单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6101 - 6120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6101 | 2025-10-06 |
Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-07-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.06.001
PMID:38942029
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析人源多能干细胞分化为角膜缘干细胞过程中的异质性 | 首次在hPSC-LSC分化过程中发现并描述了四种先前未知的细胞状态（中胚层样或未分化亚群） | 研究仅涉及三种hPSC细胞系，样本规模有限 | 解析hPSC分化为角膜缘干细胞过程中的细胞异质性 | 人源多能干细胞分化的角膜缘干细胞 | 单细胞组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种hPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6102 | 2025-10-06 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids reveal tubular epithelial pathobiology of heterozygous HNF1B-associated dysplastic kidney malformations
2024-06-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.04.011
PMID:38788724
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞衍生的肾脏类器官揭示HNF1B杂合突变导致肾发育不良的肾小管上皮病理机制 | 首次利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建HNF1B杂合突变肾脏类器官模型，发现谷氨酸能信号通路在肾脏发育中的新作用 | 类器官模型可能无法完全模拟体内肾脏发育的复杂性 | 研究HNF1B杂合突变导致肾发育不良的病理机制 | 人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 发育生物学 | 肾发育不良 | CRISPR-Cas9基因编辑, RNA测序 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据 | 来自HNF1B相关肾发育不良家族的iPSCs和基因编辑的ESCs | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6103 | 2025-10-06 |
The Contribution of Meckel's Cartilage-Derived Type II Collagen-Positive Cells to the Jawbone Development and Repair
2024-Jun-05, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241259059
PMID:38836522
|
研究论文 | 本研究揭示了源自米克尔软骨的II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的关键作用 | 首次发现II型胶原阳性细胞来源于原始米克尔软骨，并在胚胎期和出生后阶段均参与下颌骨成骨过程 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的具体作用机制 | 小鼠下颌骨组织 | 发育生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，他莫昔芬诱导CreER系统 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胚胎期10.5天小鼠下颌骨 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6104 | 2025-10-06 |
Multi-omic profiling reveals potential biomarkers of hepatocellular carcinoma prognosis and therapy response among mitochondria-associated cell death genes in the context of 3P medicine
2024-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00362-8
PMID:38841626
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了基于线粒体相关细胞死亡基因的肝细胞癌预后预测模型 | 开发了整合10种机器学习算法和67种组合的共识线粒体细胞死亡指数(MCDI)，首次在3P医学框架下系统评估线粒体细胞死亡基因在肝细胞癌中的预后和治疗反应预测价值 | 需要进一步的大规模临床验证来确认模型的普适性 | 构建肝细胞癌预后和治疗反应预测模型以支持预测性、预防性和个性化医学策略 | 肝细胞癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 多组学分析、RT-qPCR、western blotting、免疫组织化学染色 | 集成机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 训练队列、验证队列和内部临床队列 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 6105 | 2025-10-06 |
The diversification of methods for studying cell-cell interactions and communication
2024-Jun, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00685-8
PMID:38238518
|
综述 | 本文探讨细胞间相互作用研究方法的最新进展和工具多样化 | 重点关注下一代计算工具的演变，能够处理细胞异质性、空间组织和复杂数据集 | NA | 推动细胞间相互作用和通讯研究的发展 | 细胞间分子相互作用和通讯机制 | 生物信息学 | NA | 转录组学，单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞数据，空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6106 | 2025-10-06 |
Acquisition of Drug Resistance in Basal Cell Nevus Syndrome Tumors through Basal to Squamous Cell Carcinoma Transition
2024-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.040
PMID:38157930
|
研究论文 | 本研究通过多组学和空间转录组学分析，揭示了基底细胞痣综合征肿瘤通过基底细胞向鳞状细胞癌转化获得SMO抑制剂耐药性的机制 | 首次发现Gorlin综合征肿瘤可通过基底细胞向鳞状细胞癌转化获得SMO抑制剂耐药性，并鉴定出PCYT2、ETNK1和磷脂酰乙醇胺生物合成途径作为该耐药性的遗传抑制因子 | 基于单个病例研究，样本量有限，需要更多病例验证 | 探究Gorlin综合征患者长期SMO抑制剂治疗后产生耐药性的分子机制 | 基底细胞痣综合征（Gorlin综合征）患者的SMO抑制剂耐药性肿瘤 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 空间全外显子组基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 1例Gorlin综合征患者的耐药性肿瘤 | NA | 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 6107 | 2025-10-06 |
Unique challenges and best practices for single cell transcriptomic analysis in toxicology
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100475
PMID:38645720
|
综述 | 探讨毒理学中单细胞转录组学应用的独特挑战及最佳分析实践 | 系统阐述毒理学领域单细胞转录组分析的特有挑战并提出针对性解决方案 | NA | 提升单细胞转录组学在毒理学研究中的应用效果 | 毒理学研究中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6108 | 2025-10-06 |
Endothelial Cell Flow-Mediated Quiescence Is Temporally Regulated and Utilizes the Cell Cycle Inhibitor p27
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320671
PMID:38602102
|
研究论文 | 本研究揭示了血流介导的内皮细胞静息状态具有时间调节特性，并发现细胞周期抑制剂p27在此过程中起关键作用 | 首次发现内皮细胞静息深度具有时间动态调节特性，并阐明p27通过HES1和ID3转录调控介导不同静息状态转换的机制 | 研究主要基于体外流动模型和模式生物，在人类生理环境中的验证仍需进一步研究 | 探究血流介导的内皮细胞静息状态的建立和维持机制 | 人原代内皮细胞、小鼠和斑马鱼内皮细胞 | 细胞生物学 | 血管功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达调控、体内细胞行为分析 | NA | 基因表达数据、细胞行为数据 | 原代内皮细胞、小鼠和斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6109 | 2025-10-06 |
Performing Suction Blister Skin Biopsies
2024-Jun, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.1073
PMID:38924322
|
研究论文 | 介绍一种替代传统皮肤活检的微创无疤痕皮肤采样方法——吸疱皮肤活检技术 | 提出使用负压和温和加热诱导吸疱的微创皮肤采样方法，无需麻醉且不留永久疤痕 | NA | 开发改进的皮肤组织采样技术 | 人体皮肤组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞培养 | NA | 细胞,蛋白质,代谢物 | 每个活检部位最多产生5个直径10mm的水疱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6110 | 2025-10-06 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
|
研究论文 | 本研究探讨IL-1β抑制对饮食诱导动脉粥样硬化消退的负面影响 | 首次揭示IL-1β在维持动脉粥样硬化斑块稳定性中的关键保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中进行验证 | 探究降脂治疗中IL-1β对晚期动脉粥样硬化斑块组成和稳定性的调控机制 | Apoe-/-基因敲除小鼠的动脉粥样硬化病变 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,飞行时间细胞术,免疫染色,共聚焦显微镜 | 小鼠动脉粥样硬化模型 | 基因表达数据,图像数据 | Apoe-/-小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6111 | 2025-10-06 |
Cellular-resolution gene expression mapping reveals organization in the head ganglia of the gastropod, Berghia stephanieae
2024-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25628
PMID:38852042
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和原位杂交链式反应技术，揭示了裸鳃类动物Berghia stephanieae头部神经节的细胞类型分子标记和空间组织 | 首次在裸鳃类动物中结合高通量单细胞RNA测序和原位杂交技术，识别并可视化神经元和胶质细胞的分子标记，揭示了神经节内和神经节间新的离散区域 | 研究仅针对特定物种Berghia stephanieae，结果可能无法直接推广到其他腹足类动物 | 建立腹足类动物神经系统的基本细胞组织结构与功能关系 | 裸鳃类动物Berghia stephanieae的头部神经节细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交链式反应 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6112 | 2025-10-06 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Jun, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.04.041
PMID:38685385
|
研究论文 | 本研究通过敲低Xkr8基因增强化疗效果并调节肿瘤免疫微环境 | 首次在临床相关原位模型中评估Xkr8敲低联合化疗策略，并通过单细胞RNA测序阐明其作用机制 | 研究仅使用胰腺肿瘤模型，尚未在其他癌症类型中验证 | 评估Xkr8敲低联合化疗的抗肿瘤免疫反应增强效果 | 胰腺肿瘤模型中的肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低技术 | 原位肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6113 | 2025-10-06 |
Neutrophil-derived PAD4 induces citrullination of CKMT1 exacerbates mucosal inflammation in inflammatory bowel disease
2024-Jun, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01158-6
PMID:38720063
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的PAD4通过瓜氨酸化CKMT1加剧炎症性肠病黏膜炎症的分子机制 | 首次发现PAD4通过细胞外囊泡进入肠上皮细胞并瓜氨酸化CKMT1，破坏线粒体稳态和肠道屏障功能 | 研究主要基于DSS诱导的小鼠结肠炎模型，临床样本验证有限 | 阐明PAD4在炎症性肠病中的具体作用机制 | 小鼠结肠炎模型和IBD患者样本 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，底物瓜氨酸化定位分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | DSS诱导结肠炎小鼠模型和IBD患者临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6114 | 2025-10-06 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2024-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00419.2023
PMID:38601985
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Esm-1在糖尿病肾病中作为肾小球转录极化的标志物 | 首次在单细胞水平系统表征Esm-1在糖尿病肾病中的表达模式及其与肾小球转录极化的关联 | 主要依赖公共数据库数据，样本量有限，需要进一步实验验证机制 | 探究Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，RNAscope，批量转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞（来自3个小鼠和4个人类数据库），20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6115 | 2025-10-06 |
Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100465
PMID:38586548
|
综述 | 探讨单细胞技术如何促进生殖毒理学研究，解析环境暴露对生殖细胞的跨代影响 | 整合单细胞多组学技术研究环境暴露对生殖细胞的跨代影响，提供细胞类型特异性响应分析 | 主要基于模式生物研究，人类生殖细胞研究存在技术挑战 | 推进生殖毒理学研究，解析环境因素对生殖细胞功能的影响机制 | 生殖细胞、模式生物（斑马鱼和小鼠） | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学分析 | NA | 单细胞转录组、表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6116 | 2025-10-06 |
TCL1A-expressing B cells are critical for tertiary lymphoid structure formation and the prognosis of oral squamous cell carcinoma
2024-05-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05292-7
PMID:38764038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TCL1A在B细胞中高表达，并揭示其通过促进三级淋巴结构形成改善口腔鳞癌预后的机制 | 首次揭示TCL1A在B细胞中的表达与三级淋巴结构形成的关系，及其通过调控CR2表达促进B细胞对树突状细胞的胞啃作用 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究B细胞在口腔鳞癌免疫治疗中的作用机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和B淋巴母细胞系 | 癌症免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 慢病毒转导 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织芯片数据, RNA测序数据 | 13例癌组织+8例癌旁组织（单细胞测序）, 146例临床样本（组织芯片）, 359例TCGA样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6117 | 2025-10-06 |
Single-cell approaches define two groups of mammalian oligodendrocyte precursor cells and their evolution over developmental time
2024-05-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.03.002
PMID:38579710
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示哺乳动物少突胶质前体细胞在发育过程中的两个亚群及其演化特征 | 首次在发育过程中鉴定出两个具有不同定位、转录和表观遗传特征的少突胶质前体细胞亚群，并发现成年期髓鞘再生过程与发育期存在本质差异 | 研究仅聚焦于小鼠皮层组织，未验证其他脑区或物种的普适性 | 解析哺乳动物少突胶质前体细胞在发育过程中的异质性和演化规律 | 小鼠皮层少突胶质前体细胞(OPCs) | 单细胞组学 | 神经系统发育 | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组、表观基因组、空间转录组数据 | 小鼠皮层发育不同时间点的OPC细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6118 | 2025-10-06 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SOX17因子可将人多能干细胞直接编程为内皮祖细胞 | 首次发现SOX17过表达单独即可诱导内皮祖细胞分化，并与FGF2联合实现90%以上分化效率 | 未探讨SOX17调控下游靶基因的具体分子机制 | 探索转录因子在人多能干细胞向内皮祖细胞分化过程中的调控作用 | 人多能干细胞(hPSCs)和内皮祖细胞(EPs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas13d基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6119 | 2025-10-06 |
MSX1+PDGFRAlow limb mesenchyme-like cells as an efficient stem cell source for human cartilage regeneration
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.001
PMID:38428414
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了具有显著骨软骨再生能力的MSX1间充质祖细胞，并开发了从人多能干细胞生成MSX1+PDGFRAlow肢体间充质样细胞的方法 | 首次发现MSX1间充质祖细胞中PDGFRA亚群具有最强的骨软骨再生能力，并成功从人多能干细胞生成功能相似的肢体间充质样细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞在人体内的长期安全性和有效性仍需验证 | 寻找用于人类软骨再生的高效干细胞来源 | MSX1间充质祖细胞及其PDGFRA亚群，人多能干细胞衍生的肢体间充质样细胞 | 再生医学 | 骨关节疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6120 | 2025-10-06 |
Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.002
PMID:38428413
|
研究论文 | 本研究揭示了间充质干细胞通过CCL2/CCR2信号通路促进髓系细胞分化的机制 | 首次发现PDGFRαSca-1阳性MSCs在LPS刺激下分泌CCL2，并通过该信号通路调控髓系细胞分化命运 | 主要基于小鼠模型研究，人类骨髓细胞的验证数据相对有限 | 探究间充质干细胞对造血干细胞/祖细胞分化的影响机制 | 小鼠间充质干细胞、造血干细胞/祖细胞、人类骨髓细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |