单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 5981 - 6000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5981 | 2024-12-14 |
Unveiling the role of TGF-β signaling pathway in breast cancer prognosis and immunotherapy
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1488137
PMID:39664194
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号通路在乳腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 开发了一种新的TGF-β通路相关预后签名（TSPRS），并验证了其在乳腺癌预后和免疫治疗中的预测能力 | NA | 研究TGF-β信号通路与乳腺癌临床结果及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 乳腺癌患者的转录组和单细胞测序数据 | NA | 乳腺癌 | 转录组测序，单细胞测序，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌转录组和单细胞测序数据，涉及54个与TGF-β信号通路相关的基因 |
| 5982 | 2024-12-13 |
Computational analysis of the functional impact of MHC-II-expressing triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497251
PMID:39664386
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研究论文 | 研究分析了MHC-II表达的三阴性乳腺癌的功能影响 | 揭示了MHC-II表达的肿瘤细胞在调节免疫环境和影响患者生存结果中的功能重要性，并开发了一个包含40个显著基因的预后标志物，通过机器学习模型成功预测了患者的生存结果和免疫浸润程度 | NA | 理解MHC-II表达的肿瘤细胞在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA |
| 5983 | 2024-12-14 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
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研究论文 | 本研究探讨了补体C1q在肿瘤相关巨噬细胞介导的CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍中的作用 | 首次揭示了C1q在M2巨噬细胞极化中的依赖性作用，并证明了C1q缺乏可以恢复CD8 T细胞的耗竭状态，增强CD8 T细胞和NK细胞的免疫活性 | 实验仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究C1q在恶性胸腔积液中的作用及其对免疫细胞功能的影响 | 恶性胸腔积液中的巨噬细胞、CD8+ T细胞和NK细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq、代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、代谢物数据 | 使用C1qa小鼠MPE模型进行实验 |
| 5984 | 2024-12-14 |
Harnessing Nanotechnology for Gout Therapy: Colchicine-Loaded Nanoparticles Regulate Macrophage Polarization and Reduce Inflammation
2024, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0089
PMID:39665079
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研究论文 | 本研究探讨了秋水仙碱对巨噬细胞极化的调控作用，并开发了一种基于纳米载体的秋水仙碱递送系统，以增强痛风炎症的治疗效果 | 首次揭示了秋水仙碱通过关键基因AHNAK调控巨噬细胞极化的机制，并开发了一种基于R4F-NM@F127纳米载体的秋水仙碱递送系统，能够靶向调节巨噬细胞极化，减少对正常组织的毒性 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 探讨秋水仙碱对巨噬细胞极化的调控作用，并开发一种新的纳米载体系统以增强痛风的治疗效果 | 痛风小鼠模型中的巨噬细胞极化和炎症反应 | NA | 痛风 | 单细胞RNA测序、分子对接、慢病毒干预、生物化学指标检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、生物化学指标数据 | 小鼠模型和外周血单核细胞样本 |
| 5985 | 2024-12-14 |
A high OXPHOS CD8 T cell subset is predictive of immunotherapy resistance in melanoma patients
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20202084
PMID:34807232
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学发现了一种高氧化磷酸化（OXPHOS）的CD8 T细胞亚群，该亚群在黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂（ICI）疗法的耐药性相关，并开发了一种基于该细胞亚群转录组特征的ICI疗法反应预测模型 | 首次发现并验证了高OXPHOS的CD8 T细胞亚群（CD8+ TOXPHOS细胞）与黑色素瘤患者ICI疗法耐药性的关联，并开发了基于该细胞亚群的预测模型 | NA | 研究黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂疗法耐药性相关的免疫细胞亚群，并开发预测ICI疗法反应的模型 | 黑色素瘤患者的CD8 T细胞亚群及其与ICI疗法耐药性的关系 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个验证队列中的黑色素瘤患者 |
| 5986 | 2024-12-14 |
Cancer-Associated Fibroblasts and Squamous Epithelial Cells Constitute a Unique Microenvironment in a Mouse Model of Inflammation-Induced Colon Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.878920
PMID:35600339
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和多重免疫荧光成像（MxIF）分析了两种小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境差异 | 发现了AOM/DSS模型中癌症相关成纤维细胞（CAFs）和鳞状上皮细胞的独特微环境，并揭示了它们与肿瘤细胞的潜在机制联系 | NA | 揭示炎症诱导的结直肠癌模型中肿瘤微环境的复杂性 | 小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光成像（MxIF） | NA | 基因表达数据，图像 | 两种小鼠结直肠癌模型（Lrig1;Apc和AOM/DSS） |
| 5987 | 2024-12-14 |
STAT3 signaling in myeloid cells promotes pathogenic myelin-specific T cell differentiation and autoimmune demyelination
2020-03-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913997117
PMID:32094172
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研究论文 | 研究揭示了STAT3信号在髓系细胞中对病理性髓鞘特异性T细胞分化和自身免疫性脱髓鞘的促进作用 | 首次发现髓系细胞中的STAT3信号对髓鞘反应性T细胞的激活至关重要，并提出髓系STAT3作为自身免疫性脱髓鞘疾病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨STAT3信号在髓系细胞中对多发性硬化症（MS）发病机制的影响 | 髓系细胞、髓鞘特异性T细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE） | NA | 多发性硬化症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 野生型和突变型小鼠的髓系细胞 |
| 5988 | 2024-12-13 |
Immune cell-enriched single-cell RNA sequencing unveils the interplay between infiltrated CD8+ T resident memory cells and choroid plexus epithelial cells in Alzheimer's disease
2025-Jan-15, Journal of neuroimmunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jneuroim.2024.578488
PMID:39571412
|
研究论文 | 本研究通过免疫细胞富集的单细胞RNA测序，揭示了阿尔茨海默病中浸润的CD8+ T记忆细胞与脉络丛上皮细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了阿尔茨海默病模型小鼠中CD8+ T记忆细胞和脉络丛上皮细胞的基因表达差异，揭示了T细胞耗竭标志物的显著升高以及脉络丛上皮细胞基因表达模式的改变 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证结果 | 探索阿尔茨海默病脑微环境的特征及其潜在机制 | 阿尔茨海默病模型小鼠的脑实质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,587个单细胞样本，来自12个月大的5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和对照小鼠 |
| 5989 | 2024-12-13 |
SpaInGNN: Enhanced clustering and integration of spatial transcriptomics based on refined graph neural networks
2025-Jan, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.006
PMID:39542070
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进图神经网络的空间转录组学聚类与整合方法SpaInGNN，以提高空间域识别的准确性 | SpaInGNN通过整合空间位置数据、组织学信息和基因表达谱，利用图神经网络生成低维潜在嵌入，并结合组织图像距离和欧几里得距离优化空间位置图，从而提高空间域识别的准确性 | NA | 解决空间转录组学中单细胞水平空间域识别的挑战 | 小鼠嗅球和人类外侧前额叶皮层样本 | 空间转录组学 | NA | 图神经网络 | GNN | 空间位置数据、组织学信息、基因表达谱 | 小鼠嗅球和人类外侧前额叶皮层样本 |
| 5990 | 2024-12-13 |
CAR-NK cells derived from cord blood originate mainly from CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK progenitor cells
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101374
PMID:39659759
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研究论文 | 研究探讨了脐血来源的CAR-NK细胞主要来源于CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK祖细胞 | 首次确定CAR-NK细胞主要来源于CD56 NK祖细胞，并揭示了CD56CD7CD34HLA-DR Lin细胞是人类脐血来源CAR-NK细胞的主要来源 | 研究未详细探讨如何增强从这些NK祖细胞中产生NK细胞的质量和数量 | 探讨CAR-NK细胞在脐血中的起源 | 脐血来源的CAR-NK细胞及其祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 脐血单个核细胞 |
| 5991 | 2024-12-13 |
Tissue Resident CD8+T-cells as mediators of protective immunity in breastmilk transmission of HCMV
2024-Dec-11, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae618
PMID:39661655
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研究论文 | 研究探讨了母乳中CD8+T细胞在预防婴儿通过母乳感染人巨细胞病毒（HCMV）中的作用 | 首次描述了母乳中组织驻留记忆T细胞（Trm）的存在，并发现非传播者母亲母乳中CD8+ Trm T细胞的频率较高，且与母乳中HCMV病毒载量呈负相关 | 研究仅限于母乳中的T细胞，未探讨这些细胞在婴儿体内的作用机制 | 探讨母乳中T细胞在预防婴儿通过母乳感染HCMV中的作用 | 母乳中记忆T细胞的频率及类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及传播者和非传播者母亲的母乳样本 |
| 5992 | 2024-12-13 |
Cancer-associated fibroblasts promote melanoma progression by inducing immune evasion: A risk prediction study based on single-cell RNA-seq and RNA-Seq data
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.12.007
PMID:39665934
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5993 | 2024-12-13 |
Pericancerous cross-presentation to cytotoxic T lymphocytes impairs immunotherapeutic efficacy in hepatocellular carcinoma
2024-Dec-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.10.012
PMID:39547231
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研究论文 | 研究揭示了在肝细胞癌中，癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制介导的细胞质途径交叉呈递抗原给CD103细胞毒性T淋巴细胞，导致CD103 CTLs滞留在癌周区域，激活NLRP3炎症小体，促进肝癌进展并抵抗免疫治疗 | 首次揭示了癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制交叉呈递抗原给CD103 CTLs，并阐明了这一过程如何促进肝癌进展和免疫治疗抵抗 | 研究主要集中在单细胞RNA测序和空间转录组学分析，可能需要进一步的实验验证 | 探讨癌周巨噬细胞与细胞毒性T淋巴细胞在肝细胞癌中的相互作用及其对免疫治疗效果的影响 | 肝细胞癌患者的癌周巨噬细胞和CD103细胞毒性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 | NA | RNA | 肝细胞癌患者 |
| 5994 | 2024-12-13 |
A low level of tumor necrosis factor α in tumor microenvironment maintains the self-renewal of glioma stem cells by Vasorin-mediated glycolysis
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae147
PMID:39093693
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中低水平的肿瘤坏死因子α（TNFα）如何通过Vasorin介导的糖酵解维持胶质瘤干细胞（GSCs）的自我更新 | 首次揭示了TNFα通过Vasorin介导的糖酵解机制维持GSCs自我更新的作用，并解释了内源性TNFα在胶质母细胞瘤（GBM）治疗中失效的原因 | 研究主要基于体外和体内模型，尚未在临床试验中验证其有效性 | 探讨TNFα在肿瘤微环境中对GSCs自我更新的影响及其机制 | 胶质瘤干细胞（GSCs）和肿瘤微环境中的TNFα | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学、免疫印迹、球体形成实验、极限稀释、基因表达分析、质谱、RNA测序、qRT-RNA、免疫荧光、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 5995 | 2024-12-13 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和光谱细胞术分析了48个人类胶质瘤的免疫景观，揭示了IDH状态、复发和治疗对免疫微环境的影响 | 发现了22种与胶质瘤免疫相关的免疫细胞类型，并识别出表达颗粒酶的炎症性小胶质细胞亚群，提供了超越M1/M2范式的巨噬细胞极化框架和GlioTIME-36参考签名 | NA | 研究IDH状态、复发和治疗对人类胶质瘤免疫微环境的影响 | 人类胶质瘤的免疫细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组学，光谱细胞术 | NA | 转录组数据 | 48个人类胶质瘤样本，包含超过200万免疫细胞 |
| 5996 | 2024-12-13 |
Deletion of RFX6 impairs iPSC-derived islet organoid development and survival, with no impact on PDX1+/NKX6.1+ progenitors
2024-Dec, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06232-2
PMID:39080045
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研究论文 | 研究RFX6缺失对iPSC衍生的胰岛类器官发育和存活的影响，并探讨其在胰腺发育中的具体作用 | 首次揭示了RFX6在胰腺发育中的保护作用，并通过RNA-seq分析了RFX6缺失对胰腺内分泌分化、胰岛素分泌和离子转运相关基因的下调作用 | 研究主要集中在体外模型，未能在体内环境中验证RFX6缺失的影响 | 探讨RFX6在胰腺发育和糖尿病发病机制中的具体作用 | RFX6在胰腺发育中的表达及其对iPSC衍生的胰岛类器官发育和存活的影响 | 干细胞生物学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9, RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个iPSC系和hESC衍生的胰腺细胞 |
| 5997 | 2024-12-13 |
Characterizing the impacts of dataset imbalance on single-cell data integration
2024-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02097-9
PMID:38429430
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研究论文 | 本研究探讨了数据集不平衡对单细胞数据整合的影响，并提出了评估和缓解不平衡影响的工具和指南 | 引入了新的属性（聚合细胞类型支持和最小细胞类型中心距离）来量化不平衡的影响，并提出了平衡聚类指标和不平衡整合指南 | 未提及具体的局限性 | 研究数据集不平衡对单细胞转录组数据整合的下游分析和生物学解释的影响 | 单细胞转录组数据整合方法在不同样本和条件下的表现 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2600次整合实验 |
| 5998 | 2024-12-13 |
Single-cell atlas of healthy vocal folds and cellular function in the endothelial-to-mesenchymal transition
2024-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13723
PMID:39245637
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫染色技术，研究了成年Sprague-Dawley大鼠声带的细胞组成和功能 | 本文首次识别出与上皮-间充质转化相关的上皮细胞亚群，并揭示了其在病理状态下的功能重要性 | 研究仅限于成年Sprague-Dawley大鼠的声带，未涉及其他物种或病理条件 | 揭示声带黏膜的细胞和分子框架，并探讨发育通路在癌症病理状态中的功能重要性 | 成年Sprague-Dawley大鼠的声带细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5836个细胞 |
| 5999 | 2024-12-13 |
Omics in allergy and asthma
2024-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.09.023
PMID:39384073
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综述 | 本文综述了组学技术在过敏和哮喘研究中的变革性影响，重点介绍了基因组学和转录组学相关的高通量技术的进展 | 单细胞RNA测序技术的快速普及显著提升了对过敏性疾病分子病理学的理解，高通量基因组测序加速了单基因疾病的发现 | 微生物组学、蛋白质组学、脂质组学和代谢组学等领域虽然迅速发展，但许多当前的研究结果仍缺乏确凿的证据 | 探讨组学技术在过敏和哮喘研究中的应用，以期通过整合组学数据深入理解疾病机制，推动精准医学的发展 | 过敏和哮喘的分子病理学及相关的单基因疾病 | NA | 过敏和哮喘 | 单细胞RNA测序、高通量基因组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 6000 | 2024-12-13 |
A Single-Cell RNA Sequencing Guided Multienzymatic Hydrogel Design for Self-Regenerative Repair in Diabetic Mandibular Defects
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410962
PMID:39436107
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病环境下阻碍巨噬细胞极化的关键因素，并设计了一种多酶水凝胶支架用于糖尿病下颌骨缺损的自修复 | 通过单细胞RNA测序技术指导设计多酶水凝胶支架，显著提升了糖尿病环境下骨组织工程的自修复能力 | NA | 探索糖尿病环境下骨组织再生的新方法 | 糖尿病下颌骨缺损中的巨噬细胞、间充质干细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |