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当前共找到 38358 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-15 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种名为cosmoDA的新型差异丰度测试方案，用于处理具有相关特征的组成型高通量测序数据 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息，并结合广义得分匹配估计框架，显著降低了相关特征导致的假阳性检测 | 未明确说明模型对极端稀疏数据或大规模特征交互的适用性限制 | 开发能够准确估计群体异质性下特征交互并降低假发现率的差异丰度测试方法 | 稀疏组成型计数数据，特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序，单细胞RNA-seq，扩增子测序 | a-b幂交互模型，广义得分匹配估计 | 组成型计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-04-15 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-11, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
|
研究论文 | 本研究通过大规模测序数据和CRISPRi实验，揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中广泛存在的转座子失调及其与神经炎症的关联 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统表征了转座子表达数量性状位点，并通过CRISPRi实验验证了特定转座子对C1QTNF4基因表达的神经元特异性抑制作用 | 研究主要基于三个脑库的数据，样本代表性可能有限，且CRISPRi实验仅在iPSC衍生神经元中进行，未涵盖其他脑细胞类型 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座子失调的遗传调控机制及其在疾病中的作用 | 人类阿尔茨海默病患者的衰老脑组织样本及iPSC衍生神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序、全基因组测序、CRISPR干扰 | 数量性状位点分析 | 基因组数据、转录组数据 | 基于三个人类AD脑库的大规模样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-04-15 |
A scalable approach to topic modelling in single-cell data by approximate pseudobulk projection
2024-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402713
PMID:39107066
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研究论文 | 本文提出了一种名为ASAP的可扩展近似方法，用于单细胞RNA-seq数据中的主题建模，通过近似伪批量投影提高计算效率 | ASAP方法在单细胞RNA-seq数据分析中实现了比现有方法更准确且计算时间和内存消耗大幅降低的可扩展近似主题建模 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种可扩展的近似方法，用于单细胞数据中的主题建模，以降低计算资源需求 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-04-15 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 本研究通过抑制TRPC3通道，改善了阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 | 首次发现TRPC3在AD患者和模型中的上调，并鉴定出抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 | 研究主要基于动物和细胞模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | AD患者脑组织、AD小鼠模型（急性和慢性）以及培养的大鼠海马神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、RNA-seq | NA | RNA-seq数据、细胞和动物模型数据 | AD患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据、死后AD脑组织、急性和慢性AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-15 |
Lin-CD117+CD34+FcεRI+ progenitor cells are increased in chronic spontaneous urticaria and predict clinical responsiveness to anti-IgE therapy
2024-09, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16127
PMID:38634175
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研究论文 | 本研究探讨了慢性自发性荨麻疹患者外周血中Lin-CD117+CD34+FcεRI+祖细胞的增加及其对抗IgE疗法临床反应性的预测价值 | 首次将外周血中特定的祖细胞亚群（Lin-CD34+CD117+FcεRI+）与CSU的临床表型及抗IgE治疗反应相关联，并利用单细胞RNA测序揭示了其细胞谱系组成 | 样本量相对有限（CSU患者n=55，对照组n=22），单细胞RNA测序仅在部分患者（n=8）和对照（n=4）中进行，需要更大规模的研究验证 | 探究慢性自发性荨麻疹的病理机制，并寻找预测抗IgE治疗（奥马珠单抗）临床反应性的生物标志物 | 慢性自发性荨麻疹患者（n=55，其中12人接受奥马珠单抗治疗）和健康对照（n=22）的外周血样本 | 免疫学，皮肤病学 | 慢性自发性荨麻疹 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞转录组数据 | CSU患者55例（其中12例接受奥马珠单抗），健康对照22例；scRNA-Seq子集：CSU患者8例，健康对照4例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-04-15 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-06, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
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综述 | 本文回顾了肝类器官作为研究工具的发展历程，并探讨了其在肝脏基础研究、药物发现与安全性测试以及疾病病理生物学理解三个领域的贡献 | 系统性地阐述了肝类器官从“青春期”向“成熟期”发展的关键路径，并前瞻性地指出了未来五年内单细胞RNA测序、CRISPR技术与类器官方法学改进相结合将带来的突破 | 未提供具体的实验数据或案例研究，主要基于现有文献和发展趋势进行评述 | 评估肝类器官作为研究工具的当前应用与未来潜力，推动其在肝脏疾病研究和治疗中的应用 | 肝类器官及其在肝脏研究中的应用 | 组织工程与疾病模型 | 肝脏疾病（包括肝纤维化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR技术、类器官培养技术 | 类器官模型 | 综述性文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-04-15 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-02, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
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研究论文 | 本研究通过分析NAFLD患者的单细胞RNA测序数据、肝组织样本和LX-2细胞，揭示了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的高表达及其通过TGFβ通路调控纤维化的机制 | 首次在NAFLD中通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，明确了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的特异性高表达，并发现其通过非经典TGFβ-SMAD2/3通路调控胶原生成 | 研究主要基于体外细胞模型（LX-2细胞）和基因数据集分析，缺乏体内实验验证；样本量未明确说明，可能影响结果的普适性 | 识别NAFLD中表达THBS2/TSP2的特定细胞，并探究其上调的分子机制 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者肝组织、肝星状细胞（HSCs）及LX-2细胞系 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量聚合酶链反应（qPCR）、原位杂交、计算生物学、遗传学、免疫学和药理学方法 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-04-14 |
A multi-scale biocompatibility atlas of porous silicon nanoparticles: From whole embryo to single-cell resolution
2026-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究建立了一个多尺度评估流程，利用斑马鱼模型结合整体表型分析和单细胞RNA测序，系统评估了多孔硅纳米颗粒的生物相容性 | 首次将整体生物体表型分析与单细胞转录组测序相结合，构建了从胚胎到单细胞分辨率的多尺度生物相容性图谱 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型，其结果向更复杂哺乳动物系统的外推仍需进一步验证 | 评估多孔硅纳米颗粒的生物安全性和生物相容性，为其临床转化提供依据 | 多孔硅纳米颗粒 | 纳米医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-04-14 |
Multi-layer molecular profiling defines an immune-active colorectal cancer subtype with therapeutic relevance
2026-Jun-16, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102907
PMID:41971068
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据定义了结直肠癌的免疫活性亚型，并开发了预后模型和联合治疗策略 | 建立了整合转录组、表观遗传和突变谱的多组学框架，识别出具有免疫活性的CS3亚型，该亚型在临床微卫星稳定肿瘤中可能被常规检测忽略 | 未明确说明样本的具体来源和验证队列的规模，临床转化仍需进一步验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2026-04-14 |
Subtypes estimation in single-cell multi-omics data via S-multi-SNE
2026-Jun-07, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2026.112442
PMID:41895518
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研究论文 | 本文提出S-multi-SNE方法，用于单细胞多组学数据的细胞亚型估计和可视化 | 将多视图降维方法multi-SNE和S-multi-SNE应用于单细胞RNA测序数据，并展示其在跨个体、跨物种和跨测序技术数据中识别细胞亚型的有效性，同时整合scATAC-seq和scRNA-seq数据以改进细胞亚型识别 | NA | 开发用于单细胞多组学数据细胞亚型估计和可视化的多视图降维方法 | 单细胞RNA测序数据和单细胞多组学数据（包括scATAC-seq和scRNA-seq） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | S-multi-SNE，multi-SNE | mRNA计数矩阵，多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-04-14 |
Identifying Potential Drug Targets in the Knee Osteoarthritis: Insights from the Druggable Genome
2026-Jun, Rejuvenation research
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15491684251403435
PMID:41457786
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研究论文 | 本研究通过整合可药基因组和孟德尔随机化分析，识别了膝骨关节炎的潜在药物靶点 | 结合了可药基因组、孟德尔随机化、单细胞MR分析、蛋白质组学验证及遗传信息空间映射框架，从外周和中枢组织角度识别并验证了多个潜在治疗靶点 | 需要未来进一步实验验证所识别靶点在膝骨关节炎中的作用机制 | 寻找膝骨关节炎的潜在药物靶点 | 膝骨关节炎（KOA） | 生物信息学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化分析、单细胞MR分析、蛋白质组学验证、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质定量性状位点数据、全基因组关联研究数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-04-14 |
A proliferative subpopulation of coelomocytes in sea cucumber is identified and characterized by single-cell RNA-seq after evisceration
2026-Jun, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111262
PMID:41796696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在海参中鉴定并表征了去内脏后体腔中一个增殖性亚群的体腔细胞 | 首次在海参中利用单细胞RNA测序技术，系统识别了体腔和水管系统中的体腔细胞亚群，并揭示了去内脏后一个增殖性亚群（簇10）的动态变化和分化能力 | 研究主要基于海参单一物种，且依赖于同源物种的细胞标记进行亚群分配，可能限制了结果的普适性 | 探究海参去内脏后体腔细胞的恢复机制，特别是增殖性亚群的鉴定和功能表征 | 海参（Apostichopus japonicus）的体腔细胞，包括体腔和水管系统中的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及海参体腔和水管系统的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-04-14 |
Single-cell sequencing reveals metabolic reprogramming and immune regulation underlie the maintenance of teleost granulomas
2026-Jun, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111287
PMID:41866100
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研究论文 | 本研究通过整合多组织转录组学、单细胞RNA测序、超微结构成像和荧光原位杂交技术，揭示了硬骨鱼肉芽肿中代谢重编程和免疫调控的维持机制 | 首次在脊椎动物模型中系统解析了肉芽肿的代谢和功能景观，发现了上皮样巨噬细胞（E-Macs）同时上调氧化磷酸化和糖酵解基因的代谢适应现象，并证实了该调控特征在斑马鱼中的进化保守性 | 研究主要基于硬骨鱼模型，在哺乳动物中的普适性仍需进一步验证；单细胞测序样本量相对有限 | 探究脊椎动物肉芽肿结构的生物能量学和维持调控机制 | 大口黑鲈（Micropterus salmoides）和诺卡氏菌（Nocardia seriolae）感染模型，以及斑马鱼比较分析 | 单细胞组学 | 慢性肉芽肿性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组织转录组学、超微结构成像、荧光原位杂交（FISH） | NA | 单细胞转录组数据、组织转录组数据、图像数据 | 多组织（头肾、脾脏、肝脏、肾脏）样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-04-14 |
SpNeigh: spatial neighborhood and differential expression analysis for high-resolution spatial transcriptomics
2026-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag039
PMID:41972009
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研究论文 | 本文介绍了SpNeigh，一个用于高分辨率空间转录组学空间邻域分析和差异表达建模的R包 | SpNeigh通过边界检测、空间邻域提取、距离加权和基于梯度的统计测试，明确建模局部组织环境，如边界、邻域或梯度 | NA | 开发一个灵活且可解释的框架，用于解析复杂组织中的空间基因表达动态 | 小鼠大脑、人类乳腺癌和人类肝脏组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 基于样条的回归模型 | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | NA |
| 55 | 2026-04-14 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-May-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
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研究论文 | 本文研究了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的机制 | 揭示了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中的新作用机制，即通过调控HIF-1α依赖性糖酵解来促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，尚未在人体临床试验中得到验证 | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化进程中的调控机制 | 巨噬细胞、DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 糖尿病肾病 | Western blotting、单细胞测序、免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞测序数据、GEO数据库数据 | 22周龄DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-04-14 |
From antigen to atlas: A multi-omics, single-cell pipeline for discovering safe and effective CAR targets in ovarian cancer
2026-May, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105249
PMID:41794160
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综述 | 本文提出了一种用于发现卵巢癌安全有效CAR靶点的多组学单细胞整合分析流程 | 提出了一个结合多组学、单细胞和空间转录组学的综合分级验证流程，并建立了三级同质性分类系统来指导CAR靶点的工程策略 | 作为一篇综述，主要提出概念框架，缺乏大规模实验数据的验证 | 开发一个用于发现和验证卵巢癌CAR-T细胞疗法安全有效靶点的综合流程 | 卵巢癌（OC）的肿瘤抗原和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学，空间转录组学，糖蛋白组学，免疫表型分析 | NA | 多组学数据，单细胞数据，空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-04-14 |
Integrated Plasma Proteomics and Functional Analyses Reveal Hepatic CDHR2 as a Potential Therapeutic Target in MASLD
2026-May, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70623
PMID:41804813
|
研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质组学与功能分析，发现肝细胞中的CDHR2是MASLD发展的新型调控因子和潜在治疗靶点 | 首次通过整合多源数据（包括孟德尔随机化分析）识别并功能验证了CDHR2在MASLD中的因果作用 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步的体内实验和临床验证 | 识别和验证与代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）相关的蛋白质治疗靶点 | MASLD患者、肝细胞（原代肝细胞、HepG2和AML12细胞系） | 生物信息学与功能基因组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 血浆蛋白质组学、孟德尔随机化分析、RNA-seq、免疫染色、基因沉默与过表达 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据、临床数据 | UK Biobank中具有影像学cT1和血浆蛋白质组数据的MASLD参与者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-04-14 |
Chronic psychological stress disrupts liver homeostasis by dysregulating oxidative phosphorylation via the PI3K/AKT/FoxO3a axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115389
PMID:41971987
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研究论文 | 本研究通过慢性束缚应激小鼠模型，揭示了慢性心理应激通过PI3K/AKT/FoxO3a轴抑制氧化磷酸化，从而破坏肝脏稳态的机制 | 首次在单细胞水平上识别FoxO3a作为关键转录因子，介导心理应激诱导的氧化磷酸化抑制，并发现FoxO3a驱动的表观遗传沉默作用 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；机制细节如FoxO3a具体靶基因有待深入探索 | 探究慢性心理应激导致慢性肝病的分子机制 | 慢性束缚应激小鼠模型中的肝细胞，特别是门静脉周围肝细胞（区域1） | 单细胞组学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化分析，电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织图像，生化指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-04-14 |
SpaHE-Infil: A spatial heterogeneity framework for decoding TME infiltration from H&E-stained slides
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115155
PMID:41971992
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研究论文 | 开发了一个名为SpaHE-Infil的多模态计算框架，通过整合空间转录组学和全切片图像，从H&E染色切片中解码肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 | 结合空间转录组学和全切片图像，利用随机森林模型提取形态、纹理和密度特征，动态校准临床样本中的免疫细胞比例偏差，实现高精度的空间细胞分布预测 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于图像质量和样本可用性 | 解码肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布，以预测免疫治疗反应和患者生存 | 肿瘤微环境中的12种核心细胞类型，包括免疫细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学，全切片图像分析 | 随机森林 | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2026-04-14 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Apr-13, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
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研究论文 | 本文研究了PEPITEM在早期、未治疗类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态及其在临床前模型中的治疗效果 | 揭示了PEPITEM通过抑制COX-2和NF-κB信号通路，改变关节内白细胞亚群组成，从而减轻关节炎严重性 | 研究主要基于临床前动物模型，尚未在人类患者中进行大规模临床试验验证 | 探究PEPITEM在免疫介导的炎症性关节炎中的调控作用及治疗潜力 | 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞，以及三种不同的炎症性关节炎动物模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、Western blot、单细胞RNA测序、多重分析 | NA | 流式细胞数据、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 临床疑似关节痛和疑似炎症性关节炎患者的外周血样本，以及三种动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |