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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 6001 - 6020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6001 | 2025-12-24 |
Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP)
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
PMID:40992707
|
综述 | 本文综述了人工智能在癌症空间转录组学中的应用，特别聚焦于YY1和RKIP蛋白，探讨了机器学习、人工智能和统计方法在解析空间转录组数据、推动癌症分类、临床结果预测及个性化医疗方面的作用 | 通过整合机器学习、人工智能和统计方法，为空间转录组数据提供新的解析视角，特别以YY1和RKIP为例，展示了这些技术在揭示癌基因驱动因子、癌症异质性和个性化治疗途径中的创新应用 | 作为一篇综述文章，主要基于现有研究进行总结和讨论，未涉及原始数据或实验验证，可能无法覆盖所有最新技术进展 | 探讨人工智能和机器学习方法在癌症空间转录组学研究中的应用，以提升对癌症微环境、基因表达及个性化治疗的理解 | 空间转录组学数据，特别关注YY1和RKIP蛋白在癌症中的表达和作用 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学技术 | 支持向量机(SVM), 随机森林(RF), 聚类, 降维方法(PCA, t-SNE, UMAP) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6002 | 2025-12-24 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除痛觉外还具有调节功能，并验证了通过抑制神经支配或CGRP信号可显著减缓肉瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析虽支持结论但需进一步验证 | 探索感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 | 小鼠骨肉瘤模型及人类骨肉瘤样本 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多模态多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | 小鼠模型及人类骨肉瘤样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6003 | 2025-12-24 |
A defined bacterial consortium and spatial transcriptomics highlight the complex interaction between Campylobacter jejuni and the murine intestine
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.23.678081
PMID:41040308
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研究论文 | 本研究通过建立定义的细菌联合体并结合空间转录组学技术，揭示了空肠弯曲菌与小鼠肠道之间复杂的相互作用 | 首次使用定义的13种细菌联合体（C13）和空间转录组学技术，高分辨率地解析了感染诱导的基因表达空间分布和宿主-微生物-病原体互作 | 研究基于无菌小鼠模型，可能无法完全反映自然状态下复杂微生物群落的影响，且样本量有限 | 阐明特定肠道细菌与空肠弯曲菌介导的宿主反应之间的相互作用机制 | 无菌C57BL/6小鼠、定义的13种细菌联合体（C13）、空肠弯曲菌81-176菌株 | 空间转录组学 | 肠道感染 | 16S rRNA基因测序、荧光原位杂交（FISH）、RNAscope、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、微生物组成数据 | 三组无菌小鼠（C13组、C13+空肠弯曲菌组、无菌对照组），具体数量未明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6004 | 2025-09-07 |
Comment on "Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network pharmacology"
2025-Sep-06, Urolithiasis
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00240-025-01839-5
PMID:40913665
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6005 | 2025-12-24 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前庭毛细胞中动纤毛的分子特征，结合免疫染色和活体成像，证明了动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的分子特性，并具有主动运动能力 | 首次通过单细胞RNA测序揭示前庭毛细胞动纤毛的分子双重身份，并证实其具有主动运动能力，填补了结构、分子组成和功能上的知识空白 | NA | 阐明前庭毛细胞动纤毛的结构、分子组成和功能特性 | 成年小鼠、斑马鱼、人类的前庭毛细胞以及牛蛙和小鼠的壶腹嵴毛细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色、活体成像 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 成年小鼠、斑马鱼、人类的前庭毛细胞以及牛蛙和小鼠的壶腹嵴毛细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6006 | 2025-12-24 |
EnrichSci: Transcript-guided Targeted Cell Enrichment for Scalable Single-Cell RNA Sequencing
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651937
PMID:40654882
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研究论文 | 本研究开发了一种名为EnrichSci的可扩展单细胞RNA测序平台，用于靶向富集和解析复杂组织中稀有细胞类型的转录组动态 | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引技术，实现了无需微流控的靶向细胞富集，并首次在单细胞水平揭示了衰老过程中少突胶质细胞亚型的转录后调控特征 | 研究目前仅在小鼠脑衰老模型中验证，尚未在人类样本或其他疾病模型中广泛应用 | 开发可扩展的靶向单细胞转录组测序技术，以解析复杂组织中稀有细胞类型的分子动态 | 衰老小鼠脑组织中的少突胶质细胞及其亚型 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，杂交链式反应RNA FISH，组合索引 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | EnrichSci | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引的微流控-free单核转录组测序平台 |
| 6007 | 2025-12-24 |
Integrative analysis of taurine metabolism-related genes prognostic signature with immunotherapy and identification of ABCB1 and GORASP1 as key genes in nasopharyngeal carcinoma
2025-Apr-24, Amino acids
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s00726-025-03452-7
PMID:40272558
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研究论文 | 本研究通过整合多数据库数据，构建了与牛磺酸代谢相关基因的预后特征模型，并验证了其在鼻咽癌中的预后价值及与免疫治疗和药物敏感性的关联 | 首次报道了牛磺酸代谢相关基因在鼻咽癌中的作用，并构建了一个基于三个关键基因的预后模型，同时通过分子对接和单细胞测序验证了其可靠性 | 研究主要基于数据库分析和实验验证，样本量可能有限，且模型在临床广泛应用前需进一步验证 | 探究牛磺酸代谢相关基因在鼻咽癌中的预后价值及其与免疫治疗和药物敏感性的关系 | 鼻咽癌患者 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 基因表达分析、Cox回归、LASSO回归、免疫组化、分子对接、单细胞测序 | 预后特征模型 | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6008 | 2025-12-24 |
Turncoat antibodies unmasked in a model of autoimmune demyelination: from biology to therapy
2024-Dec-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.623846
PMID:39677612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自身免疫性脑脊髓炎模型中产生致病性抗体的浆母细胞特性，并开发了一种新型抗体疗法来中和这些致病抗体 | 首次在EAE模型中发现分泌致病性抗体的滤泡外浆母细胞，并利用合成抗体8-18C5及其变体成功阻断致病抗体结合，为自身免疫性疾病提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类MOGAD患者的验证数据有限，且抗体疗法的长期安全性和有效性需进一步评估 | 开发选择性中和致病性自身抗体的疗法，并深入理解自身免疫性脑脊髓炎模型中抗体反应的生物学特性 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型和MOG抗体疾病（MOGAD）患者样本 | NA | 自身免疫性脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6009 | 2025-12-24 |
The MRAP2 accessory protein directly interacts with melanocortin-3 receptor to enhance signaling
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.06.622243
PMID:39574659
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研究论文 | 本文通过单分子下拉技术证实了MC3R与MRAP2的相互作用，并揭示了MRAP2如何增强MC3R信号传导，从而在能量稳态中发挥关键作用 | 首次使用单分子下拉技术确认MC3R与MRAP2的相互作用，并发现它们以1:1化学计量形成异二聚体，同时通过结构模型和突变分析揭示了关键相互作用残基 | 研究主要在HEK293细胞中进行，可能无法完全反映体内复杂环境，且功能分析集中于cAMP信号通路，其他信号途径的影响未全面探讨 | 探究MRAP2对MC3R信号传导的调节机制及其在能量稳态中的作用 | MC3R受体、MRAP2辅助蛋白及其在HEK293细胞和人类下丘脑神经元中的相互作用 | 分子生物学 | 肥胖症 | 单分子下拉技术、荧光光漂白分析、单核转录组学、空间转录组学、结构同源建模、丙氨酸诱变 | NA | 细胞实验数据、转录组数据、结构模型数据 | HEK293细胞系及人类下丘脑神经元样本 | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6010 | 2025-12-24 |
TrkA + sensory neurons regulate osteosarcoma proliferation and vascularization to promote disease progression
2024-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.20.599869
PMID:38979210
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研究论文 | 本研究揭示了表达TrkA的感觉神经元通过调节肿瘤微环境中的CGRP和VEGF信号通路，促进骨肉瘤的生长、血管化和疾病进展 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨肉瘤进展中具有超越痛觉感知的调控功能，并证实通过抑制TrkA或使用局麻药脂质体可破坏肿瘤神经支配，从而抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的多组学分析仍需进一步验证；临床转化潜力有待后续研究确认 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控功能及其分子机制 | 骨肉瘤（OS）小鼠模型、人类骨肉瘤骨样本、人类背根神经节神经元 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多组学分析、化学遗传学方法 | NA | 转录组数据、多组学数据 | 转基因小鼠模型及人类样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6011 | 2025-12-24 |
Under pressure: integrated endothelial cell response to hydrostatic and shear stresses
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596749
PMID:38854073
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研究论文 | 本研究探讨了流体静压和剪切应力对内皮细胞响应的综合影响，通过体外模型和转录组分析揭示了压力在血管发育和疾病中的协同作用 | 开发了体外模型以研究压力如何影响内皮细胞对流动的响应，首次系统性地整合了流体静压与剪切应力在内皮细胞机械转导中的作用 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的血管环境；压力与剪切应力的相互作用机制仍需进一步探索 | 阐明流体静压和剪切应力在内皮细胞身份和功能中的综合作用，以更好地理解血管发育和疾病机制 | 人类内皮细胞和早期小鼠胚胎血管发育过程 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6012 | 2025-12-24 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、谱系追踪和基因靶向技术，揭示了皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子动态，并发现了一种非内皮性间充质神经周细胞类型 | 首次描述了一种非典型VE-钙黏蛋白细胞群，即非内皮性间充质神经周细胞，并揭示了Alk1在该细胞中维持神经分支稳态的新作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性的验证尚需进一步研究 | 探究皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子机制 | 小鼠皮肤VE-钙黏蛋白细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、基因靶向 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6013 | 2025-12-24 |
Constructing a full, multiple-layer interactome for SARS-CoV-2 in the context of lung disease: Linking the virus with human genes and microbes
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011222
PMID:37410793
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研究论文 | 本研究通过开发MLCrosstalk统计建模方法，构建了SARS-CoV-2在肺部疾病背景下的全多层互作网络，整合病毒、人类基因和微生物数据 | 首次提出基于潜在狄利克雷分配的MLCrosstalk方法，超越已知蛋白质互作，构建包含miRNA、人类蛋白编码基因和外源微生物的完整SARS-CoV-2互作组 | 方法依赖患者样本数据的共现模式，可能受样本选择和测序技术限制，且网络推断需要进一步实验验证 | 构建SARS-CoV-2感染的全互作网络，以促进COVID-19新药开发、区分长新冠特征并识别器官病理学标志 | SARS-CoV-2病毒、人类蛋白编码基因、microRNAs（miRNAs）及外源微生物（如Rothia mucilaginosa和Prevotella melaninogenica） | 生物信息学 | COVID-19 | 统计建模、网络传播分析、单细胞测序数据验证 | 潜在狄利克雷分配（LDA） | 多源组学数据（微生物、基因、miRNA、蛋白质互作） | 未明确指定样本数量，基于患者样本数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6014 | 2025-12-24 |
Single-cell transcriptomics of adult skin VE-cadherin expressing lineages during hair cycle
2023-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533784
PMID:36993228
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠毛发周期中表达VE-cadherin的皮肤细胞群体，揭示了血管内皮细胞在毛发生长过程中的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下比较了毛发周期静止期和生长期中VE-cadherin表达细胞的转录组变化，发现了持续增殖的内皮细胞亚群和与血管重塑相关的代谢改变 | 研究仅针对VE-cadherin表达细胞群体，未涵盖皮肤中所有细胞类型；使用小鼠模型的结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探究成年皮肤中血管内皮细胞谱系在毛发周期中的细胞和分子动力学变化 | 通过Cdh5-CreER遗传标记的VE-cadherin表达细胞，包括血液和淋巴管结构细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 单细胞转录组数据 | 从毛发周期静止期（telogen）和生长期（anagen）分选的VE-cadherin表达细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 6015 | 2025-12-24 |
Systematic single cell RNA sequencing analysis reveals unique transcriptional regulatory networks of Atoh1-mediated hair cell conversion in adult mouse cochleae
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0284685
PMID:38079436
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了成年小鼠耳蜗中Atoh1介导的毛细胞转换过程中的独特转录调控网络 | 采用多种高通量测序分析工具（WGCNA、SCENIC、ARACNE和VIPER）构建独立的表达模块，并识别出多个转换阶段，发现了包括Nhlh1、Lhx3、Barhl1和Nfia在内的关键调控因子 | 研究基于现有数据集（Yamashita等人，2018年）进行分析，可能受限于原始数据的质量和样本量，且主要关注成年小鼠模型，结果在人类或其他哺乳动物中的适用性需进一步验证 | 探究成年哺乳动物耳蜗中毛细胞再生的调控机制，特别是Atoh1诱导的支持细胞向毛细胞转换过程 | 成年小鼠耳蜗中的支持细胞和毛细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基于Yamashita等人（2018年）和Kolla等人（2020年）的公开数据集，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6016 | 2025-12-23 |
Pathway to precision: machine learning and bioinformatics in diabetes gene expression studies
2026-Jun, Journal of diabetes and metabolic disorders
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s40200-025-01814-2
PMID:41424950
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综述 | 本文综述了2020年至2024年间糖尿病基因表达研究中机器学习与生物信息学的应用现状与进展 | 系统性地将现有研究归纳为六个类别，并量化分析了最常用的数据采集技术、生物信息学方法和机器学习技术，同时指出了RNA-seq和单细胞RNA-seq等新技术在糖尿病研究中的应用不足 | 纳入文献仅限于2020-2024年发表的开放获取英文文章，可能遗漏更早或非英文的重要研究；且为综述性文章，未进行原始数据分析 | 总结糖尿病研究中生物信息学、基因表达分析和机器学习的最新进展，以促进糖尿病精准医疗的发展 | 糖尿病相关的基因表达数据、生物标志物及研究方法 | 生物信息学 | 糖尿病 | 微阵列、RNA-seq、单细胞RNA-seq | LASSO, PCA | 基因表达数据 | 基于96篇文献的综述 | NA | NA | NA | NA |
| 6017 | 2025-12-23 |
Decoding CNS regeneration: Insights from single-cell RNA sequencing in SCI and TBI across multiple species
2026-Jan-09, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤和创伤性脑损伤后中枢神经系统再生机制的多物种研究成果 | 通过整合哺乳动物、青蛙和斑马鱼等多种物种的scRNA-seq数据，进行跨物种比较分析，揭示了中枢神经系统损伤后保守的细胞反应和再生机制 | NA | 深入理解中枢神经系统损伤与修复的分子和细胞机制 | 脊髓损伤和创伤性脑损伤模型中的细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6018 | 2025-12-23 |
Single-cell RNA seq reveals heterogeneous survival strategies of Vibrio parahaemolyticus against ampicillin
2026-Jan, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107343
PMID:41297564
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研究论文 | 本研究创新性地应用基于液滴的单细胞RNA测序技术，揭示了副溶血弧菌在氨苄青霉素压力下的异质性生存策略 | 首次将液滴单细胞RNA测序技术应用于细菌耐药性异质性分析，突破了传统批量RNA测序只能获取群体平均表达水平的限制 | 研究仅针对氨苄青霉素一种抗生素，未涉及其他抗生素或联合用药场景 | 解析副溶血弧菌对抗生素的异质性耐药机制 | 副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus） | 微生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 6019 | 2025-12-23 |
Machine learning and multi-omics-based identification of hub paternal imprinted genes PEG11/RTL1, PEG9/DLK1, PEG6/NDN, and PEG5/NNAT in sperm of couples experiencing idiopathic recurrent pregnancy loss
2026-Jan-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111369
PMID:41397315
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和机器学习方法，鉴定了在特发性复发性妊娠丢失（IRPL）患者精子中异常表达和甲基化的关键父源印记基因 | 首次结合多组学数据和机器学习模型，系统性地揭示了父源印记基因在IRPL中的关键作用，并构建了高预测准确性的共识模型 | 样本量相对有限，且研究主要聚焦于特定父源印记基因，未全面评估其他潜在遗传或表观遗传因素 | 探究父源印记基因在特发性复发性妊娠丢失（IRPL）中的遗传和表观遗传贡献，并识别潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 经历特发性复发性妊娠丢失（IRPL）的夫妇的精子样本 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA-seq, DNA甲基化分析 | Random Survival Forest | 基因表达数据, DNA甲基化数据 | 未明确指定样本数量，但涉及IRPL组和对照组的精子样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6020 | 2025-12-23 |
Ischemia/Reperfusion Injury and Outcomes in Liver Transplantation Assessed by Omics Technologies: Where Do We Stand?
2026-Jan-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005466
PMID:40797081
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综述 | 本文综述了利用组学技术（如表观基因组学、转录组学和蛋白质组学）评估肝移植中缺血/再灌注损伤的研究进展 | 强调了单细胞RNA测序、空间转录组学和多重蛋白质组学等前沿组学技术的整合应用，为肝移植监测提供精确生物标志物和新疗法开发铺平道路 | NA | 深入理解肝移植中的生物学挑战，以改善患者护理和移植结果 | 肝移植过程中的缺血/再灌注损伤、移植物排斥或耐受以及疾病复发 | 数字病理学 | 肝移植相关并发症 | 表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、多重蛋白质组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重蛋白质组学 | NA | NA |