单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
6001 2024-11-24
Macrophage depletion in inflamed rat knees prevents the activation of synovial mesenchymal stem cells by weakening Nampt and Spp1 signaling
2024-Nov-20, Inflammation and regeneration IF:5.0Q1
研究论文 研究探讨了在炎症状态下,通过清除巨噬细胞来抑制滑膜间充质干细胞的激活 首次揭示了巨噬细胞通过Nampt和Spp1信号通路调控滑膜间充质干细胞的激活 研究仅在急性炎症模型中进行,未探讨慢性炎症情况下的效果 探究巨噬细胞在炎症和组织再生中的作用及其与滑膜间充质干细胞的相互作用 滑膜间充质干细胞和巨噬细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及大鼠膝关节样本,具体数量未明确提及
6002 2024-11-24
Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids
2024-Nov-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究分析了肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官的分子异质性和药物敏感性 通过单细胞RNA测序/ATAC测序、空间转录组学和高通量药物筛选,揭示了肝母细胞瘤中两种不同的肿瘤上皮特征及其药物敏感性 NA 研究肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性,以开发靶向疗法 肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序/ATAC测序、空间转录组学、高通量药物筛选 NA 基因表达数据 肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官
6003 2024-11-24
A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma
2024-Nov-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究使用组织学引导和空间转录组学技术,分析了肝母细胞瘤中胚胎胆道谱系程序与Wnt激活的相互作用,揭示了非遗传机制对肿瘤进化的影响 揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt/β-catenin信号通路的合作,通过FGF19作为旁分泌生长信号促进肿瘤细胞增殖的机制 NA 探讨肝母细胞瘤中胚胎胆道谱系程序与Wnt激活的相互作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 肝母细胞瘤 数字病理学 儿童疾病 空间转录组学 NA 转录组数据 患者来源的肿瘤细胞
6004 2024-11-24
Pulrodemstat, a selective inhibitor of KDM1A, suppresses head and neck squamous cell carcinoma growth by triggering apoptosis
2024-Nov-20, BMC pharmacology & toxicology IF:2.8Q2
研究论文 研究了一种名为Pulrodemstat的选择性KDM1A抑制剂,通过触发凋亡来抑制头颈鳞状细胞癌的生长 Pulrodemstat在临床试验中显示出比传统化疗药物5-Fu更强的抗肿瘤活性,并且对正常细胞无毒性 NA 寻找更精确和有效的头颈鳞状细胞癌治疗方案 头颈鳞状细胞癌 NA 头颈鳞状细胞癌 高通量筛选、单细胞测序、CCK-8检测、流式细胞术 NA 基因组数据 NA
6005 2024-11-24
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究通过阻断TNFR2受体来增强胰腺导管腺癌(PDAC)的抗肿瘤免疫反应 提出了一种新的治疗策略,即结合CD40激动剂和TNFR2拮抗剂来治疗PDAC 单独使用TNFR2阻断剂对CD8+ T细胞的激活效果有限,肿瘤生长抑制效果不显著 探讨TNFR2阻断剂在PDAC中的抗肿瘤免疫反应机制 胰腺导管腺癌(PDAC)患者和免疫活性小鼠模型 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞分析数据 24名PDAC患者和免疫活性小鼠模型
6006 2024-11-24
Prediction of single-cell RNA expression profiles in live cells by Raman microscopy with Raman2RNA
2024-Nov, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Raman2RNA的方法,通过拉曼显微镜图像预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 Raman2RNA方法通过无标记的超光谱拉曼显微镜图像和领域翻译技术,实现了对活细胞中单细胞RNA表达谱的非破坏性预测 NA 开发一种非破坏性的方法来预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 活细胞中的单细胞RNA表达谱 数字病理学 NA 拉曼显微镜 对抗自编码器 图像 涉及小鼠成纤维细胞和胚胎干细胞的活细胞追踪
6007 2024-11-24
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用,特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 NA 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 甲状腺乳头状癌和正常样本
6008 2024-11-24
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
综述 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病(PD)的文献,特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果,展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 本文主要基于文献综述,未提供新的实验数据 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 帕金森病患者的人脑组织 数字病理学 神经退行性疾病 RNA测序 NA 转录组数据 NA
6009 2024-11-24
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
综述 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术,并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态,还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 NA 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用,揭示疾病的具体机制,并为新的治疗策略提供依据 神经系统疾病及其相关细胞 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
6010 2024-11-24
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用,并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 NA 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 肿瘤学 NA RNA测序 (RNA-seq),单细胞RNA测序 (scRNA-seq),CRISPR Cas9 NA RNA 多种癌细胞系,小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型,人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞
6011 2024-11-24
Targeting IL-33 reprograms the tumor microenvironment and potentiates antitumor response to anti-PD-L1 immunotherapy
2024-09-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究探讨了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用,并开发了sST2-Fc融合蛋白和双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2,以增强抗肿瘤效果 首次揭示了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的免疫抑制机制,并开发了新的融合蛋白策略以增强抗肿瘤效果 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在临床试验中验证其效果 探讨IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用,并开发新的治疗策略以增强抗肿瘤效果 IL-33/ST2信号、PD-L1抗体、sST2-Fc融合蛋白、双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2 NA 肺癌、结肠癌 RNA测序、ELISA、WB、免疫荧光 NA RNA、蛋白质 小鼠肿瘤模型
6012 2024-11-24
Bulk and single cells transcriptomes with experimental validation identify USP18 as a novel glioma prognosis and proliferation indicator
2024-May, Experimental and therapeutic medicine IF:2.4Q3
研究论文 本研究通过批量和单细胞转录组分析,结合实验验证,揭示了USP18作为胶质瘤预后和增殖的新指标 首次揭示了USP18在胶质瘤中的上调与不良预后相关,并影响患者对免疫治疗的反应 研究仅限于U251和U87MG ATCC细胞系,未涵盖所有胶质瘤细胞类型 探讨USP18在胶质瘤中的作用及其对预后和增殖的影响 胶质瘤细胞和患者的预后及增殖情况 数字病理学 脑癌 转录组分析 NA 转录组数据 U251和U87MG ATCC细胞系
6013 2024-11-24
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits IF:3.4Q2
review 本文综述了果蝇听觉感知中的“先天与后天”现象,特别是歌曲偏好学习的神经机制 整合了单细胞转录组和脑连接组等组学数据库,结合传统分子遗传学,使果蝇成为研究听觉感知和行为中“先天与后天”神经基础的杰出模型 NA 探讨果蝇歌曲偏好学习的神经机制及其在听觉感知和行为中的作用 果蝇的歌曲偏好学习及其神经回路 NA NA NA NA NA NA
6014 2024-11-24
Single-cell sequencing reveals transcriptional dynamics regulated by ERα in mouse ovaries
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究使用单细胞RNA测序揭示ERα在小鼠卵巢中的转录调控动态 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ERα缺失对卵巢细胞转录组的影响 研究仅限于αERKO小鼠模型,可能无法完全代表所有卵巢功能障碍的情况 阐明ERα调控卵巢细胞转录动力学的分子机制 ERα敲除小鼠的卵巢细胞 NA NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 转录组数据 野生型和αERKO小鼠的卵巢细胞
6015 2024-11-24
BreCML: identifying breast cancer cell state in scRNA-seq via machine learning
2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本文开发了一种基于机器学习的预测工具BreCML,用于准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因 BreCML在训练数据集上达到了98.92%的准确率,并在测试数据集上展示了卓越的准确性、精确度、召回率和F1分数 NA 开发一种能够准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因的机器学习预测工具 乳腺癌细胞及其相关标记基因 机器学习 乳腺癌 scRNA-seq XGBoost 基因数据 NA
6016 2024-11-24
Cellular Characterization and Interspecies Evolution of the Tree Shrew Retina across Postnatal Lifespan
2024, Research (Washington, D.C.)
研究论文 研究了树鼩视网膜细胞在出生后生命周期中的细胞特征和跨物种进化 建立了树鼩视网膜细胞的年龄相关单细胞RNA测序图谱,并进行了跨物种分析 NA 探讨树鼩视网膜细胞在不同年龄阶段的细胞组成和基因表达模式 树鼩视网膜细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 15只树鼩
6017 2024-11-24
Integrated analysis of single-cell, spatial and bulk RNA-sequencing identifies a cell-death signature for predicting the outcomes of head and neck cancer
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,识别出一种细胞死亡特征,用于预测头颈部癌症的预后 本文创新性地整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,构建了一个细胞死亡相关特征风险评分模型(CDRscore),用于预测头颈部癌症的预后 NA 研究细胞死亡在头颈部癌症复发和术后预后中的作用,并开发一种预测预后的模型 头颈部癌症患者的单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和空间转录组学数据 数字病理学 头颈部癌症 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 机器学习模型 RNA测序数据 涉及五种主要亚型的头颈部癌症相关单细胞RNA测序数据,以及来自TCGA数据集的批量RNA测序数据和喉鳞状细胞癌的空间转录组学数据
6018 2024-11-23
Atlas of Metastatic Gastric Cancer Links Ferroptosis to Disease Progression and Immunotherapy Response
2024-Dec, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 研究通过单细胞转录组和免疫分析,揭示了胃腺癌转移过程中铁死亡与疾病进展及免疫治疗反应的关系 首次大规模分析了胃腺癌转移的单细胞数据,揭示了铁死亡在疾病进展中的作用,并提出了联合CAR-T细胞疗法的新治疗策略 研究主要集中在治疗前患者的样本,未来需进一步验证在治疗后患者中的效果 深入理解胃腺癌转移的肿瘤和免疫生物学机制,开发创新有效的治疗方法 胃腺癌转移的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 胃癌 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 68对治疗前原发性和转移性肿瘤样本
6019 2024-11-23
CVGAE: A Self-Supervised Generative Method for Gene Regulatory Network Inference Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出了一种基于单细胞RNA测序数据的自我监督生成方法CVGAE用于基因调控网络推断 使用图神经网络进行归纳表示学习,将基因表达数据和观测拓扑结构合并到低维向量空间中,并采用多层GraphSAGE作为编码器和改进的解码器来克服网络稀疏性问题 NA 改进基因调控网络推断的准确性和模型泛化能力 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图神经网络 基因表达数据 多个包含四个相关真实网络的单细胞数据集
6020 2024-11-23
Luteinizing Hormone Receptor Mutation (LHRN316S) Causes Abnormal Follicular Development Revealed by Follicle Single-Cell Analysis and CRISPR/Cas9
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 通过单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9技术研究黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响 首次通过单细胞RNA测序揭示了黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响,并利用CRISPR/Cas9技术构建了LHR小鼠模型 研究主要集中在体外实验和小鼠模型,需要进一步的人体研究来验证结果 探讨黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响及其在女性不孕治疗中的潜在应用 卵泡中的卵母细胞、卵丘颗粒细胞和壁颗粒细胞 NA 女性不孕 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9 NA RNA 14只LHR雌性小鼠和ICR野生型雄性小鼠交配
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