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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6141 | 2025-10-06 |
ENPP1 promotes immune suppression, drug resistance, and adverse outcomes in bladder cancer: Potential for targeted therapy
2025-Jun, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2025.03.001
PMID:40058167
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨ENPP1在膀胱癌中的促癌作用及其对免疫微环境和化疗耐药性的影响 | 首次系统揭示ENPP1在膀胱癌中通过调节免疫细胞浸润和凋亡通路促进肿瘤进展和化疗耐药的新机制 | 样本量有限(36例本地临床队列),需要更大规模研究验证 | 探究ENPP1在膀胱癌进展、免疫调节和化疗耐药中的作用机制 | 膀胱癌患者组织样本、TCGA和GEO数据库数据、UMUC3和J82膀胱癌细胞系 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、免疫组织化学、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | TCGA-BLCA数据集、GEO数据集、36例本地膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6142 | 2025-10-06 |
Characterizing the Cellular Constituents of Proximal Airway Disease in Granulomatosis With Polyangiitis
2025-Jun, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.1197
PMID:40062629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肉芽肿性多血管炎患者近端气道病变的细胞组成 | 首次在GPA气道瘢痕中发现独特的CD4-/CD8-炎症性T细胞亚群 | 单中心研究,样本量有限 | 表征GPA近端气道病变的细胞组成和疾病发病机制 | GPA患者及疾病对照组的近端气道组织样本 | 单细胞组学 | 肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | Monocle 3 | 单细胞转录组数据 | GPA患者9例,特发性声门下狭窄7例,插管后近端狭窄5例,对照10例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6143 | 2025-10-06 |
Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression
2025-06, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154129
PMID:40174762
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研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定苯并[a]芘暴露与肝细胞癌进展相关的共享信号通路和核心靶点 | 首次系统识别了BaP与HCC关联的169个潜在靶点,并通过分子对接验证了核心靶点与BaP的高结合稳定性 | 研究主要基于数据库分析和计算预测,缺乏实验验证 | 探索苯并[a]芘在肝癌进展中的潜在分子机制 | 苯并[a]芘暴露相关的分子靶点和肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析、分子对接、单细胞测序分析 | PPI网络分析、分子对接模型 | 基因组数据、蛋白质互作数据、临床数据 | 基于多个公共数据库(ChEMBL、TCGA等)的数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
6144 | 2025-10-06 |
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03011-7
PMID:40211026
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研究论文 | 本研究构建了一个多维度策略来预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后 | 开发了整合基因组特征和肿瘤免疫微环境的综合模型,发现序列熵和突变特征比传统TMB具有更好的预测性能 | 样本量较小(60例患者),需要更大规模验证 | 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胆道癌患者 | 生物信息学 | 胆道癌 | 520基因panel测序,多重循环细胞因子检测,单细胞转录组分析 | LASSO算法,Cox回归,集成模型 | 基因组测序数据,细胞因子数据,单细胞转录组数据 | 60例接受抗PD-1治疗的晚期胆道癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,靶向测序 | NA | NA |
6145 | 2025-10-06 |
Alternative splicing in autism spectrum disorder: Recent insights from mechanisms to therapy
2025-Jun, Asian journal of psychiatry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.ajp.2025.104501
PMID:40273800
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综述 | 本文综述了自闭症谱系障碍中异常选择性剪接的机制、调控因子及基于RNA剪接的治疗策略 | 系统整合了长读长测序、单细胞测序、空间转录组学和CRISPR-Cas系统等新兴技术对ASD中选择性剪接研究的新见解 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体细节 | 探讨异常剪接机制在自闭症谱系障碍发病中的作用及治疗策略开发 | 自闭症谱系障碍相关的选择性剪接事件和剪接调控因子 | 自然语言处理 | 自闭症谱系障碍 | 长读长测序,单细胞测序,空间转录组学,CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
6146 | 2025-10-06 |
Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation
2025-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0268350
PMID:40438388
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研究论文 | 本研究通过飞秒激光光刺激方法调控细胞内钙信号,探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)过程中的作用机制 | 首次采用紧密聚焦的飞秒激光扫描技术激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调,实时观察EMT细胞在体内的动态变化 | 研究仅使用前列腺癌PC3细胞构建皮下肿瘤模型,未验证其他肿瘤类型;PLCG2抑制剂对转移细胞无显著影响的具体机制尚不明确 | 探究PLCG2是否作为EMT的直接驱动因子及其在肿瘤发展中的作用 | 前列腺癌PC3细胞及由其构建的皮下肿瘤模型 | 单细胞分析 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,飞秒激光光刺激 | NA | 单细胞转录组数据 | 前列腺癌PC3细胞构建的皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6147 | 2025-06-01 |
Unravelling heart failure cellular signalling heterogeneity with spatial transcriptomics
2025-May-30, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf311
PMID:40444774
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6148 | 2025-06-01 |
Single-cell sequencing atlas construction for tracheobronchial adenoid cystic carcinoma
2025-May-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06622-z
PMID:40448199
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6149 | 2025-10-06 |
An Arabidopsis single-nucleus atlas decodes leaf senescence and nutrient allocation
2025-May-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.024
PMID:40220755
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研究论文 | 本研究通过构建拟南芥单核转录组图谱,揭示了叶片衰老和养分分配的系统性调控机制 | 首次构建了包含20个组织、超过100万个核的拟南芥单核转录组图谱;开发了两种分子指标在单细胞分辨率下量化叶片细胞衰老状态;通过时间分辨采样揭示了主要叶细胞类型间高度协调的衰老进程 | 研究仅限于拟南芥模型植物,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 解析叶片衰老和养分分配的系统性调控机制 | 拟南芥多个发育阶段的20个组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 单核转录组数据 | 超过100万个核,来自20个组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6150 | 2025-10-06 |
Unraveling the mechanisms of irAEs in endometrial cancer immunotherapy: insights from FAERS and scRNA-seq data
2025-May-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02723-3
PMID:40436981
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研究论文 | 整合FAERS数据库和单细胞转录组数据研究子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良事件的机制 | 首次将FAERS数据库与单细胞RNA测序数据相结合,揭示PD-1抑制剂通过补偿性激活CXCR4和CXCR6通路导致免疫相关不良事件的新机制 | 需要进一步的临床研究和机制研究来验证这些发现 | 研究子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良事件的潜在机制 | 子宫内膜癌患者和免疫检查点抑制剂相关不良事件 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 数据库分析 | Weibull模型, 贝叶斯置信传播神经网络, 伽马泊松收缩器 | 单细胞转录组数据, 药物不良事件报告数据 | 从FAERS数据库中检索21,838,627份药物相关报告,其中2,202份与免疫检查点抑制剂相关 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6151 | 2025-10-06 |
Deciphering the cellular and molecular landscape of cervical cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-28, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00948-z
PMID:40437003
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术解析宫颈癌进展过程中的细胞和分子景观 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学方法,首次系统揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44信号轴在宫颈癌免疫抑制微环境中的关键作用 | 未明确说明样本数量和研究队列的多样性限制 | 全面表征宫颈癌进展过程中的肿瘤微环境动态变化 | 正常宫颈组织、HPV感染宫颈组织、高级别鳞状上皮内病变和浸润性宫颈癌组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
6152 | 2025-10-06 |
Natural killer cells adopt an activated and decidual-like phenotype after autologous hematopoietic stem cell transplantation in children with cancer
2025-May-28, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-00911-w
PMID:40437214
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研究论文 | 本研究揭示了儿童癌症患者在自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞呈现活化及蜕膜样表型的动态变化 | 首次在儿童自体造血干细胞移植后发现自然杀伤细胞获得短暂性蜕膜样表型,并阐明IL-15和TGF-β联合诱导这一独特表型的机制 | 样本量较小(13名儿童患者),缺乏长期随访数据 | 探究儿童癌症患者自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞的动态功能变化 | 13名儿童癌症患者(3-11岁)及8名健康成人供者 | 免疫学 | 癌症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞因子检测 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据,血浆细胞因子数据 | 13名儿童患者,8名健康成人供者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6153 | 2025-10-06 |
ITIH4 attenuates acute lung injury by Fe-containing particulate matter in mice via Hippo pathway in type II alveolar epithelial cells
2025-May-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03256-z
PMID:40437524
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研究论文 | 本研究探讨了ITIH4通过调节II型肺泡上皮细胞中的Hippo通路减轻含铁颗粒物诱导的小鼠急性肺损伤 | 首次揭示ITIH4通过调节II型肺泡上皮细胞中Hippo通路来减轻含铁颗粒物诱导的急性肺损伤 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究ITIH4对含铁颗粒物诱导的急性肺损伤的保护作用及机制 | C57BL/6JNarl和B6.Sftpc-CreERT2;Ai14(RCL-tdT)-D小鼠 | 呼吸系统疾病研究 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, ICP-MS, 单细胞ICP-MS | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞计数数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6154 | 2025-10-06 |
AAV-mediated silencing of Sox4 leads to long-term amelioration of liver phenotypes in mouse models of Alagille syndrome
2025-May-28, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.04.033
PMID:40446945
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研究论文 | 本研究通过AAV介导的Sox4基因沉默,在小鼠Alagille综合征模型中实现了肝脏表型的长期改善 | 首次证明AAV介导的Sox4基因沉默可改善Alagille综合征肝脏表型,并发现Sox4/SOX4在患者肝脏中表达增加 | 研究基于小鼠模型,临床转化仍需进一步验证 | 寻找治疗Alagille综合征胆汁管缺乏的新治疗靶点 | Alagille综合征小鼠模型和人类肝脏样本 | 基因治疗 | Alagille综合征 | 单细胞RNA测序, RNAscope, 腺相关病毒介导的基因沉默 | NA | 基因表达数据, 组织学图像, 血清化学数据 | 临床前小鼠模型和人类肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6155 | 2025-10-06 |
Comparative analysis of the syncytiotrophoblast in placenta tissue and trophoblast organoids using snRNA sequencing
2025-May-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.101170
PMID:40424181
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研究论文 | 通过单核RNA测序比较胎盘组织与滋养层类器官中合体滋养层的异质性 | 首次在合体滋养层中鉴定出三种核亚型,并建立滋养层类器官作为研究模型 | RYBP敲除未影响细胞融合但导致基因表达改变,机制尚未完全阐明 | 解析合体滋养层分化过程及核异质性 | 人类胎盘组织和滋养层类器官 | 单细胞组学 | 胎盘发育 | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 早孕期胎盘、足月胎盘及滋养层类器官样本 | NA | 单核RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
6156 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing reveals the role of local renin-angiotensin system in regulating ovarian physiological cycle and promoting PCOS
2025-May-27, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02531-8
PMID:40425574
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示卵巢局部肾素-血管紧张素系统在调节生理周期和促进多囊卵巢综合征中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示卵巢局部RAS在发情周期中的动态变化,并发现AngII与IRS1/PI3K/AKT通路串扰导致胰岛素抵抗的潜在机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究卵巢局部肾素-血管紧张素系统在生理周期和PCOS发病机制中的作用 | 小鼠卵巢细胞 | 单细胞组学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | PCOS小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠卵巢单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6157 | 2025-10-06 |
Deep exploration of logical models of cell differentiation in human preimplantation embryos
2025-May-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00537-7
PMID:40425601
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研究论文 | 开发了SCIBORG计算工具,通过整合单细胞转录组数据和先验知识网络来推断基因调控的布尔网络模型 | 提出SCIBORG方法,使用逻辑编程处理单细胞数据高维搜索空间,无需扰动数据即可构建动态布尔网络模型 | 模型验证仅通过计算机模拟进行,细胞分类准确率为67%-73%,缺乏实验验证 | 模拟人类胚胎植入前滋养外胚层细胞分化过程中的基因调控网络 | 人类胚胎植入前滋养外胚层细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组测序,布尔网络建模,逻辑编程 | 布尔网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6158 | 2025-10-06 |
Novel ribosome biogenesis-related biomarkers and therapeutic targets identified in psoriasis
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03833-8
PMID:40425712
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析鉴定出11个与核糖体生物合成相关的银屑病生物标志物,并验证了MPHOSPH6和ISG20的潜在治疗价值 | 首次系统性地将核糖体生物合成过程与银屑病发病机制联系起来,并通过多组学数据分析鉴定出关键生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能性研究确认机制 | 探索核糖体生物合成在银屑病发病机制中的作用,并寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 银屑病患者转录组数据 | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,差异表达分析,加权基因共表达网络分析,蛋白质相互作用分析,分子对接 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
6159 | 2025-10-06 |
A robust multi-scale clustering framework for single-cell RNA-seq data analysis
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03603-6
PMID:40425750
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据分析的鲁棒多尺度聚类框架 | 结合多维PCA降维、K-means聚类和加权集成元聚类方法,并通过自注意力驱动的Transformer模型优化聚类性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据高维度、稀疏性和噪声带来的聚类挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, K-means, PCA | 基因表达数据 | 八个单细胞RNA测序数据集(包括PBMC5k数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6160 | 2025-10-06 |
Optimized culturing yields high success rates and preserves molecular heterogeneity, enabling personalized screening for high-grade gliomas
2025-May-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00946-1
PMID:40425813
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研究论文 | 开发了一种优化的高级别胶质瘤细胞培养方案,显著提高培养成功率并保留肿瘤分子异质性 | 结合超声抽吸和3D组织片段培养方法,实现96%的高成功率,并首次证明超声抽吸来源的培养物具有更高转录组异质性 | 研究样本数量有限(114例),且仅针对高级别胶质瘤 | 建立可靠的患者来源胶质瘤细胞培养模型以支持精准医疗 | 高级别胶质瘤患者手术标本 | 数字病理 | 脑癌 | 单细胞测序,拷贝数分析 | 细胞培养模型 | 基因组数据,转录组数据 | 114例高级别胶质瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |