单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 6101 - 6120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6101 | 2024-11-18 |
Discovering explainable biomarkers for breast cancer anti-PD1 response via network Shapley value analysis
2024-Dec, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108481
PMID:39488042
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研究论文 | 本文提出了一种基于合作博弈理论的新型特征选择方法，用于识别乳腺癌免疫治疗反应的解释性生物标志物 | 本文创新性地将Shapley值分析应用于基因调控网络，以量化特征重要性，并通过网络扩展原则和节点邻接性来增强特征选择的可解释性 | NA | 旨在识别预测乳腺癌免疫治疗反应的生物标志物 | 乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 机器学习 | 乳腺癌 | Shapley值分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 6102 | 2024-11-18 |
Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion
2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0362
PMID:38922360
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研究论文 | 本文研究了左炔诺孕酮宫内节育器（LIUD）治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期随访结果，发现复发与免疫耗竭相关 | 首次通过空间转录组学和计算细胞类型反卷积及通路分析，研究了LIUD治疗后的复发机制，揭示了免疫耗竭在复发中的作用 | 研究样本量较小，仅包括5名患者的纵向活检样本，可能影响结果的普适性 | 探讨LIUD治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期疗效及复发机制 | 子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌患者 | NA | 妇科肿瘤 | 空间转录组学（Nanostring GeoMX数字空间分析） | NA | 转录组数据 | 43名患者，其中5名患者的纵向活检样本 |
| 6103 | 2024-11-18 |
YAP1 Inhibition Induces Phenotype Switching of Cancer-Associated Fibroblasts to Tumor Suppressive in Prostate Cancer
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0932
PMID:39137404
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研究论文 | 研究揭示了YAP1抑制剂在前列腺癌中诱导癌症相关成纤维细胞表型转换的机制 | 首次揭示了YAP1在调节癌症相关成纤维细胞表型中的作用，并提出了一种通过靶向YAP1来改变成纤维细胞亚型以增强免疫检查点阻断疗法效果的治疗策略 | NA | 揭示调节癌症相关成纤维细胞可塑性的机制，以增强前列腺癌对免疫检查点阻断疗法的响应 | 前列腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其表型转换 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个前列腺癌单细胞RNA测序数据集 |
| 6104 | 2024-11-18 |
A Dual-Payload Antibody-Drug Conjugate Targeting CD276/B7-H3 Elicits Cytotoxicity and Immune Activation in Triple-Negative Breast Cancer
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-4099
PMID:39186778
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研究论文 | 研究开发了一种双载荷抗体药物偶联物（DualADC），用于治疗三阴性乳腺癌（TNBC），通过靶向CD276/B7-H3诱导细胞毒性和免疫激活 | 首次开发了一种双载荷抗体药物偶联物，结合了传统的细胞毒性载荷和免疫调节的Toll样受体7/8激动剂，有效杀伤多种TNBC亚型并增强肿瘤微环境中的免疫功能 | NA | 开发一种新的抗体药物偶联物，用于治疗难治性转移性三阴性乳腺癌 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | NA | 乳腺癌 | 抗体药物偶联物（ADC） | NA | RNA测序、多重细胞因子分析、组织学 | NA |
| 6105 | 2024-11-18 |
Identification of feature genes in intestinal epithelial cell types
2024-Nov-15, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00208-8
PMID:39542983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人和小鼠肠道不同细胞类型的特征基因，并通过免疫荧光染色和CRISPR/Cas9敲除技术探讨了这些基因在调节肠道上皮细胞增殖和分化中的作用 | 本研究不仅报道了多种肠道上皮细胞类型的新标记物，还阐明了相关基因在决定上皮细胞命运和维持干细胞稳态中的作用 | NA | 深入探索肠道上皮细胞的代表性标记物和转录因子，以进行全面的细胞命运轨迹分析 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR/Cas9敲除 | NA | 基因表达数据 | 人和小鼠的肠道上皮细胞 |
| 6106 | 2024-11-18 |
Insulin-like growth factor 2 drives fibroblast-mediated tumor immunoevasion and confers resistance to immunotherapy
2024-Nov-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183366
PMID:39545420
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研究论文 | 本文揭示了胰岛素样生长因子2（IGF2）在肿瘤免疫逃逸和免疫治疗耐药中的关键作用 | 发现IGF2通过促进癌症相关成纤维细胞（CAFs）与T细胞的相互作用，驱动肿瘤免疫逃逸，并增加免疫治疗耐药性 | NA | 探讨IGF2在肿瘤免疫逃逸和免疫治疗耐药中的作用机制 | 胰岛素样生长因子2（IGF2）及其在肿瘤免疫逃逸中的作用 | NA | NA | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用IGF2缺陷小鼠模型进行研究 |
| 6107 | 2024-11-18 |
A multimodal zebrafish developmental atlas reveals the state-transition dynamics of late-vertebrate pluripotent axial progenitors
2024-Nov-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.047
PMID:39454574
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研究论文 | 本文介绍了Zebrahub，一个整合了单细胞测序时间序列数据和光片显微镜重建的斑马鱼胚胎发育动态图谱 | Zebrahub提供了高分辨率和深入的分子洞察力，通过在十个发育阶段对单个胚胎进行测序，并重建细胞轨迹，同时包含一个交互式工具来导航复杂的细胞流动和谱系 | NA | 阐明生物体发育过程，全面理解细胞谱系在空间、时间和分子域中的变化 | 斑马鱼胚胎发育中的神经-中胚层前体细胞（NMPs）和联合肾-造血干细胞前体细胞的起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，光片显微镜 | NA | 单细胞数据 | 十个发育阶段的单个斑马鱼胚胎 |
| 6108 | 2024-11-18 |
Multi-omics with dynamic network biomarker algorithm prefigures organ-specific metastasis of lung adenocarcinoma
2024-Nov-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53849-3
PMID:39543109
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研究论文 | 本研究通过动态网络生物标志物算法和多组学数据，预测肺腺癌的器官特异性转移 | 首次利用动态网络生物标志物算法结合单细胞RNA测序和液相色谱-质谱数据，预测肺腺癌的器官特异性转移 | 研究仅基于两个临床队列的数据，样本量有限 | 开发早期检测肺腺癌转移的有效策略，提高患者生存率 | 肺腺癌的器官特异性转移及其早期检测 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、液相色谱-质谱 | 神经网络模型 | 基因组数据、蛋白质组数据 | 两个临床队列，包括四种主要类型的肺腺癌远处转移 |
| 6109 | 2024-11-18 |
Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq
2024-Nov-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54202-4
PMID:39543112
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dyna-vivo-seq的新方法，通过体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序技术，揭示了急性肾损伤期间的细胞RNA动态变化 | Dyna-vivo-seq方法能够在体内进行时间分辨的动态转录组分析，揭示新旧RNA的差异，从而提供细胞异质性的额外维度 | NA | 研究急性肾损伤期间的基因表达动态变化 | 急性肾损伤期间的小鼠近端小管细胞 | 基因组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性小鼠 |
| 6110 | 2024-11-18 |
Machine learning-driven discovery of novel therapeutic targets in diabetic foot ulcers
2024-Nov-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00955-z
PMID:39543487
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研究论文 | 利用机器学习方法识别糖尿病足溃疡（DFU）中的治疗反应基因 | 首次通过机器学习方法识别出与DFU相关的关键基因SCUBE1和RNF103-CHMP3，并探讨了其在免疫调节和细胞通讯中的作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证，并探索其在临床治疗中的应用潜力 | 通过机器学习方法识别糖尿病足溃疡中的潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者的转录组数据和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 转录组分析 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 糖尿病足溃疡患者和健康对照的转录组数据，以及单细胞转录组数据 |
| 6111 | 2024-11-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of the cellular ecosystem of primary hepatocellular carcinoma
2024-Nov-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03574-0
PMID:39543644
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在原发性肝细胞癌（HCC）细胞生态系统中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了HCC细胞生态系统的复杂性和异质性 | NA | 理解HCC的发展并识别新的治疗靶点 | HCC细胞及其非恶性基质细胞的异质性和相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 6112 | 2024-11-18 |
Comparison of functional characterization of cancer stem cells in different tumor tissues of pseudomyxoma peritonei
2024-Nov-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05730-6
PMID:39543711
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研究论文 | 本研究比较了伪黏液瘤腹膜（PMP）患者不同肿瘤组织中癌症干细胞（CSCs）的功能特征 | 首次比较了PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的增殖、迁移和抗炎能力 | 样本量较小，未涉及长期疗效和临床应用 | 研究PMP患者不同肿瘤组织中CSCs的生物学特性 | PMP患者的癌症干细胞（CSCs） | 数字病理学 | 腹膜肿瘤 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 涉及PMP患者的不同肿瘤组织中的CSCs |
| 6113 | 2024-11-18 |
Transcriptome-based network analysis related to regulatory T cells infiltration identified RCN1 as a potential biomarker for prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-14, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-024-00404-x
PMID:39543725
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研究论文 | 研究通过转录组网络分析识别与调节性T细胞浸润相关的RCN1作为透明细胞肾细胞癌的潜在预后生物标志物 | 开发了一个与调节性T细胞浸润相关的预后模型，并发现RCN1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值 | NA | 识别透明细胞肾细胞癌的预后标志物和治疗靶点 | 调节性T细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 生物信息学 | 肾癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 转录组数据 | TCGA-KIRC样本 |
| 6114 | 2024-11-18 |
Preexisting senescent fibroblasts in the aged bladder create a tumor-permissive niche through CXCL12 secretion
2024-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00704-1
PMID:39251867
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研究论文 | 研究揭示了衰老膀胱中预先存在的衰老成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 首次揭示了衰老膀胱中p16-sn成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于基因修饰小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨衰老如何通过特定机制促进膀胱癌的发生 | 衰老膀胱中的成纤维细胞及其在膀胱癌中的作用 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因修饰小鼠模型中的成纤维细胞 |
| 6115 | 2024-11-18 |
Jag1 insufficiency alters liver fibrosis via T cell and hepatocyte differentiation defects
2024-Nov, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-024-00145-8
PMID:39358604
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研究论文 | 研究Jag1不足如何通过T细胞和肝细胞分化缺陷影响肝纤维化 | 首次揭示了Jag1不足导致的肝细胞和T细胞分化缺陷与肝纤维化之间的关系 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨Jag1不足对肝纤维化的影响及其机制 | Jag1小鼠模型、T细胞、肝细胞 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术 | NA | RNA | 涉及Jag1小鼠和患者肝样本 |
| 6116 | 2024-11-18 |
Integrated single-cell transcriptomic analyses identify a novel lineage plasticity-related cancer cell type involved in prostate cancer progression
2024-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105398
PMID:39418984
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组分析，识别出一种与前列腺癌进展相关的新型细胞类型，该细胞类型具有谱系可塑性 | 首次识别出一种新型谱系可塑性相关的前列腺癌细胞类型，并揭示其在肿瘤进展中的关键作用 | NA | 识别并验证与前列腺癌进展相关的谱系可塑性相关细胞类型 | 前列腺癌细胞及其谱系可塑性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3314个样本和222,529个细胞 |
| 6117 | 2024-11-18 |
Biologically informed machine learning modeling of immune cells to reveal physiological and pathological aging process
2024-Oct-24, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00479-4
PMID:39449067
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研究论文 | 研究构建了首个涵盖人类生命周期的免疫细胞转录组图谱，并开发了一种新的生物年龄预测模型PHARE，用于揭示生理和病理衰老过程 | 首次构建了涵盖人类生命周期的免疫细胞转录组图谱，并开发了新的生物年龄预测模型PHARE | NA | 揭示免疫细胞功能随年龄变化的过程，并为不同生命阶段的患者提供精准治疗 | 免疫细胞在不同年龄段的组成和功能变化 | 机器学习 | 冠状动脉疾病 | scRNA-seq和bulk RNA-seq | PHARE模型 | 转录组数据 | 涵盖从新生儿到超级百岁老人的多个年龄段样本 |
| 6118 | 2024-11-18 |
CXCL8 secreted by immature granulocytes inhibits WT hematopoiesis in chronic myelomonocytic leukemia
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180738
PMID:39545419
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研究论文 | 研究探讨了不成熟粒细胞（iGRANs）在慢性粒单核细胞白血病（CMML）进展中的作用 | 发现CXCL8在不成熟粒细胞中高表达，抑制了野生型造血干细胞和祖细胞的增殖，而CXCL8受体抑制剂和CXCL8阻断剂可以恢复野生型造血干细胞的增殖 | 研究仅限于体外实验，尚未在临床上验证CXCL8抑制剂的治疗效果 | 探讨不成熟粒细胞在慢性粒单核细胞白血病进展中的作用及其潜在治疗策略 | 慢性粒单核细胞白血病患者的外周血中的不成熟粒细胞及其分泌的细胞因子CXCL8 | 血液学 | 白血病 | 流式细胞术、RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 慢性粒单核细胞白血病患者的外周血样本 |
| 6119 | 2024-11-18 |
Comprehensive profiling of the human fecal proteome from IBD patients with DIA-MS enables evaluation of disease-relevant proteins
2024-Sep, Proteomics. Clinical applications
DOI:10.1002/prca.202300075
PMID:38552248
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研究论文 | 本文使用DIA-MS技术对IBD患者的粪便蛋白质组进行全面分析，以评估与疾病相关的蛋白质 | 本文揭示了新的粪便蛋白质，这些蛋白质可能作为非侵入性生物标志物来监测IBD疾病活动的特定方面 | NA | 评估与炎症性肠病（IBD）相关的非侵入性生物标志物 | IBD患者的粪便蛋白质组 | NA | 炎症性肠病 | DIA-MS | NA | 蛋白质组数据 | 两个独立队列，Cohort 1：健康5例，UC 5例，CD 5例；Cohort 2：健康20例，UC 10例，CD 10例 |
| 6120 | 2024-11-18 |
γδ T cell profiling in a cohort of preterm infants reveals elevated frequencies of CD83+ γδ T cells in sepsis
2024-Jul-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231987
PMID:38753245
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研究论文 | 研究了早产儿中γδ T细胞的特征，发现败血症患儿中CD83+ γδ T细胞频率升高 | 首次在早产儿中进行γδ T细胞的纵向研究，并发现败血症患儿中胎儿来源的Vγ9Vδ2 T细胞水平升高 | 研究仅限于早产儿，未涉及其他年龄段的人群 | 探讨早产儿中γδ T细胞的特征及其在败血症中的作用 | 早产儿中的γδ T细胞 | NA | 新生儿败血症 | 下一代测序、流式细胞术、功能性检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 一组早产儿 |