单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
581 2025-04-24
Single-cell atlas profiling revealed cellular characteristics and dynamic changes after PD-1 blockade therapy of brain metastases from laryngeal squamous cell carcinoma
2025-Apr, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析喉鳞状细胞癌脑转移患者在PD-1阻断治疗前后的细胞特征和动态变化 首次使用单细胞RNA测序技术分析PD-1阻断治疗前后喉鳞状细胞癌脑转移的细胞特征和动态变化,揭示了治疗对癌细胞和免疫细胞功能的影响 样本量有限,且仅针对喉鳞状细胞癌脑转移患者 研究PD-1阻断治疗对喉鳞状细胞癌脑转移的细胞特征和动态变化的影响 喉鳞状细胞癌脑转移患者的肿瘤样本 数字病理学 喉鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq), bulk RNA测序 NA RNA测序数据 配对的转移性肿瘤样本(治疗前后)和原发性喉鳞状细胞癌数据集
582 2025-04-24
Endothelial RUNX3 controls LSEC dysfunction and angiocrine LRG1 signaling to prevent liver fibrosis
2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 研究探讨了内皮RUNX3在控制肝窦内皮细胞(LSEC)功能障碍和血管分泌LRG1信号传导中的作用,以预防肝纤维化 首次揭示了RUNX3在LSEC中的功能及其通过调节LRG1分泌影响肝纤维化的机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床应用的转化仍需进一步验证 探究RUNX3在肝纤维化中的作用及其分子机制 肝窦内皮细胞(LSEC)和肝纤维化 分子生物学 肝纤维化 单细胞RNA测序、定量RT-PCR 小鼠模型 基因表达数据 小鼠模型和人类肝病患者样本
583 2025-04-24
Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 通过纵向单细胞RNA测序揭示系统性红斑狼疮患者在接受belimumab治疗期间B淋巴细胞的动态变化 首次利用纵向单细胞RNA测序技术分析系统性红斑狼疮患者在接受抗BAFF治疗期间B细胞的动态变化和亚群特异性反应 样本量较小(仅4名患者),且仅限于韩国人群 探究抗BAFF治疗在系统性红斑狼疮患者中的免疫学机制 系统性红斑狼疮患者的B淋巴细胞 单细胞组学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 4名韩国SLE患者的PBMCs(超过73,000个细胞),以及22名日本SLE患者的批量转录组数据
584 2025-04-24
Crosstalk between endothelial cells and dermal papilla entails hair regeneration and angiogenesis during aging
2025-Apr, Journal of advanced research IF:11.4Q1
research paper 研究揭示了内皮细胞(ECs)和真皮乳头(DP)之间的相互作用如何调节衰老过程中的血管生成和毛发再生 发现了ECs分泌的EDN1与DP表达的EDNRA结合增强牛磺酸(TA)代谢促进毛发再生,以及DP分泌的CTF1与ECs表达的IL6ST结合激活α-亚麻酸(ALA)代谢促进血管生成的新信号通路 研究主要基于小鼠模型和体外器官培养,人类组织中的验证尚未进行 探索毛发和血管在衰老过程中如何通过相互作用调节血管生成和毛发再生 内皮细胞(ECs)和真皮乳头(DP) 细胞生物学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CellChat、CellCall、单细胞代谢分析(scMetabolism)、iPATH 小鼠毛发拔除模型和器官培养模型 单细胞转录组数据、代谢数据 NA
585 2025-04-24
Tolerogenic dendritic cell-mediated regulatory T cell differentiation by Chinese herbal formulation attenuates colitis progression
2025-Apr, Journal of advanced research IF:11.4Q1
research paper 研究探讨了中药配方CDD-2103及其生物活性成分在结肠炎小鼠模型中调节免疫的机制 揭示了CDD-2103通过促进耐受性树突状细胞积累和功能上调电子传递链相关基因,从而增加调节性T细胞分化的新机制 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 探讨CDD-2103及其生物活性成分在调节免疫耐受中的作用 结肠炎小鼠模型 免疫学 溃疡性结肠炎 单细胞转录组分析、液相色谱-质谱联用(LC-MS) 小鼠结肠炎模型 转录组数据、质谱数据 两种实验性结肠炎模型小鼠
586 2025-04-24
Mesenchymal stem cells alleviate mouse liver fibrosis by inhibiting pathogenic function of intrahepatic B cells
2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
research paper 该研究探讨了间充质干细胞(MSCs)通过抑制肝内B细胞的致病功能来缓解小鼠肝纤维化的机制 发现了一种新的幼稚B细胞亚型(B-II),并揭示了MSCs通过外泌体调控MAPK和NF-κB信号通路抑制B细胞的增殖和细胞因子产生的机制 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 探索MSCs治疗肝纤维化的新机制 小鼠肝纤维化模型和肝内B细胞 细胞治疗 肝纤维化 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 NA
587 2025-04-24
Integrative Analyses of Bulk and Single-Cell RNA Seq Identified the Shared Genes in Acute Respiratory Distress Syndrome and Rheumatoid Arthritis
2025-Apr, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
研究论文 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别急性呼吸窘迫综合征(ARDS)和类风湿性关节炎(RA)之间的共享基因 首次通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别出ARDS和RA之间的共享基因,并揭示了这些基因与免疫细胞的关联 研究主要依赖于公共数据库的数据,可能受到样本来源和数量的限制 识别ARDS和RA之间的共享基因,为临床药物发现提供潜在靶点 急性呼吸窘迫综合征(ARDS)和类风湿性关节炎(RA)的基因表达数据 生物信息学 急性呼吸窘迫综合征和类风湿性关节炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、随机森林(RF)和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)算法 随机森林(RF)、LASSO 基因表达数据 来自Gene Expression Omnibus数据库的批量RNA测序数据以及ALI小鼠的肺组织转录组测序数据
588 2025-04-24
The Predictive Value of Neutrophil Extracellular Trap-Related Risk Score in Prognosis and Immune Microenvironment of Colorectal Cancer Patients
2025-Apr, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
research paper 该研究构建了一个基于中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)相关基因的风险评分模型,用于预测结直肠癌(CRC)患者的预后和免疫微环境特征 首次在CRC中构建NET相关风险评分模型,并揭示其与患者预后、疾病分期及免疫微环境的相关性 研究基于回顾性数据库分析,需要前瞻性临床研究验证 开发结直肠癌预后预测工具并探索免疫微环境特征 结直肠癌患者 digital pathology colorectal cancer RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析 LASSO Cox回归模型 基因表达数据 TCGA-CRC数据库及GEO验证数据集中的结直肠癌样本
589 2024-12-30
Correction to: Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
590 2025-04-24
Single-Cell RNA Sequencing Revealed Functional Conjunctival Keratinocytes Loss via TGF-β-Wnt/β-Catenin Signaling in Sjögren's Syndrome Related Dry Eye
2025-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术研究Sjögren综合征相关干眼病中结膜角质形成细胞的功能丧失及其机制 揭示了TGF-β-Wnt/β-catenin信号轴在Sjögren综合征相关干眼病中调控功能性角质形成细胞丧失的新机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 阐明Sjögren综合征相关干眼病中结膜的功能变化及其分子机制 Sjögren综合征小鼠模型的结膜组织 数字病理学 干眼病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、T细胞受体测序(TCR sequencing)、Western blot、免疫荧光、多重免疫组化(mIHC)、流式细胞术 小鼠模型 RNA测序数据、蛋白质表达数据 Sjögren综合征小鼠模型的结膜组织
591 2025-04-24
Exploring Multi-Target Therapeutic Strategies for Glioblastoma via Endogenous Network Modeling
2025-Apr-01, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过系统生物学视角,基于内源网络的动态分析,探索了多靶点治疗胶质母细胞瘤的策略 利用内源网络建模和单细胞RNA测序数据验证,识别出多种潜在有效的多靶点组合,强调了多靶点干预策略在癌症治疗中的必要性 临床实验和实施多靶点组合治疗存在困难,研究尚未进行实际临床验证 探索胶质母细胞瘤的多靶点治疗策略 胶质母细胞瘤 系统生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 内源网络模型 RNA测序数据 NA
592 2025-04-24
Molecular Mechanisms of Propofol-Induced Cognitive Impairment: Suppression of Critical Hippocampal Pathways
2025-Apr, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了丙泊酚通过抑制海马区关键信号通路导致认知功能障碍的分子机制 首次使用单细胞RNA测序和高通量转录组分析揭示丙泊酚抑制HTR1A/GRIA2/PIK3R1信号通路的具体机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性有待进一步验证 阐明丙泊酚引起术后认知功能障碍的分子机制 丙泊酚对海马区神经重塑的影响 神经科学 术后认知功能障碍 scRNA-seq, 高通量转录组分析 NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未提及)
593 2025-04-24
Single-Cell Sequencing Reveals the Heterogeneity of Hepatic Natural Killer Cells and Identifies the Cytotoxic Natural Killer Subset in Schistosomiasis Mice
2025-Mar-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
research paper 该研究通过单细胞测序技术揭示了血吸虫病小鼠肝脏自然杀伤细胞(NK细胞)的异质性,并鉴定出具有细胞毒性的NK细胞亚群 首次利用单细胞测序技术系统解析了血吸虫病模型中肝脏NK细胞的异质性,并发现Thy1NK亚群可作为抗肝纤维化的靶细胞 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体样本中验证 探究血吸虫病肝脏纤维化过程中NK细胞的异质性及其功能亚群 血吸虫病小鼠模型中的肝脏NK细胞 digital pathology schistosomiasis single-cell sequencing, RT-qPCR NA single-cell RNA sequencing data 未感染小鼠和感染4周/6周小鼠的肝脏NK细胞
594 2025-04-24
Identification of a Cancer Stem Cell-Related Gene Signature in Hepatocellular Carcinoma Based on Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Analysis
2025-Mar-24, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过结合TCGA和ICGC的临床数据集以及bulk RNA测序数据,利用GSE156625单细胞RNA测序数据集,探索了肝癌中癌症干细胞(CSCs)生物标志物的预后意义 开发了一个基于九个特定BCSCs的预后风险模型,揭示了高风险患者总体生存率较低,并描述了肿瘤微环境中免疫细胞的组成及基因表达水平和突变率的显著差异 需要进一步的实验验证这些CSCs在疾病进展中的作用 探索肝癌中癌症干细胞(CSCs)生物标志物的预后意义 肝癌(LIHC)患者 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和bulk RNA测序 预后风险模型 RNA测序数据 TCGA和ICGC的临床数据集及GSE156625单细胞RNA测序数据集
595 2025-04-24
IL-24 promotes atopic dermatitis-like inflammation through driving MRSA-induced allergic responses
2025-Mar-08, Protein & cell IF:13.6Q1
research paper 研究发现IL-24通过驱动MRSA诱导的过敏反应促进特应性皮炎样炎症 首次揭示IL-24在MRSA诱导的特应性皮炎发展中的关键作用及其机制 研究主要基于动物模型,需要进一步在人类患者中验证 探究MRSA在特应性皮炎发病机制中的作用 角质形成细胞和特应性皮炎动物模型 免疫学 特应性皮炎 单细胞RNA测序 动物模型 基因表达数据 NA
596 2025-03-08
Erratum for the Research Article "Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria" by A. Sarfatis et al
2025-Mar-07, Science (New York, N.Y.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
597 2025-04-24
Recent Innovations and Technical Advances in High-Throughput Parallel Single-Cell Whole-Genome Sequencing Methods
2025-Mar, Small methods IF:10.7Q1
综述 本文综述了高通量平行单细胞全基因组测序方法的最新技术进展 总结了高通量单细胞全基因组测序在策略设计、数据效率、平行处理平台等方面的技术进步 总成本限制 探讨高通量单细胞全基因组测序方法的技术进步及其应用 人类基因组 基因组学 癌症 单细胞全基因组测序(scWGS) NA 基因组数据 NA
598 2025-04-24
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
研究论文 本文更新并扩展了先前关于心脏神经生物学分子和细胞基础的白皮书,重点关注心脏自主神经发育、新的细胞内通路和神经可塑性的最新发现 探讨了患者特异性干细胞在研究心脏交感神经损伤中的应用,以及新型成像技术和空间转录组学在治疗心脏自主神经功能障碍中的潜在作用 文中提到了一些未解决的问题和争议领域 研究心脏疾病的分子和细胞神经心脏病学基础 心脏自主神经系统、细胞内通路和神经可塑性 神经心脏病学 心血管疾病 空间转录组学、新型成像技术 NA 分子和细胞数据 NA
599 2025-04-24
Discrete placental gene expression signatures accompany diabetic disease classifications during pregnancy
2025-Mar, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1
研究论文 本研究通过整合RNA测序技术,揭示了妊娠期糖尿病亚型与胎盘基因表达特征的关联 结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术,首次在胎盘细胞亚群和组织微环境中识别出糖尿病亚型特异的基因表达特征 样本量相对有限,且未考虑其他可能影响基因表达的因素 探究不同类型糖尿病(GDMA1、GDMA2和T2DM)妊娠期胎盘基因表达的差异特征 妊娠期糖尿病患者的胎盘组织 基因组学 妊娠期糖尿病 bulk RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组学、RT-qPCR 机器学习模型(未明确具体类型) 基因表达数据 初始队列54例(bulk RNA-seq),验证队列122例(RT-qPCR)
600 2025-04-24
Deciphering programmed cell death mechanisms in osteosarcoma for prognostic modeling
2025-Mar, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 该研究探讨了程序性细胞死亡(PCD)基因在骨肉瘤(OS)中的作用,并利用先进的生物信息学方法开发了一个预后模型 通过单细胞测序数据和大样本测序数据结合,识别了PCD相关基因的表达和通路评分,并开发了一个基于五个关键基因的预后模型 研究依赖于公开数据库的数据,可能受到数据质量和样本量的限制 研究PCD基因在骨肉瘤中的作用并开发预后模型 骨肉瘤(OS)患者 生物信息学 骨肉瘤 单细胞测序、ssGSEA、LASSO算法 预后模型 基因表达数据 来自GEO和TARGET数据库的测序数据
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