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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6021 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals extracellular matrix remodeling and collagen dynamics during lactation in sheep mammary gland
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143669
PMID:40319976
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示绵羊乳腺在哺乳期细胞外基质重塑和胶原蛋白动态变化 | 首次在绵羊乳腺中应用单细胞转录组学技术,系统描绘哺乳期细胞图谱并揭示成纤维细胞-上皮细胞互导驱动的胶原重塑机制 | 仅分析了产后60天和150天两个时间点,未能覆盖整个哺乳周期;物种间比较仅限于细胞类型保守性分析 | 解析绵羊乳腺在哺乳期的细胞结构和分子调控机制 | 绵羊乳腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 产后60天和150天两个时间点的绵羊乳腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6022 | 2025-10-06 |
KDELR3 and YOD1 proteins as critical endoplasmic reticulum stress mediators and potential therapeutic targets in diabetic foot ulcers: An integrated bioinformatics analysis
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144095
PMID:40354856
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定糖尿病足溃疡中内质网应激关键介质KDELR3和YOD1蛋白作为潜在治疗靶点 | 首次系统鉴定糖尿病足溃疡中内质网应激相关差异表达蛋白,并通过多组学分析揭示KDELR3和YOD1的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索糖尿病足溃疡发病机制中的内质网应激关键蛋白及其治疗潜力 | 糖尿病足溃疡患者组织样本和GEO数据库数据集 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习, 分子对接, qRT-PCR, 孟德尔随机化分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库糖尿病足溃疡数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
6023 | 2025-10-06 |
The Potential Role of Monocyte-Derived Macrophages in Preventing Malarial Parasitemic Recrudescence in a Mouse Model
2025-Jun, Parasite immunology
IF:1.4Q3
DOI:10.1111/pim.70010
PMID:40459245
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究单核细胞来源巨噬细胞在预防疟疾寄生虫血症复发中的潜在作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析疟疾感染过程中脾脏吞噬细胞的动态变化,揭示MDMs在控制寄生虫血症复发中的新作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,CCR2小鼠实验表明单核细胞向MDMs的转化可能不存在于该模型中 | 探究特定吞噬细胞类型在控制疟疾寄生虫复发中的作用机制 | 感染Plasmodium chabaudi chabaudi AS的小鼠脾脏吞噬细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6024 | 2025-10-06 |
TRAF3 as a potential diagnostic biomarker for recurrent pregnancy loss: insights from single-cell transcriptomics and machine learning
2025-May-31, BMC pregnancy and childbirth
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s12884-025-07742-6
PMID:40450232
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习技术,探索TRAF3作为复发性流产潜在诊断标志物的价值 | 首次结合单细胞转录组学和机器学习方法鉴定TRAF3作为RPL的诊断标志物,并发现特定dNK细胞亚型在RPL中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证诊断模型的临床适用性 | 探索复发性流产的发病机制并寻找潜在诊断标志物和治疗靶点 | 复发性流产患者和正常妊娠女性的蜕膜组织 | 生物信息学 | 复发性流产 | 单细胞转录组测序, RT-PCR, 免疫组织化学, 分子对接分析 | 机器学习, WGCNA | 单细胞转录组数据 | RPL患者和正常妊娠女性的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6025 | 2025-10-06 |
Temporally resolved single-cell RNA sequencing reveals protective and pathological responses during herpes simplex virus CNS infection
2025-May-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03471-x
PMID:40450318
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研究论文 | 本研究通过时间分辨单细胞RNA测序揭示了单纯疱疹病毒中枢神经系统感染期间的保护性和病理性免疫反应 | 首次在时间维度上解析HSV-1感染中枢神经系统期间的单细胞转录组动态变化,并识别出病毒特异性激活的小胶质细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证;空间转录组分析可能受技术分辨率限制 | 阐明HSV-1感染中枢神经系统期间的免疫细胞动态和分子机制 | HSV-1感染的小鼠脑干组织 | 单细胞组学 | 病毒感染性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | HSV-1感染小鼠模型 | NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组技术 |
6026 | 2025-10-06 |
Human endothelial cells promote a human neural stem cell type B phenotype via Notch signaling
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60194-6
PMID:40447618
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研究论文 | 研究发现人内皮细胞通过Notch信号通路促进人神经干细胞向B型表型分化 | 首次揭示人内皮细胞通过Notch-DLL4信号轴调控人神经干细胞B型表型,并鉴定了S100A6和LeX作为人B型细胞新标志物 | 研究主要关注Notch信号通路,可能还存在其他调控机制未探索 | 探究人内皮细胞与人神经干细胞间的相互作用机制 | 人神经干细胞和人内皮细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6027 | 2025-10-06 |
Immunogenicity and cellular response of a herpes zoster virus gEgI fusion protein adjuvanted with CpG-emulsion in mice
2025-May-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03423-w
PMID:40448056
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研究论文 | 本研究开发了一种新型带状疱疹疫苗,通过gEgI融合蛋白与CpG-乳剂复合佐剂XUA09C的组合,在小鼠模型中评估其免疫原性和细胞免疫反应 | 开发了gE和gI的融合蛋白疫苗,并采用新型复合佐剂XUA09C,相比现有疫苗Shingrix能诱导更强的T细胞反应和早期免疫激活 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发更安全、更易获取的带状疱疹疫苗替代方案 | 成年小鼠、VZV预免疫小鼠和老年小鼠 | 免疫学 | 带状疱疹 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠群体(成年、VZV预免疫、老年) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6028 | 2025-10-06 |
Multiplex imaging reveals novel patterns of MRTFA/B activation in the breast cancer microenvironment
2025-May-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06559-3
PMID:40448123
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研究论文 | 通过多重成像技术研究MRTFA/B在乳腺癌微环境中的表达模式和激活状态 | 首次在人类乳腺癌中发现MRTFA/B在肿瘤微环境中的差异表达模式,特别是MRTFA在非裔美国患者转移瘤中高表达及其在血管周围抗原呈递细胞中的特异性表达 | 研究主要基于组织微阵列和生物信息学分析,需要进一步功能验证实验 | 探究MRTFA/B转录因子在乳腺癌进展和转移中的作用机制 | 乳腺癌组织样本、肿瘤微环境细胞(癌细胞、内皮细胞、抗原呈递细胞) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光、生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 两个乳腺癌组织微阵列(CHTN_BrCaProg3和UIC-001-TMA),包含原发肿瘤和淋巴结转移样本 | Broad Institute | 单细胞RNA测序 | NA | Broad Institute单细胞RNA测序门户 |
6029 | 2025-10-06 |
INBRX-106: a hexavalent OX40 agonist that drives superior antitumor responses via optimized receptor clustering
2025-May-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011524
PMID:40404202
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研究论文 | 本文介绍了一种新型六价OX40激动剂INBRX-106,通过优化受体聚类增强抗肿瘤免疫反应 | 开发了首个六价OX40激动剂,能够独立于Fc介导的交联实现优化的受体三聚体结合,显著增强下游信号传导 | NA | 评估六价OX40激动剂INBRX-106在增强抗肿瘤T细胞反应中的疗效和机制 | T细胞、小鼠肿瘤模型、离体人类样本、临床试验患者样本 | 免疫治疗 | 癌症 | NF-kß报告基因检测、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 分子信号数据、细胞图像、基因表达数据、临床样本数据 | 小鼠肿瘤模型、离体人类样本、I/II期临床试验患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6030 | 2025-06-04 |
Correction to: "GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish"
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf098
PMID:40457745
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6031 | 2025-10-06 |
PERK+ Macrophages Drive Immunotherapy Resistance in Lymph Node Metastases of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3135
PMID:40036693
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研究论文 | 本研究系统评估了口腔鳞状细胞癌淋巴结转移灶对新辅助免疫治疗的病理反应差异,并发现PERK+巨噬细胞是导致治疗抵抗的关键因素 | 首次在淋巴结转移灶中发现PERK+巨噬细胞通过内质网应激反应和细胞外基质重塑导致免疫治疗抵抗 | 样本量有限,研究结果需要在更大规模临床试验中验证 | 评估口腔鳞癌淋巴结转移灶对免疫治疗的病理反应并寻找改善治疗效果的潜在靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者及其淋巴结转移灶 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学,空间转录组学,多重免疫组化 | NA | 转录组数据,图像数据 | 参与II期临床试验的口腔鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
6032 | 2025-10-06 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
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研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA-seq分析性能 | 首次系统比较牛津纳米孔和PacBio长读长测序技术在单细胞RNA-seq分析中的性能表现 | 仅评估了两种长读长测序平台,未涵盖其他新兴技术 | 评估长读长测序平台在单细胞转录组分析中的性能表现 | 单细胞cDNA文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | NA | 测序数据 | 不同细胞数量的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA-seq, 长读长测序 | ONT, PacBio | 第三代测序技术平台 |
6033 | 2025-10-06 |
Sympathetic hyperinnervation drives abdominal aortic aneurysm development by promoting vascular smooth muscle cell phenotypic switching
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.028
PMID:38821358
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研究论文 | 本研究揭示了交感神经过度支配通过促进血管平滑肌细胞表型转换驱动腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现交感神经过度支配在腹主动脉瘤中的作用,并阐明其通过eATP-P2rx4-p38信号通路和破骨样细胞分泌Sema4D的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究交感神经过度支配在腹主动脉瘤发展中的作用及分子机制 | 小鼠腹主动脉瘤模型和腹主动脉瘤患者组织样本 | 分子病理学 | 腹主动脉瘤 | Western blotting, 免疫化学染色, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型(Sema4D-/-) | 蛋白质印迹数据, 免疫染色图像, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6034 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered the immunoregulatory mechanism of TPPU in alleviating sepsis-related acute liver injury
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.018
PMID:39956402
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示TPPU通过调节巨噬细胞和中性粒细胞缓解脓毒症相关急性肝损伤的免疫调节机制 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明sEH抑制剂TPPU通过促进抗炎性M2样巨噬细胞和CAMP+NGP+CD177+中性粒细胞扩增,并抑制CCL6-CCR1信号通路来改善脓毒症肝损伤 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究TPPU在缓解脓毒症相关急性肝损伤中的免疫调节机制 | 脓毒症相关急性肝损伤小鼠模型 | 单细胞分析 | 脓毒症相关急性肝损伤 | 飞行时间流式细胞术,单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据,流式细胞数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,飞行时间流式细胞术 | NA | NA |
6035 | 2025-10-06 |
Robust generation of photoreceptor-dominant retinal organoids from porcine induced pluripotent stem cells
2025-04-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102425
PMID:40054472
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研究论文 | 本研究开发了从猪诱导多能干细胞高效生成光感受器主导的视网膜类器官的方法 | 建立了首个能够稳定生成猪诱导多能干细胞来源视网膜类器官的系统,解决了猪这一重要临床前大动物模型中视网膜细胞来源问题 | 研究主要聚焦于类器官的生成和表征,尚未进行体内移植功能验证 | 开发猪诱导多能干细胞生成视网膜类器官的可靠方法,为视网膜退行性疾病研究提供临床前模型 | 猪诱导多能干细胞及其分化的视网膜类器官 | 再生医学 | 视网膜退行性疾病 | 免疫细胞化学,单细胞RNA测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6036 | 2025-10-06 |
Impact of lymph node metastasis on immune microenvironment and prognosis in colorectal cancer liver metastasis: insights from multiomics profiling
2025-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02921-2
PMID:39753715
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨淋巴结转移对结直肠癌肝转移患者预后的影响及其免疫机制 | 首次整合SEER数据库和中国多中心队列,结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和蛋白质组学数据系统分析淋巴结转移对免疫微环境的影响 | 回顾性研究设计,需要前瞻性验证 | 研究淋巴结转移对结直肠癌肝转移患者预后的影响及免疫机制 | 结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 病理图像 | 来自SEER队列和中国多中心队列的结直肠癌肝转移患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
6037 | 2025-10-06 |
Exploration of common molecular mechanisms of psoriatic arthritis and aging based on integrated bioinformatics and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167730
PMID:39965531
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研究论文 | 通过整合生物信息学和单细胞RNA测序分析探索银屑病关节炎与衰老的共同分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序数据整合分析发现银屑病关节炎与衰老共享的CD8-CM细胞亚群和关键基因 | 样本来源有限,仅分析了滑膜液和外周血数据 | 研究银屑病关节炎与衰老之间的共同分子机制 | 银屑病关节炎患者的滑膜液、衰老患者的外周血样本以及正常人群 | 生物信息学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, KEGG通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 银屑病关节炎患者滑膜液、衰老患者外周血和正常人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6038 | 2025-10-06 |
20 years of stemness: From stem cells to hypertranscription and back
2025-03-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102406
PMID:39919752
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综述 | 回顾干细胞转录组学20年发展历程,探讨干细胞超转录状态的发现与意义 | 发现2002年干细胞特征基因签名实际上是干细胞超转录状态的标志,这一发现早于超转录概念的确立 | NA | 回顾干细胞转录组学研究进展,探讨干细胞超转录状态的特征与意义 | 胚胎干细胞和成体干细胞 | 转录组学 | NA | 微阵列,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6039 | 2025-10-06 |
Profiling immune cell tissue niches in the spatial -omics era
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.001
PMID:39522655
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综述 | 本文综述了空间组学技术在免疫细胞组织生态位研究中的最新进展,并提出了定义免疫生态位的三步框架 | 提出了定义和表征免疫生态位的三步框架,整合了空间多参数分析的最新方法学进展 | 免疫生态位的定义标准在文献中存在不一致性,且空间分析方法仍在发展中 | 探讨空间组学技术如何促进对组织免疫景观的深入理解 | 免疫细胞及其组织环境 | 空间组学 | 免疫相关疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6040 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and machine learning provide candidate drugs against drug-tolerant persister cells in colorectal cancer
2025-03, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167693
PMID:39870146
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习方法,在结直肠癌患者来源类器官中识别药物耐受持久性细胞并筛选候选药物 | 首次在家族性腺瘤性息肉病相关类器官中应用单细胞RNA测序和机器学习识别DTP细胞,并发现YM-155和THZ2与曲美替尼的协同作用 | 研究仅基于三个患者来源类器官样本,样本量有限 | 开发针对结直肠癌中药物耐受持久性细胞的靶向治疗策略 | 家族性腺瘤性息肉病患者来源的类器官(良性肿瘤、恶性肿瘤和正常类器官) | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 3个患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |