本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-05-21 |
3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment
2024-12-13, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad998f
PMID:39668784
|
研究论文 | 本研究设计并制备了一种3D打印的PGCL@PLA/10CSPL复合支架,装载纤连蛋白1用于治疗椎间盘退变 | 首次将单细胞转录组分析鉴定的纤连蛋白1装载于具有电活性的3D打印复合支架中,用于促进异常髓核退变加速和骨融合 | NA | 开发一种新型支架系统用于椎间盘退变治疗,以恢复椎间盘高度和生物力学功能 | 人类正常和退变髓核的单细胞转录组数据,以及3D打印复合支架的体内外性能 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组分析,3D打印 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞转录组数据集(正常和退变髓核样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 582 | 2026-05-21 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱细胞术分析IDH分层的人原发性和复发性胶质瘤的免疫图谱 | 首次揭示了IDH状态和复发相关的免疫微环境差异,发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群,并建立了胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量有限,仅包含48例人胶质瘤;研究结果需在更大队列中验证 | 解析IDH基因型分层的人原发性和复发性胶质瘤的免疫景观及其影响因素 | 48例人胶质瘤样本中的免疫细胞 | 自然语言处理 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫细胞计数数据 | 144,678个单细胞和超过200万个免疫细胞,来自48例人胶质瘤 | NA | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | NA |
| 583 | 2026-05-21 |
Spatial Transcriptomics Reveals the Transcriptomic Signatures in a Mouse Model of Pediatric Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis
2024-12, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.08.008
PMID:39222909
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术揭示儿童代谢功能障碍相关脂肪性肝炎小鼠模型的转录组特征 | 首次利用空间转录组学技术表征儿童MASH小鼠模型的肝脏转录组图谱,并鉴定出细胞色素p450 2E1在门静脉周围区域的表达上调与疾病发病机制相关 | 未提及 | 探索儿童MASH的发病机制 | C57BL/6J小鼠 | 数字病理学 | 儿童代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量,涉及WD+CCl处理组小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 584 | 2026-05-21 |
Pathogenic mechanisms, diagnostic, and therapeutic potential of microvesicles in diabetes and its complications
2024-11, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2024.110168
PMID:39349130
|
综述 | 综述了微囊泡在糖尿病及其并发症(如肾病、视网膜病变、心肌病和神经病变)发病机制中的新兴作用,并探讨其作为生物标志物和治疗工具的潜力 | 全面分析微囊泡通过携带蛋白质、脂质、mRNA和miRNA调节炎症、氧化应激、免疫反应和组织重塑等关键过程,在糖尿病进展中的作用,并提出其作为药物递送系统的治疗潜力 | 微囊泡的分离与表征困难,其分子机制理解不足,临床试验验证仍面临挑战,需改进分离纯化方法并借助单细胞RNA测序和蛋白质组学等先进技术 | 探讨微囊泡在糖尿病及其并发症中的致病机制、诊断和治疗潜力 | 微囊泡在糖尿病及并发症(肾病、视网膜病变、心肌病、神经病变)中的作用 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 585 | 2026-05-21 |
Characterization of Ucp1-iCre knockin mice reveals the recombination activity in male germ cells
2024-10-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00128.2024
PMID:39230395
|
研究论文 | 对Ucp1-iCre敲入小鼠进行表征,揭示其在雄性生殖细胞中的重组活性,并验证其作为产热脂肪组织条件基因操作工具的潜力 | 首次系统鉴定Ucp1-iCre敲入小鼠品系,明确其相较于传统Ucp1-Cre品系具有更低的异位活性,同时发现雄性生殖细胞中意外的高频重组活性 | 未深入探讨雄性生殖细胞重组对后代表型的长期影响,且雌性小鼠无类似现象的原因未阐明 | 评估Ucp1-iCre敲入小鼠作为产热脂肪组织特异性基因操作工具的实用性和局限性 | Ucp1-iCre敲入小鼠(雄性和雌性)及Rosa-tdTomato报告小鼠 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组分析、Cre-loxP重组系统 | NA | 基因表达数据、图像(报告基因荧光) | 涉及Ucp1-iCre雄性和雌性小鼠,与Rosa-tdTomato报告小鼠交配后的后代分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组分析用于检测精子细胞中Ucp1 mRNA表达 |
| 586 | 2026-05-21 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卡麦角林治疗对泌乳素瘤肿瘤及微环境细胞的影响 | 首次揭示卡麦角林治疗后CD8+ T细胞的激活及其可能参与肿瘤杀伤作用 | 样本量较小(仅5例肿瘤),且缺乏功能验证实验 | 揭示多巴胺激动剂在人类泌乳素瘤及周围基质和免疫细胞中的靶向和非靶向作用机制 | 5例手术切除的泌乳素瘤(3例经卡麦角林治疗,2例未经治疗) | 数字病理学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例人类泌乳素瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 587 | 2026-05-21 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatotoxic analgesic generating AM404 in the midbrain PAG region
2024-05-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61791-z
PMID:38750093
|
研究论文 | 该研究开发了一种非肝毒性镇痛药SRP-001,其通过在中脑PAG区域生成AM404发挥镇痛作用,具有与对乙酰氨基酚相当的效果且无肝毒性 | 首次设计并验证了SRP-001作为非阿片类、非肝毒性镇痛药的分子机制,通过单细胞转录组学揭示其与对乙酰氨基酚共享的疼痛相关基因调控网络 | 未明确提及研究局限性 | 开发一种安全的非肝毒性非阿片类镇痛药SRP-001,并验证其在中脑PAG区域的镇痛机制和安全性 | SRP-001分子、CD-1小鼠及I期临床试验中的人类受试者 | 生物信息学 | 疼痛 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | CD-1小鼠及I期临床试验中的受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 588 | 2026-05-21 |
Unveiling cell subpopulations in T1D mouse islets using single-cell RNA sequencing
2024-05-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00323.2023
PMID:38506753
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示1型糖尿病小鼠胰岛细胞亚群 | 通过单细胞RNA测序技术构建了T1D小鼠模型胰岛的全面单细胞图谱,并发现了α和β细胞亚群在T1D进展中的潜在重要作用 | 主要基于小鼠模型,结果可能需要进一步在人类样本中验证 | 研究1型糖尿病小鼠胰岛内的细胞异质性及其与发病机制的关系 | 链脲佐菌素诱导的1型糖尿病小鼠模型胰岛细胞 | 机器学习和生物信息学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据, 流式细胞术数据 | T1D小鼠模型胰岛样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2026-05-21 |
Highlights of how single-cell analyses are illuminating differentiation and disease in the gastric corpus
2024-03-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00164.2023
PMID:38193187
|
综述 | 单细胞RNA测序技术在胃体分化与疾病研究中的应用与进展 | 总结了单细胞RNA测序在胃体发育、细胞标记鉴定以及再生和肿瘤发生过程中转录变化的创新见解 | 未明确提及具体研究局限性 | 阐述单细胞RNA测序如何揭示胃体分化与疾病的转录机制 | 人类和小鼠胃体组织中的细胞 | 自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 590 | 2026-05-21 |
Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons
2024-03-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00200.2023
PMID:38193160
|
研究论文 | 通过形态学、分子和功能分析系统表征小鼠谷氨酸能肌间神经元的特性 | 首次系统揭示VGLUT2阳性肠神经元(VGLUT2-EN)的单一尾向投射长轴突形态、遗传表达谱及响应结直肠机械拉伸的间接激活机制 | 仅在远段结肠和直肠组织中分析,样本量(52个VGLUT2-EN进行scRNA-seq)有限 | 明确小鼠结直肠中VGLUT2阳性肌间神经元的结构与功能特性 | 小鼠结直肠中VGLUT2阳性肠神经元(VGLUT2-EN) | 神经科学 | 内脏痛症 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq)、GCaMP6f钙成像、腺相关病毒稀疏标记 | NA | 基因表达数据、钙成像荧光信号 | 52个VGLUT2-EN用于scRNA-seq;215个VGLUT2-EN进行钙成像 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2026-05-21 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
|
研究论文 | 通过多组学和机器学习综合分析,鉴定糖尿病与慢性阻塞性肺疾病共有的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过多组学数据结合多种机器学习算法,系统鉴定出糖尿病与COPD共有的4个诊断生物标志物(CADPS、EDNRB、THBS4、TMEM27),并利用单细胞测序、临床样本和动物模型进行验证 | 未说明具体局限性 | 揭示糖尿病与慢性阻塞性肺疾病之间的分子机制联系,寻找共有诊断生物标志物 | 糖尿病和慢性阻塞性肺疾病患者 | 机器学习 | 糖尿病, 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞测序 | WGCNA, 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多中心患者队列,具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 592 | 2026-05-21 |
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1528248
PMID:39850483
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在三阴性乳腺癌(TNBC)代谢通路与免疫功能相互作用中的研究进展 | 结合单细胞和空间转录组学技术,系统阐述TNBC代谢重编程对免疫细胞功能调节的影响,并探讨代谢干预联合免疫检查点抑制剂治疗的潜力 | 主要基于现有文献总结,未提供新的实验数据或机制验证 | 探讨TNBC中代谢通路与免疫功能相互作用,为免疫治疗策略提供新见解 | 三阴性乳腺癌及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 593 | 2026-05-21 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
|
研究论文 | 通过分析2型糖尿病胰岛细胞的基因表达模式,识别胰腺星状细胞特异性的基因标志物及其与lncRNA的相互作用网络 | 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞是2型糖尿病特有的基因签名,并揭示了lncRNA-mRNA调控网络在2型糖尿病免疫微环境重塑中的潜在作用 | 结果主要基于公开数据集分析,缺乏实验验证;lncRNA-mRNA相互作用为预测性分析,未进行功能实验确认 | 探索2型糖尿病胰岛细胞的基因表达特征及胰腺星状细胞在疾病进展中的作用机制 | 2型糖尿病和1型糖尿病患者的胰岛细胞及外周血单核细胞 | 自然语言处理 | 2型糖尿病 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公共数据集:3个T2D单细胞RNA测序数据集、1个T1D单细胞RNA测序数据集及2个T2D批量测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2026-05-21 |
Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons
2023-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558146
PMID:37781576
|
研究论文 | 系统表征小鼠结肠直肠中VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特性 | 首次通过稀疏标记、单细胞mRNA测序和钙成像技术,全面揭示VGLUT2阳性肠神经元为功能独特的神经元群体,具有单个向尾端投射的长轴突,并通过烟碱型胆碱能神经传递间接响应结直肠机械拉伸 | 单细胞mRNA测序仅分析52个VGLUT2阳性神经元,样本量较小;研究局限于小鼠远端结肠和直肠,未涉及其他肠道区域或物种 | 阐明小鼠结肠直肠中VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特征 | 小鼠结肠直肠中的VGLUT2阳性肠神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞mRNA测序、AAV稀疏标记、GCaMP6f钙成像 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 31个VGLUT2阳性肠神经元用于形态分析,52个用于单细胞测序,215个用于钙成像 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 595 | 2026-05-20 |
Identifying mitochondria-related signatures for tuberculosis diagnosis through machine learning on single-cell transcriptomics data and experimental verification
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108489
PMID:41967724
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据和机器学习识别线粒体相关基因特征用于结核病诊断,并经过实验验证 | 首次将单细胞RNA测序数据与机器学习算法相结合,识别出三个线粒体相关基因(STAT2、CASP1和COX7B)作为结核病诊断标志物,构建了基于血液的诊断模型 | 模型在独立临床队列中进行了初步验证,但样本量有限,需更大规模研究进一步确认 | 探索线粒体相关基因特征作为结核病诊断的生物标志物 | 活动性结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序、微阵列、定量PCR、LASSO、SVM-RFE | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 训练集125例,验证集30例,两个测试集分别15例和26例,独立临床队列52例 | Illumina | 单细胞RNA测序、微阵列 | Illumina NovaSeq, Illumina HumanHT-12 | GSE19491微阵列数据,SRP247583单细胞RNA测序数据,GSE54992和GSE34608微阵列数据 |
| 596 | 2026-05-20 |
Atopic dermatitis: Multi-omics insights into microbiota-driven modulation of the gut-skin axis
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108504
PMID:42019770
|
综述 | 本文综述了多组学技术揭示的微生物群驱动肠-皮肤轴调控特应性皮炎的作用机制 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞转录组学等多组学数据,识别出以拟杆菌和普雷沃菌为主的特应性皮炎内型特征,为精准分层和靶向治疗提供了新框架 | 该综述主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证,且未详细讨论不同研究间方法学差异对结论一致性的影响 | 总结宿主遗传学、微生物群网络和多组学生物标志物在特应性皮炎内型中的作用,为精准诊断和靶向干预提供依据 | 特应性皮炎患者及其肠道微生物群、代谢产物和免疫反应特征 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 宏基因组学, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 597 | 2026-05-20 |
Extracellular vimentin promotes neutrophil-dominant granulomatous inflammation in progressive pulmonary sarcoidosis
2026-Jun-10, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20250651
PMID:42084847
|
研究论文 | 本研究通过计算机分析和动物实验,发现细胞外波形蛋白在进展性肺结节病中促进中性粒细胞主导的肉芽肿性炎症 | 首次揭示细胞外波形蛋白可作为触发因子,驱动中性粒细胞介导的炎症通路,导致肺结节病进展和纤维化 | 未明确提及具体局限性 | 探索进展性肺结节病中中性粒细胞及其效应分子的作用机制 | 进展性肺结节病患者肺组织样本和波形蛋白诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 进展性纤维化结节病患者与自愈性疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2026-05-20 |
Cuproptosis-Related Gene FDX1 Induces Malignant Progression and Immune Suppression in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11242-9
PMID:40911146
|
研究论文 | 本文研究了铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌中诱导恶性进展及免疫抑制的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铜死亡关键基因FDX1在三阴性乳腺癌上皮细胞中高表达,并通过体外实验和共培养模型证明其促进肿瘤细胞增殖、迁移并抑制CD8 T细胞免疫应答 | 研究仅基于公共单细胞RNA测序数据集和体外实验,缺乏临床样本验证及体内免疫微环境动态调控机制的深入探讨 | 探究铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌恶性进展及免疫抑制中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、细胞功能实验、共培养体系、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及体外细胞系(未明确样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共scRNA-seq数据集(具体平台未说明) |
| 599 | 2026-05-20 |
Integrating multiomic layers to decode psychiatric disease mechanisms
2026-Jun, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102451
PMID:41831411
|
综述 | 整合多组学数据以解析精神疾病的分子机制 | 通过单细胞转录组学、表观组学、蛋白质组学和空间组学等多组学技术,系统连接遗传变异与基因调控、细胞类型脆弱性和环路功能障碍,推动从变异到机制和环路的转化 | 未提及具体局限性 | 利用新兴多组学技术整合分析精神疾病的遗传机制,为生物标志物发现、患者分层和精准治疗策略奠定基础 | 精神疾病,包括精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症 | 计算生物学 | 精神疾病 | NA | NA | 多组学数据(转录组、表观组、蛋白质组、空间组) | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 单细胞 ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 600 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-06, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |