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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-05 |
An integrated machine learning and mendelian randomization approach identifies SERPING1 as a prognostic biomarker associated with CD8 + T-cell infiltration in DLBCL
2026-Jun-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05340-2
PMID:42236612
|
研究论文 | 通过整合机器学习和孟德尔随机化方法,鉴定SERPING1为与CD8+T细胞浸润相关的DLBCL预后生物标志物 | 首次利用多组学整合与机器学习算法,结合孟德尔随机化分析,从多角度确认SERPING1在DLBCL中的核心作用及其与CD8+T细胞浸润的关系 | 研究依赖于公共数据库,样本量有限,且SERPING1作为风险因子的机制尚未完全阐明 | 鉴定DLBCL中与CD8+T细胞相关的新预后标志物和治疗靶点 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的肿瘤组织和基因表达数据 | 机器学习 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 分子对接, 孟德尔随机化 | LASSO, LDA, 随机森林, XGBoost, SHAP | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO的6个数据集(GSE56315, GSE25638, GSE12453, GSE12195, GSE32018, GSE83632)以及TCGA-DLBC RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2026-06-05 |
Vascular SMC-like CAF-derived THBS1 drives tumor-associated neutrophil recruitment to orchestrate an immunosuppressive microenvironment in gastric cancer
2026-Jun-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08945-1
PMID:42236667
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research paper | 本研究揭示血管平滑肌样CAF来源的THBS1通过招募肿瘤相关中性粒细胞,在胃癌中形成免疫抑制微环境并促进肿瘤进展 | 首次阐明血管平滑肌样CAF通过分泌THBS1驱动中性粒细胞趋化因子(CXCL1/5/6)产生,从而招募肿瘤相关中性粒细胞的机制,并证实THBS1可作为胃癌免疫治疗新靶点 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证规模有限;THBS1下游信号通路及与其他免疫细胞亚群的交互作用未深入探讨 | 探究胃癌中肿瘤相关中性粒细胞(TANs)招募及免疫抑制微环境形成的分子机制 | 血管平滑肌样成纤维细胞(VSMC-like CAF)、肿瘤相关中性粒细胞(TANs)、胃癌组织样本 | machine learning | 胃癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、患者来源异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据、组织切片图像 | 胃癌组织样本(具体数量未明确) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-06-05 |
Heterogeneity and dynamics of DENV-specific CD8 + T cells in dengue infection
2026-Jun-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73491-5
PMID:42236711
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析DENV特异性CD8+ T细胞在登革感染中的异质性和动态变化,揭示不同疾病严重程度相关的细胞亚群 | 首次利用HLA四聚体结合单细胞RNA测序,系统描绘了DENV特异性CD8+ T细胞在登革感染中的表型异质性,并发现与疾病严重程度相关的特定细胞亚群和转录组特征 | NA | 探究DENV特异性CD8+ T细胞的表型异质性如何与登革疾病严重程度相关 | DENV特异性CD8+ T细胞,通过HLA四聚体从登革患者外周血中识别 | 单细胞组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于板的单细胞RNA测序(plate-based single-cell RNA sequencing) |
| 44 | 2026-06-05 |
Modulation of intestinal bile acids influences colonic mucosal responses
2026-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55206-4
PMID:42236792
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研究论文 | 通过小鼠定植和单细胞RNA测序,研究肠道胆汁酸调节对结肠黏膜反应的影响 | 首次结合小鼠定植实验、单细胞RNA测序和人体活检,详细解析了次级胆汁酸(特别是脱氧胆酸DCA)对结肠上皮细胞亚群的特异性影响,并发现PDK4和MUC2表达的临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,结论的普适性需进一步验证,且未完全阐明胆汁酸调控的分子机制 | 探究肠道胆汁酸调节对结肠上皮细胞反应的在体和原位影响 | 定植特定菌群的无菌小鼠、观察性患者队列(增生性息肉或癌症患者)、胆酸螯合剂干预的造口患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 小鼠(定植实验组和对照组)、人类活检样本(观察队列和干预研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-06-05 |
privateST: a feasible framework for privacy-preserving spatial transcriptomics prediction from histopathology images
2026-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55961-4
PMID:42236846
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研究论文 | 提出一种基于同态加密的隐私保护框架,用于从组织病理学图像预测空间转录组学 | 首次将同态加密应用于空间转录组学预测,通过下采样、辅助基因集预测和架构调整实现隐私保护下的高精度预测任务 | 输入图像经下采样后分辨率降低,可能影响空间信息的精细捕捉;仅验证100个目标基因的场景 | 实现跨机构数据共享时保护隐私的空间转录组学预测 | 空间转录组学预测模型及组织病理学图像 | 数字病理学、隐私保护机器学习 | 一般性肿瘤研究(未指定具体疾病) | 空间转录组学预测 | 改进的ResNet-18架构 | 组织病理学图像 | 未明确说明样本数量(间接涉及100个目标基因和150个辅助基因) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-06-05 |
IL-22 promotes genesis of small intestinal secretory cells that protect against cholera in mice
2026-Jun-03, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02375-7
PMID:42236988
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠小肠上皮和免疫细胞,发现IL-22通过促进分泌性细胞生成,特别是Muc2-producing杯状细胞,增强黏膜防御,从而保护小鼠免受霍乱弧菌感染 | 首次揭示IL-22通过诱导小肠分泌性细胞谱系(尤其是分泌黏液的杯状细胞)来防御霍乱弧菌的机制,并鉴定出高表达防御功能基因的肠细胞亚型 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;IL-22Fc的治疗效果需进一步评估其临床转化潜力 | 探究IL-22在小肠先天免疫防御霍乱弧菌中的作用机制 | 新生小鼠的小肠上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 霍乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠的小肠组织样本,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 47 | 2026-06-05 |
Single-cell multi-omic atlas and morphogen screening informs midbrain and hindbrain organoid engineering
2026-Jun-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02316-x
PMID:42237030
|
研究论文 | 该研究通过单细胞多组学图谱和形态发生素筛选,为中脑和后脑类器官工程提供指导 | 结合单细胞转录组和可及染色质测序,构建多组学图谱,并通过多重筛选揭示形态发生素对类器官模型的扩展作用 | 未明确提及其局限性 | 绘制中脑和后脑类器官的细胞组成和调控机制,并筛选形态发生素以改进模型 | 中脑和后脑类器官模型中的细胞类型及调节机制 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序和可及染色质测序 | NA | 转录组和染色质数据 | 涉及中脑和后脑类器官模型中的细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-06-05 |
Dopamine inhibits retinal pathological neovascularization in the oxygen-induced retinopathy mouse model
2026-Jun-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70080
PMID:42237060
|
研究论文 | 通过氧气诱导视网膜病变小鼠模型,研究多巴胺抑制视网膜病理性新生血管的机制 | 首次整合单细胞RNA测序与Müller细胞特异性Drd2基因敲除小鼠模型,揭示多巴胺通过Müller细胞中Drd2信号调控HIF-α和VEGF-A合成,从而抑制病理性血管生成的机制 | NA | 探究多巴胺及其受体在视网膜病理性新生血管中的作用机制 | 氧气诱导视网膜病变小鼠模型及Müller细胞特异性Drd2基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 早产儿视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 49 | 2026-06-05 |
CIITA/PRMT5 promote CD4+Gzma+ T cell activation via H3R2me2-mediated endothelial expression of MHC class II in smoking-induced atherosclerosis
2026-Jun-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04975-w
PMID:42237295
|
研究论文 | 该研究揭示了吸烟通过CIITA/PRMT5介导的H3R2me2修饰促进内皮细胞MHC II表达,进而激活CD4+Gzma+ T细胞从而加剧动脉粥样硬化进展的免疫机制 | 首次发现CIITA与PRMT5相互作用通过H3R2对称二甲基化修饰调控MHC II表达,并阐明CD4+Gzma+ T细胞亚群在吸烟相关动脉粥样硬化中的关键致病作用 | 研究主要在ApoEKO小鼠模型和体外细胞实验中验证,缺乏临床样本的进一步验证 | 探究吸烟促进动脉粥样硬化进展中CD4+Gzma+ T细胞活化的免疫分子机制 | ApoEKO小鼠、小鼠动脉内皮细胞、人冠状动脉内皮细胞 | 免疫学与心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-06-05 |
Linking childhood interstitial lung disease to IARS-related disorder: clinical and preliminary functional studies in four new cases
2026-Jun-03, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00998-9
PMID:42237414
|
研究论文 | 通过四例新病例的临床和初步功能研究,将儿童间质性肺病与IARS相关疾病联系起来 | 首次将IARS基因双等位突变确立为儿童间质性肺病/肺泡蛋白沉积症的新致病基因,并揭示了单核细胞/巨噬细胞谱系的内在缺陷可能参与表面活性物质清除障碍的免疫相关致病机制 | 病例数量有限,仅四例;功能研究尚属初步阶段,未深入验证具体分子机制 | 探究IARS基因双等位突变与儿童间质性肺病及肺泡蛋白沉积症的关联及其潜在致病机制 | 四名表现为进行性儿童间质性肺病/肺泡蛋白沉积症并伴肺外表现(生长迟缓、智力障碍、肌张力低下和肝病)的儿科患者 | 数字病理学 | 儿童间质性肺病,肺泡蛋白沉积症 | 全外显子测序,AlphaFold蛋白结构预测,PAS和ORO染色,Western blot,透射电镜,单细胞RNA测序 | AlphaFold | 基因组数据,蛋白质结构数据,染色图像,电镜图像,单细胞转录组数据 | 四名儿科患者 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 51 | 2026-06-05 |
Loss of miR-29a/b1 Cluster Reprograms the Tumor Microenvironment and Contributes to Immunosuppression in Lung Cancer
2026-Jun-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1060
PMID:41739590
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研究论文 | 该研究探讨了miR-29a/b1簇缺失如何重编程肿瘤微环境并促进肺癌免疫抑制 | 首次揭示miR-29家族通过调控ATX及其他靶基因影响肿瘤微环境和抗肿瘤免疫通路,与免疫检查点抑制剂反应相关 | NA | 探究miR-29在肺癌免疫检查点抑制剂耐药中的作用机制 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型及肺腺癌患者肿瘤样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及公共数据库中的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-06-05 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Jun-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性地分析了肿瘤浸润NK细胞的异质性,发现了两类具有免疫抑制或促炎功能的NK细胞亚群 | 首次揭示了NK细胞中存在由不同内在信号程序驱动的二分性表型和功能景观,其中组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点治疗反应相关 | NA | 探究肿瘤浸润NK细胞的异质性及其对免疫反应和临床结果的影响 | 肿瘤浸润NK细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-06-05 |
Smart Microneedles Regulate Reactive Oxygen Species and Deliver Matrix Metalloproteinases for Pathological Scar Treatment
2026-Jun-02, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c00171
PMID:42148523
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研究论文 | 开发了一种智能微针,能够调节活性氧并递送基质金属蛋白酶,用于病理性疤痕治疗 | 提出了一种结合病理信号解码与靶向干预的闭环治疗策略,利用智能微针同时清除活性氧和递送基质金属蛋白酶以重塑细胞外基质 | 未明确说明局限性,但可能涉及临床转化中的长期效果和安全性评估 | 研究病理性疤痕的形成机制并开发新型治疗方法 | 病理性疤痕患者样本、兔和猪病理性疤痕模型 | 数字病理学 | 病理性疤痕 | 单细胞测序、组织学染色 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、组织学染色 | NA | NA |
| 54 | 2026-06-05 |
Activated PIK3CD drives marginal zone B cell development from early transitional progenitors by enhancing ADAM10 expression
2026-Jun-02, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02241-6
PMID:42228175
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研究论文 | 通过小鼠模型和单细胞测序技术,揭示激活的PI3Kδ通过增强ADAM10表达促进边缘区B细胞从早期过渡前体细胞发育的机制 | 首次发现过度活跃的P110δ在B细胞发育的T1阶段即通过上调表面ADAM10水平促进脾脏边缘区B细胞前体扩增,并利用单细胞RNA测序揭示T1阶段的差异性细胞分化 | 从较浅的视角揭示了APDS中边缘区B细胞发育失衡的机制,仅为未来靶向自身免疫性B细胞策略的初步研究平台 | 探究激活的PI3Kδ信号在脾脏边缘区B细胞发育中的具体作用机制 | 激活的PI3Kδ综合征小鼠模型中的脾脏边缘区B细胞及其前体 | 机器学习 | 原发性免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 55 | 2026-06-05 |
Network Methods for Diagonal Integration of Unpaired Single-Cell Multi-Omics Data: A Review
2026-Jun-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag353
PMID:42234838
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综述 | 综述了用于非配对单细胞多组学数据对角集成的网络方法,涵盖从转录组学骨架构建到跨模态整合的完整计算流程 | 首次聚焦于非配对单细胞蛋白质组学数据的对角集成挑战,系统总结了生成式蛋白质组翻译、归纳先验嵌入和基于扰动的因果基准测试三大未来发展方向 | 未提供新的软件或算法实现,基准资源表仅作为补充材料提供 | 综述用于非配对单细胞多组学数据(特别是scMS与单细胞转录组)对角集成的网络方法 | 非配对的单细胞转录组与蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞质谱法 | 图神经网络, 生成模型, 概率图模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 56 | 2026-06-05 |
ADAM12-programmed ECM-CAF remodeling activates PI3K-AKT and enforces an immune-excluded microenvironment to drive bladder cancer progression and therapy resistance
2026-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112398
PMID:41651177
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研究论文 | 通过多组学分析探究ADAM12介导的ECM-CAF重塑在膀胱癌进展和治疗抵抗中的作用机制 | 首次整合单细胞转录组、成纤维细胞GWAS数据及多平台数据,系统揭示ADAM12作为基质驱动因子连接基质重塑、PI3K-AKT信号通路与膀胱癌免疫抑制的分子机制 | 未提及具体局限性 | 阐明膀胱癌中肿瘤相关成纤维细胞介导的基质重塑的致病机制及潜在治疗靶点 | 膀胱癌组织、细胞系和小鼠模型 | 计算机视觉 | 膀胱癌 | 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据、TCGA和GEO数据集 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-06-05 |
Serum procalcitonin: A novel tumor biomarker for diagnosis and disease monitoring in fibrolamellar hepatocellular carcinoma
2026-Jun, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.01.015
PMID:41654224
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研究论文 | 本研究探讨血清降钙素原作为纤维板层肝细胞癌的一种新型肿瘤生物标志物,用于诊断和疾病监测 | 首次证实降钙素原在纤维板层癌患者血清中显著升高,且具有高度敏感性和特异性,可作为该罕见肝癌的诊断和治疗监测生物标志物 | 样本量较小,需在更大规模和更多样化的队列中进行前瞻性研究以完善诊断阈值并确认特异性 | 评估血清降钙素原作为纤维板层癌诊断和监测生物标志物的潜力 | 纤维板层癌患者、肝细胞癌患者、胆管癌患者、肝硬化患者 | 机器学习 | 肝癌 | RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 图像 | 18例纤维板层癌患者34份样本,64例肝细胞癌患者,24例胆管癌患者,20例肝硬化患者;27例纤维板层癌肿瘤、331例肝细胞癌肿瘤、39例胆管癌肿瘤、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤、55例非肿瘤肝脏样本用于RNA测序;3例纤维板层癌肿瘤用于空间转录组学;13例纤维板层癌肿瘤和34例其他原发或继发性肝癌用于免疫组织化学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-06-05 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Jun, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性肺移植功能障碍中内皮和上皮细胞协同激活蛋白-1的激活 | 首次通过空间转录组学分析,发现CLAD中上皮和内皮细胞中AP-1靶基因(如JUNB和FOS)显著上调,并揭示两者在促炎和促纤维化基因网络中的协同作用 | 未提及明确限制;可能受限于样本量较小或空间分辨率不足(根据常识推断) | 探究慢性肺移植功能障碍(CLAD)中细胞特异的基因表达谱及其分子机制 | 人类肺组织样本,包括CLAD患者、非CLAD移植接受者和非移植对照组 | 数字病理学 | 慢性肺移植功能障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-06-05 |
Multi-omics reveals that CTHRC1 secreted by cancer-associated fibroblasts promotes EMT by ITGA5/PI3K/AKT signaling pathway in HNSCC
2026-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112409
PMID:41651176
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研究论文 | 通过多组学分析揭示头颈鳞癌中癌相关成纤维细胞分泌的CTHRC1通过ITGA5/PI3K/AKT信号通路促进上皮间质转化 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了CTHRC1+ CAFs在HNSCC中的空间分布及其通过ITGA5/PI3K/AKT信号轴促进肿瘤进展的机制 | NA | 阐明头颈鳞癌中癌相关成纤维细胞的关键功能分子及其在肿瘤进展中的作用机制 | 头颈鳞癌细胞及癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和多个GEO队列数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 60 | 2026-06-05 |
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于多组学分析,探讨MYB基因在三阴性乳腺癌中的潜在治疗靶点作用,重点关注PI3K/AKT信号通路 | 首次通过整合113种算法组合、多组学数据(转录组、单细胞RNA测序、空间转录组)和分子对接模拟,系统揭示MYB基因在TNBC与Non-TNBC预后差异中的关键角色,并发现桃红四物汤主要成分与MYB的强结合能力 | 研究主要基于公共数据库数据分析,缺乏独立临床队列验证;分子对接模拟结果需要后续实验验证;桃红四物汤成分与MYB结合的体内外功能验证尚未开展 | 探究PI3K/AKT信号通路中关键基因导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌和非三阴性乳腺癌的转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个转录组数据集,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |