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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-16 |
Comprehensive multi-omics analysis reveals the core role of glycerophospholipid metabolism in the influence of short-chain fatty acids on the development of sepsis
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13322-7
PMID:40783504
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研究论文 | 通过多组学分析揭示短链脂肪酸通过甘油磷脂代谢途径影响脓毒症发展的核心机制 | 首次整合代谢组学、转录组学、单细胞测序和孟德尔随机化方法，系统阐明短链脂肪酸通过调节甘油磷脂代谢影响脓毒症发展的因果机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步扩展 | 探究短链脂肪酸在脓毒症发展中的具体作用机制 | C57BL/6小鼠和人类转录组数据 | 多组学分析 | 脓毒症 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | SVM-RFE, LASSO回归 | 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | 60只C57BL/6小鼠，多个公共数据库数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-16 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2025-Jul-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03682-8
PMID:40702544
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研究论文 | 提出一种名为Decipher的深度生成模型，用于整合单细胞基因组学数据并可视化正常与异常细胞状态间的转变 | 开发首个能联合建模和可视化正常与扰动单细胞RNA-seq数据中基因表达和细胞状态的深度生成模型 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征正常到异常细胞状态的转变 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-16 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示致病性SHP2变异导致的不同表型结果 | 结合单细胞转录谱分析与蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学，系统解释致病突变如何失调信号传导 | NA | 理解SHP2结构扰动、细胞结果与人类疾病之间的联系 | 表达临床多样性SHP2变异的细胞 | 单细胞组学 | 努南综合征、癌症 | 单细胞转录组分析、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-16 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
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研究论文 | 开发基于深度神经网络的DeepScence方法，用于在单细胞和空间转录组数据中检测衰老细胞 | 提出了CoreScence衰老相关基因集，并开发了DeepScence深度学习方法，在多种数据平台上均能准确识别衰老细胞 | NA | 开发准确识别衰老细胞的方法，研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-16 |
Distinct tumor architectures and microenvironments for the initiation of breast cancer metastasis in the brain
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.015
PMID:39270646
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研究论文 | 本研究揭示了不同类型乳腺癌脑转移的独特肿瘤结构和微环境特征 | 发现TNBC和HER2+乳腺癌在脑转移过程中形成不同的肿瘤结构，并引发差异性的阿尔茨海默病相关小胶质细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类组织样本，需要更大规模临床验证 | 理解乳腺癌脑转移的早期定植机制 | 三阴性乳腺癌和HER2+乳腺癌的脑转移过程 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织样本数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-16 |
scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614685
PMID:39386549
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度学习模型scEMB，用于从大规模单细胞转录组数据中学习基因的上下文表示 | 提出创新的分箱策略整合多平台数据，同时保留基因表达层次和细胞类型特异性，在批次整合、聚类和细胞类型注释等下游任务中表现优于现有模型 | NA | 从大规模单细胞转录组数据中挖掘复杂的基因-基因关系 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞转录组数据 | 超过3000万个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-16 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-Feb-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑皮层中表达生长抑素的抑制性神经元在发育过程中的分化轨迹 | 首次发现SST+抑制性神经元在胚胎阶段就分为长程投射神经元和两种中间神经元类型，并遵循不同的发育轨迹 | 研究仅针对小鼠模型，且中间神经元的多样性可能在出生后早期继续完善 | 探究大脑皮层抑制性神经元的发育多样性和分化机制 | 小鼠大脑皮层中表达生长抑素(SST+)的抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-16 |
A Novel Prognostic Pyroptosis-Related Gene Signature Correlates to Oxidative Stress and Immune-Related Features in Gliomas
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/4256116
PMID:36778205
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研究论文 | 构建并验证了一个基于焦亡相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次将焦亡相关基因与胶质瘤预后关联，并构建了包含9个基因的预后特征 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发胶质瘤预后预测工具并探索潜在治疗靶点 | 胶质瘤患者和U87胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，LASSO-Cox回归，Kaplan-Meier分析，KEGG/GO富集分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和CGGA队列的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-16 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类与小鼠在中间神经元发育过程中共享保守的转录调控程序 | 首次在人类胚胎脑组织中系统表征神经节隆起区域的细胞多样性，并发现与啮齿类动物相似的转录调控机制 | 研究仅关注胚胎发育阶段，未涉及成年期神经元功能验证 | 探究人类GABA能神经元发育的转录调控机制及其进化保守性 | 人类胚胎脑组织中的神经节隆起区域细胞 | 神经科学 | 自闭症、精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-15 |
Exploring the Epidemiology and Molecular Mechanisms of Riboflavin Against Chronic Kidney Disease Based on Data Mining, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2025 Nov-Dec, Journal of the American Nutrition Association
IF:6.8Q1
DOI:10.1080/27697061.2025.2509900
PMID:40435123
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研究论文 | 本研究通过数据挖掘、单细胞RNA测序和分子对接探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及分子机制 | 首次结合流行病学调查、单细胞RNA测序和分子对接技术系统揭示核黄素通过调节炎症因子和信号通路预防慢性肾脏病的机制 | 研究主要基于公共数据库和回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及其分子作用机制 | 慢性肾脏病患者及核黄素作用靶点 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 数据挖掘, 逻辑回归模型, 限制性立方样条 | 逻辑回归模型, 中介分析模型 | 流行病学调查数据, 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | 美国国家健康与营养调查数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-15 |
Etiological basis for chronic pain genetic variation in brain and dorsal root ganglia cell types
2025-Jul-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.07.03.25330832
PMID:40630576
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研究论文 | 通过整合慢性疼痛GWAS数据与单细胞测序数据，揭示慢性疼痛遗传变异在脑部和背根神经节细胞类型中的病因学基础 | 首次在脑部和背根神经节中系统识别与慢性疼痛相关的特定细胞类型，并揭示其在中央和外周神经系统中的细胞类型特异性遗传结构 | 样本量相对有限（特别是背根神经节样本），主要基于相关性分析 | 阐明慢性疼痛的遗传变异在特定细胞类型中的分布和作用机制 | 人类脑组织、背根神经节、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | GWAS样本1,235,695例，背根神经节样本12例 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性分析 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-15 |
CrebA regulation of secretory capacity: Genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659381
PMID:40667345
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研究论文 | 通过DNA结合实验和单细胞RNA测序研究果蝇CrebA转录因子调控分泌能力的机制 | 结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究，首次在单细胞水平揭示CrebA调控分泌通路基因的机制 | CrebA结合基因数量远超其调控基因，功能结合的特征尚不明确；在其他果蝇胚胎组织中的作用仍需验证 | 探究CrebA转录因子调控分泌能力的分子机制及其在进化中的保守性 | 果蝇胚胎唾液腺及哺乳动物Creb3L家族转录因子 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, DNA结合测定, 表达分析, 结合位点诱变 | NA | 基因表达数据, DNA结合数据 | 野生型和CrebA缺失型果蝇胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-15 |
A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.531610
PMID:36993575
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术构建了水螅神经系统最全面的分子和空间图谱 | 首次系统鉴定水螅神经系统的八种神经元类型和十五种转录亚型，并解析其空间分布和基因调控网络 | 研究聚焦于水螅这一模式生物，结果向更复杂神经系统的推广性有待验证 | 揭示神经系统发育、稳态和再生的分子机制 | 水螅（Hydra vulgaris）神经系统 | 发育神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 轨迹推断 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-15 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享共同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞，扩展了该组织中已知祖细胞群体的范围 | 使用培养的原代细胞模型可能无法完全反映体内真实情况 | 研究白色和棕色脂肪前体细胞在培养条件下的身份特征和异质性 | 培养的原代白色和棕色脂肪前体细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 原代白色和棕色脂肪前体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-10-15 |
T cell-mediated SIV dissemination into the CNS: a single-cell transcriptomic analysis
2025-May-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6537361/v1
PMID:40386405
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD4+细胞毒性样T细胞在SIV病毒进入中枢神经系统的关键作用 | 首次在急性SIV感染期发现同时表达髓系和淋巴系基因的独特脑细胞簇，并鉴定CD4+细胞毒性样T细胞是病毒进入中枢神经系统的主要媒介 | 研究仅基于三只急性感染猕猴，样本量较小，且为动物模型研究 | 表征急性感染期间脑淋巴细胞的作用及CD4+T细胞表型在SIV传播至中枢神经系统中的功能 | 急性SIV感染的恒河猴脑部和血液细胞 | 单细胞转录组学 | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 三只急性SIV感染恒河猴的脑部和血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-15 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探究了负载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒通过介导心肌细胞铁死亡改善年龄相关性心力衰竭的作用机制 | 开发了新型抗氧化多酚纳米颗粒PN@Col，首次结合单细胞RNA测序和AUCell分析揭示STAT3在心力衰竭中的关键作用，并验证其通过减轻氧化应激和铁死亡改善心脏功能 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；样本规模有限 | 探究新型纳米颗粒治疗剂对年龄相关性心力衰竭的治疗效果及作用机制 | 心肌细胞、老年心力衰竭小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、AUCell分析、细胞实验、动物实验 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 老年心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-15 |
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643710
PMID:40166238
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研究论文 | 本研究探讨LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调节MHC-I和树突状细胞激活以增强头颈鳞癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现LSD1抑制通过激活H3K4me2与MHC-I直接相互作用的新机制，并阐明其在CXCL9-CXCR3轴介导的抗肿瘤免疫中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 阐明LSD1在头颈鳞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞癌小鼠模型、人源化小鼠模型、人类头颈鳞癌细胞系、外周血单核细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型、细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠模型、人类细胞系和TCGA数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-10-15 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.05.592608
PMID:38766132
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的自监督空间域检测工作流程CellTransformer，用于小鼠大脑精细区域发现 | 开发了新颖的编码器-解码器架构CellTransformer，能够分层学习组织特征，并实现多百万细胞数据集的扩展分析 | NA | 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈，实现精细组织空间域的检测 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，自监督学习 | Transformer，编码器-解码器架构 | 空间转录组数据 | 900万细胞，200多个组织切片，4只小鼠 | NA | 空间转录组学，MERFISH，Slide-seqV2 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-15 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定滑液中的常驻滑膜巨噬细胞，探讨其在滑膜屏障完整性评估和炎症性关节炎中的作用 | 首次在人类滑液中鉴定常驻滑膜巨噬细胞，并建立新型体外组织块模型验证发现 | 研究未明确这些细胞在滑膜屏障破坏后是否持续或引发慢性炎症 | 研究常驻滑膜巨噬细胞在滑液中的存在及其与滑膜屏障完整性的关联 | 人类滑液样本和滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | 体外组织块模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-15 |
Bypassing cisplatin resistance in Nrf2 hyperactivated head and neck cancer through effective PI3Kinase targeting
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.10.632413
PMID:39868226
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研究论文 | 本研究评估PI3K抑制剂在绕过Nrf2介导的顺铂耐药头颈癌中的疗效 | 发现PI3K抑制剂gedatolisib可通过激活自噬、衰老和破坏脂肪酸代谢来抑制顺铂耐药头颈癌增殖并增强顺铂效果 | 研究主要使用临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 评估PI3K抑制剂在克服头颈鳞状细胞癌顺铂耐药中的治疗效果 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和多种小鼠模型 | 癌症治疗研究 | 头颈癌 | 转录组学、代谢组学、信号通路分析、空间转录组学 | 皮下、原位和转移性异种移植模型，免疫缺陷和人源化小鼠模型 | 基因表达数据、代谢数据、信号通路数据 | 多种头颈癌细胞系和多个小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |