单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 32106 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-11-04
Deciphering the role of RGS1-overexpressing CD8+T cells in immune evasion of bone metastatic cancer in the urinary system via single-cell sequencing analysis
2025-Oct-30, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞测序分析揭示RGS1过表达的CD8+T细胞在泌尿系统骨转移癌免疫逃逸中的作用机制 首次阐明RGS1在骨转移癌免疫微环境中对CD8+T细胞功能的调控作用,并建立了前列腺癌骨转移小鼠模型进行验证 样本量相对有限(8例肾细胞癌和9例前列腺癌患者),需要更大规模研究验证 阐明RGS1在肿瘤骨转移免疫微环境中的调控作用及CD8+T细胞功能 肾细胞癌和前列腺癌患者的骨转移病灶组织及小鼠前列腺癌骨转移模型 单细胞测序分析 肾细胞癌,前列腺癌 单细胞RNA测序 小鼠骨转移模型 单细胞RNA测序数据 8例肾细胞癌患者和9例前列腺癌患者的骨转移病灶,共215,864个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
42 2025-11-04
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Oct-30, Pathology, research and practice
综述 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 全面探讨了NGS在临床基因组学中的多领域应用,并强调了云计算平台和多组学数据整合的未来发展方向 作为综述文章,未涉及原始实验数据或具体案例研究 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 新一代测序技术及其在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗中的应用 生物信息学 癌症、罕见病 NGS, 单细胞测序 NA DNA测序数据, RNA测序数据 NA NA 新一代测序, 单细胞测序 NA NA
43 2025-11-04
Advancements in Personalized Medicine for Leukemia: Integrating Genetic, Transcriptomic, and Artificial Intelligence Insights
2025-Oct-29, Current pharmaceutical design IF:2.6Q2
综述 探讨遗传学、转录组学和人工智能在白血病精准医疗中的整合应用与进展 整合多组学数据与人工智能算法推动白血病个性化治疗策略的优化 存在克隆进化、遗传异质性和治疗耐药性等挑战 推进白血病精准医疗发展 白血病患者 自然语言处理 白血病 RNA测序, 单细胞RNA测序 机器学习, 深度学习 基因组数据, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2025-11-04
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2025-Oct-28, Asian journal of andrology IF:3.0Q1
研究论文 评估II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 首次通过临床试验和动物实验证实II型5α-还原酶抑制剂能促进TURP术后伤口修复,并揭示其通过减轻纤维化和炎症的作用机制 样本量相对有限(87例患者,12只比格犬),随访时间较短(6个月) 研究II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 BPH患者和比格犬动物模型 医学研究 前列腺增生 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 NA 临床数据,分子标记数据,组织学数据 87例BPH患者(47例治疗组,42例安慰剂组),12只比格犬 NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2025-11-04
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态及IFNγ信号的关键作用 开发MetTag单细胞追踪技术,首次发现早期播散克隆具有IFNγ依赖的转移适应机制 研究主要聚焦腹膜转移模型,其他转移器官的普适性需进一步验证 解析肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态和分子决定因素 播散性肿瘤细胞(DTCs)和转移微环境 单细胞组学 癌症转移 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9筛选,RNA速度分析 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 腹水和转移灶组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
46 2025-11-04
Isolation of mitochondrial mutation-specific T cell receptors
2025-Oct-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究首次成功分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性T细胞受体 首次报道从健康供体中分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性TCRs,证明了线粒体突变也能产生可被T细胞识别的新抗原 研究中存在一些生物学障碍需要考虑,且仅针对HLA-A*0201等位基因进行了筛选 探索肿瘤线粒体DNA突变是否能够产生被T细胞受体识别的新抗原 肿瘤线粒体DNA非同义突变及其对应的T细胞受体 免疫学 癌症 单细胞测序,表位预测算法,TCR筛选验证 NA 基因组数据,蛋白质序列数据 10名HLA-A*0201纯合子健康供体,38种肿瘤类型的3,798个非同义单核苷酸突变 NA 单细胞测序 NA NA
47 2025-11-04
Single-Cell Transcriptomics Shows Cellular Heterogeneity, Intercellular Communication, and Extracellular Matrix Remodeling in Corneal Fibrosis In Vivo
2025-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术揭示兔角膜纤维化过程中细胞异质性、细胞间通讯和细胞外基质重塑的动态变化 首次在体内建立角膜纤维化的整合转录组框架,识别四种基质细胞亚群及其双向分化轨迹 研究仅使用新西兰白兔模型,未验证人类样本 表征角膜纤维化过程中的细胞异质性和细胞外基质重塑机制 新西兰白兔的正常和碱损伤纤维化角膜 单细胞组学 角膜纤维化 单细胞RNA测序 无监督聚类、轨迹推断、CellChat分析 单细胞转录组数据 新西兰白兔角膜样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2025-11-04
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种用于评估空间转录组学数据聚类性能的计算框架STEAM 开发了首个专门针对空间转录组学数据聚类性能评估的计算流程,结合机器学习分类预测方法,支持多样本训练和跨重复样本的聚类一致性评估 缺乏真实标签数据仍然是验证聚类一致性和可重复性的挑战 解决空间转录组学数据聚类性能评估的标准化问题 空间转录组学和空间蛋白质组学数据 生物信息学 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 机器学习分类和预测方法 空间组学数据 多个公共数据集,涵盖多细胞到单细胞分辨率,正常和病变组织 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
49 2025-11-04
Integration of phospho-signaling and transcriptomics in single cells reveals distinct Th17 cell fates
2025-Aug-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 开发了一种名为Vivo-seq的创新平台,可在单细胞水平同时捕获转录组和磷酸化信号状态 开发了Vivo-seq平台,首次实现单细胞水平转录组与磷酸化信号状态的同步捕获 NA 研究Th17细胞分化过程中的信号转导和功能可塑性机制 T辅助17细胞 单细胞多组学 NA 单细胞RNA测序,细胞内转录组和表位索引测序 NA 单细胞转录组数据,磷酸化信号数据 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞多组学 Vivo-seq 使用低共熔溶剂固定细胞的单细胞转录组和表位索引测序平台
50 2025-11-04
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞转录组学解码毒理学中的细胞应激状态 应用TempO-LINC平台系统分析多种化学物质诱导的细胞应激反应,揭示了细胞应激状态的异质性和动态转变 仅使用HepaRG细胞系,未涉及其他细胞类型或体内模型 解码毒理学中细胞应激状态及其动态转变 约40,000个暴露于七种不同化学物质的HepaRG细胞 单细胞组学 毒理学 单细胞转录组测序 基于广义Jaccard度量的聚类分析 单细胞转录组数据 约40,000个HepaRG细胞 NA 单细胞RNA-seq TempO-LINC平台 TempO-LINC单细胞转录组平台
51 2025-11-04
Atlas-scale metabolic activities inferred from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一个名为scCellFie的计算框架,用于从单细胞和空间转录组数据推断代谢活动 提出了首个能够从转录组数据系统推断代谢活动的计算框架,并应用于约3000万个细胞图谱分析 基于转录组数据间接推断代谢活动,而非直接测量代谢物 开发计算工具从转录组数据推断细胞代谢功能 人类和小鼠的单细胞及空间转录组数据 生物信息学 子宫内膜异位症,子宫内膜癌 单细胞RNA-seq,空间转录组学 计算框架 转录组数据 约3000万个细胞图谱 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
52 2025-11-04
Inhibition of DKK-1 by WAY262611 Inhibits Osteosarcoma Metastasis
2025-May-02, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过小分子抑制剂WAY262611抑制DKK-1,证实其可激活经典Wnt信号通路并抑制骨肉瘤转移 首次证明小分子DKK-1抑制剂WAY262611在体内外均能抑制骨肉瘤转移并诱导成骨分化 未提及临床转化潜力及潜在毒副作用 验证DKK-1作为骨肉瘤治疗靶点的可行性 骨肉瘤细胞系和患者来源的骨肉瘤异种移植模型 肿瘤学研究 骨肉瘤 单细胞RNA测序,原位移植/截肢模型 NA 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
53 2025-11-04
A 3D Self-Assembly Platform Integrating Decellularized Matrix Recapitulates In Vivo Tumor Phenotypes and Heterogeneity
2025-May-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 开发了一种无水凝胶自组装平台MatriSpheres,用于建立富含细胞外基质的3D肿瘤模型 使用脱细胞小肠粘膜下层ECM构建水凝胶自由的3D自组装平台,能够更好地模拟体内肿瘤表型和异质性 NA 研究肿瘤微环境中细胞外基质对肿瘤生物学的影响 小鼠和人类结直肠癌细胞 组织工程 结直肠癌 单细胞RNA测序 3D细胞培养模型 转录组数据、蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2025-11-04
Spatial Transcriptomics of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Reveals Divergent Indolent and Malignant States
2025-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析导管内乳头状黏液性肿瘤,揭示了惰性和恶性状态的不同转录组特征 首次在IPMN中发现三种不同的上皮转录组状态,并将其与胰腺导管腺癌的分子亚型相关联 样本量较小(10个标本),需要更大规模研究验证 探索IPMN的转录组特征以改进风险分层 导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)标本 数字病理学 胰腺癌 数字空间RNA分析(DSP-RNA), 全转录组分析 NA 空间转录组数据, 基因表达数据 10个IPMN标本 NA 空间转录组学 NA 数字空间RNA分析(DSP-RNA)
55 2025-11-04
Immune checkpoint TIM-3 regulates microglia and Alzheimer's disease
2025-May, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了免疫检查点分子TIM-3通过TGFβ信号通路维持小胶质细胞稳态,并探索其在阿尔茨海默病中的治疗潜力 首次发现TIM-3通过其羧基末端与SMAD2和TGFBR2相互作用,增强TGFβ信号传导,从而维持小胶质细胞稳态 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究TIM-3在小胶质细胞中的具体功能及其在阿尔茨海默病中的作用机制 小鼠小胶质细胞和5×FAD转基因阿尔茨海默病模型小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 单核RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 转基因小鼠模型 NA 单核RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
56 2025-11-04
Construction of a prognostic prediction model for concurrent radiotherapy in cervical cancer using GEO and TCGA databases with preliminary validation analysis
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 利用GEO和TCGA数据库构建宫颈癌同步放疗预后预测模型并进行初步验证分析 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出MPP5、SNX7、LSM12和GALNT3四个与放疗敏感性相关的关键基因并构建预后预测模型 研究样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 开发宫颈癌同步放疗的预后预测模型,识别可靠的预后标志物 宫颈癌患者和相关的基因表达数据 生物信息学 宫颈癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 Cox回归模型 基因表达数据, 临床数据 144例宫颈癌样本(来自TCGA数据库)和两个GEO数据集(GSE236738和GSE56363) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
57 2025-11-04
In-Silico discovery of Pediatric Acute-Myeloid-Leukemia (pAML) causing druggable molecular signatures highlighting their pathogenetic processes and therapeutic agents through single-cell RNA-Seq profile analysis
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析发现儿童急性髓系白血病的可靶向分子特征及其治疗药物 首次通过整合单细胞RNA测序数据识别pAML关键细胞类型和核心基因,并系统筛选潜在治疗药物 研究基于计算模拟和体外数据分析,需要进一步实验验证 发现儿童急性髓系白血病的致病分子特征和替代治疗药物 儿童急性髓系白血病患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 生物信息学 白血病 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 PPI网络分析,调控网络分析,GSEA分析 单细胞RNA测序数据 两个数据集(GSE154109和GSE235923) NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2025-11-04
Integrating single-cell transcriptomics and whole-genome CRISPR CAS9 screen identifies a cell cluster associated with tumor dependency in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和全基因组CRISPR筛选,识别出与三阴性乳腺癌肿瘤依赖性相关的细胞亚群 首次将单细胞转录组学与全基因组CRISPR筛选相结合,识别出与TNBC肿瘤依赖性相关的特异性细胞亚群及其生物标志物 研究主要基于公共数据库分析,实验验证仅限于体外细胞功能验证 识别三阴性乳腺癌的肿瘤依赖性基因和潜在治疗靶点 三阴性乳腺癌细胞和患者数据 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序,全基因组CRISPR CAS9筛选,基因组测序 NA 基因表达数据,单细胞数据,基因组数据 多个公共数据库(TCGA-BRCA,METABRIC,DEPMAP)的样本 NA 单细胞RNA-seq,全基因组筛选 NA NA
59 2025-11-04
Amelioration of intervertebral disc degeneration using engineered extracellular vesicle-delivered ZDHHC5 via inhibiting PANoptosis
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过工程化细胞外囊泡递送ZDHHC5抑制PANoptosis来改善椎间盘退变 首次发现PANoptosis是椎间盘退变的关键机制,并揭示PTH预处理的细胞外囊泡通过ZDHHC5/YBX1/ZBP1轴抑制PANoptosis的新机制 细胞外囊泡产量有限且作用机制尚未完全明确 开发基于细胞外囊泡的无细胞治疗策略治疗椎间盘退变 人脐带间充质干细胞来源的细胞外囊泡及椎间盘退变机制 细胞治疗 椎间盘退变 单细胞RNA测序,转录组分析 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
60 2025-11-04
Enhanced ICOS Signaling Between Dendritic Cells and T Cells Characterizes the Immune Landscape of Human Cholangiocarcinoma
2025, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示胆管癌肿瘤微环境中树突状细胞与T细胞间增强的ICOS信号传导特征 首次在胆管癌中发现树突状细胞与T细胞间增强的ICOS信号传导,并验证其功能重要性 NA 探究胆管癌肿瘤微环境中的细胞间通讯网络和免疫调控机制 人类胆管癌组织样本 单细胞组学 胆管癌 单细胞RNA测序 CellChat分析 单细胞转录组数据 两个独立单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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