌患者Tarlatamab治疗疗效预测生物标志物的可行性 | 小细胞肺癌患者 | 医学图像分析 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | 20例患者的前瞻性队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 607 | 2026-06-07 |
An integrative multi-cohort transcriptomic study reveals cell cycle- and adhesion-related hub genes as diagnostic biomarkers for pulmonary arterial hypertension
2026-May, Advances in biological regulation
DOI:10.1016/j.jbior.2026.101145
PMID:41576688
|
研究论文 | 通过整合多个GEO数据集和实验验证,发现细胞周期和黏附相关关键基因CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1可作为肺动脉高压的诊断生物标志物 | 首次综合多队列转录组分析并结合单细胞测序数据及动物模型验证,鉴定出CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1四个关键基因作为PAH的多基因诊断标志物 | NA | 筛选并验证肺动脉高压相关关键基因作为无创诊断生物标志物 | 肺动脉高压患者血液或组织样本及尼古丁诱导的肺动脉高压小鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 基因表达芯片、单细胞测序、RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE117261, GSE24988, GSE53408, GSE113439, GSE33463, GSE228644)及小鼠模型样本 | NA | 批量RNA-seq | NA | NA |
| 608 | 2026-06-07 |
MICALL2 promotes angiogenesis of colorectal cancer by regulating the EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA axis
2026-May, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117757
PMID:41617093
|
研究论文 | MICALL2通过调控EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA轴促进结直肠癌血管生成 | 首次发现MICALL2在结直肠癌上皮细胞中高表达并与血管生成相关通路(如VEGFA/VEGFR2信号)相关,揭示其通过抑制EGFR溶酶体降解来稳定EGFR,进而激活PI3K/AKT通路并上调KLF5和VEGFA表达的新机制 | 未明确提及具体局限性,但可能包括体内外模型缺乏临床样本验证或药物抑制的特异性问题 | 探索结直肠癌血管生成的新型分子机制和潜在治疗靶点 | 结直肠癌上皮细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、免疫组化、体外细胞功能实验和体内动物模型 | NA | 基因表达数据、图像、细胞功能数据 | 未明确具体样本量,涉及scRNA-seq、WGCNA、免疫组化及体内外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2026-06-07 |
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115676
PMID:41621472
|
研究论文 | 本研究利用小鼠模型证明单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进缺血性卒中后的视网膜损伤 | 首次阐明单核细胞来源的巨噬细胞在缺血性卒中后视网膜损伤中的关键作用及其IL-1β依赖机制 | 主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;可能未涵盖所有潜在的免疫细胞亚型 | 探究缺血性卒中后视网膜损伤的炎症机制 | 利用中脑动脉闭塞模型模拟缺血性卒中的小鼠视网膜 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | 涉及小鼠样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 视网膜bulk RNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台 |
| 610 | 2026-06-07 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
|
研究论文 | 该文章报告了一例18岁女性患者携带KRAS和STAT5B体细胞嵌合变异,导致混合性获得性免疫缺陷的病例 | 首次报道两种不同的获得性免疫缺陷(Ras相关自身免疫性白细胞增殖性疾病和非克隆性STAT5B功能获得性疾病)共同导致混合临床表型 | NA | 研究一例携带KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异的独特病例,探讨其与免疫缺陷疾病的关联 | 一名18岁女性患者,患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长单细胞RNA测序、长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 1例患者的纵向血液和组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长和长读长单细胞RNA测序 |
| 611 | 2026-06-07 |
Multi-omics identifies an epithelial-B cell cross-talk that drives functional B cell diversion in breast cancer lymph node metastasis
2026-May, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112394
PMID:41610965
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示乳腺癌淋巴结转移中上皮细胞与B细胞间的相互作用,导致B细胞功能分化 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体内功能模型,系统描绘乳腺癌转移过程中B细胞状态和相互作用 | NA | 阐明乳腺癌淋巴结转移中B细胞的功能异质性和作用机制 | 乳腺癌原发肿瘤和转移淋巴结中的B细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 配对的原发肿瘤和转移淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 612 | 2026-06-07 |
Depression-related chronic stress promotes ovarian cancer progression via metabolic dysfunction and IRF1-mediated immune suppression
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106471
PMID:41605304
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研究论文 | 探讨抑郁相关慢性应激如何通过代谢功能障碍和IRF1介导的免疫抑制促进卵巢癌进展 | 首次揭示抑郁相关慢性应激通过下调IRF1表达、重塑免疫-代谢微环境促进卵巢癌进展的机制,并提出抗抑郁药联合化疗作为潜在治疗策略 | 未明确说明 | 研究抑郁与卵巢癌进展的关系及抗抑郁药物的潜在治疗价值 | 卵巢癌患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 卵巢癌患者样本及小鼠慢性应激模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 613 | 2026-06-07 |
Spatial Multiomics Reveal Insights Into ADC Efficacy
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70190
PMID:42083302
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综述 | 本文综述了空间多组学技术在抗体-药物偶联物疗效解析中的应用,提出了整合空间读数与机器学习驱动的分析框架 | 创新性在于提出将空间转录组学和蛋白质组学与机器学习/深度学习相结合的综合分析框架,用于预测ADC疗效、毒性和指导下一代ADC设计 | 未明确说明局限性,推测包括空间多组学技术的成本、通量和数据分析复杂性等挑战 | 探讨空间多组学技术在解析ADC作用机制和耐药性中的应用,提出整合分析框架以改善患者分层和治疗设计 | 转移性尿路上皮癌患者中的ADC治疗反应和耐药机制 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 多重蛋白成像, RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 空间转录组数据, 蛋白成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 614 | 2026-06-07 |
Mapping of Neutrophils in Cancers: Insights From Spatial Omics Technologies
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70194
PMID:42095467
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综述 | 本文综述了空间组学技术在癌症中性粒细胞研究中的应用 | 首次系统总结了空间转录组学在肿瘤中性粒细胞研究中的技术进展和应用,并提出了优化测序策略和样本处理的建议 | 未详细讨论不同空间组学技术平台之间的具体性能比较 | 探讨空间组学技术如何深化对肿瘤中性粒细胞在肿瘤微环境中调控机制的理解 | 肿瘤中性粒细胞 | 数字病理学 | 多种癌症类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 615 | 2026-06-07 |
TNBC Spatial Transcriptomic Analysis across Clinical States Reveals Subtype-Specific Networks and Immunosuppressive Niches
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0808
PMID:42100798
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研究论文 | 通过GeoMx空间转录组学分析不同临床状态的三阴性乳腺癌,揭示亚型特异性网络和免疫抑制微环境 | 首次整合分子亚型、免疫浸润和空间结构,提出免疫-空间分子亚型(ISMS)框架,揭示三阴性乳腺癌在疾病进展中的异质性和免疫-空间可塑性 | NA | 通过空间转录组学分析三阴性乳腺癌在非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移中的转录组和免疫空间变化,以阐明疾病进展机制 | 三阴性乳腺癌患者的非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多个临床状态的肿瘤样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组平台 |
| 616 | 2026-06-07 |
scGHSOM: A Hierarchical Framework for Single-Cell Data Clustering and Visualization
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3593632
PMID:40811172
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研究论文 | 开发了一个基于层次生长自组织映射的框架scGHSOM,用于单细胞数据的分层聚类和可视化 | 提出了显著属性识别算法以最小化簇内变异并最大化簇间变异,并引入簇特征图和簇分布图两种新可视化工具 | 仅在三个CyTOF数据集上验证性能,未在更多样化的单细胞RNA测序数据上测试 | 解决高维单细胞数据分析中的层次聚类和可视化挑战 | 单细胞数据集,包括CyTOF和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | CyTOF, 单细胞RNA测序 | 层次生长自组织映射 (GHSOM) | 高维单细胞数据 | 三个CyTOF数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 617 | 2026-06-07 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 研究补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化减轻COPD气道黏液高分泌的机制 | 首次发现补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化来减轻COPD气道黏液高分泌,并利用DARTS技术、单细胞测序和分子对接等先进方法阐明其作用机制 | 未提及具体局限性,可能包括实验动物模型与人体差异、BFF-4的临床转化可行性待验证 | 探究补肺方通过TRIM56介导的泛素化缓解COPD气道黏液高分泌的机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠及香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、免疫共沉淀、质谱、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | COPD小鼠和体外气道上皮细胞(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 618 | 2026-06-07 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞驱动淋巴结节转移性肢端黑色素瘤的肿瘤微环境相互作用 | 首次识别出SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并发现S100A8细胞在转移性肿瘤中为优势恶性亚群,以及抗SPP1疗法在体内可诱导巨噬细胞表型转换并减少肿瘤负荷 | 未明确说明研究局限性 | 研究肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移进展中的作用 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配的相邻正常样本,分为淋巴结转移阳性与阴性组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 治疗初治的肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 619 | 2026-06-07 |
SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data
2026-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04069-z
PMID:42015285
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研究论文 | 提出SpaNiche空间生态位分析框架,用于探索空间转录组数据中的共定位模式和细胞间相互作用 | 利用图正则化联合非负矩阵分解整合细胞丰度和配体-受体表达信息,并通过共识聚类定义“生态型”,增强多样本空间转录组数据分析的实用性 | 未明确说明 | 开发计算框架以揭示空间转录组中的细胞共定位模式和推断潜在配体-受体相互作用 | 结直肠癌、前列腺癌和早期阿尔茨海默病的脑皮层组织 | 数字病理学 | 结直肠癌, 前列腺癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 620 | 2026-06-07 |
Deciphering the role of circulating inflammatory proteins in myocarditis: Novel strategies for targeted therapy
2026-Apr-15, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2026.134198
PMID:41605333
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research paper | 使用孟德尔随机化和单细胞RNA测序解析循环炎症蛋白在心肌炎中的作用,为靶向治疗提供新策略 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞转录组分析,鉴定了LIF作为心肌炎的因果性炎症蛋白和潜在治疗靶点 | 研究依赖公开数据集,可能受样本异质性和统计效力限制;LIF在心肌炎中的具体机制仍需实验验证 | 探究循环炎症蛋白与心肌炎的因果关系,并评估其作为治疗靶点的转化潜力 | 91种循环炎症蛋白与心肌炎之间的因果关系 | machine learning | cardiovascular disease | GWAS, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA(基于公开GWAS汇总统计数据和GEO数据集,具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |