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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-04-28
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Nov-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 通过将人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞整合到心脏类器官中,构建出人心脏-巨噬细胞组装体模型,用于模拟免疫-心脏相互作用和心律失常疾病建模 首次利用自体人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞与心脏类器官整合,生成具有生理相关性的胚胎组织驻留巨噬细胞,并长期维持以促进心脏发生 未明确提及 研究心脏组织驻留巨噬细胞在心脏发育和心律失常疾病中的功能及机制 人类心脏-巨噬细胞组装体模型及心脏驻留巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 类器官模型 单细胞转录组数据、活体成像数据、蛋白质组数据 未明确提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
582 2026-04-28
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了抗磷脂综合征(APS)中微血管内皮细胞通过YAP1和CCN2介导的信号通路促进血管病变的机制 首次通过单细胞RNA测序鉴定出APS患者皮肤微血管内皮细胞中CCN1和CCN2表达增高,并阐明YAP1-CCN2信号轴在介导内皮细胞与血管平滑肌细胞间的促增殖通讯中的关键作用 未能在摘要中明确指出研究局限性 阐明APS血管病变的细胞和分子机制,寻找潜在治疗靶点 抗磷脂综合征(APS)患者及其微血管内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜、ELISA、定量PCR、免疫印迹 NA 图像、文本 APS患者的皮肤活检样本、肾脏活检样本以及血浆样本;健康人真皮微血管内皮细胞培养;小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
583 2026-04-28
Ongoing genome doubling shapes evolvability and immunity in ovarian cancer
2025-08, Nature IF:50.5Q1
research paper 探讨全基因组加倍在高级别浆液性卵巢癌中作为持续突变过程对肿瘤演化性和免疫逃逸的影响 首次在单细胞分辨率下揭示全基因组加倍是卵巢癌中的持续性突变过程,并开发了基于突变的WGD计时方法doubleTime来解析其驱动肿瘤演化的具体模式 未提及具体局限性,但样本来源仅限于高级别浆液性卵巢癌患者,可能限制对其他癌症类型的推广性 研究全基因组加倍在肿瘤体细胞演化及免疫逃逸中的作用机制 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 machine learning ovarian cancer 单细胞全基因组测序、单细胞RNA测序、高分辨率免疫荧光显微镜 NA 基因组数据、转录组数据、图像数据 来自41名患者的70个高级别浆液性卵巢癌样本(30,260个肿瘤基因组) NA 单细胞全基因组测序、单细胞RNA测序 NA NA
584 2026-04-28
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2025-07, Nature IF:50.5Q1
研究论文 利用基因编辑小鼠和灵长类模型,揭示了人类特异性增强子HARE5通过调控WNT信号通路精细调节神经祖细胞增殖与皮层发育的机制 首次在活体动物模型中证明人类加速区(HAR)中的HARE5增强子通过四个人类特异性碱基变异上调WNT信号活性,从而增强神经祖细胞自我更新并扩大大脑皮层体积 未明确说明该研究的局限性 探究人类加速区(HAR)增强子HARE5在灵长类大脑皮层进化中的功能及其调控机制 人类(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)和黑猩猩(Pan troglodytes)的神经祖细胞及皮层类器官 发育生物学 神经系统疾病 基因编辑、单细胞RNA测序、活体成像、谱系分析 NA 基因表达数据、细胞图像、电生理记录 基因编辑小鼠(具体数量未提及)、人类和黑猩猩神经祖细胞及皮层类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
585 2026-04-28
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过对前庭毛细胞的单细胞RNA测序,揭示前庭动纤毛同时具有初级纤毛和运动纤毛的分子特征,并发现其自发性运动功能 首次发现前庭动纤毛同时表达初级纤毛与运动纤毛相关基因,且具有自发性运动能力,改变了传统上对动纤毛仅为感觉支撑结构的认知 未明确动纤毛自发性运动的确切分子机制,且样本局限于成年动物模型,缺乏人类活体功能验证 阐明前庭动纤毛的分子组成、结构特性及其在毛细胞束中的功能角色 成年小鼠、牛蛙、斑马鱼和人类的前庭毛细胞 数字病理学 前庭系统疾病 单细胞RNA测序、免疫染色、活细胞成像 NA 基因表达数据、图像数据 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞(未提供具体数量)、牛蛙与小鼠壶腹嵴毛细胞(未提供具体数量)、斑马鱼和人类前庭毛细胞(未提供具体数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
586 2026-04-28
SOAR elucidates biological insights and empowers drug discovery through spatial transcriptomics
2025-Jun-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 提出一个全面的空间转录组学分析平台SOAR,包含3461个统一处理样本,涵盖13个物种、42种组织类型和19种技术 首次构建集成多物种、多组织、多平台空间转录组数据的统一分析资源,并展示其在药物发现中的创新应用 未明确提及具体局限性,但可能包括数据覆盖的偏倚或分析方法对某些技术平台的适用性 通过空间转录组学数据整合与分析,推动生物学发现和药物研发 13个物种的空间转录组样本,包括人、小鼠等模式生物 数字病理学 癌症, 溃疡性结肠炎 空间转录组学 NA 基因表达数据 3461个样本 NA 空间转录组学 NA 整合19种不同空间转录组学技术平台的数据
587 2026-04-28
Single-cell RNA sequencing reveals tissue-specific transcriptomic changes induced by perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) in larval zebrafish (Danio rerio)
2025-06-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析PFOS暴露对斑马鱼幼虫组织特异性转录组的影响 首次使用单细胞RNA-seq揭示PFOS在斑马鱼幼虫中诱导的组织特异性转录组变化,并发现消化器官、肌肉和耳石是受影响最显著的组织 研究局限于单一浓度(16 µM)和短期暴露(3-72小时),未测试剂量-反应关系或长期效应 探究全氟辛烷磺酸(PFOS)对斑马鱼幼虫发育毒性的组织特异性分子机制 斑马鱼幼虫(Danio rerio) 机器学习 发育毒性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 暴露于16 µM PFOS或0.01% DMSO的斑马鱼幼虫,共检测27,698个基因,其中2,390个差异表达 10x Genomics 单细胞转录组 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
588 2026-04-28
Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation
2025-06, Nature IF:50.5Q1
research paper 本研究利用单细胞技术揭示癌基因异常驱动髓母细胞瘤进展而非起始的过程 首次通过单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序和空间转录组学技术,证明大规模染色体畸变是早期肿瘤起始事件,而单基因癌基因事件在后期出现并呈亚克隆性 未提及具体限制 阐明癌基因异常和广泛拷贝数变异在髓母细胞瘤肿瘤进化和治疗抵抗中的作用 3/4组髓母细胞瘤患者肿瘤样本 单细胞组学 髓母细胞瘤 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序、空间转录组学 群体遗传学模型 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 一群已知MYC、MYCN和PRDM6癌基因改变的3/4组髓母细胞瘤患者 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA NA
589 2026-04-28
Concurrent loss of the Y chromosome in cancer and T cells impacts outcome
2025-06, Nature IF:50.5Q1
研究论文 该研究通过泛癌分析揭示Y染色体缺失在癌症与T细胞中并发存在并影响患者预后 首次系统证明外周血单核细胞和肿瘤中Y染色体缺失的关联性,并建立恶性上皮细胞与免疫细胞中LOY共存的预后模型 未明确LOY导致免疫抑制的分子机制及功能验证的局限性 探究Y染色体缺失在外周血单核细胞、免疫细胞和癌细胞中的相互关系及其对癌症死亡率的影响 29种人类肿瘤类型的bulk和单细胞RNA测序数据,以及自发性及同源小鼠肿瘤模型 数字病理学 泛癌种 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 文本序列数据 涵盖29种人类肿瘤类型及小鼠模型的多组学数据 Illumina, 10x Genomics bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq, 10x Chromium 使用Illumina NovaSeq进行bulk RNA测序,10x Chromium进行单细胞测序
590 2026-04-28
Insight into perfluorooctanoic acid-induced impairment of mouse embryo implantation via single-cell RNA-seq
2025-05-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示全氟辛酸诱导小鼠胚胎着床障碍的机制 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示低剂量PFOA暴露通过破坏子宫内膜上皮细胞功能及ANGPTL信号通路导致胚胎着床失败的具体分子机制 该研究仅在小鼠模型中开展,缺乏人类临床样本验证;未深入探讨其他细胞类型(如免疫细胞)在PFOA暴露下的作用 探究全氟辛酸暴露对子宫内膜容受性的影响及其分子机制 小鼠子宫内膜组织及胚胎着床过程 数字病理学 生殖相关疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及具体样本量,但涉及多组小鼠模型的子宫内膜组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
591 2026-04-28
Programs, origins and immunomodulatory functions of myeloid cells in glioma
2025-04, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、染色质可及性、空间转录组学和胶质瘤类器官外植体系统,系统研究胶质瘤中髓系细胞的免疫调节程序、起源和功能 首次发现四种免疫调节表达程序,包括两种原发性脑肿瘤特有的小胶质细胞炎症和清除免疫抑制程序,以及两种非脑肿瘤中也表达的系统性炎症和补体免疫抑制程序,并揭示了微环境信号驱动而非细胞类型或突变状态决定这些程序 未明确说明具体局限性 阐明胶质瘤中髓系细胞的免疫调节表型及其调控机制 胶质瘤中的髓系细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序, 染色质可及性测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
592 2026-04-28
Uncovering endothelial to mesenchymal transition drivers in atherosclerosis via multi-omics analysis
2025-02-17, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3
研究论文 通过整合多组学数据,揭示了动脉粥样硬化中调控内皮-间充质转化的新候选因子 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据,系统鉴定出七个新的内皮-间充质转化候选基因(PTGS2、TPM1、SERPINE1、FN1、RASD1、SEMA3C和ESM1) 研究主要依赖公开数据库和生物信息学分析,验证仅通过qPCR和western blotting进行,尚未在体内模型或临床样本中进行功能验证 识别动脉粥样硬化中调控内皮-间充质转化的新候选分子 动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞及体外内皮-间充质转化模型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列分析、qPCR、western blotting NA 基因表达数据 三个数据集:GSE159677(scRNA-seq)、GSE118446(bulk RNA-seq)和GSE56309(微阵列) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
593 2026-04-28
Liver X receptor unlinks intestinal regeneration and tumorigenesis
2025-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 研究发现肝X受体(LXR)通路在肠道损伤中激活,通过调节上皮细胞分泌双调蛋白(Areg)促进再生,同时抑制肿瘤发生 首次揭示LXR可作为肠道再生与肿瘤发生之间的分子开关,通过CYP27A1酶介导的配体生成机制实现损伤修复与抗癌的平衡调节 需要进一步验证LXR在人肠道中的具体调控网络,以及长期激活LXR对正常组织稳态的影响 探究肠道损伤后组织再生与肿瘤发生之间是否存在解偶联的分子机制 小鼠肠道损伤模型、肠道类器官、人结直肠癌标本 分子生物学, 癌症生物学 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 药理学干预, 基因敲除/过表达 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 两种小鼠肠道损伤模型的RNA-seq数据集, 人结直肠癌标本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
594 2026-04-28
Single-cell multi-omics analysis reveals cellular subpopulations associated with relapse in high-risk B-ALL following intensified chemotherapy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 对高危B细胞急性淋巴细胞白血病强化化疗后复发相关的细胞亚群进行单细胞多组学分析 结合scRNA-seq和scATAC-seq的单细胞多组学分析,首次鉴定出与强化化疗耐药相关的HSC/MPP和Pro-B细胞亚群及其分子特征 NA 揭示高危B-ALL强化化疗后复发的分子机制 高危B-ALL患儿强化化疗后的外周血单核细胞(PBMCs)及健康对照 数字病理学 儿童急性淋巴细胞白血病(B-ALL) scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞组学数据 高危B-ALL患儿及健康对照的PBMCs 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Chromium Single Cell ATAC
595 2026-04-28
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-10, The ocular surface
研究论文 评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响,重点关注单核吞噬细胞的变化 首次通过单细胞RNA测序揭示干眼症诱导结膜单核吞噬细胞中TLF+调节性巨噬细胞和CCR2+炎性细胞的差异化基因表达模式,并证实调节性巨噬细胞对抑制炎症和杯状细胞丢失的关键作用 主要基于小鼠模型,尚需在人类样本中验证;调节性巨噬细胞耗竭实验依赖甘露糖化氯膦酸盐脂质体,可能存在非特异性效应 阐明干眼症条件下结膜免疫细胞的动态变化及调节性巨噬细胞的免疫抑制功能 C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞 数字病理学 干眼症 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq Monocle 3细胞轨迹模型 单细胞转录组数据、染色质开放性数据 非应激和干燥应激处理的C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA 对分选的结膜免疫细胞进行单细胞RNA测序和scATAC-seq分析
596 2026-04-28
Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space
2024-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过空间转录组学分析了来自6种癌症类型的131个肿瘤切片,结合单核RNA测序和CODEX数据,研究了肿瘤在二维和三维空间中的演化及其与微环境的相互作用 首次大规模结合Visium空间转录组学、单核RNA测序和CODEX多模态数据,定义了肿瘤微区域和空间亚克隆,并利用深度学习算法重建三维肿瘤结构,揭示了免疫热区和冷区的空间分布 样本量有限且仅涵盖6种癌症类型;三维重构基于连续切片可能引入对齐误差;深度学习算法依赖未监督学习,需进一步验证其生物学意义 研究肿瘤细胞与非癌细胞在二维和三维空间中的空间相互作用和演化机制 来自78例病例的131个肿瘤切片,涵盖6种癌症类型 数字病理学 多种癌症 空间转录组学, 单核RNA测序, CODEX多重免疫荧光 无监督深度学习 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, CODEX多重成像数据 131个肿瘤切片(78例患者,6种癌症类型),48例匹配的单核RNA测序样本,22例匹配的CODEX样本 10x Genomics 空间转录组学, 单核RNA测序 10x Visium Visium空间转录组学平台,结合10x单核RNA测序和CODEX多重免疫荧光技术
597 2026-04-28
A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine
2024-08, Nature IF:50.5Q1
研究论文 利用空间转录组学、空间蛋白质组学和单分子荧光原位杂交技术,重建了成人近端小肠的综合空间表达图谱,揭示了沿隐窝-绒毛轴的区域化表达和细胞类型分布 首次在成人近端小肠中系统描绘了沿隐窝-绒毛轴的基因表达空间异质性,发现迁移性肠上皮细胞从绒毛底部脂滴组装和铁吸收向顶端乳糜微粒合成和铁释放的转变,并揭示绒毛顶端细胞具有促免疫原性特征 未明确提及具体局限性 重建成人近端小肠的空间表达图谱,解析隐窝-绒毛轴的基因表达和细胞类型空间异质性 成人近端小肠组织 空间转录组学 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单分子荧光原位杂交 NA 空间基因表达数据, 空间蛋白质表达数据 成人近端小肠组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 空间转录组学, 单分子荧光原位杂交 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台, 单分子荧光原位杂交技术
598 2026-04-28
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of lacrimal gland in GVHD mouse model
2024-07, The ocular surface
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示GVHD小鼠模型泪腺的转录景观 首次构建GVHD小鼠泪腺细胞图谱,发现Lrg1高表达上皮细胞新亚群,并描绘细胞间通信网络 仅基于小鼠模型,需在人类样本中验证;部分转录结果通过免疫荧光验证,缺乏功能实验 研究GVHD小鼠模型中泪腺细胞群的全局转录表达谱,揭示眼表GVHD的发病机制 GVHD小鼠模型的泪腺细胞 转录组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 GVHD小鼠模型泪腺细胞(具体样本量未提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
599 2026-04-28
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 揭示急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞被炎症性募集的机制 首次证明健康造血干细胞和祖细胞在低白血病浸润时即主动参与骨髓微环境炎症反应,并识别出AML来源的纳米级胞外囊泡是触发该炎症反应的关键因素 未明确讨论样本量大小及临床验证结果 探究急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞是否主动参与炎症传播及其机制 急性髓系白血病小鼠模型中的健康造血干细胞和祖细胞 机器学习 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个独立同源小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
600 2026-04-28
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-04, The ocular surface
研究论文 通过单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞微环境及潜在发病机制 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析翼状胬肉的细胞异质性,发现免疫成纤维细胞、EMT上皮细胞和活化血管内皮细胞等新亚群,并揭示巨噬细胞与ACKR1+活化血管内皮细胞的相互作用在疾病发展中的关键作用 需要进一步的体内外实验验证单细胞测序发现的细胞间相互作用机制,且样本量有限 探究翼状胬肉的发病机制及潜在治疗靶点 翼状胬肉患者及正常对照者的结膜组织细胞 数字病理学 眼部疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 45605个细胞(来自翼状胬肉患者和正常对照) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
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