单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
581	2025-07-19	Identification and validation of genes related to stem cells and telomere maintenance mechanisms as biomarkers for breast cancer 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1618193 PMID:40666524	研究论文	该研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，探讨了干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因作为乳腺癌潜在生物标志物的作用及其细胞机制	首次整合转录组和单细胞RNA测序分析，揭示了JUN、NFKB1和SP1作为乳腺癌潜在生物标志物的作用，并强调了间充质细胞在肿瘤生物学中的关键角色	样本量较小（8个乳腺癌肿瘤样本和8个匹配的癌旁组织），可能影响结果的普遍性	探索干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因作为乳腺癌生物标志物的潜力及其作用机制	乳腺癌肿瘤样本和匹配的癌旁组织	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）	LASSO算法	RNA测序数据	8个乳腺癌肿瘤样本和8个匹配的癌旁组织
582	2025-07-19	Thymic hyperplasia in myasthenia gravis: a narrative review 2025, Mediastinum (Hong Kong, China) DOI:10.21037/med-25-12 PMID:40666538	综述	本文回顾了早期发病型重症肌无力(EOMG)中胸腺病理学的当前知识，探讨了导致胸腺增生的免疫学和环境因素，并指出了未来研究的方向	强调了新兴技术如单细胞和空间转录组学以及胸腺类器官模型在研究胸腺滤泡增生(TFH)机制中的新应用	未具体说明文献检索的时间范围和纳入研究的数量限制	探讨胸腺病理学在早期发病型重症肌无力(EOMG)中的作用及其机制	早期发病型重症肌无力(EOMG)患者的胸腺病理变化	医学研究	重症肌无力	单细胞转录组学, 空间转录组学, 胸腺类器官模型	NA	文献数据	NA
583	2025-07-19	Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling 2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.10.627758 PMID:39713449	research paper	该研究通过实验和计算多尺度方法，揭示了出生后主动脉扩张的生物学原理及其与脊柱而非体重的比例关系	发现主动脉扩张通过两波独特的动脉细胞增殖波进行，这些波在空间上是随机的但在时间上是协调的，并且揭示了内皮细胞挤出对稳态主动脉生长的重要性	研究主要关注主动脉生长，可能不适用于其他血管或组织的生长机制	探索出生后血管生长和比例控制的生物学原理	主动脉及其细胞增殖动态	生物医学工程	NA	单细胞RNA测序、数学建模	NA	基因表达数据、细胞增殖数据	NA
584	2025-07-19	Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway 2024-10-09, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae051 PMID:39167061	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓中与血管化相关的细胞亚群PDGFRβ+ DPSCs，并探讨了其在牙髓再生治疗中的潜力	发现了一个新的牙髓干细胞亚群PDGFRβ+ DPSCs，证实其具有显著的促血管生成能力，并揭示了PDGFR/PI3K/AKT信号通路的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未进行人体临床试验	解决牙髓再生治疗中的干细胞异质性挑战	牙髓干细胞(DPSCs)，特别是PDGFRβ+ DPSCs亚群	干细胞生物学	牙科疾病	单细胞RNA测序，流式细胞术，转录组测序	基因编辑小鼠模型	单细胞测序数据，转录组数据	未明确说明样本数量，但使用了人牙髓干细胞和小鼠模型
585	2025-07-19	Unveiling impaired vascular function and cellular heterogeneity in diabetic donor-derived vascular organoids 2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae043 PMID:39049437	research paper	该研究通过糖尿病供体来源的血管类器官（VOs）揭示了糖尿病血管功能障碍和细胞异质性	首次在糖尿病供体来源的VOs中发现血管功能受损、ROS水平升高及特定内皮细胞亚群的存在	VOs是否能完全模拟人类血管疾病及细胞组成尚不明确，可能需要额外的器官特异性分化因子诱导	探究糖尿病供体来源VOs的血管功能异常及细胞异质性	糖尿病和非糖尿病供体来源的诱导多能干细胞（iPSCs）生成的血管类器官	digital pathology	diabetes	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	糖尿病和非糖尿病供体来源的VOs样本
586	2025-07-19	Dual-specificity phosphatases 13 and 27 as key switches in muscle stem cell transition from proliferation to differentiation 2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae045 PMID:38975693	研究论文	该研究揭示了双特异性磷酸酶DUSP13和DUSP27在肌肉干细胞从增殖向分化转变过程中的关键作用	首次发现MyoD直接靶向DUSP13和DUSP27，并阐明其在肌肉干细胞命运转变中的调控机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类细胞中验证	探究肌肉干细胞从增殖向分化转变的分子机制	肌肉干细胞（MuSCs）	分子生物学	肌肉疾病	单细胞RNA测序、基因敲除	MyoD敲入小鼠模型	基因表达数据	MyoD敲入小鼠的肌肉干细胞
587	2025-07-19	Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs 2024-09-01, Journal of neurophysiology IF:2.1Q3 DOI:10.1152/jn.00045.2024 PMID:38988287	研究论文	通过整合长读长测序和功能数据，鉴定了源自人类iPSCs的不同皮质层神经元亚型	比较了两种培养基（StemFlex Medium和Essential 8 Medium）在iPSCs向神经元分化中的效率，发现E8M培养基能在更短时间内高效生成功能性神经元	研究仅比较了两种培养基，可能未涵盖所有潜在的高效分化条件	提高iPSCs向神经元分化的效率，以促进再生医学和药物发现	人类诱导多能干细胞（iPSCs）及其分化的神经元	再生医学	NA	长读长单细胞RNA测序、免疫细胞化学、全细胞膜片钳记录	NA	RNA测序数据、功能数据	未明确提及具体样本数量，但涉及iPSCs在两种培养基中的分化比较
588	2025-07-19	Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells 2024-07-08, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae030 PMID:38655770	研究论文	本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了循环髓系细胞的起源、分化及其在生理过程中的作用	首次初步揭示了循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化及其在生理过程中的作用，特别是确认了循环髓系细胞亚群a（aCMCs）属于特定细胞类型	NA	理解循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化及其在各种生理和病理过程中的作用	循环髓系细胞（CMCs）及其亚群a（aCMCs）	单细胞RNA测序	创伤性损伤、癌症、病原体感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
589	2025-07-19	Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice 2024-04-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814 PMID:38499264	研究论文	该研究探讨了白色念珠菌感染对口腔肿瘤微环境中髓系细胞和T淋巴细胞轴的影响	揭示了白色念珠菌感染通过改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成促进口腔肿瘤发展的机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探索白色念珠菌感染如何通过免疫微环境促进口腔肿瘤发展	口腔肿瘤小鼠模型	肿瘤免疫学	口腔癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
590	2025-07-19	An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC 2024-04-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813 PMID:38499266	研究论文	本研究建立了一种高效的两阶段NMBzA诱导的大鼠食管鳞状细胞癌(ESCC)模型，并发现FAT-Hippo-YAP1轴驱动ESCC的进展	使用多激酶抑制剂索拉非尼作为肿瘤促进剂，显著提高了肿瘤发生率和缩短了肿瘤形成时间，并通过多组学分析揭示了FAT-Hippo-YAP1轴的激活在ESCC进展中的关键作用	研究仅基于大鼠模型，结果在人类ESCC中的直接应用需要进一步验证	研究ESCC的发病机制和新的治疗策略	NMBzA诱导的大鼠ESCC模型及衍生的肿瘤细胞系	癌症研究	食管鳞状细胞癌	全基因组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、三维器官培养	NA	基因组数据、转录组数据	NA
591	2025-07-19	Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death 2024-02-01, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015 PMID:38211590	研究论文	本文探讨了人类2型先天淋巴样细胞(ILC2s)通过诱导颗粒酶B介导的肿瘤细胞死亡的潜在治疗应用	首次发现人类ILC2s分泌颗粒酶B(GZMB)并通过诱导焦亡和/或凋亡直接溶解肿瘤细胞，揭示了DNAM-1-CD112/CD155相互作用调控FOXO1的机制	未提及具体临床转化面临的挑战或体内应用的潜在副作用	探索人类ILC2s在肿瘤治疗中的潜在应用价值	人类2型先天淋巴样细胞(ILC2s)和肿瘤细胞	免疫治疗	白血病和实体瘤	单细胞RNA测序	NA	分子和细胞数据	未明确提及具体样本数量，但建立了可扩展2000倍的人类ILC2s培养平台
592	2025-07-19	Single-Cell RNA Sequencing Technology Landscape in 2023 2024-01-13, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxad077 PMID:37934608	review	本文综述了2023年单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的现状及其在细胞异质性和基因表达动态研究中的重要性	总结了scRNA-seq和snRNA-seq的优缺点，并概述了当前多种scRNA-seq技术（如基于液滴、平板、水凝胶和空间转录组学）的发展	未具体讨论每种技术的详细性能比较或实际应用案例	探讨单细胞RNA测序技术的现状及其在细胞生物学和疾病机制研究中的应用	单细胞RNA测序技术及其在干细胞研究中的应用	生物信息学	NA	scRNA-seq, snRNA-seq, 空间转录组学	NA	RNA测序数据	NA
593	2025-07-19	Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq 2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3 DOI:10.1177/15330338241252610 PMID:38766816	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了S100A6/S100A11在肝细胞癌（HCC）T细胞免疫调节中的作用	首次揭示了S100A6/S100A11通过NF-κB通路调控HCC中T细胞亚群的分化和细胞活性，并发现其低表达与良好预后相关	研究机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证	探索S100蛋白家族成员在HCC免疫细胞中的功能机制	肝细胞癌（HCC）和乙型肝炎病毒相关HCC的肿瘤微环境	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	TCGA数据集和研究者收集的HCC样本（具体数量未说明）
594	2025-07-18	Targeting KIT With Antibody-Drug Conjugates in Chromophobe Renal Cell Carcinoma 2025-Aug, Clinical genitourinary cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.clgc.2025.102359 PMID:40408838	研究论文	该研究探讨了在嗜铬肾细胞癌（ChRCC）中靶向KIT的抗体-药物偶联物（ADC）的治疗潜力	首次在ChRCC中测试了靶向KIT的ADC，并证实其有效性	研究仅基于细胞系和有限的患者样本，未进行大规模临床试验	探索KIT作为ChRCC治疗靶点的可行性	嗜铬肾细胞癌（ChRCC）细胞系和患者样本	肿瘤学	肾细胞癌	单细胞RNA测序、Western blot分析	NA	RNA表达数据、蛋白质表达数据	15例转移性ChRCC样本和5个ChRCC细胞系
595	2025-07-18	SOX11 and GLIS2: Novel Biomarkers for Understanding the Progression of Oral Leukoplakia 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100872 PMID:40543136	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，探讨了口腔白斑病（LP）进展中的转录调控机制，并鉴定了SOX11和GLIS2作为潜在的生物标志物	首次将单细胞RNA测序技术应用于LP研究，发现SOX11和GLIS2作为LP特异性分子标志物，并揭示其通过调控EMT和血管生成影响疾病进展	研究样本量有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证	探索口腔白斑病进展的分子机制并寻找潜在生物标志物	口腔白斑病（LP）组织样本和口腔鳞状细胞癌（OSCC）样本	数字病理学	口腔癌	单细胞RNA测序，大块RNA测序，免疫组化染色	NA	RNA测序数据，临床生存数据	LP组织样本和TCGA数据库中的OSCC样本
596	2025-07-18	Decoding Cellular Landscapes: Unravelling Periodontitis and Periapical Periodontitis at the Single-Cell Frontier 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100851 PMID:40554261	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中关键基因表达和细胞异质性的差异	首次在单细胞水平上比较了牙周炎和根尖周炎的关键基因表达和细胞异质性，并识别了疾病特异性的关键基因和细胞类型	研究仅基于公开可用的单细胞RNA测序数据集，未进行独立实验验证	阐明牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的分子和细胞差异	牙周炎和根尖周炎患者的牙槽骨组织	单细胞组学	牙周炎和根尖周炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)	NA	单细胞RNA测序数据	两个公开数据集(GSE171213和GSE181688)
597	2025-07-18	Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension 2025-Aug, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979) DOI:10.1161/HYPERTENSIONAHA.125.24664 PMID:40575858	研究论文	通过整合分析确定GPX1在衰弱和高血压中的作用	首次通过两样本孟德尔随机化分析评估2532个可药物化基因对衰弱和高血压的因果效应，并利用RNA表达谱和单细胞RNA测序进行验证	研究主要基于遗传学和分子水平分析，缺乏临床干预实验验证	确定衰弱和高血压的有效药物靶点	老年人群中的衰弱和高血压患者	生物医学研究	老年疾病	两样本孟德尔随机化分析, RNA表达谱, 单细胞RNA测序, 分子对接	NA	遗传数据, RNA测序数据	2532个可药物化基因的分析
598	2025-07-18	Interleukin (IL)-34 promotes the inflammatory role of IL-1β-producing myeloid cells in pemphigus lesions 2025-Jul-17, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljaf130 PMID:40203120	研究论文	研究探讨了髓系细胞在天疱疮病变中形成异位淋巴样结构（ELS）的作用，并揭示了IL-34/CSF-1R通路作为潜在治疗靶点	首次发现IL-1β产生的髓系细胞（IL1B_Macro）是天疱疮病变中的主要髓系亚群，并揭示IL-34和TNF-α协同促进其分化	研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，尚未进行体内功能验证	探究髓系细胞在天疱疮病变中形成ELS的机制并寻找潜在治疗靶点	天疱疮患者的皮肤病变组织	免疫病理学	天疱疮	scRNA-seq, IHC, 免疫荧光, 流式细胞术, bulk RNA-seq, Transwell趋化实验	NA	单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据	天疱疮患者的皮肤病变组织样本（未明确数量）
599	2025-07-18	An unbiased genomewide screen uncovers 7 genes that drive hematopoietic stem cell fate from mouse embryonic stem cells 2025-Jul-17, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027742 PMID:40209065	研究论文	通过全基因组CRISPR激活筛选，发现了7个基因在小鼠胚胎干细胞向造血干细胞分化过程中的关键作用	采用了一种新颖且无偏的全基因组CRISPR激活筛选方法，首次鉴定了7个在造血干细胞命运决定中起关键作用的基因	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类细胞中验证	探索体外生成造血干细胞的关键调控因素	小鼠胚胎干细胞和造血干细胞	再生医学	血液系统疾病	全基因组CRISPR激活筛选、单细胞RNA测序	小鼠模型	基因组数据、转录组数据	未明确说明具体样本数量，使用了小鼠胚胎干细胞和免疫缺陷NSG小鼠
600	2025-07-18	PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202507167 PMID:40673864	研究论文	该研究揭示了PLAUR+中性粒细胞在肝细胞癌患者中通过塑造免疫抑制微环境驱动抗PD-1治疗耐药的作用	首次发现PLAUR+中性粒细胞在免疫治疗无应答者中富集，并通过多组学分析揭示其在塑造免疫抑制微环境中的关键作用，同时发现一种新型PLAUR抑制剂可逆转中性粒细胞的免疫抑制表型	研究主要基于临床队列和临床前模型，需要进一步在更大规模的临床试验中验证PLAUR抑制剂的疗效	探索肝细胞癌中免疫治疗耐药的机制并寻找潜在的治疗策略	肝细胞癌患者和临床前模型中的PLAUR+中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序、基于结构的虚拟筛选	NA	临床数据、测序数据	未明确提及具体样本数量，涉及临床队列和多种体内肿瘤模型