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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-01-14
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别了与非小细胞肺癌患者吸烟状态相关的肿瘤浸润自然杀伤细胞亚群,并探讨了它们对手术和化疗免疫治疗反应的预测价值 首次在非小细胞肺癌中识别出与吸烟和慢性阻塞性肺疾病严重程度相关的两种自然杀伤细胞亚群,并建立了它们与不同治疗策略(直接手术 vs 新辅助化疗免疫治疗)疗效的关联 研究样本量相对有限(总计185例),且为回顾性分析,需要前瞻性研究验证 识别吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导非小细胞肺癌患者的治疗策略分层 非小细胞肺癌患者的肺组织样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA RNA测序数据 61例肺组织(用于单细胞RNA测序),102例切除的非小细胞肺癌和24例接受新辅助化疗免疫治疗的非小细胞肺癌患者(用于批量RNA测序) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
582 2026-01-14
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了接受睾酮替代治疗(TRT)的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织,揭示了睾酮治疗与乳腺中激素信号通路减少的关联 首次在单细胞水平上系统分析了睾酮治疗对乳腺激素信号通路的影响,并发现TRT能显著降低雌激素信号下游基因的表达 样本量相对较小,且未涉及长期随访数据,可能限制结果的普遍性 探究睾酮治疗对乳腺生物学的影响,评估TRT的长期安全性 接受睾酮替代治疗的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 一个人口统计学匹配的队列,包括顺性别女性和接受TRT的跨性别男性 NA 单细胞RNA-seq NA NA
583 2026-01-14
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法,构建了一个核苷酸代谢相关特征(NMRS),用于预测肺腺癌(LUAD)的预后和免疫治疗反应 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性,并构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征(NMRS),同时通过实验验证了关键基因ENO1的功能 研究主要基于公开的回顾性数据集,需要前瞻性临床队列进一步验证NMRS的预测效能;体外实验仅初步验证了ENO1的功能,缺乏体内模型和机制深入探索 探究肺腺癌中核苷酸代谢的细胞异质性及其对肿瘤进展、免疫微环境和治疗反应的影响,并开发相关的预后和预测标志物 肺腺癌(LUAD)患者肿瘤组织中的细胞,特别是恶性上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),机器学习算法组合 多种机器学习算法组合(共101种组合),inferCNV,Monocle2,CellChat 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 来自独立LUAD患者的公开scRNA-seq数据集,TCGA-LUAD队列和多个GEO队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
584 2026-01-14
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨了内皮细胞中CEPT1通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用 首次揭示了CEPT1在糖尿病背景下通过PPARα和VEGF-A信号通路促进缺血后血管生成和恢复的机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且未探讨CEPT1在其他疾病模型中的作用 探究CEPT1在糖尿病背景下促进缺血后血管生成和恢复的分子机制 人类外周动脉疾病患者样本、条件性内皮细胞特异性Cept1过表达小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 分子生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、分子通路分析 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 人类患者样本和小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
585 2026-01-14
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2026-Jan, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2
研究论文 提出了一种名为CausalGenDiff的生成因果扩散模型,用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 首次将扩散和自回归过程相结合以利用基因间的因果依赖关系,并将原本用于图像生成的因果注意力变换器扩展应用于高维基因表达数据,无需依赖预定义关系即可捕捉基因调控机制 未明确说明模型的计算复杂度或对计算资源的需求,也未讨论模型在更广泛组织类型或疾病状态下的泛化能力 提高单细胞RNA测序和空间转录组学数据整合的性能,以更好地理解空间背景下的基因表达 基因表达数据 计算生物学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 扩散模型,自回归模型,因果注意力变换器,VAE 基因表达数据 10个组织数据集 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
586 2026-01-14
Optimization of Brain Tissue Preservation for Nucleic Acid Stability
2026 Jan-Feb, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
研究论文 本文通过优化脑组织保存方案,旨在提高空间转录组学研究中核酸稳定性与细胞结构完整性 首次系统比较了不同保存条件对羊脑组织RNA质量和细胞结构的影响,为空间转录组学样本制备提供实证指导 研究基于羊脑模型,尚未在人类样本中验证;冷冻方案仍需改进以达到FFPE组织的细胞结构水平 优化脑组织保存方法以提升空间转录组学研究的样本质量 羊脑组织(n=16)的FFPE和冷冻样本 空间转录组学 NA 空间转录组学、RNA完整性分析、组织形态学分析 NA RNA质量数据、组织切片图像 16个羊脑样本 NA 空间转录组学 NA NA
587 2026-01-14
Transcriptional Heterogeneity Reveals a Synaptic Gene Program in Developing and Adult Human Oligodendrocyte Precursor Cells
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎和成年大脑皮层中少突胶质前体细胞(OPCs)的转录异质性,并鉴定出一个表达突触相关基因的新型亚群 首次在人类胚胎大脑皮层中鉴定出一个表达突触发育、突触信号传导和神经调节相关基因的新型少突胶质前体细胞亚群(eSyn-OPCs),并在成年大脑中发现了其转录相似的对应亚群(aSyn-OPCs) 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本主要来自孕周12-22周的胚胎组织,成年样本来自公开数据集 揭示人类少突胶质前体细胞在发育过程中的异质性及其在神经元-胶质细胞通讯中的潜在作用 人类胚胎和成年大脑皮层中的少突胶质前体细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学分析 无监督聚类分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 超过2300个纯化的少突胶质前体细胞,来自孕周17的人类大脑皮层;孕周12-22的胚胎组织样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
588 2026-01-14
KCNV2-Deficient Retinal Organoid Model of Cone Dystrophy-In Vitro Screening for AAV Gene Replacement Therapy
2025-Dec-31, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究建立了KCNV2缺陷的人视网膜类器官模型,用于评估AAV基因替代疗法的载体效力 首次利用患者来源和基因编辑的视网膜类器官作为生理相关模型,在体外评估AAV基因治疗载体的效力,并通过单细胞RNA测序在单细胞分辨率下验证治疗效果 研究为体外模型,仍需动物实验和临床试验进一步验证;类器官模型可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境 开发用于评估基因治疗载体效力的视网膜疾病模型,并筛选先导治疗候选物 KCNV2基因缺陷的人视网膜类器官 基因治疗 视网膜锥细胞营养不良 单细胞RNA测序,基因编辑,AAV载体构建 视网膜类器官模型 基因表达数据,蛋白质定量数据 来自两个独立来源的视网膜类器官:患者血液来源的iPSCs和对照细胞系的基因编辑产物 NA 单细胞RNA-seq NA NA
589 2026-01-14
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025-Dec-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)与炎症性肠病(IBD)患者胃肠道中肥大细胞MRGPRX2受体表达的变化及其临床意义 首次将HαT基因型与IBD患者胃肠道肥大细胞表型(特别是MRGPRX2表达)联系起来,并采用多平台互补方法(基因分型、空间转录组学、质谱流式细胞术)进行验证 样本量相对较小(空间转录组学n=8,质谱流式细胞术n=14),且为观察性研究,无法确定因果关系 探究HαT是否通过改变肥大细胞MRGPRX2表达影响IBD的胃肠道症状 IBD患者(包括HαT和非HαT个体)的结肠和小肠组织样本 数字病理学 炎症性肠病 基因分型、空间转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、ddPCR NA 基因型数据、转录组数据、蛋白质表达数据 854份生物样本库的IBD样本进行基因分型;8例结肠组织(4 HαT, 4 非HαT)进行空间转录组学;14例小肠活检样本(5 HαT, 9 对照)进行质谱流式细胞术 NA 空间转录组学, 质谱流式细胞术 NA NA
590 2026-01-14
MFAP5 Activates ITGA5 to Drive Tooth Germ Mineralization Through the MAPK/ERK Pathway: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术构建了小型猪牙胚的高分辨率细胞图谱,揭示了MFAP5通过激活ITGA5并驱动MAPK/ERK通路来调控牙胚矿化的新机制 首次在牙胚发育中识别出MFAP5作为牙源性程序的新调控因子,并阐明其通过MFAP5-ITGA5-ERK/MAPK信号轴以细胞状态特异性方式驱动矿化的机制 研究主要基于体外功能实验和小型猪模型,其在人类牙胚发育中的直接适用性及体内功能验证仍需进一步探索 探究牙胚矿化的分子调控机制 小型猪的牙胚组织 单细胞转录组学 牙科发育与再生 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞RNA测序平台
591 2026-01-14
Primordial cardiomyocytes orchestrate myocardial morphogenesis and vascularization but are dispensable for regeneration
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在成年斑马鱼心脏中发现了一个独特的、表达特定标记物的心肌细胞亚群,并揭示了其在心脏形态发生中的关键作用及其在再生过程中的非必要性 首次在成年斑马鱼心脏中鉴定出一个独特的原始心肌细胞亚群,并明确其在心脏发育(形态发生和血管化)中起关键组织者作用,但在心脏再生中并非必需,揭示了发育与再生程序之间的根本差异 研究主要基于斑马鱼模型,结论在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证;原始心肌细胞再生能力有限的分子机制尚未完全阐明 探究脊椎动物心脏中不同心肌细胞亚群在心脏发育和修复中的具体作用 成年斑马鱼心脏中的心肌细胞亚群 发育生物学、心脏再生 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传消融技术 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
592 2026-01-14
Macrophage-Dendritic Cell-T-Cell Tetrads Orchestrate Antitumor Immunity and Response to Checkpoint Blockade
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文识别了一种由巨噬细胞、cDC1s、CD4 T细胞和CD8 T细胞组成的空间组织多细胞免疫单元,称为“四联体”,它协调抗肿瘤免疫和对检查点阻断的反应 首次发现并定义了“四联体”这一多细胞免疫单元,揭示了其在抗肿瘤免疫和检查点阻断反应中的关键作用,并明确了ICOS-ICOSL通路的重要性 研究主要基于小鼠和人类肿瘤的成像与转录组学数据,可能未涵盖所有肿瘤类型或治疗场景,且临床样本量有限 定义调控有效抗肿瘤免疫的细胞结构,以解释免疫检查点抑制剂仅对部分患者有效的机制 小鼠和人类肿瘤中的免疫细胞,包括巨噬细胞、cDC1s、CD4 T细胞和CD8 T细胞 数字病理学 膀胱癌 多重成像和空间转录组学 NA 图像和转录组数据 小鼠和人类肿瘤样本,具体数量未明确 NA 空间转录组学 NA NA
593 2026-01-14
Multi-Omics Integration Identifies TNFRSF1A as a Causal Mediator of Immune Microenvironment Reprogramming in Diabetic Kidney Disease
2025-Dec-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过多组学整合方法,揭示了TNFRSF1A在糖尿病肾病免疫微环境重编程中的因果中介作用 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、伪时间轨迹分析、细胞间通讯分析和孟德尔随机化等多种技术,系统性地鉴定了TNFRSF1A作为糖尿病肾病进展的因果驱动因子 研究未排除其他调控通路的参与,且斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 探究糖尿病肾病进展中的炎症介质及其因果驱动机制 糖尿病肾病患者的肾脏组织及斑马鱼胚胎模型 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 孟德尔随机化 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确说明人类样本数量,使用斑马鱼胚胎模型进行验证 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
594 2026-01-14
Eurotium cristatum-Fermented White Tea Ameliorates DSS-Induced Colitis by Multi-Scale
2025-Dec-25, Foods (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究探讨了冠突散囊菌发酵白茶(FWT)通过多尺度机制改善DSS诱导的小鼠结肠炎 首次结合单细胞/空间转录组学揭示FWT通过增强肠上皮细胞、杯状细胞和干细胞群,优化功能并诱导抗菌和免疫调节因子,修复肠道屏障 研究基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;机制涉及多因素,具体因果关联需深入探究 探究FWT对结肠炎的治疗效果及其多尺度作用机制 DSS诱导的结肠炎小鼠模型 NA 结肠炎 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
595 2026-01-14
Therapeutic reprogramming of circulating myeloid cells via signal regulatory protein α extracellular vesicles in acute kidney injury
2025-Dec-23, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文探讨了通过表达高亲和力信号调节蛋白α变体的细胞外囊泡靶向CD47,以治疗急性肾损伤 开发了表达高亲和力SIRPα变体的细胞外囊泡,用于系统性靶向循环髓系细胞中的CD47,提供了一种先于组织浸润的免疫调节策略 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性需进一步评估 研究急性肾损伤的治疗策略,特别是通过靶向CD47调节髓系细胞功能 人类AKI样本、小鼠AKI模型(顺铂和双侧缺血/再灌注模型)、人骨髓间充质干细胞衍生的细胞外囊泡 NA 急性肾损伤 单细胞RNA测序、CD47蛋白染色 NA RNA测序数据、蛋白质表达数据 人类AKI标本和两种小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
596 2026-01-14
DUSP5 Downregulation in Nucleus Accumbens Core Correlates with Cocaine-Induced Maladaptive Synaptic Plasticity
2025-Dec-23, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究探讨了双特异性磷酸酶5(DUSP5)在可卡因诱导的伏隔核核心区(NAcore)突触可塑性中的作用 首次探索DUSP5在可卡因成瘾中的具体作用,揭示了其与可卡因诱导的突触可塑性及行为适应的关联 研究主要基于大鼠模型和公开数据库,尚未在人体中进行验证 探究可卡因成瘾中NAcore突触可塑性的分子机制 大鼠可卡因自我给药模型、可卡因处理的NAcore单细胞RNA测序数据 神经科学 药物成瘾 单细胞RNA测序、分子分析 大鼠可卡因自我给药模型 RNA测序数据、行为数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
597 2026-01-14
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过培养患者来源的回肠类器官,探究了缺氧环境如何通过HIF-1α依赖的方式影响肠道干细胞命运 首次在患者来源的回肠类器官模型中,明确了生理性缺氧通过稳定HIF-1α直接调控干细胞命运的机制 研究主要基于体外类器官模型,体内生理环境的复杂性可能未被完全模拟 探究氧气可用性如何影响肠道干细胞增殖与分化 患者来源的人回肠类器官(enteroids) NA NA bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
598 2026-01-14
Effects of TGFBR1 on Proliferation of Dermal Papilla Cells in Fine-Wool Sheep
2025-Dec-23, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1
研究论文 本研究探讨了TGFBR1基因对细毛羊真皮乳头细胞增殖的影响及其分子机制 首次通过单细胞转录组测序在细毛羊真皮乳头细胞中鉴定出TGFBR1为差异表达基因,并验证其通过调控Wnt/β-catenin、BMP和Notch等多条信号通路抑制细胞增殖 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型的验证,且信号通路调控的具体分子机制有待进一步阐明 探究TGFBR1在细毛羊毛囊发育和周期性生长中的生物学功能及分子机制 细毛羊的真皮乳头细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序、RT-qPCR、EDU染色、CCK-8检测 NA 基因表达数据、细胞增殖数据 未明确说明具体样本数量,但涉及细毛羊真皮乳头细胞的原代分离培养 NA 单细胞RNA-seq NA NA
599 2026-01-14
Emerging Technologies for Exploring the Cellular Mechanisms in Vascular Diseases
2025-Dec-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了用于探索血管疾病细胞机制的新兴技术,包括单细胞与空间转录组学、超分辨率成像、微流控器官芯片、CRISPR基因编辑和人工智能等 整合多种前沿技术(如单细胞多组学、器官芯片和人工智能)来系统评估其在血管疾病研究中的转化准备度、局限性和临床应用潜力 现有技术仍需要多中心大规模验证研究、实验协议标准化以及与临床数据和人类样本的进一步整合 评估新兴技术在揭示血管疾病细胞分子机制、促进靶向治疗和精准诊断发展方面的应用 血管疾病(VDs)和心血管疾病(CVDs)的细胞与分子基础 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、超分辨率成像、光声成像、微流控器官芯片、CRISPR/Cas9基因编辑、人工智能 NA 多组学数据、成像数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
600 2026-01-14
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过感染5xFAD小鼠与野生型小鼠,探讨了小鼠适应型SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学的影响,发现感染未改变Aβ斑块但广泛改变了中枢神经系统细胞类型的基因表达 首次在小鼠模型中结合bulk RNA测序和空间转录组学技术,系统评估了SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病模型小鼠神经病理和基因表达的影响,揭示了感染虽不改变Aβ斑块但引起广泛基因表达变化的新机制 研究仅使用小鼠模型,可能无法完全模拟人类疾病;未检测长期感染效应;病毒RNA未在中枢神经系统检测到,限制了直接神经病理影响的评估 探究SARS-CoV-2感染如何影响阿尔茨海默病神经病理学的潜在机制 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型C57BL/6小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 bulk RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据 10-14月龄的5xFAD和野生型C57BL/6小鼠 NA bulk RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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