单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 6121 - 6140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6121 | 2024-12-01 |
Cellular diversity of human inner ear organoids revealed by single-cell transcriptomics
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202524
PMID:39612289
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类内耳类器官的细胞多样性 | 本文讨论了通过单细胞转录组学分析提供的新见解，有助于定义理解内耳发育的新研究路径 | 目前尚不清楚这些类器官在多大程度上模拟了体内人类内耳的发育和细胞组成 | 研究人类内耳类器官的细胞多样性及其在发育、听力损失和眩晕相关突变以及新疗法中的应用 | 人类内耳类器官及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6122 | 2024-12-07 |
Alpha-2-macroglobulin mitigates glucocorticoid-induced osteonecrosis via Keap1/Nrf2 pathway activation
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了α-2-巨球蛋白通过激活Keap1/Nrf2信号通路减轻糖皮质激素诱导的股骨头坏死的作用 | 首次揭示了α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其通过Keap1/Nrf2通路减轻症状的机制 | 研究主要基于动物模型和患者样本的转录组和蛋白质组分析，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其机制 | 糖皮质激素诱导的股骨头坏死及其相关生物标志物 | NA | 股骨头坏死 | 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 患者样本和糖皮质激素诱导的股骨头坏死大鼠模型 |
| 6123 | 2024-12-07 |
Taurine ameliorates radiation-induced oxidative stress in bone marrow mesenchymal stromal cells and promotes osteogenesis
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了牛磺酸对辐射诱导的骨髓间充质干细胞氧化应激的影响及其促进成骨的作用 | 首次揭示了牛磺酸代谢在辐射后下颌骨间充质细胞中的激活，并通过补充牛磺酸显著改善了辐射小鼠的生存率和下颌骨成骨 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨牛磺酸在辐射诱导的下颌骨坏死中的作用及其潜在的治疗价值 | 骨髓间充质干细胞和辐射小鼠 | NA | NA | scRNA-Seq 和代谢组学 | NA | NA | 辐射和未辐射的骨髓间充质干细胞，以及辐射和未辐射的小鼠 |
| 6124 | 2024-12-07 |
[Revealing research progress for immunological characteristics of chronic hepatitis B applying single-cell RNA sequencing technology]
2024-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在慢性乙型肝炎免疫特征研究中的进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示慢性乙型肝炎中免疫细胞转录组微小变化，为探索免疫发病机制和潜在治疗靶点提供技术支持 | NA | 探讨慢性乙型肝炎的免疫机制和潜在治疗靶点 | 慢性乙型肝炎患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6125 | 2024-12-07 |
Hexokinase 2 expression in apical enterocytes correlates with inflammation severity in patients with inflammatory bowel disease
2024-10-23, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03710-7
PMID:39444028
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研究论文 | 研究了炎症性肠病患者中顶端肠上皮细胞的己糖激酶2表达与炎症严重程度的关系 | 首次系统研究了己糖激酶2表达与炎症性肠病活动性的关系，并提出了靶向己糖激酶2抑制作为潜在治疗途径 | 研究基于两个独立队列的数据，但样本量和队列数量有限 | 探讨己糖激酶2表达与炎症性肠病炎症严重程度的关系 | 炎症性肠病患者的顶端肠上皮细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 两个独立队列的炎症性肠病患者，包括克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 |
| 6126 | 2024-12-07 |
Integrative bioinformatics analysis for identifying the mitochondrial-related gene signature associated with immune infiltration in premature ovarian insufficiency
2024-10-08, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03675-7
PMID:39379953
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，识别与早发性卵巢功能不全（POI）相关的线粒体基因特征及其与免疫浸润的关系 | 首次揭示了线粒体功能与免疫反应在POI发展中的相互作用，并识别出可能的生物标志物和治疗药物 | 研究主要基于转录组数据和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨线粒体功能与免疫反应在早发性卵巢功能不全中的相互作用 | 早发性卵巢功能不全（POI）及其相关的线粒体基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 生殖疾病 | 转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括POI模型和人类颗粒细胞（GCs）在内的多种细胞类型 |
| 6127 | 2024-12-07 |
Early amyloid-induced changes in microglia gene expression in male APP/PS1 mice
2024-03, Journal of neuroscience research
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/jnr.25295
PMID:38515329
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研究论文 | 研究了阿尔茨海默病模型小鼠中早期淀粉样蛋白诱导的微胶质细胞基因表达变化 | 首次揭示了早期淀粉样蛋白诱导的微胶质细胞基因表达变化，并使用单细胞RNA测序技术分析了从稳态到CD11c阳性微胶质细胞的转录轨迹 | 研究仅限于雄性APP/PS1小鼠，且样本量较小 | 探究阿尔茨海默病早期淀粉样蛋白诱导的微胶质细胞基因表达变化 | 雄性APP/PS1小鼠的海马微胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个月大的APP/PS1小鼠和野生型同窝小鼠的海马微胶质细胞 |
| 6128 | 2024-12-07 |
Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations
2024-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576093
PMID:38328127
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研究论文 | 本文开发了一种生成模型和贝叶斯推断方法，用于解决现有RNA速度算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题，并在细胞周期研究中验证了其有效性 | 提出了一个生成模型和贝叶斯推断方法，将速度场和流形估计结合在一个统一的框架中，以一致地识别自主动力系统的参数 | NA | 开发一种新的RNA速度推断方法，以解决现有算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题 | 细胞周期中的基因调控动力学 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA速度 | 生成模型 | 基因表达数据 | 多个样本和全基因组Perturb-seq数据 |
| 6129 | 2024-12-07 |
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00883-1
PMID:37225873
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综述 | 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 | 提出了血流诱导的内皮细胞重编程（FIRE）作为潜在的致动脉粥样硬化机制 | NA | 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 | NA | NA | 使用小鼠模型进行研究 |
| 6130 | 2024-12-06 |
Subtype-specific transcription factors affect polyamine metabolism and the tumor microenvironment in breast cancer
2025-Feb, Cancer innovation
DOI:10.1002/cai2.138
PMID:39629335
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研究论文 | 研究了转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢和肿瘤微环境的影响 | 首次确定了三个亚型特异性转录因子，它们调控高风险乳腺癌亚型中的三个多胺代谢基因，并影响肿瘤微环境 | 研究仅限于乳腺癌亚型，未涵盖其他癌症类型 | 探讨转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢基因的调控及其对肿瘤微环境的影响 | 乳腺癌亚型中的多胺代谢基因及其转录因子 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及四种乳腺癌亚型的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 |
| 6131 | 2024-12-06 |
Dietary caloric restriction protects experimental autoimmune uveitis by regulating Teff/Treg balance
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111279
PMID:39628557
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研究论文 | 研究探讨了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其机制 | 首次详细研究了饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响，并揭示了其通过调节Teff/Treg平衡来减轻疾病的机制 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨饮食热量限制对实验性自身免疫性葡萄膜炎的治疗潜力 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | 小鼠颈部引流淋巴结样本 |
| 6132 | 2024-12-06 |
A transcriptome-based risk model in sepsis enables prognostic prediction and drug repositioning
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111277
PMID:39628572
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研究论文 | 本研究开发了一种基于转录组特征的脓毒症风险模型，用于早期风险分层和药物再定位 | 该模型在脓毒症诊断和预后方面表现优异，揭示了高风险患者的免疫抑制状态和低风险患者对氢化可的松的反应不佳，并通过单细胞转录组分析进一步阐明了四个基因在免疫细胞类型中的表达模式和效应 | NA | 开发一种基于转录组特征的脓毒症风险模型，用于早期风险分层和药物再定位 | 脓毒症患者的风险分层和药物再定位 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组分析 | 风险评分模型 | 转录组数据 | NA |
| 6133 | 2024-12-06 |
Complete Genomic Landscape Reveals Hidden Evolutionary History and Selection Signature in Asian Water Buffaloes (Bubalus bubalis)
2024-Dec-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407615
PMID:39630943
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研究论文 | 研究揭示了亚洲水牛（Bubalus bubalis）的完整基因组图谱，揭示了其隐藏的进化历史和选择特征 | 首次对470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组进行了测序和整合，揭示了驯化和生产力的遗传决定因素 | NA | 识别亚洲水牛驯化和生产力的遗传决定因素 | 驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 470个驯化河流和沼泽水牛及其假定祖先野生水牛的基因组 |
| 6134 | 2024-12-06 |
Dual function of PHF16 in reinstating homeostasis of murine intestinal epithelium after crypt regeneration
2024-Dec-02, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.08.009
PMID:39232563
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研究论文 | 研究报告了PHF16在肠道上皮再生后恢复稳态中的双重功能 | 首次揭示了PHF16通过调节HBO1介导的组蛋白H3K14乙酰化和CDC73的泛素化来恢复肠道上皮稳态 | NA | 研究PHF16在肠道上皮再生后的稳态恢复中的作用 | PHF16在小鼠肠道上皮再生中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 (RNA-seq), ATAC测序 | NA | RNA, ATAC | Phf16小鼠的肠道器官样本 |
| 6135 | 2024-12-06 |
Neutrophil-based single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to explore a prognostic model of sepsis
2024-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80791-7
PMID:39622858
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型 | 本研究首次结合单细胞测序和转录组测序数据，构建了一个基于中性粒细胞的脓毒症预后模型，并展示了其强大的预测准确性 | 本研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探索脓毒症的分子机制，并构建一个有效的预后模型 | 脓毒症患者的中性粒细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序、转录组测序 | Lasso回归模型 | 单细胞数据、基因表达数据 | 脓毒症患者的单细胞和基因表达数据来自公开数据库，具体样本数量未提及 |
| 6136 | 2024-12-06 |
Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2024-Dec-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07308-w
PMID:39622943
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析左心房组织，揭示了心房颤动患者中巨噬细胞和单核细胞的异质性及其与非免疫细胞的相互作用，并识别出功能性生物标志物 | 首次通过单细胞和核RNA测序技术分析左心房组织，揭示了心房颤动患者中巨噬细胞和单核细胞的异质性及其与非免疫细胞的相互作用，并发现Amphiregulin作为心房颤动的替代标志物 | 研究样本量较小，且仅限于左心房组织，未来需要更大规模的研究来验证结果 | 识别心房颤动患者中巨噬细胞和单核细胞的异质性及其与非免疫细胞的相互作用，并寻找功能性生物标志物 | 心房颤动患者左心房组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞和核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 心房颤动患者和健康对照组的左心房组织样本 |
| 6137 | 2024-12-06 |
Multi-omics joint screening of biomarkers related to M2 macrophages in gastric cancer
2024-Dec-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01623-8
PMID:39623254
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研究论文 | 本研究通过多组学联合筛选胃癌中与M2巨噬细胞相关的生物标志物，并构建诊断模型 | 本研究首次通过多组学分析筛选出与M2巨噬细胞相关的三个生物标志物，并构建了基于这些标志物的诊断模型 | 本研究主要基于公共数据库的数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探索胃癌中M2巨噬细胞作为生物标志物的潜力，并构建诊断模型 | 胃癌中的M2巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、差异表达基因筛选（DESeq2）、差异表达蛋白筛选（limma） | 诊断模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 4146个差异表达基因和1946个差异表达蛋白 |
| 6138 | 2024-12-06 |
Cross-species single-cell analysis reveals divergence and conservation of peripheral blood mononuclear cells
2024-Dec-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11030-6
PMID:39623297
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研究论文 | 本文通过跨物种单细胞转录组测序分析，揭示了外周血单核细胞在不同物种间的差异和保守性 | 首次在12个物种中进行外周血单核细胞的单细胞转录组比较分析，揭示了免疫细胞在进化过程中的保守性和特异性 | NA | 研究免疫细胞在不同物种间的进化保守性和差异 | 外周血单核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 12个物种的外周血单核细胞 |
| 6139 | 2024-12-06 |
SMART: spatial transcriptomics deconvolution using marker-gene-assisted topic model
2024-Dec-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03441-1
PMID:39623485
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SMART的空间转录组解卷积方法，通过标记基因辅助主题模型同时推断每个点的细胞类型特异性基因表达谱和细胞组成 | SMART方法在现实环境中优于现有方法，并提供两阶段方法以增强对细胞亚型的性能 | NA | 开发一种新的空间转录组解卷积方法，以提高细胞类型特异性基因表达和细胞组成的推断精度 | 空间转录组数据中的细胞类型特异性基因表达和细胞组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 主题模型 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 6140 | 2024-12-06 |
Prediction of Tumor-Associated Macrophages and Immunotherapy Benefits Using Weakly Supervised Contrastive Learning in Breast Cancer Pathology Images
2024-Dec, Journal of imaging informatics in medicine
DOI:10.1007/s10278-024-01166-y
PMID:38886290
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研究论文 | 本文提出了一种结合对比学习和弱监督学习的方法，用于从乳腺癌病理图像中预测肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 本文首次将对比学习和弱监督学习应用于病理图像分析，以量化预测肿瘤浸润免疫细胞，特别是巨噬细胞的浸润水平 | 本文的实验主要基于乳腺癌数据，未来需要验证该方法在其他癌症类型中的适用性 | 研究旨在通过病理图像分析预测肿瘤免疫微环境中的免疫细胞浸润情况，以及评估免疫治疗效果 | 研究对象为乳腺癌病理图像中的肿瘤相关巨噬细胞和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对比学习 | 对比学习模型 | 图像 | 两个独立的乳腺癌队列和空间转录组数据 |