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当前共找到 41393 篇文献,本页显示第 581 - 600 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-07-03
An artificial intelligence optimized hepatic differentiation unveils NR5A2 and AP-1 transcriptional regulation in hepatic maturation
2026-Jun, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 利用机器学习人工智能工具优化肝细胞分化方案,发现NR5A2和AP-1在肝细胞成熟中的转录调控机制 开发基于机器学习的人工智能工具,利用肝祖细胞明场图像优化肝分化方案,无需免疫染色或谱系追踪,结合转录组和表观基因组分析揭示NR5A2和AP-1的关键调控作用 未明确说明 提高肝分化成功率并解析肝细胞成熟的基因调控机制 人多能干细胞衍生的肝祖细胞和肝细胞样细胞 机器学习 肝脏疾病 单细胞RNA测序、转录组分析、表观基因组分析 机器学习模型 明场图像 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
582 2026-07-03
Spermidine Mitigates Immune Cell Senescence and Boosts Vaccine Responses in Healthy Older Adults-A Pilot Study
2026-06, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 一项随机双盲安慰剂对照试验,评估亚精胺对健康老年人免疫细胞衰老和疫苗应答的影响 首次在老年人临床试验中证明亚精胺可通过增强自噬改善疫苗无应答者的免疫反应,并鉴定出免疫衰老标志物可作为疫苗失败的预测指标 样本量较小(40人),仅针对SARS-CoV-2疫苗,需在更大样本和不同疫苗中验证 评估亚精胺补充剂对老年人疫苗诱导免疫的改善效果及其安全性 65岁以上健康老年人在接种第三剂SARS-CoV-2疫苗后的免疫应答 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 NA scRNA-seq数据 40名65岁以上健康老年人 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
583 2026-07-03
Praxis-BGM: clustering of omics data using semi-supervised transfer learning for Gaussian mixture models via natural-gradient variational inference
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出了一个名为Praxis-BGM的半监督迁移学习框架,通过自然梯度变分推断对高斯混合模型进行聚类,以改善小样本组学数据的稳定性与泛化能力 将半监督迁移学习引入高斯混合模型,利用大规模参考数据的稳健聚类结构作为先验,结合自然梯度变分推断实现小样本条件下的高效聚类 仅针对组学数据的有限样本量场景进行评估,未涵盖其他数据类型或更大规模异质性样本的验证 开发一种针对高维小样本组学数据的高斯混合模型聚类方法,提升聚类性能与生物可解释性 乳腺癌批量转录组数据(亚型恢复)和单细胞转录组数据(跨平台细胞类型标签迁移) 机器学习和数字病理学 乳腺癌 转录组测序(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq) 高斯混合模型 (GMM) 基因表达数据(转录组) 模拟数据及两个真实数据集(乳腺癌批量转录组和单细胞转录组样本) NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
584 2026-07-03
Exploring mechanisms of scar-free skin wound healing in adult zebrafish in comparison to mouse
2026-Jun, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较成年斑马鱼与小鼠皮肤伤口愈合机制,揭示斑马鱼无疤痕愈合的分子基础 首次利用HCR-based空间转录组学分析斑马鱼皮肤伤口愈合过程中细胞动态,发现斑马鱼成纤维细胞缺乏胶原表达但表达促纤维化基因,且TGFβ信号诱导plod2表达但不影响肉芽组织消退 斑马鱼基因组缺乏retln基因,但仍存在plod2表达和胶原交联,提示存在其他未明确的促进暂时性纤维化消退的途径 探究成年斑马鱼无疤痕皮肤伤口愈合的细胞和分子机制,并与小鼠进行比较 成年斑马鱼和小鼠的皮肤伤口愈合过程 数字病理学 皮肤损伤 单细胞RNA测序、HCR-based空间转录组学 NA 基因表达数据 斑马鱼和小鼠的皮肤伤口样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和HCR-based空间转录组学
585 2026-07-03
Hypoxic niche drives lineage imbalance and early tumorigenesis in EGFR-mutant lung cancer
2026-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 该研究揭示了缺氧微环境通过核糖体碰撞信号驱动EGFR突变肺癌早期肿瘤发生和谱系失衡的机制 首次发现中心型EGFR突变肺腺癌的早期恶性进展与缺氧微环境相关,并阐明ZAKα-MAPK-c-Fos轴介导的核糖体碰撞信号在肺泡谱系失衡中的作用 研究主要基于小鼠模型和类器官,人类患者数据有限,且未深入探讨不同缺氧程度对肿瘤进展的剂量效应 明确EGFR突变肺腺癌早期侵袭性进展的空间临床决定因素,并建立基于谱系的机制框架 EGFR突变肺腺癌细胞、小鼠模型、3D类器官、临床样本 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学分析 NA 基因表达数据、组织图像 277例临床样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
586 2026-07-03
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
研究论文 通过整合功能与转录组方法,研究ZNF469在肺纤维化中通过TGF-β1/SMAD3轴驱动细胞外基质调控的机制 首次揭示ZNF469作为TGF-β1/SMAD3轴的下游转录因子在肺成纤维细胞激活及细胞外基质沉积中的关键作用,并利用CUT&RUN技术证明其直接调控胶原基因启动子 未在体内模型中验证ZNF469的促纤维化功能,且未阐明ZNF469与SMAD3相互作用的分子细节 揭示ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞激活和细胞外基质沉积的转录机制 人类肺成纤维细胞及来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本 NA 肺纤维化 RNA-seq, CUT&RUN, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA 转录组数据, 基因表达数据 来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
587 2026-07-03
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-05-15, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 利用Scissor算法鉴定与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,对结直肠癌亚型进行分类并评估免疫微环境 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,鉴定出与结直肠癌不良预后显著相关的成纤维细胞亚群,并揭示其促转移通路激活及免疫激活但功能耗竭的特征 未提及具体局限性,可能包括算法依赖的数据整合质量及验证样本的有限性 识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,用于亚型分类和免疫微环境评估 结直肠癌成纤维细胞亚群及肿瘤微环境中的免疫细胞 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Scissor算法 基因表达数据 从TCGA和GEO数据库整合的批量RNA-seq及单细胞RNA-seq数据 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
588 2026-07-03
Single-cell profiling identifies a pro-tumoral VCAN positive macrophage subset and defines a prognostic signature in glioblastoma
2026-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定胶质母细胞瘤中促肿瘤的VCAN阳性巨噬细胞亚群并构建预后特征 首次鉴定出GBM微环境中VCAN⁺巨噬细胞亚群,揭示其终末分化状态、TNF-α驱动的独特极化表型及SPP1信号介导的促肿瘤免疫抑制机制,并基于其相关基因构建有效预后模型 样本量较小,需更大队列和功能性验证以明确该亚群的治疗潜力和空间分布模式 解析胶质母细胞瘤微环境中巨噬细胞的异质性,鉴定关键亚群并建立预后模型 胶质母细胞瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学学习 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 机器学习模型 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
589 2026-07-03
Combining single cell and bulk transcriptomics with Mendelian randomization identifies gut microbiota related prognostic genes and mechanisms in thyroid cancer
2026-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 结合单细胞与批量转录组学及孟德尔随机化方法,鉴定甲状腺癌中与肠道菌群相关的预后基因及机制 首次通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和孟德尔随机化分析,系统鉴定与肠道菌群相关的甲状腺癌预后基因,并揭示成纤维细胞在甲状腺癌进展中的关键作用 未明确提及局限性 鉴定与甲状腺癌及肠道菌群相关的预后基因,并探索其分子机制 甲状腺癌患者 机器学学习 甲状腺癌 RNA-seq 机器学习模型(如用于构建预后模型) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
590 2026-07-03
Integrating machine learning and single-cell sequencing to reveal the role of kinase-related genes in subtype classification and prognostic significance of lung squamous cell carcinoma
2026-May-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合机器学习和单细胞测序,揭示激酶相关基因在肺鳞癌亚型分类和预后中的作用 首次大规模系统探索激酶相关基因在肺鳞癌生存预后和微环境重塑中的调控功能,并构建包含四个关键激酶基因的预测模型 模型在训练和外部验证队列中1年、3年和5年的AUC值均在0.60左右,预测性能中等,可能存在进一步改进空间 研究激酶相关基因对肺鳞癌发展的影响,构建预后预测模型,为个性化治疗提供理论支持 肺鳞癌患者 机器学习和数字病理学 肺癌 RNA-seq,单细胞RNA测序 LASSO-Cox回归模型 转录组数据 TCGA-LUSC队列和两个GEO外部数据集(GSE157010和GSE73403),以及单细胞RNA测序数据(GSE127465和GSE162498) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
591 2026-07-03
Super-enhancer-driven LncRNA MIR205HG promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via glycolysis reprogramming
2026-May-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 超级增强子驱动的长非编码RNA MIR205HG通过糖酵解重编程促进食管鳞状细胞癌进展 首次鉴定并表征了超级增强子驱动的lncRNA MIR205HG在食管鳞状细胞癌中的致癌作用及其通过结合PTBP3促进HIF-1α翻译和糖酵解的新机制 仅初步验证了MIR205HG在食管鳞状细胞癌中的作用,其在其他鳞状细胞癌中的功能及相关临床试验尚待进一步研究 探究超级增强子相关的长非编码RNA在食管鳞状细胞癌发生发展中的分子机制 食管鳞状细胞癌细胞系及患者样本 分子生物学 食管癌 ChIP-Seq, HiChIP-Seq, ChIP-qPCR, 双荧光素酶报告基因检测, CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 NA 基因组数据, 基因表达数据 未明确说明具体样本数量,涉及体外细胞系实验、体内异种移植瘤模型及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
592 2026-07-03
Single-cell profiling uncovers a hypoxia-vascular-immune axis underlying poor immunotherapy response in acral versus cutaneous melanoma
2026-May-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示肢端黑色素瘤与皮肤黑色素瘤之间缺氧-血管-免疫轴差异,解释肢端黑色素瘤对免疫治疗反应较差的原因 首次系统性对比肢端与皮肤黑色素瘤的肿瘤微环境差异,发现RGS5+/COL3A1+周细胞与NECTIN2-TIGIT免疫抑制轴在免疫治疗抵抗中的关键作用 研究主要基于公开数据集,可能受到样本异质性和批次效应影响;功能验证主要依赖体外实验,缺乏体内模型验证 阐明肢端黑色素瘤对免疫治疗反应差的肿瘤微环境机制 肢端黑色素瘤、皮肤黑色素瘤及正常皮肤样本 机器学习, 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, qPCR, 蛋白印迹 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 31例肢端黑色素瘤、13例皮肤黑色素瘤、35例正常皮肤样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
593 2026-07-03
A pyroptosis-related molecular signature stratifies prognosis and highlights GSDMB-mediated malignancy in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-May-07, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 基于焦亡相关分子特征对肝内胆管癌进行预后分层并揭示GSDMB介导的恶性机制 首次构建基于焦亡相关基因(PRGs)的八基因预后模型,并整合单细胞转录组、空间转录组和磷酸化蛋白质组等多组学数据,揭示了TGF-β-GSDMB-CDH3轴在肝内胆管癌恶性进展中的新作用 预后模型仍需在更大规模独立队列中验证,且TGF-β-GSDMB-CDH3轴的机制研究仅在体外进行,缺乏体内动物模型和临床样本的进一步确认 阐明焦亡在肝内胆管癌中的临床和生物学意义,建立预后分层工具并探索潜在治疗靶点 肝内胆管癌患者组织样本及对应临床数据 机器学习和数字病理学 肝癌(肝内胆管癌) 批量转录组测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、基因组突变分析 Lasso回归和Cox比例风险回归模型 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、基因组突变数据 来自多个队列的肝内胆管癌患者样本,其中单细胞RNA测序包含165,236个细胞 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
594 2026-07-03
Single-cell RNA sequencing of intestinal Behçet's disease identifies putative pathogenic programs and potential therapeutic targets
2026-May-06, Biomolecules & biomedicine
研究论文 通过单细胞RNA测序解析肠白塞病的致病机制和潜在治疗靶点 首次构建人类肠白塞病的单细胞转录组图谱,并系统比较其与克罗恩病的细胞和分子差异 样本量较小(仅4例活动性肠白塞病患者),可能限制发现的普遍性 阐明肠白塞病的单细胞转录组特征,鉴定潜在致病程序和治疗靶点 肠白塞病患者末端回肠活检标本(发炎和正常组织),以及公共数据集中的克罗恩病患者和健康对照 单细胞转录组学 肠白塞病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 4例活动性肠白塞病患者的配对活检标本,整合12例克罗恩病患者和6例健康对照的公共数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
595 2026-07-03
SwiftTCR: efficient computational docking protocol of TCRpMHC-I complexes using restricted rotation matrices
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了一种基于受限旋转矩阵的TCRpMHC-I复合物高效计算对接协议 利用TCRpMHC复合物独特的对接模式,大幅减少快速傅里叶变换旋转集,结合超快结构叠加工具GradPose加速聚类,实现25-40倍速度提升 研究仅针对I类MHC分子,未涵盖II类MHC;基准测试集规模较小(38个复合物) 开发快速高效的TCRpMHC-I复合物计算对接方法,辅助癌症免疫治疗设计及T细胞识别研究 TCRpMHC-I复合物的三维结构 计算生物学 肿瘤 计算对接 集成建模协议 三维结构数据 38个TCRpMHC-I复合物基准集 NA NA NA NA
596 2026-07-03
Single-cell transcriptomic profiling reveals cellular stress responses to hypothermic preservation in liver-on-chip model
2026-May-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用肝芯片模型进行单细胞转录组分析,揭示低温保存诱导的细胞应激反应 首次在肝芯片模型上利用单细胞RNA测序研究低温保存对多种肝细胞类型的转录组影响,并比较了不同保存液(UW与HPG)的效果 观察结果仅为探索性,需要独立的生物学重复和功能验证,包括代谢流分析和ROS检测,才能得出关于线粒体保护或临床保存效果的结论 研究低温保存在肝芯片模型中诱导的细胞类型特异性转录程序,以及不同保存液对转录谱的影响 肝芯片模型中的患者来源类器官、肝星状细胞、肝窦内皮细胞和巨噬细胞 单细胞转录组学 肝缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 肝芯片实验样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA 肝芯片模型,包括UW溶液和HPG配方保存液
597 2026-07-03
Repeated TLR7 activation induces cell type- and brain region-specific transcriptome changes in male mice
2026-Apr-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 重复TLR7激活诱导雄性小鼠细胞类型和脑区特异性转录组变化 首次通过单核RNA测序和原位空间转录组学揭示TLR7重复激活引起的细胞类型和脑区特异性转录组变化,特别是血脑屏障调节基因的变化 研究仅使用雄性小鼠,未涉及雌性小鼠或人类样本,且未完全阐明TLR7激活导致饮酒增加的具体机制 识别TLR7诱导的神经炎症中细胞类型特异性转录组模式,可能指导饮酒增加 雄性C57BL/6J小鼠 机器学习 酒精滥用 单核RNA测序,原位空间转录组学 NA 转录组数据 两组小鼠,一半用于饮酒行为测试,另一半用于脑组织分析 10x Genomics 单核RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Xenium 10x Chromium用于单核RNA测序,10x Xenium用于原位空间转录组学
598 2026-07-03
CXCL5 is associated with neutrophil-driven intestinal inflammation and IL-17-associated epithelial signaling in inflammatory bowel disease
2026-Apr-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 探究CXCL5在炎症性肠病中驱动中性粒细胞介导的肠道炎症及其与IL-17信号通路相互作用的作用机制 首次发现CXCL5在IBD中以阶段性方式参与中性粒细胞驱动的肠道炎症,并揭示CXCL5/IL-17A轴作为潜在治疗靶点 CXCL5缺失在慢性结肠炎模型中未显著改变疾病严重程度,表明其作用具有阶段依赖性,需要进一步机制研究 研究CXCL5在炎症性肠病中的作用及其与IL-17信号通路的关联 IBD患者结肠组织、急性/慢性鼠结肠炎模型、人肠道上皮细胞体外实验 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 IBD患者结肠组织样本和公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
599 2026-07-03
A machine learning-driven framework integrating cell death and senescence signatures for multi-target drug design and immunotherapy optimization in ovarian cancer
2026-Apr-26, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 提出一种机器学习驱动框架,整合细胞死亡与衰老特征,用于卵巢癌的多靶点药物设计和免疫治疗优化 首次将非凋亡性细胞死亡和衰老通路整合到预测模型中,并利用多组学分析、单细胞RNA测序和人工智能工具开发针对RB1基因的靶向小分子化合物 NA 开发整合细胞死亡与衰老特征的机器学习预测模型,以优化卵巢癌的多靶点药物设计和免疫治疗策略 卵巢癌患者队列(1858例样本)和免疫治疗数据集,以及RB1基因的功能验证实验 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序, 多组学分析, 人工智能靶向分子设计 机器学习模型 转录组数据, 单细胞序列数据 1858例卵巢癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
600 2026-07-03
Identification of synovial lymphatic system in the temporomandibular joint and their roles in arthritis and pain
2026-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过基因报告小鼠、人体组织、组织透明化、3D体积成像和功能研究,鉴定了颞下颌关节中的滑膜淋巴系统,并揭示了其在关节炎和疼痛中的作用 首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴系统,并通过单细胞RNA测序揭示了淋巴功能障碍通过诱导成纤维细胞-巨噬细胞杂交细胞群体加剧炎症和疼痛的机制 未提及具体限制,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异及治疗干预的长期效果未知 探索颞下颌关节中淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的功能 颞下颌关节中的滑膜淋巴系统 数字病理学 颞下颌关节炎 单细胞RNA测序, 基因报告小鼠, 组织透明化, 3D体积成像 NA 图像, 文本 小鼠模型(具体数量未说明)及人体组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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