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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5981 - 6000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5981 | 2025-10-06 |
Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191059
PMID:40401523
|
综述 | 本文综述了心肺血管内皮细胞通过转录特征调控免疫反应在健康和疾病状态中的作用 | 揭示了心肺血管系统中内皮细胞亚群具有特异性免疫调节功能，及其在疾病中的转录重编程机制 | NA | 探讨内皮细胞在心肺健康与疾病中的免疫调节功能 | 心肺血管内皮细胞及其亚群 | 单细胞生物学 | 心肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5982 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing and Inferred Protein Activity Analysis Reveal a Distinct Tumor Phenotype in Early-Onset Colorectal Cancer Patients
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653154
PMID:40462964
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白活性分析揭示早发性结直肠癌的独特肿瘤表型 | 首次结合单细胞RNA测序和VIPER蛋白活性推断方法，识别出EO-CRC中TLR4/CCR5高表达的上皮亚群和成纤维细胞富集特征 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 比较早发性和晚发性结直肠癌的分子特征和肿瘤微环境差异 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 基因调控网络分析 | VIPER | 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 免疫荧光图像 | 整合公共数据和内部临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5983 | 2025-10-06 |
High-Resolution Spatial Profiling of Microglia Reveals Proximity Associated Immunometabolic Reprogramming in Alzheimer's Disease
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654329
PMID:40462993
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学揭示阿尔茨海默病中斑块邻近小胶质细胞的免疫代谢重编程 | 首次通过高分辨率空间转录组学解析小胶质细胞亚型分布及其与淀粉样斑块邻近关系的代谢通路变化 | 研究基于小鼠模型和有限的人类尸检组织，样本量相对有限 | 探究阿尔茨海默病病理特征邻近性对小胶质细胞基因表达的影响 | 小胶质细胞、淀粉样斑块、tau病理 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、机器学习 | 机器学习 | 空间基因表达数据 | 三种小鼠模型（PS19、APP/PS1、5xFAD）和人类尸检背外侧前额叶皮层组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台配合完全定制化基因panel |
| 5984 | 2025-10-06 |
PML1-Mediated Feedforward Loop Through PI3K and MAPK Axes Drives Endocrine Resistance
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653365
PMID:40463196
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研究论文 | 本研究揭示了PML1通过PI3K和MAPK信号轴驱动乳腺癌内分泌耐药的新机制 | 首次发现PML1介导的前馈循环机制是内分泌耐药的关键驱动因素，并证明三氧化二砷可有效破坏该循环 | 研究主要基于细胞模型，需要进一步临床验证 | 探索乳腺癌内分泌耐药机制并寻找克服耐药的治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 多种内分泌耐药乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5985 | 2025-10-06 |
Klf9 promotes the repair of myocardial infarction by regulating macrophage recruitment and polarization
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187072
PMID:40198141
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子Klf9通过调控IFN-γ/STAT1信号通路调节巨噬细胞募集和极化，促进心肌梗死后的修复过程 | 首次发现Klf9通过直接结合Stat1基因启动子调控其转录，进而影响巨噬细胞在心肌梗死后的动态变化过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究Klf9在心肌梗死后巨噬细胞表型和功能调控中的作用机制 | 小鼠心肌梗死模型中的巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型和Klf9敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5986 | 2025-10-06 |
The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189362
PMID:40100274
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研究论文 | 本研究揭示了急性应激通过脑-体回路抑制ILC2细胞活化从而缓解细菌性膀胱炎炎症反应的机制 | 首次发现急性应激通过下丘脑-垂体-肾上腺轴和糖皮质激素信号通路抑制ILC2细胞活化，介导抗炎反射 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证 | 阐明心理应激通过脑-体回路调节膀胱感染免疫反应的机制 | 尿路感染小鼠模型和膀胱免疫细胞 | 免疫学 | 泌尿系统感染 | 单细胞RNA测序，逆行标记 | 动物模型 | 基因表达数据，细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5987 | 2025-10-06 |
Target Screening and Single Cell Analysis of Diabetic Retinopathy and Hepatocarcinoma
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70521
PMID:40293350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别肝细胞癌与糖尿病视网膜病变之间的共享基因和通路 | 首次发现铁蛋白吞噬相关基因在HCC和DR中的共同作用机制，并构建了具有高诊断效能的机器学习模型 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证相对有限 | 探索肝细胞癌与糖尿病视网膜病变之间的共同病理机制和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本和糖尿病视网膜病变大鼠视网膜样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌, 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | GEO数据集GSM7494113, GSE209872, GSE160306 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5988 | 2025-10-06 |
A Robust Kernel-Based Workflow for Niche Trajectory Analysis
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401199
PMID:40411819
|
研究论文 | 提出一种基于核函数的生态位轨迹分析工作流程，用于建模组织微环境的空间连续变化 | 开发了无需细胞类型注释的核函数策略，将生态位结构建模为基因表达空间的连续函数 | NA | 改进空间转录组数据分析方法，提高生态位轨迹分析的稳健性和准确性 | 组织微环境的空间变化 | 空间转录组学 | 组织损伤相关疾病 | 核函数方法，细胞类型反卷积分析 | 核函数模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5989 | 2025-10-06 |
SpaMask: Dual masking graph autoencoder with contrastive learning for spatial transcriptomics
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012881
PMID:40179332
|
研究论文 | 提出一种名为SpaMask的双重掩码图自编码器，结合对比学习用于空间转录组学数据分析 | 首次在空间转录组学中引入双重掩码机制，同时掩码节点和边，并结合图自编码器与对比学习模块 | 未明确说明 | 提高空间转录组学数据聚类的准确性和鲁棒性 | 空间转录组学数据中的细胞位置和基因表达 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨转录组学 | 图神经网络, 图自编码器, 对比学习 | 空间基因表达数据 | 来自5个不同平台的8个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5990 | 2025-10-06 |
[Mechanism of Quanduzhong Capsules in treating knee osteoarthritis from perspective of spatial heterogeneity]
2025-Apr, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学数据挖掘和动物实验验证，系统表征拳杜仲胶囊对膝骨关节炎软骨病变的靶向作用 | 首次从空间异质性角度揭示拳杜仲胶囊在膝骨关节炎不同软骨区域的靶向作用机制 | 研究主要基于大鼠模型和有限临床样本，需进一步扩大临床验证 | 阐明拳杜仲胶囊治疗膝骨关节炎的作用机制 | SD大鼠膝骨关节炎模型和临床膝骨关节炎患者软骨组织 | 空间转录组学 | 膝骨关节炎 | 空间转录组学,HE染色,免疫组化,生物信息学分析 | NA | 空间转录组数据,组织图像数据 | SD大鼠模型和临床患者软骨组织数据集GSE254844 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5991 | 2025-10-06 |
Proximal tubule cells contribute to the thin descending limb of the loop of Henle during mouse kidney development
2025-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633065
PMID:39868227
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠肾脏单细胞RNA测序数据和谱系追踪实验，揭示了近端小管细胞在肾脏发育过程中对髓袢降支细段形成的贡献 | 首次发现近端小管细胞可分化形成髓袢降支细段细胞，并证实转录因子Hnf4a在此过程中的关键调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究肾脏发育过程中髓袢降支细段细胞的起源和形成机制 | 发育中的小鼠肾脏细胞 | 发育生物学 | 肾脏发育疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，基因敲除 | NA | 单细胞基因表达数据 | 整合多个非突变发育小鼠肾脏数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5992 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals atypical monocytes circulating ahead of acute graft-versus-host disease clinical onset
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae229
PMID:39432735
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现急性移植物抗宿主病临床发病前循环中的非典型单核细胞 | 首次在aGVHD临床发病前长达18天的血液样本中发现特定单核细胞和细胞毒性T细胞亚群，并鉴定出CD163/SIGLEC1共表达单核细胞作为早期生物标志物 | 样本量较小（3例患者+1例对照），需要更大规模研究验证 | 探索急性移植物抗宿主病的早期诊断生物标志物 | 异基因造血干细胞移植患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 3例aGVHD患者+4例对照患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5993 | 2025-10-06 |
CoupleVAE: coupled variational autoencoders for predicting perturbational single-cell RNA sequencing data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf126
PMID:40178283
|
研究论文 | 提出一种名为CoupleVAE的耦合变分自编码器方法，用于预测扰动后的单细胞RNA测序数据 | 通过两个耦合的VAE和连接器实现潜在空间中更复杂的单细胞状态转换，在三个真实数据集上验证了其优越性能 | NA | 预测单细胞扰动响应，解决计算生物学领域的关键挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5994 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis and luteolin treatment reveal three adipogenic genes, including Aspn, Htra1 and Efemp1
2025-03, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
DOI:10.1016/j.bbalip.2024.159585
PMID:39662603
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现Aspn、Htra1和Efemp1是木犀草素可上调的脂肪生成抑制基因 | 首次通过比较肥胖与瘦小鼠脂肪干祖细胞的单细胞转录组数据，鉴定出三个新的脂肪生成抑制基因，并发现木犀草素能逆转这些基因的表达下调 | 研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系，尚未在人类样本中验证 | 鉴定新的脂肪生成相关基因并探索木犀草素的调控作用 | 小鼠皮下脂肪组织中的脂肪干祖细胞和3T3-L1前脂肪细胞系 | 单细胞组学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5995 | 2025-10-06 |
Integrative genetics and multiomics analysis reveal mechanisms and therapeutic targets in vitiligo highlighting JAK STAT pathway regulation of CTSS
2025-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86134-4
PMID:39824912
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研究论文 | 通过整合遗传学和多组学分析揭示白癜风发病机制及治疗靶点，重点关注JAK/STAT通路对CTSS的调控作用 | 首次通过整合GWAS荟萃分析、蛋白质数量性状位点(pQTL)和表达数量性状位点(eQTL)关联分析，结合微阵列和单细胞RNA-seq数据，系统揭示JAK/STAT通路调控CTSS在白癜风中的作用机制 | 需要进一步研究验证结果并评估CTSS及相关基因的治疗潜力 | 阐明白癜风发病的遗传和分子机制，识别潜在治疗靶点 | 白癜风患者 | 多组学分析 | 白癜风 | GWAS荟萃分析, SMR分析, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | NA | 遗传数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5996 | 2025-10-06 |
Big data analytics and scRNA-seq in human aortic aneurysms and dissections: role of endothelial MerTK
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.103851
PMID:39744231
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和大数据分析探讨了内皮细胞MerTK在人类升主动脉瘤和夹层中的作用机制 | 首次发现内皮细胞MerTK表达在AAAD中显著抑制，并证实其缺陷通过内皮功能障碍和SMC表型改变促进AAAD发展 | NA | 研究内皮细胞MerTK在升主动脉瘤和夹层发病机制中的作用 | 人类AAAD样本和内皮细胞特异性MerTK缺陷小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 约600,000次交叉分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5997 | 2025-10-06 |
PIM1 instigates endothelial-to-mesenchymal transition to aggravate atherosclerosis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.102597
PMID:39744686
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研究论文 | 本研究揭示了PIM1通过促进内皮-间质转化加重动脉粥样硬化的分子机制 | 首次发现PIM1/P-NDRG1(S330)/PTBP1/EndMT轴在动脉粥样硬化进展中的关键作用，并验证小分子抑制剂Max-40279的治疗潜力 | 机制研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类临床样本中充分验证 | 探究PIM1在动脉粥样硬化中调控内皮-间质转化的分子机制 | 小鼠动脉粥样硬化模型、人内皮细胞、小鼠内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qPCR, western blotting, 免疫组化, 免疫共沉淀, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织图像数据 | 小鼠动脉粥样硬化模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5998 | 2025-10-06 |
Research Trends and Dynamics in Single-cell RNA Sequencing for Musculoskeletal Diseases: A Scientometric and Visualization Study
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.104697
PMID:39898252
|
综述 | 通过科学计量学和可视化分析方法，系统回顾了过去15年单细胞RNA测序技术在肌肉骨骼疾病研究领域的发展趋势 | 首次对肌肉骨骼疾病领域单细胞RNA测序研究进行全面科学计量分析，识别关键研究方向和未来展望 | 仅基于Web of Science核心合集数据，可能存在文献收录不全的局限性 | 分析单细胞RNA测序在肌肉骨骼疾病研究中的发展趋势和现状 | 肌肉骨骼疾病相关的单细胞RNA测序研究文献 | 生物信息学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 2009年1月1日至2024年9月6日期间Web of Science核心合集收录的相关文献 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5999 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies Senescent Osteocytes That Trigger Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-12-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0857
PMID:39312185
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现衰老骨细胞是乳腺癌骨转移中引发骨破坏的关键因素 | 首次揭示乳腺癌骨转移中骨细胞发生早衰并产生促破骨细胞生成的衰老相关分泌表型 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程的机制 | 乳腺癌骨转移小鼠模型和患者样本中的骨细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，多重原位杂交，人工智能辅助分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 乳腺癌骨转移小鼠和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6000 | 2025-10-06 |
Dynamic Evolution of Fibroblasts Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Human Pancreatic Cancer
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0489
PMID:39485038
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示人类胰腺癌中成纤维细胞的动态演化过程 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析，开发新方法注释癌细胞基因组改变，首次系统揭示成纤维细胞在胰腺癌中的时空分化轨迹和细胞间互作网络 | NA | 研究胰腺导管腺癌中肿瘤微环境的基质重塑机制 | 正常、炎症和恶性胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |