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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6041 | 2025-10-06 |
Omics based technology application in poultry meat research
2025-Jan, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104643
PMID:39662255
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综述 | 本文综述了组学技术在禽肉研究中的应用,包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学等方法 | 系统整合多种组学技术研究禽肉品质问题,特别关注空间转录组学和代谢组学在木质胸病研究中的应用 | NA | 探讨组学技术如何增进对禽肉品质问题和复杂性状的理解 | 家禽肉类品质,特别是鸡肉品质和肌肉病变 | 生物信息学 | 禽类肌肉疾病 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、空间转录组学、空间代谢组学、多组学分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 多组学分析 | NA | NA |
6042 | 2025-10-06 |
A novel Tc17 population recruited by tumor cells promotes tumor progression in gastric cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1592328
PMID:40452847
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术揭示了胃癌微环境中Tc17细胞的免疫抑制功能及其促进肿瘤进展的机制 | 首次系统性地揭示了Tc17细胞在胃癌微环境中的免疫抑制功能,发现肿瘤细胞通过CXCL16-CXCR6轴招募Tc17细胞,而Tc17细胞通过分泌IL-17A和IL-26促进肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验验证,缺乏体内动物模型验证;样本量相对有限 | 探究Tc17细胞在胃癌肿瘤微环境中的功能和作用机制 | 胃癌患者组织样本和细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多色免疫组化染色, SCENIC分析, 伪时间分析, 细胞-细胞相互作用分析 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 65例胃癌样本的单细胞测序数据(296,879个细胞), 10例胃癌样本的空间转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6043 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming signature predicts prognosis and immune landscape in small cell lung cancer: MOCS2 validation and implications for personalized therapy
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1592888
PMID:40452920
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研究论文 | 本研究通过多组学分析建立了小细胞肺癌的代谢重编程预后模型,并验证了关键基因MOCS2的功能 | 首次系统识别小细胞肺癌代谢重编程特征并构建基于梯度提升机的预后模型,通过实验验证MOCS2基因功能 | 使用公共数据集,样本来源有限;功能验证仅限于体外实验 | 开发小细胞肺癌预后预测模型并探索代谢重编程的临床意义 | 小细胞肺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA敲低, WGCNA分析 | 梯度提升机(GBM) | 基因表达数据 | 来自GSE60052和cBioportal队列的公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6044 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Aspirin Restores Intervertebral Disc Integrity via Ferroptosis Regulation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519218
PMID:40453974
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研究论文 | 通过单细胞分析发现阿司匹林通过调控铁死亡恢复椎间盘完整性 | 首次在椎间盘退变中鉴定出CDKN1A⁺aNPC亚型作为早期预警标志,并揭示阿司匹林通过靶向GPX4抑制铁死亡的新机制 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步深入 | 探究椎间盘退变的细胞异质性及阿司匹林的治疗机制 | 椎间盘髓核细胞亚群 | 单细胞分析 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,分子对接,体外实验,体内实验 | Harmony算法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个独立单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6045 | 2025-10-06 |
To Explore the Key Subgroup and Their Immune Microenvironment During the Formation of Coronary Plaque With scRNA-seq
2025, Cardiology research and practice
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/crp/3221767
PMID:40454289
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索冠状动脉斑块形成过程中的关键NK细胞亚群及其免疫微环境 | 首次发现C1 RACK1+ NK细胞亚群在冠状动脉斑块形成中的关键作用,并系统分析其在伪时间轨迹、细胞相互作用和转录因子调控中的表达特征 | 样本量较小(15例),需要更大规模研究验证发现 | 探索冠状动脉斑块形成过程中的关键细胞亚群及其免疫微环境机制 | 冠状动脉斑块组织中的NK细胞亚群 | 单细胞组学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, CytoTRACE, monocle, slingshot, CellChat, SCENIC | NA | 单细胞转录组数据 | 15例个体标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6046 | 2025-10-06 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2024-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494074/v1
PMID:39711542
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向β-catenin的siRNA脂质纳米颗粒疗法,可重编程肿瘤微环境并增强免疫治疗在肝癌中的疗效 | 首次证明靶向β-catenin的LNP-CTNNB1可通过重编程肿瘤细胞信号和免疫微环境,克服Wnt活性肝癌对免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究主要基于临床前模型,需要在人类临床试验中进一步验证 | 开发针对β-catenin突变肝细胞癌的新型治疗策略,克服免疫治疗耐药性 | β-catenin突变的肝细胞癌模型和患者 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, siRNA技术 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个免疫活性HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
6047 | 2025-10-06 |
Derivation of transplantable human thyroid follicular epithelial cells from induced pluripotent stem cells
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.004
PMID:39515316
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研究论文 | 本研究从人类诱导多能干细胞成功分化出可移植的甲状腺滤泡上皮细胞 | 开发了表达NKX2-1和PAX8位点荧光标记物的新型iPSC系,建立了无血清培养基逐步分化方案 | iPSC来源的甲状腺滤泡细胞在体内无法挽救甲状腺功能减退症 | 开发治疗术后和先天性甲状腺功能减退症的新型治疗方法 | 人类诱导多能干细胞分化的甲状腺滤泡细胞 | 干细胞与再生医学 | 甲状腺功能减退症 | 单细胞RNA测序,异种移植 | NA | 基因表达数据,蛋白质检测数据 | 多个iPSC细胞系,无甲状腺免疫缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6048 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals molecular cues underlying the site specificity of the adult mouse oral mucosa and its stem cell niches
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.007
PMID:39547226
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示成年小鼠口腔黏膜及其干细胞微环境的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术系统解析口腔黏膜不同部位的分子特征,并鉴定出成纤维细胞生长因子通路作为口腔上皮干细胞的潜在微环境因子 | 研究仅限于小鼠模型,人类口腔黏膜可能存在物种特异性差异 | 解析成年小鼠口腔黏膜部位特异性的分子机制及其干细胞微环境维持机制 | 成年小鼠的舌部、颊部和腭部口腔黏膜组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学(tomo-seq),类器官形成效率检测 | NA | 空间转录组数据,类器官实验数据 | 成年小鼠的多个口腔部位组织样本 | NA | 空间转录组学 | tomo-seq | NA |
6049 | 2025-10-06 |
Bone morphogenetic protein 4 induces hematopoietic stem cell development from murine hemogenic endothelial cells in culture
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.005
PMID:39547225
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现BMP4信号在E9.5造血内皮细胞中激活,并证明BMP4可诱导早期造血内皮细胞分化为造血干细胞 | 首次发现BMP4是促进早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的关键因子,为体外诱导造血干细胞提供了新方法 | 研究仅使用小鼠胚胎细胞,尚未在人类细胞中验证 | 阐明早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的信号需求 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6050 | 2025-10-06 |
Validation of non-destructive morphology-based selection of cerebral cortical organoids by paired morphological and single-cell RNA-seq analyses
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.09.005
PMID:39393360
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研究论文 | 通过配对形态学和单细胞RNA测序分析验证基于非破坏性形态学的脑皮质类器官筛选方法 | 首次证明非破坏性形态分析可准确区分由脑皮质组织构成的类器官与其他脑组织类器官 | NA | 评估脑类器官分化培养中形成的类器官形态与其细胞组成的关系 | 脑类器官 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 形态学图像,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6051 | 2025-10-06 |
Lineage-specific dynamics of loss of X upregulation during inactive-X reactivation
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.001
PMID:39486405
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研究论文 | 本研究探讨了失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的变化规律 | 首次揭示了Xi重新激活与Xa上调状态丢失在不同细胞类型中的非同步性现象 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞数据相对有限 | 探究失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的动态变化 | 小鼠胚胎外胚层、诱导多能干细胞、生殖细胞、胚胎外内胚层干细胞和人类B细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型,具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6052 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the process of CA19-9 production and dynamics of the immune microenvironment between CA19-9 (+) and CA19-9 (-) PDAC
2024-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003130
PMID:38816396
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌中CA19-9的产生过程及CA19-9阳性与阴性患者免疫微环境的动态差异 | 首次在单细胞分辨率下识别出三种高产生CA19-9的癌细胞亚型,发现CA19-9通过抗原呈递癌症相关成纤维细胞的旁路产生机制,并证实CA19-9促进巨噬细胞M2极化的新功能 | 样本量较小(仅6个PDAC样本和2个癌旁样本),需更大规模研究验证 | 阐明CA19-9在胰腺导管腺癌中的产生机制及其在肿瘤微环境中的作用 | 胰腺导管腺癌患者组织样本(CA19-9阳性和阴性)及体外共培养细胞模型 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,体外共培养 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像 | 6个PDAC样本(3个CA19-9阳性,3个阴性)+2个癌旁样本+在线数据库补充样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6053 | 2025-10-06 |
The integrated molecular and histological analysis defines subtypes of esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53164-x
PMID:39419971
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研究论文 | 通过整合分子和病理学分析定义食管鳞状细胞癌的亚型 | 首次结合基因组-转录组特征和AI辅助病理图像分析对ESCC进行综合分型,发现具有特定分子和病理特征的四种亚型 | 样本量相对有限(120例),仅针对中国人群 | 阐明食管鳞状细胞癌的分子和免疫特征,推动个性化治疗策略发展 | 120例中国食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 基因组学, 转录组学, 免疫组织化学 | 深度学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 病理图像 | 120例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6054 | 2025-10-06 |
Multimodal Spatial Profiling Reveals Immune Suppression and Microenvironment Remodeling in Fallopian Tube Precursors to High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.615007
PMID:39386723
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研究论文 | 通过整合高plex成像和空间转录组学分析输卵管前体病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子变化和肿瘤微环境重塑 | 首次通过多模态空间分析揭示输卵管前体病变中染色体不稳定性、持续性干扰素信号传导及免疫失调等分子变化 | 研究样本数量未明确说明,且仅关注输卵管前体病变向HGSOC的转变过程 | 阐明输卵管前体病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子机制和肿瘤微环境变化 | 人类输卵管组织样本,包括p53特征、浆液性输卵管上皮内癌和侵袭性HGSOC | 数字病理学 | 卵巢癌 | 高plex成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6055 | 2025-10-06 |
Bronchopulmonary Dysplasia with Pulmonary Hypertension Associates with Loss of Semaphorin Signaling and Functional Decrease in FOXF1 Expression
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609955
PMID:39253423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析早产儿肺组织,揭示了支气管肺发育不良伴肺动脉高压与信号素信号通路缺失及FOXF1表达功能下降的关联 | 首次在人类早产儿肺组织中通过单细胞RNA测序识别出BPD+PH特有的异常毛细血管细胞状态,并发现信号素引导信号通路缺陷 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证发现 | 探究驱动人类支气管肺发育不良发展的细胞和分子动态机制 | 早产儿肺组织(BPD和BPD+PH阶段)与足月婴儿肺组织的对比 | 单细胞基因组学 | 支气管肺发育不良,肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 早产儿和足月婴儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6056 | 2025-10-06 |
Advancing cell-based therapy in sepsis: An anesthesia outlook
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003097
PMID:38708689
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综述 | 本文从麻醉学角度综述细胞疗法在脓毒症治疗中的研究进展、现状及围手术期管理策略 | 整合单细胞测序与基因编辑技术探讨脓毒症特异性免疫反应,提出CAR-免疫细胞疗法新方向 | 未涉及具体临床试验数据验证,主要基于理论机制探讨 | 探索细胞疗法在脓毒症围手术期管理中的应用潜力 | 脓毒症患者及免疫细胞治疗机制 | 医学研究 | 脓毒症 | 单细胞测序, 基因编辑 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6057 | 2025-10-06 |
Identification of potential immune-related mechanisms related to the development of multiple myeloma
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003116
PMID:38844445
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析初治多发性骨髓瘤患者的免疫微环境,特别关注单核/巨噬细胞的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统揭示初治多发性骨髓瘤患者骨髓免疫细胞特征,发现干扰素应答细胞群和免疫抑制性单核/巨噬细胞的富集 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究多发性骨髓瘤免疫微环境特征,特别关注单核/巨噬细胞的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6058 | 2025-10-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨FICZ通过激活芳烃受体在刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型中的保护作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术,揭示FICZ通过调控CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究仍待深入 | 探究FICZ通过芳烃受体在自身免疫性肝炎中的保护作用及机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
6059 | 2025-10-06 |
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003031
PMID:38420743
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综述 | 本文总结了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的研究进展,重点关注其表型和功能异质性、特定信号通路及靶向治疗策略 | 系统梳理了CAFs的异质性特征及其在肿瘤微环境中的多重功能,并总结了靶向CAFs的临床试验现状 | CAFs在肿瘤微环境中的复杂性尚未完全阐明,现有靶向CAFs的临床试验结果大多不理想 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6060 | 2025-10-06 |
Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response
2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.12.23.23300491
PMID:38234717
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研究论文 | 通过分析自身免疫性疾病与癌症风险呈相反效应的遗传变异,识别出5个潜在的癌症免疫治疗靶点基因 | 首次系统性识别对自身免疫性疾病和癌症风险具有相反效应的遗传变异,并整合多组学数据验证其功能 | 研究主要基于欧洲人群数据,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别对自身免疫性疾病和癌症风险具有相反效应的遗传变异,发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌患者及七种自身免疫/自身炎症性疾病患者 | 遗传学 | 癌症 | GWAS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, eQTL分析 | 固定效应跨疾病荟萃分析 | 基因组数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照,112,631例自身免疫疾病患者/895,386例对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |