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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-12-11
Antiviral and immune modulatory activities of STING agonists in a mouse model of persistent hepatitis B virus infection
2025-Dec-09, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究探讨了STING激动剂在持续性乙型肝炎病毒感染小鼠模型中的抗病毒和免疫调节活性 首次在STING敲除和人源STING敲入小鼠模型中,证实了STING激动剂治疗能激活强大的先天免疫反应,并以STING依赖性方式有效抑制HBV DNA复制,为STING激动剂作为慢性乙型肝炎免疫治疗药物提供了科学依据 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;HBs-Ab仅在1/4小鼠中可检测到,表明免疫反应存在个体差异 评估STING激动剂在持续性HBV感染中的治疗潜力,旨在打破免疫耐受并实现病毒控制 AAV-HBV转导的小鼠模型,包括STING敲除和人源STING敲入小鼠 免疫学 乙型肝炎 RNA-seq NA RNA-seq数据 小鼠模型,具体数量未明确说明 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
42 2025-12-11
Longitudinal profiling of tumor and immune compartments uncovers patterns of dysregulation and associations with response in multiple myeloma
2025-Dec-09, Blood cancer discovery IF:11.5Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了多发性骨髓瘤中肿瘤与免疫微环境的动态相互作用,并识别了与治疗反应相关的生物标志物 首次在纵向研究中结合单细胞RNA测序和批量测序,全面剖析了多发性骨髓瘤的免疫微环境变化,并发现了幼稚B细胞重建作为持久反应的新生物标志物 样本量相对有限(102名患者),且主要基于骨髓样本,可能无法完全代表全身性免疫状态 探究多发性骨髓瘤治疗反应和疾病进展的免疫相关因素 多发性骨髓瘤患者及其骨髓样本中的肿瘤细胞和免疫细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全基因组测序 NA 基因表达数据, 基因组数据 243个骨髓样本(来自102名患者,共631,226个细胞)和209个样本的批量测序数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全基因组测序 NA NA
43 2025-12-11
Toward a better pan-tumor predictive signature for unleashing precision immuno-oncology
2025-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
评论 本文讨论了免疫检查点抑制剂在实体瘤治疗中的预测生物标志物现状,并提出了一个新型免疫特征评分系统以优化精准免疫肿瘤学 提出了一个基于DNA和RNA分析的新型免疫特征评分系统,旨在预测实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应,并强调了整合多组学数据和临床因素的重要性 该评分系统仍需前瞻性验证和进一步优化,以充分发挥其在精准免疫肿瘤学中的潜力 开发更有效的预测生物标志物以优化免疫检查点抑制剂在实体瘤治疗中的应用 实体瘤患者,特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 精准医学 实体瘤 DNA和RNA分析,单细胞RNA技术,多组学基因特征分析 NA 基因表达数据,分子谱数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
44 2025-12-11
RAB25 modulates pit cell commitment by coordinating transforming growth factor-alpha secretion from gastric epithelial cells
2025-Dec-09, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文探讨了RAB25通过协调胃上皮细胞分泌转化生长因子-α来调控胃小凹细胞分化的生理作用 首次揭示了RAB25在胃环境中通过调节TGFA分泌来维持正常细胞谱系分化的生理机制,并关联了人类Ménétrier's疾病 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类疾病关联性证据尚需进一步验证 探究胃中EGFR信号调控细胞谱系分化的分子机制 胃上皮细胞、小鼠模型、人类Ménétrier's疾病样本 单细胞组学 胃疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2025-12-11
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了新生儿皮肤中早期定居的调节性T细胞(ETregs)如何通过调控PPARγ信号通路影响皮肤色素沉着 首次揭示了ETregs在出生后第一周对皮肤色素沉着的关键作用,并发现其通过PPARγ信号通路调控毛囊黑色素干细胞 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自白癜风患者的单细胞转录组分析,样本量有限 探究早期皮肤定居Tregs在皮肤发育和色素沉着中的功能机制 小鼠新生儿皮肤调节性T细胞、毛囊黑色素干细胞、PPARγ信号通路 免疫学与皮肤生物学 白癜风 单细胞转录组分析、基因表达谱分析、免疫细胞耗竭 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据 小鼠新生儿皮肤样本,人类白癜风患者和健康对照的皮肤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2025-12-11
Multimodal mass spectrometry imaging for plaque- and region-specific neurolipidomics in Alzheimer's disease mouse models
2025-Dec-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了一种多模态质谱成像框架,用于研究阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块及区域特异性的神经脂质组学 整合了MALDI-2质谱成像、离子淌度质谱和荧光显微镜,提高了检测灵敏度和空间化学分辨率,并实现了多模态图像配准与斑块相关脂质发现的计算流程 研究仅基于雌性5xFAD和APP转基因小鼠模型,未涉及人类样本或其他性别,且机制推断依赖于现有空间转录组数据的整合 探究阿尔茨海默病中淀粉样斑块形成及相关的脂质改变机制 雌性5xFAD和APP转基因小鼠模型中的淀粉样斑块及周围脑组织区域 质谱成像与神经科学 阿尔茨海默病 基质辅助激光解吸/电离后电离质谱成像、离子淌度质谱、荧光显微镜 NA 质谱成像数据、荧光图像、空间转录组数据 雌性5xFAD和APP转基因小鼠(具体数量未明确) NA 质谱成像、空间转录组学 NA NA
47 2025-12-11
Functional KCC2 expression marks an evolutionarily conserved population of early-maturing interneurons in the perinatal cortex
2025-Dec-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过识别和表征小鼠皮层中一类表达KCC2的早期成熟中间神经元,揭示了GABA能功能成熟在中间神经元亚群中的异质性,并证明了该群体在人类中的进化保守性 首次在小鼠皮层中识别出一类在胚胎期就表达KCC2、出生时即具有超极化GABA反应的早期成熟中间神经元亚群,并证明其在人类中存在进化保守性 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展;对早期成熟中间神经元的具体功能回路贡献尚未完全阐明 探究皮层中间神经元GABA能反应功能成熟的时间模式异质性,并寻找早期成熟中间神经元的分子标记 小鼠及人类皮层中间神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,差异基因表达分析 NA 基因表达数据,空间转录组数据,电生理记录数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
48 2025-12-11
AUTOENCODIX: a generalized and versatile framework to train and evaluate autoencoders for biological representation learning and beyond
2025-Dec-09, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了一个名为AUTOENCODIX的开源框架,用于标准化、灵活地预处理、训练和评估自编码器架构,以促进生物表示学习 提出了一个标准化且通用的框架,支持包括基于本体和跨模态自编码器在内的多种架构,增强了表示学习的可解释性和跨模态转换能力 未明确提及具体的技术限制或框架在特定数据集上的性能瓶颈 开发一个通用框架以标准化自编码器的训练和评估,推动生物医学数据表示学习的研究 自编码器架构及其在生物医学数据中的应用 机器学习 泛癌研究 自编码器、深度学习 自编码器(包括基于本体和跨模态变体) 多模态数据(如单细胞测序数据、影像数据) NA NA NA NA NA
49 2025-12-11
A single-cell transcriptomic dataset of enterocyte-specific HHEX knockdown in the Drosophila larval midgut
2025-Dec-09, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,构建了果蝇幼虫中肠的细胞图谱,并分析了HHEX基因敲低对肠上皮细胞分化的影响 首次在果蝇中开发了肠上皮细胞特异性HHEX敲低品系,并利用单细胞转录组学精确解析了HHEX在肠道上皮成熟中的调控作用 研究局限于果蝇模型,未直接验证在哺乳动物系统中的保守性 探究HHEX基因在肠道上皮细胞分化中的调控机制 果蝇三龄幼虫中肠细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 果蝇幼虫中肠细胞图谱 NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2025-12-11
Multi-omics profiling identifies ESM1 as a key mediator of immunoevasion through the SPP1 pathway in bladder cancer
2025-Dec-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了ESM1作为膀胱癌免疫逃逸关键介质的作用机制 首次整合ChIP-Seq、ATAC-seq、单细胞测序等多组学数据,系统解析ESM1在膀胱癌中通过SPP1通路介导免疫逃逸的分子机制 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内动物模型实验验证ESM1的功能机制 探讨ESM1作为膀胱癌早期诊断和治疗预测生物标志物的价值 膀胱癌患者临床样本和细胞水平的分子机制 生物信息学 膀胱癌 ChIP-Seq, ATAC-seq, 单细胞测序, 免疫组化, GSEA, PPI网络分析 生物信息学分析模型 mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 表观遗传数据, 单细胞测序数据 1558例临床样本(mRNA分析)+ 195例内部样本(免疫组化验证) NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-Seq NA NA
51 2025-12-11
Microbial production of short-chain fatty acids attenuates long-term neurologic impairment after traumatic brain injury
2025-Dec-09, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了通过饮食促进微生物产生短链脂肪酸(SCFAs)对创伤性脑损伤(TBI)后长期神经功能缺损的改善作用及其在单细胞水平的神经保护机制 首次在TBI模型中结合高SCFA饮食干预、纵向肠道微生物组分析和单细胞转录组测序,系统揭示了SCFAs通过重塑肠道菌群、促进神经发生和诱导抗炎表型来减轻长期神经损伤的机制 研究基于小鼠模型,结果需在人类中验证;干预时间长达6个月,未探索更短期的效果;单细胞测序仅针对损伤周边组织,未涵盖全脑区域 阐明肠道微生物产生的短链脂肪酸(SCFAs)在创伤性脑损伤(TBI)后长期神经功能缺损中的保护作用及分子机制 C57BL6/J小鼠(创伤性脑损伤模型) 神经科学,微生物组学 创伤性脑损伤,神经退行性疾病 16S rRNA扩增子测序,宏基因组测序,单细胞RNA测序,组织学分析 控制性皮层撞击(CCI)小鼠模型 微生物组序列数据,单细胞转录组数据,行为学数据,组织学数据 C57BL6/J小鼠(具体数量未明确说明),粪便样本在基线、1个月和6个月时间点采集,损伤周边组织在6个月时采集用于单细胞测序 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Genomics Chromium 遵循10x Genomics单细胞RNA测序方案
52 2025-12-11
Discovery of highly potent marine-derived compound Penicolinate H reveals SREBP-1 mediated lipogenesis as a druggable vulnerability in gastric cancer
2025-Dec-09, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究从海洋来源真菌中发现了一种新型化合物Penicolinate H,并揭示其通过靶向SREBP-1介导的脂肪生成抑制胃癌生长和转移 首次报道了海洋来源化合物Penicolinate H的抗胃癌活性,并阐明其通过直接靶向SREBP-1抑制脂肪生成的新机制,为胃癌治疗提供了新的候选药物和靶点 研究主要基于细胞和动物模型,尚未进行临床试验;化合物Penicolinate H的药代动力学和毒性特征有待进一步评估 从海洋天然产物中筛选有效的抗胃癌先导化合物,并探索其作用机制以发现可行的治疗靶点 胃癌细胞系、胃癌患者数据、海洋来源真菌Penicillium brocae SYSU-CJ17的代谢产物 肿瘤学/药物发现 胃癌 高通量RNA测序、单细胞转录组分析、生物信息学分析、内源性亲和下拉实验、细胞热位移分析、表面等离子共振、分子对接 NA 转录组数据、化学结构数据、体外和体内实验数据 未明确指定具体样本数量,涉及胃癌细胞系、患者数据和动物模型 NA RNA测序、单细胞转录组学 NA NA
53 2025-12-11
Unveiling the role of angiogenesis-related biomarkers in diabetic nephropathy via transcriptomics
2025-Dec-09, Diabetology & metabolic syndrome IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学数据、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,识别了与糖尿病肾病相关的血管生成生物标志物,并探讨了它们在疾病中的作用 结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序,首次将CD44、HSPG2、LPAR1和PTGES确定为糖尿病肾病的新型生物标志物和风险因素 研究主要依赖公共数据库数据,样本来源可能有限,且实验验证仅通过qRT-PCR和Western blot进行,需要进一步功能研究 探索糖尿病肾病中血管生成相关生物标志物,为临床诊断和治疗提供理论依据 糖尿病肾病患者的转录组学数据、免疫微环境及细胞类型 生物信息学 糖尿病肾病 转录组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2025-12-11
REL overexpression and sustained NF-κB signaling associated with 2p gain induce resistance to BTK inhibitors in Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Dec-09, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究揭示了慢性淋巴细胞白血病中2号染色体短臂增益通过导致REL过表达和持续NF-κB信号传导,从而介导对BTK抑制剂耐药的机制 首次在单细胞水平上发现2p增益导致REL过表达和NF-κB通路富集,并证实这是除BTK和PLCG2突变外的一种新型BTK抑制剂耐药机制 研究主要基于体外实验和细胞系模型,临床样本验证的队列规模可能有限,且未详细探讨其他可能共存的耐药机制 探究慢性淋巴细胞白血病中2号染色体短臂增益介导BTK抑制剂耐药的分子机制 慢性淋巴细胞白血病患者样本(包括2p增益和非2p增益)及B淋巴样细胞系 数字病理学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑,体外功能分析 NA 单细胞转录组数据,DNA结合活性数据,临床治疗反应数据 大量原发性CLL样本队列(具体数量未明确说明)及B淋巴样细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2025-12-11
Aire-dependent interferon signalling shapes thymocyte maturation and central tolerance in mice
2025-Dec-09, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响胸腺细胞成熟和中枢免疫耐受 首次在单细胞水平系统揭示Aire通过调控I型干扰素信号影响胸腺微环境中多种免疫细胞的转录组特征 研究仅在小鼠模型中进行,未验证人类对应机制;未阐明干扰素信号下游的具体分子通路 探究Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响免疫细胞发育和中枢耐受建立 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结免疫细胞 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Aire缺陷型和野生型小鼠的多组织免疫细胞(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2025-12-11
ALKBH5-Mediated ITGB1 m6A Modification in Ovarian Cancer Progression and Immune Evasion
2025-Dec-09, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究揭示了m6A去甲基化酶ALKBH5通过调控ITGB1表达促进卵巢癌进展和免疫逃逸 首次发现ALKBH5通过调节ITGB1的m6A修饰在卵巢癌进展和免疫逃逸中的关键作用 未明确说明样本量或实验模型的局限性 探究ALKBH5在卵巢癌进展和免疫逃逸中的分子机制 卵巢癌细胞和T细胞 机器学习 卵巢癌 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 深度学习, 共表达网络分析 深度学习模型 RNA-seq数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
57 2025-12-11
LINC01116, a hypoxia-lncRNA marker of pathological lymphangiogenesis and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2025-Dec-09, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究鉴定出长链非编码RNA LINC01116作为肺腺癌中缺氧诱导的病理淋巴管生成标志物,并与不良预后相关 首次发现LINC01116在淋巴内皮细胞中特异性高表达,并揭示其在缺氧微环境下调控淋巴管生成的作用机制 在肿瘤细胞系中的功能实验未发现LINC01116的明确调控作用,其具体分子机制仍需进一步研究 探索肺腺癌中缺氧诱导的淋巴管生成机制及其预后标志物 肺腺癌患者队列、肺腺癌细胞系、淋巴内皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交、CRISPRi、RNA干扰 NA 转录组数据、单细胞测序数据、图像数据 多个肺腺癌患者队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2025-12-11
The intratumor microbiome and cancer immunity: from pathogenesis to therapeutic opportunities through artificial intelligence
2025-Dec-09, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2
综述 本文综述了肿瘤内微生物组在癌症免疫中的作用,探讨了其从发病机制到通过人工智能挖掘治疗机会的潜力 整合了肿瘤内微生物组与免疫系统的相互作用,并强调了人工智能在结合空间和多组学数据以推动精准肿瘤学中的应用前景 面临数据异质性、模型可解释性以及伦理问题等障碍,且需要标准化的协议和高分辨率空间分析进行外部验证 评估肿瘤内微生物组在致癌过程不同阶段与免疫系统的相互作用,并探索人工智能在诊断、治疗反应预测和个性化肿瘤学中的支持作用 肿瘤内微生物组(包括细菌、真菌和病毒)及其在肿瘤微环境中的功能 机器学习 癌症 下一代测序, 空间转录组学 机器学习, 深度学习 多组学数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
59 2025-12-11
Protocol to investigate fibroblastic reticular cell-immune cell interaction in human lung cancer
2025-Dec-08, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种用于研究人肺癌中成纤维网状细胞与免疫细胞相互作用的详细实验协议 开发了从肿瘤组织中富集稀有成纤维网状细胞进行单细胞RNA测序的步骤,并提供了分析细胞间通讯的详细计算框架 协议主要针对人肺癌组织,可能不直接适用于其他癌症类型或物种 研究成纤维网状细胞在肺癌免疫反应中的作用及其与免疫细胞的相互作用 人肺癌组织中的成纤维网状细胞和免疫细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,高分辨率显微镜 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
60 2025-12-11
Integrative epidemiological and spatial multi-omics analyses reveal SPP1⁺ macrophages with senescence-like features as key mediators linking NO₂ exposure to coronary heart disease
2025-Dec-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过整合流行病学数据、因果推断方法和多组学分析,揭示了环境污染物二氧化氮(NO₂)通过加速生物衰老(特别是PhenoAge)增加冠心病风险的机制,并识别出SPP1⁺巨噬细胞作为关键介导细胞 首次将大规模流行病学数据、因果推断方法(倾向评分匹配和孟德尔随机化)与多组学分析(包括单细胞和空间转录组学)相结合,系统阐明了NO₂暴露通过生物衰老途径影响冠心病风险的完整证据链,并识别出具有衰老样特征的SPP1⁺巨噬细胞作为关键介导细胞 研究主要基于中国人群数据,结论在其他种族/人群中的普适性有待验证;多组学分析样本量相对较小;环境暴露评估可能存在测量误差 探究环境污染物NO₂暴露通过生物衰老途径影响冠心病风险的因果机制 冠心病患者及对照人群(来自天津队列和CHARLS队列)、人类动脉粥样硬化斑块组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 孟德尔随机化, 倾向评分匹配 NA 流行病学数据, 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 流行病学队列:17,412人(13,886例患者,3,526例对照);多组学分析:人类动脉粥样硬化斑块样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
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