单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31938 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应，揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-10-05 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
|
研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A调控小鼠胚胎干细胞命运程序的分子机制 | 首次发现SMAD1/5通过招募KDM1A介导H3K4me1/2去甲基化，从而抑制特定基因表达的转录抑制新机制 | 研究主要集中于小鼠胚胎干细胞，在人类细胞或其他细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运程序的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | 基因敲除模型 | 基因组学数据,转录组数据 | Smad1/5双敲除和野生型小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 583 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 584 | 2025-10-05 |
TGF-β-Enriched Exosomes from Acute Myeloid Leukemia Activate Smad2/3-MMP2 and ERK1/2 Signaling to Promote Leukemic Cell Proliferation, Migration, and Immune Modulation
2025-Aug-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090690
PMID:41020812
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和外泌体转录组分析，揭示急性髓系白血病来源的TGF-β富集外泌体通过激活Smad2/3-MMP2和ERK1/2信号通路促进白血病进展 | 首次整合单细胞转录组与外泌体分析，发现AML外泌体通过TGF-β介导的信号通路同时增强白血病侵袭性和免疫微环境重塑的双重作用机制 | AML外泌体的精确功能特征仍未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究急性髓系白血病来源外泌体在肿瘤进展中的功能作用和分子机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓穿刺样本和外泌体 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 外泌体转录组数据 | AML患者和健康捐赠者的骨髓穿刺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 585 | 2025-10-05 |
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669006
PMID:40832362
|
研究论文 | 本研究探讨了促纤维化单核来源肺泡巨噬细胞在系统性硬化相关间质性肺病中的生物标志物和治疗靶点潜力 | 首次在SSc-ILD患者中发现MoAM与疾病严重程度相关，并证实其转录组变化与治疗反应相关 | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证 | 评估MoAM作为SSc-ILD生物标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性硬化相关间质性肺病患者和健康对照 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 流式细胞数据 | 9例SSc-ILD患者和13例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 586 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Aug-11, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100866
PMID:40803647
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次利用深度学习模型从常规H&E染色组织图像中推断空间转录组水平的分子信息，无需进行昂贵的空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学特征无法完全捕获 | 开发从H&E组织图像推断空间转录组信息的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，深度学习 | UNI, ResNet-50, Vision Transformer, Vision Mamba | 组织图像，空间转录组数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 587 | 2025-10-05 |
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06417-3
PMID:40457096
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期患者与非糖尿病供体的胰岛蛋白表达差异 | 首次在人类胰岛中揭示1型糖尿病前期阶段的蛋白质组变化，发现免疫反应增强与内质网应激和蛋白质翻译减弱并存的新现象 | 样本量较小（n=3 vs n=3），供体间变异大，统计功效有限 | 识别1型糖尿病前期胰岛β细胞功能障碍的分子通路 | 来自器官捐献者的胰岛组织 | 蛋白质组学 | 1型糖尿病 | 激光显微切割，质谱蛋白质组学，无标记定量 | NA | 蛋白质组数据 | 3名多自身抗体阳性1型糖尿病前期患者与3名匹配的非糖尿病对照 | NA | 质谱蛋白质组学，单细胞RNA-seq | NA | 液相色谱-质谱联用技术 |
| 588 | 2025-10-05 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
|
研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化中通过调控成纤维细胞代谢重编程促进疾病进展的机制 | 首次发现CBX5作为表观遗传调控因子连接代谢异常与肺成纤维细胞持续活化状态，并证明靶向CBX5可抑制纤维化发展 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人体内的直接证据仍需进一步验证 | 探究表观遗传调控在肺纤维化发病机制中的作用，特别是CBX5对成纤维细胞代谢重编程的调控机制 | 肺成纤维细胞、特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织、博来霉素诱导的肺损伤模型 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 批量RNA测序, 代谢评估 | NA | 基因表达数据, 代谢数据, 组织图像 | IPF患者肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated with Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.04.22.25326170
PMID:40313260
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次实现了直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息，无需实际进行空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学无法完全捕获 | 开发从组织学图像推断RNA表达的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，空间转录组学 | UNI, ResNet-50, ViT, VMamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 590 | 2025-10-05 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotypes and phenotypes in chronic lymphocytic leukemia
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279049.124
PMID:39965935
|
研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 结合scBayes分析方法和MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高转录本覆盖度并扩展可检测的突变信息 | 研究样本量较小，仅包含6名患者 | 研究携带BTK C481S突变的癌症亚克隆，识别共存的CLL驱动突变，并分析突变亚克隆的转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者的癌细胞亚克隆 | 单细胞测序分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | scBayes | 单细胞RNA测序数据，DNA测序数据 | 6名慢性淋巴细胞白血病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 591 | 2025-10-05 |
Integrating short-read and long-read single-cell RNA sequencing for comprehensive transcriptome profiling in mouse retina
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279167.124
PMID:40050124
|
研究论文 | 本研究通过整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术，对小鼠视网膜进行了全面的转录组分析 | 首次系统比较单细胞长读长与传统短读长RNA测序技术，发现了44,325个转录本异构体，其中38%为先前未表征，17%在特定细胞亚类中特异性表达 | 研究仅限于小鼠视网膜组织，未验证其他组织或物种的适用性 | 建立有效的转录本异构体表征方法，研究选择性剪接在视网膜生物学中的作用 | 约30,000个小鼠视网膜细胞 | 单细胞测序 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 约30,000个细胞 | Illumina, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序 | Illumina测序平台, Oxford Nanopore测序平台 | 短读长测序产生15.4亿条reads，长读长测序产生14.0亿条reads |
| 592 | 2025-10-05 |
Timing neural development and regeneration
2025-Apr, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102976
PMID:40010202
|
综述 | 探讨哺乳动物神经祖细胞时间身份调控机制及其在胶质细胞重编程中的潜在应用 | 整合时间身份调控与神经发生因子过表达以增强重编程效率并扩展神经元亚型多样性 | NA | 解析神经祖细胞时间身份调控机制及其在神经再生治疗中的应用潜力 | 哺乳动物中枢神经系统神经祖细胞和胶质细胞 | 神经发育生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 593 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies molecular biomarkers predicting late progression to CDK4/6 inhibition in patients with HR+/HER2- metastatic breast cancer
2025-Feb-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02226-9
PMID:39955556
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别预测HR+/HER2-转移性乳腺癌患者对CDK4/6抑制剂晚期进展的分子生物标志物 | 首次在单细胞水平分析CDK4/6抑制剂治疗前后肿瘤微环境变化，识别出预测晚期进展的分子特征和免疫细胞动态 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证生物标志物的临床适用性 | 开发预测HR+/HER2-转移性乳腺癌患者对CDK4/6抑制剂治疗反应的生物标志物 | HR+/HER2-转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自肝转移、胸腔积液、腹水和骨转移等多个转移部位的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-10-05 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
|
研究论文 | 提出一种名为广义二元协方差分解的统计方法，用于从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 开发了能够将肿瘤转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关共享成分的新统计方法 | 方法在强肿瘤间异质性存在时的性能优势需进一步验证 | 解析肿瘤转录异质性并识别与癌症进展相关的共享表达模式 | 胰腺导管腺癌单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 595 | 2025-10-05 |
Integrative Analysis of TLS-Associated Gene Signatures, Immune Infiltration and Drug Sensitivity in Pancreatic Cancer
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70038
PMID:41016829
|
研究论文 | 本研究通过整合分析胰腺癌中三级淋巴结构相关基因特征、免疫浸润和药物敏感性，开发个性化治疗策略 | 首次系统鉴定9个TLS相关基因并建立TLS评分系统，结合单细胞RNA-seq揭示基因在免疫细胞中的分布，证明TLS评分可预测化疗药物敏感性 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证；机制研究尚不深入 | 开发胰腺癌个性化化疗选择策略 | 胰腺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | 胰腺癌患者队列和Mia PaCa2、Jurkat细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 596 | 2025-10-05 |
The Single-Cell Triaptosis Regulatory Pattern in the Immune Microenvironment of Keloids
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S536776
PMID:41024856
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据研究瘢痕疙瘩免疫微环境中三凋亡调控模式的作用 | 首次揭示三凋亡调控模式在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用，并鉴定ELMO2为关键致病基因 | NA | 探究三凋亡在瘢痕疙瘩免疫微环境形成中的调控机制 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库样本+自有瘢痕疙瘩样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-05 |
Practical approaches to advanced molecular biology techniques
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.022
PMID:41033726
|
研究论文 | 本章详细介绍了多种先进分子生物学技术的实验方案和应用 | 系统整合了包括CRISPR-Cas9、单细胞RNA测序等前沿分子生物学技术的实用操作指南 | NA | 为分子生物学研究提供先进技术的实践指导 | 分子生物学技术及其在细胞过程研究中的应用 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Real-Time PCR, 流式细胞术, ChIP-Seq, scRNA-Seq, 质谱分析, FISH | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 598 | 2025-10-05 |
Synergy Between NK Cells and Monocytes in Potentiating Cardiovascular Disease Risk in Severe COVID-19
2024-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321085
PMID:38989579
|
研究论文 | 本研究探讨了单核细胞和自然杀伤细胞在严重COVID-19患者心血管疾病风险增加中的协同作用机制 | 首次揭示了NK细胞通过激活增强单核细胞源性巨噬细胞对氧化低密度脂蛋白的摄取，阐明了两种免疫细胞在COVID-19相关心血管风险中的协同作用机制 | 样本量相对有限（严重组31例，康复组29例，对照组17例），主要关注严重COVID-19患者 | 研究严重COVID-19期间免疫细胞改变及其与心血管疾病风险的关联 | 严重COVID-19患者、康复患者和未感染SARS-CoV-2的对照人群 | 免疫学 | 心血管疾病 | 光谱流式细胞术、单细胞转录组分析、体外实验 | NA | 流式细胞数据、转录组数据、血浆生物标志物数据 | 严重COVID-19患者31例，康复患者29例，未感染对照17例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2025-10-05 |
IRG1/ACOD1 promotes neutrophil reverse migration and alleviates local inflammation
2024-Oct-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae110
PMID:38713770
|
研究论文 | 本研究揭示了IRG1/ACOD1通过降低中性粒细胞表面ICAM-1表达促进其反向迁移并缓解局部炎症的机制 | 首次发现IRG1/ACOD1通过调控ICAM-1与Cd11a的结合促进中性粒细胞反向迁移，揭示了炎症消退的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究中性粒细胞反向迁移的分子机制及其在炎症中的作用 | 中性粒细胞（PMN）及其反向迁移现象 | 免疫学 | 急性肺部炎症 | 单细胞RNA测序，基因敲除，体内追踪 | NA | 基因表达数据，细胞迁移数据 | 小鼠炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 600 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing of human eosinophils in allergic inflammation in the esophagus
2024-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.05.029
PMID:38871184
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入分析了嗜酸性粒细胞在食管过敏炎症中的转录组特征和生物学功能 | 首次在单细胞水平揭示食管嗜酸性粒细胞存在两种不同功能状态的亚群，并发现其表达多种感应受体和炎症介质的特征 | 样本量相对有限（12名个体），且主要关注转录组水平，需要进一步功能验证 | 全面表征人类嗜酸性粒细胞在食管过敏炎症中的转录组和生物学功能 | 嗜酸性粒细胞在嗜酸性食管炎(EoE)患者中的表达特征 | 单细胞组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫染色, 刺激试验 | NA | 单细胞转录组数据 | 586个嗜酸性粒细胞（来自12名个体：6名患者血液，6名患者食管） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于重力的单细胞RNA测序方法 |