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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-06-16
Gene-guided repurposing identifies dihydroergotamine as a candidate inhibitor of the BCL2-SIVA1 axis in advanced gastric cancer in vitro
2026-Apr-17, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过整合多组学分析与计算筛选及体外验证,识别双氢麦角胺作为晚期胃癌中BCL2-SIVA1轴的候选抑制剂 首次提出BCL2-SIVA1信号轴是晚期胃癌的潜在凋亡相关脆弱性,并利用多组学结合机器学习筛选方法发现双氢麦角胺为候选调控剂 本研究主要在体外细胞系中进行验证,缺乏体内动物模型数据,且临床转化可行性尚需进一步研究 探索BCL2-SIVA1轴在晚期胃癌中的作用,并识别潜在药物靶点 晚期胃癌细胞系NCI-N87和HGC-27 机器学习 胃癌 转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 2D-QSAR机器学习 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
42 2026-06-16
Exploring and experimental validation of SLC7A11 and ferroptosis related prognostic genes in non-small cell lung cancer using bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 利用批量RNA测序和单细胞RNA测序探索并实验验证非小细胞肺癌中SLC7A11和铁死亡相关预后基因 本研究首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析SLC7A11与铁死亡相关基因在非小细胞肺癌中的表达及预后价值,并鉴定出5个关键预后基因(SLC2A1、TRIB3、HNF4A、NOS2、FLT3) 预后基因的临床验证仅基于RT-qPCR,样本量较小,且未进行外部独立队列验证 探索非小细胞肺癌中SLC7A11和铁死亡相关预后基因及其机制 非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR 预后模型 基因表达数据 未在标题和摘要中明确说明样本数量 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
43 2026-06-16
Demethylation-primed tandem CD19/CD20 CAR T cells in relapsed/refractory B-cell lymphoma: a phase I/II trial
2026-Apr-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 一项评估地西他滨预处理的CD19/CD20双靶点CAR T细胞治疗复发/难治性B细胞淋巴瘤的I/II期临床试验 首次在临床试验中验证地西他滨预处理可增强CAR T细胞的持久性和有效性,并通过单细胞测序揭示其表观遗传重编程机制 未提及 评估地西他滨预处理的CD19/CD20双靶点CAR T细胞的安全性和有效性 23名复发或难治性非霍奇金淋巴瘤患者 机器学习 B细胞淋巴瘤 CAR T细胞疗法、单细胞测序 NA 单细胞数据 23名患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
44 2026-06-16
Spatial transcriptomics reveals a molecular tumor budding signature in head and neck cancer
2026-Apr-15, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示头颈癌中分子肿瘤出芽特征 首次通过全转录组空间转录组学在HPV阴性头颈鳞状细胞癌中开发并验证了一个28基因的肿瘤出芽特征(TBS),该特征能够区分肿瘤出芽与其他组织类型,并关联预后和药物反应 未明确说明,但可能包括样本量有限、仅针对HPV阴性HNSCC、以及需要进一步验证的临床转化潜力 阐明头颈鳞状细胞癌中肿瘤出芽的分子机制,并开发可量化的分子标志物 HPV阴性头颈鳞状细胞癌的组织切片、肿瘤出芽、肿瘤主体、基质以及3D侵袭模型 数字病理学 头颈癌 空间转录组学、批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA 转录组数据 HPV阴性HNSCC组织切片中的多个兴趣区域,包括肿瘤出芽、肿瘤主体和基质;此外,使用TCGA-HNSC数据集(批量RNA-seq)、单细胞RNA-seq数据集和独立空间转录组数据集进行验证 NA 空间转录组学、批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-06-16
Single-cell and spatial transcriptome analysis of breast cancer tumor-associated fibroblast heterogeneity and its mediated remodeling of the tumor microenvironment
2026-Apr-15, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析,解析乳腺癌中肿瘤相关成纤维细胞的异质性及其对肿瘤微环境的重塑作用 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学系统绘制了乳腺癌中六种成纤维细胞亚型的空间分布图谱,并揭示了基质成纤维细胞与恶性上皮细胞通过MDK-NCL和MIF-(CD74+CD44)配体-受体轴的特异性相互作用 未明确说明研究局限性,但可能包括样本量有限(24例)以及尚未在独立队列中验证预后特征的普适性 解析乳腺癌中肿瘤相关成纤维细胞的异质性及其介导的肿瘤微环境重塑机制 乳腺癌组织中的肿瘤相关成纤维细胞及其他八种主要细胞类型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 CellChat、Seurat、Monocle2 基因表达数据、空间表达数据 24例乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
46 2026-06-16
ZNF750 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by maintaining epithelial barrier-driven mucosal immune homeostasis
2026-Apr-14, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多平台整合分析(包括bulk转录组学和单细胞RNA测序),揭示了ZNF750通过维持上皮屏障驱动的黏膜免疫稳态抑制食管鳞状细胞癌的机制 首次阐明ZNF750在食管鳞状细胞癌中通过维持上皮屏障完整性调控黏膜免疫微环境,特别是通过调控抗菌肽DEFB4A和中性粒细胞募集发挥抑癌作用 未提及具体局限性 探索ZNF750在食管鳞状细胞癌中调控黏膜免疫微环境的肿瘤抑制机制 食管鳞状细胞癌组织样本及多平台转录组数据 计算生物学 食管鳞状细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多平台数据集(TCGA, GTEx, GEO)及临床样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-06-16
Identification of senescence-related genes as diagnostic biomarkers for gastric cancer using bioinformatics and machine learning
2026-Apr-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和批量转录组学,利用生物信息学和机器学习识别与衰老相关的胃癌基因作为诊断生物标志物 首次将单细胞RNA测序与批量转录组学相结合,利用机器学习和WGCNA方法识别衰老相关胃癌基因,并开发RF-XGBoost集成模型和Shiny应用用于临床风险分层 未在大型独立队列中验证,且缺乏对PNPT1功能性机制的深入探讨 识别衰老相关基因作为胃癌诊断生物标志物并开发预测模型 胃癌细胞和衰老相关基因 机器学习 胃癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 RF-XGBoost集成模型 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 未明确说明样本量 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
48 2026-06-16
A colon mimetic screening approach reveals Lactobacillus fermentum as a microbiome-based therapy for COPD
2026-Apr-14, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
research paper 通过结肠模拟筛选平台发现发酵乳杆菌作为基于微生物组的慢性阻塞性肺疾病疗法 利用结肠模拟个性化药物meta分析筛选平台,从重度COPD患者粪便样本中鉴定出具有治疗潜力的发酵乳杆菌菌株 仅进行了临床前小鼠模型研究,缺乏临床试验数据验证 探究发酵乳杆菌对COPD的治疗作用及机制 烟熏诱导的COPD小鼠模型 machine learning chronic obstructive pulmonary disease RNA-seq, single-cell transcriptomics NA gene expression data, sequencing data 烟熏小鼠样本(具体数量未在摘要中说明) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
49 2026-06-16
Novel genetic insights into causal effects of potential metformin targets and immune mediation on sepsis
2026-Apr-14, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 本文通过孟德尔随机化、单细胞RNA-seq和脓毒症小鼠模型,探究二甲双胍对脓毒症的因果效应及免疫介导作用 首次整合孟德尔随机化与单细胞RNA-seq及动物实验,揭示PRKAB1激活及特定免疫细胞亚群在二甲双胍降低脓毒症风险中的中介作用 NA 研究二甲双胍对脓毒症的因果效应及免疫功能在其中的中介作用 二甲双胍靶标(PRKAB1)、脓毒症风险、免疫细胞亚群(如CD39+CD4+T细胞、CD14+CD16+单核细胞等) 机器学习 脓毒症 孟德尔随机化分析、单细胞RNA-seq、小鼠模型、多重免疫组化 NA 基因组数据、单细胞转录组数据、组织图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-06-16
SpaPheno: linking spatial transcriptomics to clinical phenotypes with interpretable machine learning
2026-Apr-13, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 提出一种可解释机器学习框架SpaPheno,整合空间转录组数据与临床注释的批量RNA-seq数据,以识别预测患者预后(生存、肿瘤分期、免疫治疗反应)的空间分辨生物标志物 首次实现从组织区域到细胞类型及单个空间点的多尺度可解释性分析,将空间转录组数据直接关联临床表型 未提及具体限制(根据摘要信息输出NA) 开发将空间转录组数据转化为临床可应用知识的通用策略,推动空间精准肿瘤学发展 多种癌症队列(原发性肝癌、透明细胞肾细胞癌、乳腺癌和黑色素瘤) 计算机视觉,机器学习 肝癌,肾癌,乳腺癌,黑色素瘤 空间转录组学,RNA-seq 可解释机器学习模型 空间转录组数据,批量RNA-seq数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
51 2026-06-16
Unraveling RELA as a potential dioctyl terephthalate-related target regulates M2-like macrophages to induce an immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer: a multi-omics data study by experimental validation
2026-Apr-12, Molecular diversity IF:3.9Q2
研究论文 通过多组学数据分析和实验验证,揭示DOTP通过RELA调控M2样巨噬细胞诱导结直肠癌免疫抑制微环境 首次将塑化剂DOTP与结直肠癌免疫微环境重塑关联,通过多数据库分析、分子对接、机器学习模型筛选及实验验证,锁定RELA作为关键靶点,并利用单细胞RNA测序明确其在M2样巨噬细胞中的表达模式 该研究主要基于细胞系和公共数据库分析,缺乏体内动物模型验证以及临床样本的更大规模验证,DOTP暴露对患者预后的直接因果影响尚未明确 探索DOTP在结直肠癌微环境重塑中的分子靶点和潜在机制 结直肠癌细胞系SW620和LS513以及THP-1巨噬细胞 多组学数据整合分析 结直肠癌 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 分子动力学模拟, 机器学习, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个公共数据库数据(具体数量未提及),以及SW620、LS513和THP-1细胞系样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-06-16
Bioinformatic validation of LCN2 as a common hub gene for ferroptosis, pyroptosis and necroptosis in ulcerative colitis
2026-Apr-11, BMC gastroenterology IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学方法验证了LCN2作为溃疡性结肠炎中铁死亡、焦亡和坏死性凋亡的共同枢纽基因 首次识别并验证了LCN2作为溃疡性结肠炎中三种细胞死亡形式(铁死亡、焦亡和坏死性凋亡)的共同枢纽基因,为UC发病机制提供了新见解 研究主要基于公共数据库数据分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的直接验证 识别与溃疡性结肠炎中铁死亡、焦亡和坏死性凋亡相关的潜在枢纽基因 溃疡性结肠炎患者结肠组织样本及DSS诱导结肠炎小鼠模型 生物信息学 溃疡性结肠炎 基因表达分析、WGCNA、单细胞测序分析、qRT-PCR、免疫组化染色 WGCNA 基因表达数据和单细胞测序数据 GSE75214数据集中的结肠样本,以及额外GEO数据集和DSS结肠炎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
53 2026-06-16
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the evolution and regulatory features of specialized endothelial cell subsets in non-traumatic osteonecrosis of the femoral head
2026-Apr-10, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示非创伤性股骨头坏死中特化内皮细胞亚群的演变和调控特征 首次通过单细胞RNA测序鉴定出非创伤性股骨头坏死中四种内皮细胞亚群(L型、H型、R型和动脉内皮细胞),并揭示PDK4作为H型和R型内皮细胞丰度的关键调控因子,通过促进脂肪酸氧化和铁稳态参与血管生成 未明确说明局限性 阐明非创伤性股骨头坏死微环境中特化内皮细胞的组成及其调控机制 非创伤性股骨头坏死患者股骨头中的内皮细胞和基质细胞 数字病理学 非创伤性股骨头坏死 单细胞RNA测序、外周血转录组分析、体外实验、代谢组学验证 NA RNA测序数据(单细胞和外周血) 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2026-06-16
​​Integrating machine learning and spatial transcriptomics uncovers shared immunomodulatory deubiquitinases in MAFLD and HCC
2026-Apr-10, Human genetics IF:3.8Q2
研究论文 结合机器学习和空间转录组学揭示MAFLD与HCC中共有的免疫调节去泛素化酶 首次识别MAFLD与HCC间共享的去泛素化酶(DUB)基因EIF3F,并构建新型去泛素化评分(DUBS)系统,该评分能有效分层患者预后并预测免疫治疗响应 未提及具体限制,但可能包括体外和体内实验的临床转化局限性及评分系统的验证范围 识别MAFLD与HCC之间的共享机制,筛选关键DUB基因并构建预后评分系统 代谢功能障碍相关脂肪肝病(MAFLD)和肝细胞癌(HCC)患者数据及HCC细胞系 机器学习, 数字病理学 肝细胞癌, 代谢功能障碍相关脂肪肝病 空间转录组学, RNA-seq, 体外实验, 体内实验 NA 空间转录组数据, 转录组数据 未明确说明,但基于公共数据和体外/体内实验样本 NA 空间转录组学 NA NA
55 2026-06-16
Cellular heterogeneity in hypertrophic burn scars in response to carbon dioxide laser therapy
2026-Apr-10, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究二氧化碳激光疗法对肥厚性烧伤疤痕中细胞异质性的影响 首次通过单细胞RNA测序揭示二氧化碳激光疗法对肥厚性烧伤疤痕中不同成纤维细胞亚群的作用机制,发现再生性成纤维细胞与良好治疗反应相关 样本量有限,且仅关注疤痕形成时间差异,未涉及其他可能影响治疗效果的临床因素 探究二氧化碳激光疗法减少肥厚性疤痕的细胞机制 烧伤幸存者肥厚性疤痕皮肤活检样本 数字病理学 烧伤疤痕 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 烧伤幸存者,根据治疗反应分组(良好反应组和差反应组) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
56 2026-06-16
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to reveal the spatiotemporal dynamics of retinal cells during ischemia-reperfusion injury progression in rats
2026-Apr-09, Cell & bioscience
研究论文 整合单细胞和空间转录组学技术,揭示大鼠视网膜缺血再灌注损伤过程中细胞的时空动态变化 首次构建了视网膜缺血再灌注损伤进展的全景时空动态图谱,揭示了细胞间配体-受体相互作用及转录因子调控机制,并发现阿尔茨海默症相关基因Mapt在视网膜神经节细胞中的时空特异性表达 未提及具体的局限性 阐明视网膜缺血再灌注损伤过程中细胞的时空动态和细胞间相互作用 大鼠视网膜缺血再灌注损伤模型的急性、亚急性和慢性阶段 数字病理学 青光眼, 视网膜相关疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据 大鼠视网膜组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3', Illumina NovaSeq测序平台用于空间转录组学
57 2026-06-16
PARP7 alleviates lipopolysaccharide-induced acute kidney injury by inhibiting TBK1-driven inflammation in renal tubular epithelial cells
2026-Apr-09, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 研究发现PARP7通过抑制TBK1驱动的炎症反应,在脂多糖诱导的急性肾损伤中发挥保护作用 首次证实PARP7在脓毒症急性肾损伤中表达上调,并揭示其通过单ADP-核糖基化依赖方式与TBK1相互作用发挥抗炎作用的新机制 未说明具体限制 研究PARP7在脓毒症急性肾损伤中的作用及其机制 小鼠肾近端小管上皮细胞 机器学习 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型(包含PARP7敲除和过表达小鼠) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
58 2026-06-16
CSTA and DDX24: potential biomarkers regulating ferroptosis in sepsis and their diagnostic value
2026-Apr-09, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 通过多组学分析和体外实验,鉴定CSTA和DDX24为脓毒症中调节铁死亡的关键基因,并评估其诊断价值 首次结合多种转录组数据集、单细胞RNA测序数据和三种机器学习方法筛选脓毒症中铁死亡核心基因,并验证CSTA和DDX24对铁死亡相关蛋白的调控作用 未在临床样本中验证基因表达与铁死亡的直接因果关系,且体外实验可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究脓毒症中铁死亡的分子调控机制并筛选潜在生物标志物 脓毒症患者和健康对照的转录组数据及细胞模型 机器学习和数字病理学 脓毒症 RNA-seq和单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析和三种机器学习方法 转录组数据和单细胞RNA测序数据 多组转录组数据集,具体样本量未在摘要中说明 未提及 单细胞RNA测序和批量RNA测序 未提及 未提及
59 2026-06-16
PLIN3 overexpression in lung adenocarcinoma promotes M2 macrophage-myofibroblast transition in the tumor microenvironment
2026-Apr-07, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了肺腺癌中PLIN3过表达通过肿瘤-巨噬细胞互作促进M2巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)的机制 首次发现肿瘤细胞源性PLIN3通过TGF-β1信号驱动M2巨噬细胞向肌成纤维细胞转化,并构建基于MMT相关基因的预后风险模型 未明确PLIN3调控MMT的详细分子通路,且研究仅基于公开数据集及体外实验验证 探究肺腺癌细胞是否主动驱动肿瘤相关巨噬细胞的MMT过程及其分子调控机制 肺腺癌细胞及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 机器学习, 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 双免疫荧光, 体外实验 Cox回归, 机器学习模型(如SHAP分析) 基因表达数据, 图像数据 整合多个LUAD scRNA-seq及批量转录组公共数据集,未明确具体样本数 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
60 2026-06-16
A CREM-ITGA2B-MAPK axis drives proliferation and invasiveness in gastric cancer: insights from single-cell analysis
2026-Apr-07, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了cAMP反应元件调节因子CREM通过调控ITGA2B和MAPK信号通路驱动胃癌增殖和侵袭的机制 首次在单细胞水平发现CREM是胃癌进展的关键分子驱动因子,并阐明其通过ITGA2B-MAPK轴发挥作用的机制 样本量较小(仅来自12名患者),需要更大规模队列验证;结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 阐明胃癌肿瘤微环境中恶性上皮细胞及细胞间通讯的异质性机制,寻找潜在治疗靶点 12例胃癌患者的19个新鲜样本(包括原发肿瘤、淋巴结和网膜转移) 生物信息学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 12例患者的19个新鲜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行scRNA-seq分析
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