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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6161 | 2025-12-18 |
Current Knowledge and Future Directions for Cyclospora cayetanensis Research and Its Surrogates
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70327
PMID:41347294
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综述 | 本文回顾了环孢子虫的当前研究现状,包括其发生、传播、检测方法、宿主-寄生虫相互作用、遗传学和补救策略,并评估了使用替代生物来填补研究空白 | 评估了替代生物在环孢子虫研究中的应用,并探讨了新兴工具如宏基因组学、单细胞测序和AI驱动的生物信息学在克服研究障碍方面的潜力 | 替代生物无法完全复制环孢子虫的生物学特性,限制了基于替代研究的可转化性,且基因组组装存在空白,限制了系统发育和功能分析 | 提高环孢子虫的检测能力、风险评估并指导政策制定,以减轻环孢子虫病的公共卫生负担 | 环孢子虫及其替代生物(如艾美球虫和隐孢子虫) | NA | 环孢子虫病 | 分子检测、宏基因组学、单细胞测序、AI驱动的生物信息学 | NA | 基因组数据、环境样本数据、食品样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6162 | 2025-12-18 |
A New Orthotopic Mouse Model of Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan, Head & neck
DOI:10.1002/hed.70001
PMID:40785350
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研究论文 | 本研究建立了一种新型且可重复的喉鳞状细胞癌原位小鼠模型,用于促进喉癌相关研究 | 开发了一种新型原位小鼠模型,能更真实地模拟人体免疫系统反应和肿瘤生物学演化过程 | NA | 建立喉鳞状细胞癌的原位小鼠模型,以研究喉癌的分子机制 | C57BL/6小鼠(n=16)和喉癌患者样本 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞测序,磁共振成像,光学体内三维成像,HE染色 | NA | 图像,测序数据 | 16只小鼠,15例成功模型,以及喉癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6163 | 2025-12-18 |
Exploring Single-Cell and Multi-Omics Technologies and Their Role in Unravelling Tumor Heterogeneity of Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-17, Journal of liver cancer
DOI:10.17998/jlc.2025.11.29
PMID:41402037
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综述 | 本文综述了单细胞和多组学技术在揭示肝细胞癌肿瘤异质性中的变革性作用 | 强调了单细胞和空间组学技术如何通过高分辨率分析重塑HCC研究,推动生物标志物、治疗靶点和患者分层策略的发现 | 高成本、技术要求高以及可及性有限,特别是在资源有限的环境中,是其广泛应用的主要障碍 | 探讨单细胞和多组学技术在解析肝细胞癌肿瘤异质性中的作用 | 肝细胞癌(HCC) | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、表观基因组学、多组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6164 | 2025-12-18 |
Integrating RNA-seq and Single-Cell RNA-seq to Uncover Transcriptional Signature of Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-16, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11310-0
PMID:41402612
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6165 | 2025-12-18 |
POU5F1 upregulates SPP1 to sustain stem-like traits and malignant phenotypes via JAK1/STAT3 in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004469
PMID:41403335
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研究论文 | 本研究揭示了POU5F1通过上调SPP1并激活JAK1/STAT3信号通路,维持透明细胞肾细胞癌的干细胞样特性和恶性表型 | 首次系统验证了POU5F1-SPP1-JAK1/STAT3轴在ccRCC中的作用机制,为同时靶向肿瘤细胞和癌症干细胞提供了新的治疗策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本量有限(30对组织),需要更大规模的临床验证 | 探究SPP1在透明细胞肾细胞癌中的功能及其上游调控机制 | 透明细胞肾细胞癌组织样本(30对)、786-O/769-P细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq、功能实验(增殖、迁移、肿瘤球形成)、分子机制研究(ChIP、Co-IP、双荧光素酶报告基因检测)、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床生存数据 | 30对ccRCC组织样本、2种细胞系(786-O/769-P)、裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6166 | 2025-12-18 |
Prognostic role of stress granule-related Gene signatures in pancreatic ductal adenocarcinoma: insights from 101-combination machine learning and single-cell sequencing
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004458
PMID:41403347
|
研究论文 | 本研究通过结合机器学习与单细胞测序技术,开发并验证了一个基于应激颗粒相关基因的胰腺导管腺癌预后风险模型 | 首次利用101种机器学习算法组合识别预后相关的应激颗粒基因,并结合单细胞测序分析关键细胞类型与细胞间通讯 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证 | 探究应激颗粒在胰腺导管腺癌中的机制,重点关注风险分层与治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合(包括Cox回归等) | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个PDAC数据集,包括单细胞数据集GSE197177 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6167 | 2025-12-18 |
Natural killer cell infiltration elicits gender-dependent dichotomous clinical outcomes in urothelial carcinoma
2025-Dec-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.70196
PMID:41368948
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研究论文 | 本研究通过多队列回顾性分析,揭示了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中具有性别依赖性的临床影响 | 首次系统阐明了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中的性别二态性临床作用,并揭示了其背后不同的功能状态和肿瘤微环境特征 | 研究为回顾性设计,需前瞻性研究验证;机制探索尚不完整 | 探究自然杀伤细胞如何介导尿路上皮癌的性别差异及其临床意义 | 尿路上皮癌患者 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 免疫组化、转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 885名患者(671名男性,214名女性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6168 | 2025-12-18 |
Targeting KRAS Inhibitor-Resistant Pancreatic Cancer with an MUC1-C Antibody-Drug Conjugate
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2333
PMID:41086055
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研究论文 | 本研究探讨了MUC1-C蛋白在介导胰腺导管腺癌细胞对KRAS抑制剂耐药中的作用,并评估了抗MUC1-C抗体药物偶联物的治疗效果 | 揭示了KRAS G12D抑制通过激活MUC1-C/NF-κB p65自诱导通路上调MUC1-C蛋白,进而驱动耐药的新机制,并首次证明抗MUC1-C ADC能有效克服KRAS抑制剂耐药 | 研究主要基于KRAS G12D突变模型,未涵盖其他KRAS突变类型;临床前模型的转化潜力需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌对KRAS抑制剂耐药的机制,并开发针对耐药的新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及PDAC患者肿瘤样本 | 癌症生物学与治疗学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学染色、体外和体内药效评估 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、药效数据 | 3个PDAC KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及未明确数量的PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6169 | 2025-12-18 |
Identification of diagnostic and prognostic phospholipid biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis via machine learning and in vivo validation
2025-Dec-12, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00845-3
PMID:41388329
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研究论文 | 本研究通过整合多个数据集的微阵列数据,利用机器学习技术构建了特发性肺纤维化(IPF)的诊断和预后模型,并鉴定了磷脂相关的生物标志物 | 结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习方法,首次开发了基于8个基因的诊断模型和11个基因的预后模型,并通过单细胞测序和动物模型验证了关键基因GABARAPL1和UNC13B在IPF中的下调表达 | 需要进一步验证以评估其临床适用性 | 鉴定特发性肺纤维化(IPF)的诊断和预后磷脂生物标志物 | 特发性肺纤维化(IPF)患者和IPF小鼠模型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 微阵列数据分析,加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自八个数据集的微阵列数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6170 | 2025-12-18 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces the tumor-infiltrating Treg phenotype for tumor growth
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424251122
PMID:41343674
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤微环境中前列腺素E2通过EP2/EP4信号通路诱导肿瘤浸润性调节性T细胞表型,从而促进肿瘤生长的核心机制 | 首次鉴定出PGE2-EP2/EP4-cAMP-PKA通路是诱导跨物种、跨肿瘤类型保守的TI-Treg表型的共同机制,并证实其在人和小鼠模型中的关键作用 | 研究主要聚焦于PGE2信号通路,肿瘤微环境中可能还存在其他诱导TI-Treg表型的机制未被探讨 | 探究肿瘤微环境中诱导肿瘤浸润性调节性T细胞独特表型的分子机制及其对肿瘤生长的影响 | 小鼠和人类的调节性T细胞(包括诱导性Tregs和天然Tregs)、Lewis肺癌模型、鼻咽癌患者单细胞数据 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、鼻咽癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、细胞功能数据 | 小鼠肿瘤模型、人类鼻咽癌患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6171 | 2025-12-18 |
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Dec-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084
PMID:40695620
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪肝相关肝癌中独特的肿瘤微环境免疫抑制机制,并发现靶向TNFSF14-TNFRSF14信号轴可增强免疫治疗效果 | 首次结合单细胞转录组、质谱流式细胞术和两种独立的空间转录组学平台,系统解析了SLD-HCC的免疫微环境,并识别出Treg-CAF通过TNFSF14-TNFRSF14信号介导的相互作用是驱动免疫治疗抵抗的关键机制 | 研究样本量相对有限(22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC),且主要基于观察性数据和动物模型验证,临床转化仍需进一步大规模临床试验证实 | 探究脂肪肝相关肝癌的免疫微环境特征、免疫抑制机制及免疫治疗抵抗的原因,以寻找新的治疗靶点 | 脂肪肝相关肝细胞癌患者的肿瘤组织、HCC动物模型以及接受免疫治疗的患者队列 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、空间转录组学、多重免疫组织化学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间定位数据、组织图像数据 | 22例SLD-HCC患者和31例非SLD-HCC患者的肿瘤样本,以及103例患者的独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6172 | 2025-12-18 |
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2025-Dec, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287463
PMID:39639676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体进行了转录组学分析,揭示了不同细胞簇在激素表达、营养感知机制等方面的差异 | 首次通过CRISPR-Cas9基因编辑技术构建CHGA-Venus标记的人类小肠类器官模型,并结合10X单细胞RNA测序技术,系统性地绘制了人类肠内分泌细胞的转录组图谱,发现了不同细胞类型在营养感知受体(如GPBAR1、FFAR1、FFAR2、OR51E1、SLC5A1)上的差异表达模式 | 研究基于类器官模型,可能无法完全模拟体内肠内分泌细胞的复杂微环境;样本来源仅限于十二指肠和回肠,未涵盖整个肠道区域;肠内分泌细胞在肠道上皮中占比仅约1%,在现有单细胞图谱中代表性不足 | 绘制人类肠内分泌细胞的单细胞转录组图谱,比较不同细胞类型的相似性和差异,以促进针对肠内分泌轴的药物开发 | 人类十二指肠和回肠活检组织来源的类器官中的肠内分泌细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病、肥胖症、肠道疾病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑、流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类十二指肠和回肠活检组织来源的类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Chromium | 10X单细胞RNA测序平台 |
| 6173 | 2025-12-18 |
Imbalances in adrenal hormones and their effects on bone metabolism
2025-Dec-01, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ25-0117
PMID:40545362
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综述 | 本文综述了肾上腺激素失衡对骨代谢的影响,重点关注自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症和嗜铬细胞瘤/副神经节瘤三种病理状态,以及衰老过程中的激素变化 | 总结了近期类固醇谱分析和单细胞转录组分析的新发现,揭示了肾上腺皮质腺瘤中多种类固醇激素共同影响骨代谢,而非单一激素的作用 | 本文为综述性文章,未提供新的原始研究数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨肾上腺激素失衡对骨健康的影响机制 | 肾上腺激素(皮质醇、醛固酮、儿茶酚胺等)与骨代谢的相互作用 | NA | 骨质疏松症 | 类固醇谱分析,单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6174 | 2025-12-18 |
Randomized controlled clinical trial of Shenzhuo Formula in the treatment of macroalbuminuria in diabetic kidney disease and its inflammation-modulating mechanisms
2025-Dec, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf031
PMID:41393243
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研究论文 | 一项随机对照临床试验评估了肾浊方治疗糖尿病肾病大量蛋白尿的疗效,并探讨了其调节炎症的机制 | 首次在随机双盲对照试验中评估肾浊方对糖尿病肾病大量蛋白尿患者的疗效,并结合Olink炎症蛋白组学、单细胞RNA测序及体内实验揭示其通过下调CX3CL1和MCP-1介导的抗炎作用机制 | 样本量相对较小(120例患者),研究周期为24周,长期疗效和安全性需进一步验证 | 评估肾浊方治疗糖尿病肾病大量蛋白尿的疗效和安全性,并探究其抗炎作用机制 | 糖尿病肾病伴大量蛋白尿患者(120例)及KK-Ay小鼠肾脏组织 | NA | 糖尿病肾病 | Olink炎症蛋白组学,单细胞RNA测序,体内实验 | NA | 临床数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据 | 120例患者(肾浊方组57例,厄贝沙坦组63例)及KK-Ay小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6175 | 2025-12-18 |
Targeting B cells in IgA nephropathy: from pathogenic insight to therapeutic horizon
2025-Dec, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf322
PMID:41393859
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综述 | 本文综述了IgA肾病中B细胞的靶向治疗,从病理机制到治疗前景 | 聚焦于B细胞在IgA肾病中的致病作用,并探讨了靶向黏膜免疫系统、B细胞生存和分化途径的新型治疗策略,包括晚期开发中的药物和新兴细胞及双特异性平台 | NA | 探讨IgA肾病中B细胞靶向治疗的机制、进展和未来方向 | IgA肾病(IgAN)患者 | NA | IgA肾病 | 单细胞转录组学、药物基因组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6176 | 2025-12-18 |
Uncovering the genetic architecture of pungency, carotenoids, and flavor in Capsicum chinense via TWAS-mGWAS integration and spatial transcriptomics
2025-Dec, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf243
PMID:41393923
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学、全基因组关联分析(GWAS)、转录组关联分析(TWAS)和空间转录组学,揭示了辣椒果实辛辣度、类胡萝卜素和风味的遗传与调控基础 | 首次在辣椒中整合GWAS、TWAS和空间转录组学分析,并利用CRISPR/Cas9基因编辑在番茄中验证候选基因功能 | NA | 解析辣椒果实辛辣度、颜色和风味等品质性状的遗传与调控机制 | 244个不同辣椒种质资源及其果实组织 | 植物遗传学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联研究(GWAS)、转录组关联研究(TWAS)、空间转录组学(Stereo-seq)、CRISPR/Cas9基因编辑、广泛靶向代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、空间转录组数据 | 244个辣椒种质资源 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 6177 | 2025-12-18 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583414
PMID:38496543
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研究论文 | 本研究通过对玉米和拟南芥茎尖干细胞进行大规模单细胞RNA测序分析,揭示了保守的干细胞调控因子及其与产量性状的关联 | 首次成功捕获并分析了植物茎尖干细胞的大规模单细胞转录组数据,通过跨物种比较和突变体分析发现了新的干细胞调控因子家族 | 植物干细胞获取困难,实验方法需要精细的组织解剖和优化的细胞回收协议 | 揭示植物茎尖干细胞的调控因子,为作物工程提供理论基础以提高生产力 | 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 数千个表达干细胞标记基因的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6178 | 2025-12-18 |
Spatial Transcriptomics of the Respiratory System
2025-02, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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综述 | 本文综述了呼吸系统中空间转录组学技术的应用,包括常用工作流程、优势与局限,以及机器学习和人工智能在空间数据分析中的最新进展 | 整合了空间转录组学技术与计算工具(如机器学习和深度学习),以解决肺部细胞类型在三维空间中相互作用的理解挑战,并展示了在肺发育、COVID-19、肺癌和纤维化等疾病中的新见解 | NA | 理解呼吸系统中细胞类型在三维空间中的相互作用,以促进对肺部功能(如气流、气体交换和屏障功能)在健康和疾病状态下的认识 | 呼吸系统,包括肺部和气道 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 机器学习,深度学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6179 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular diversity and gene expression dynamics in maize root development
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1666531
PMID:41393869
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了玉米根尖发育过程中的细胞多样性和基因表达动态 | 首次在玉米根尖中应用单细胞RNA测序技术,构建了高分辨率的转录图谱,并发现了与拟南芥和水稻不同的激素相关基因表达模式 | 研究仅针对玉米根尖组织,未涵盖整个根系系统;单细胞测序技术本身存在技术噪音和细胞捕获偏差 | 阐明玉米根发育在单细胞分辨率下的分子基础 | 玉米根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6180 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals breast cancer heterogeneity and identifies TCP1 as a therapeutic target in breast cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20451
PMID:41394417
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析乳腺癌异质性,识别出TCP1作为潜在治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序高分辨率解析乳腺癌肿瘤微环境异质性,首次发现KRT17阳性亚群与患者生存相关,并验证TCP1在乳腺癌细胞迁移和侵袭中的关键作用 | 样本量相对有限(68例),且主要基于回顾性分析,需要进一步前瞻性研究验证 | 解析乳腺癌肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者肿瘤样本(68例)及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),拷贝数变异推断(inferCNV) | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 68例乳腺癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |