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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-31 |
Network Pharmacological Analysis of Lentinan in Regulating Intervertebral Disc Degeneration: Combined with Machine Learning-Based Screening and Molecular Dynamics Validation
2026-May-29, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261454407
PMID:42212606
|
研究论文 | 整合网络药理学、机器学习、分子对接和分子动力学模拟，探究香菇多糖（LNT）调控椎间盘退变（IVDD）的分子机制 | 首次结合网络药理学与三种机器学习方法筛选核心靶点，并通过单细胞转录组虚拟敲除评估关键基因扰动对细胞状态和信号网络的重塑 | 未知 | 阐明香菇多糖治疗椎间盘退变的分子机制 | 椎间盘退变相关基因和香菇多糖作用靶点 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 网络药理学、机器学习、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组分析 | 机器学习模型（具体类型未提及） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 数据集GSE176205共16361个潜在IVDD相关基因，97个LNT相关靶点 | 未提及 | 转录组测序 | 未提及 | 未提及 |
| 42 | 2026-05-31 |
MAL2 drives hepatocellular carcinoma progression by recruiting regulatory T cells via CCL22 and inducing the immunosuppressive microenvironment
2026-May-29, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2026095
PMID:42212623
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研究论文 | 研究MAL2通过CCL22招募调节性T细胞诱导免疫抑制微环境促进肝细胞癌进展的机制 | 首次阐明MAL2在肝细胞癌中通过CCL22介导的Treg招募驱动免疫抑制微环境形成，并提出其作为潜在治疗靶点 | 未在更多临床样本或体内模型中验证MAL2的机制，且缺乏对MAL2下游信号通路的深入解析 | 探讨MAL2在肝细胞癌中的功能角色及促进肿瘤进展的分子机制 | 肝细胞癌恶性细胞、Hep-3B和HCC-LM3细胞系、H22细胞皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式、ELISA、免疫荧光染色 | NA | 单细胞基因表达数据、质谱流式数据 | 公开单细胞RNA测序数据（来源未明确）；细胞系实验；小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq、质谱流式 | NA | NA |
| 43 | 2026-05-31 |
JUN Specifies the Local Differentiation and Maintenance of Pro-tumoral Monocyte-Derived Macrophages
2026-May-29, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3974
PMID:42212681
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研究论文 | 本文发现AP-1因子JUN在单核细胞来源巨噬细胞的分化和维持中起关键作用，并指定促肿瘤营养功能，为癌症选择性靶向治疗提供新机会 | 首次明确JUN在单核细胞来源巨噬细胞分化和维持中的特异性作用，并揭示其与免疫调节功能的独立性 | 未提及具体局限性 | 探究JUN在肿瘤相关巨噬细胞分化中的作用及促肿瘤功能的分子机制 | 肿瘤相关巨噬细胞（包括常驻组织巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞） | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-05-31 |
Early life nutritional imbalance impairs colonic epithelial regeneration through gut microbiota dysbiosis and metabolic suppression
2026-May-29, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrag135
PMID:42213059
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研究论文 | 早期营养失衡通过肠道菌群失调和代谢抑制损害结肠上皮再生 | 首次揭示营养失衡通过肠道菌群-代谢-上皮干细胞信号轴损害宿主发育的机制，利用多组学整合分析连接菌群结构改变与宿主能量代谢及Wnt/β-catenin通路抑制 | 未明确提及具体局限性 | 探究早期生活营养失衡对结肠上皮再生的影响机制 | 小鼠模型中的结肠上皮细胞和肠道微生物群 | 机器学习 | 营养不良相关疾病 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、微生物组数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-05-31 |
HisCMCL: Cross-Modal Contrastive Learning with Hierarchical Multi-Scale Fusion for Spatial Expression Prediction
2026-May-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag342
PMID:42213081
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研究论文 | 提出一种名为HisCMCL的多模态框架，通过层级多尺度融合与跨模态对比学习，从病理图像预测空间基因表达 | 首次融合层级多尺度特征与交叉注意力机制，结合空间位置信息和对比学习策略，实现微观细胞与宏观组织的跨样本共享特征提取与对齐 | NA | 解决空间转录组学数据成本高、操作复杂的问题，通过病理图像高效推断基因表达 | 四个公开数据集中的病理图像与空间转录组数据 | 计算机视觉 | 癌症 | 空间转录组学 | CNN，交叉注意力，对比学习 | 图像 | 四个公开数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-05-31 |
Genomics-Informed Approach Identifies Which Cell Types Regulate the Metabolome
2026-May-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag330
PMID:42213079
|
研究论文 | 整合大规模代谢物数量性状位点数据集与单细胞RNA测序资源，识别调控代谢组的细胞类型 | 首次通过整合大型代谢物QTL数据集和单细胞转录组资源，系统性识别调控代谢组的特定细胞类型，并发现肝细胞是大多数代谢物的主要调控细胞类型 | 未提及明确局限性 | 确定哪些细胞类型调控体内代谢物水平 | 代谢物与细胞类型之间的调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模代谢物QTL数据集（TOPMed和UK Biobank）及单细胞RNA测序资源（Tabula Sapiens） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-05-31 |
Diving into the transcriptional landscape of leukemic stem cells in acute myeloid leukemia at single-cell resolution
2026-May-29, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06500-1
PMID:42213171
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和批量RNA测序研究急性髓系白血病中白血病干细胞群体的转录组学成果 | 强调单细胞分辨率下白血病干细胞的异质性和动态演化，揭示了其静止状态、细胞可塑性和代谢重编程等复杂特性 | 仍需建立白血病干细胞鉴定的标准化标准，且需要更多纵向研究以全面理解其在疾病进展和治疗耐药中的作用 | 总结转录组学技术在急性髓系白血病中研究白血病干细胞的进展和挑战 | 急性髓系白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 文本 | 27项研究 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-05-31 |
Convergent immune dysregulation in sepsis and colorectal cancer highlights plasma cells and identifies shared candidate genes
2026-May-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05215-6
PMID:42213300
|
研究论文 | 整合多队列脓毒症和结直肠癌的转录组数据，发现免疫失调的共同特征，并鉴定共享候选基因 | 首次系统揭示脓毒症与结直肠癌在免疫失调方面的趋同机制，并鉴定共享候选基因 | 研究依赖公共数据，缺乏独立验证队列；共享基因的功能验证尚不充分 | 探索脓毒症与结直肠癌共有的免疫调节机制 | 脓毒症和结直肠癌患者的组织与血液样本 | 机器学习 | 结直肠癌, 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多队列整合分析；独立外周血单细胞RNA测序队列包含结直肠癌3例和结直肠癌合并脓毒症3例 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-05-31 |
Single-cell transcriptomics reveals NDRG1/TGF‑β1 associated vascular smooth muscle cell phenotypic switching in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
2026-May-29, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-026-03288-2
PMID:42213334
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示NDRG1/TGF-β1通路在慢性血栓栓塞性肺动脉高压中与血管平滑肌细胞表型转换的相关性 | 首次在单细胞水平上鉴定CTEPH中平滑肌细胞的四种表型，特别是成纤维细胞样平滑肌细胞的扩增，并发现NDRG1作为核心基因通过TGF-β/SMAD通路促进表型转换 | 仅基于公共数据集和体外实验，缺乏体内动物模型验证，且样本量较小 | 阐明CTEPH中肺动脉平滑肌细胞表型转换的分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者的肺动脉组织样本 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | Seurat, DESeq2, Monocle3, hdWGCNA | 转录组数据 | 来自两个scRNA-seq数据集（GSE224143, GSE228644）和一个bulk RNA-seq数据集（GSE84538） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-05-31 |
A STAT1/ETC/GBP1 axis represents a potential therapeutic target for noncommunicable granulomatous skin disease
2026-May-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea0773
PMID:42213834
|
研究论文 | 揭示STAT1/ETC/GBP1轴在非传染性肉芽肿性皮肤病中的潜在治疗靶点 | 首次识别出IFN-γ激活的巨噬细胞中氧化磷酸化为优势代谢通路，并发现GBP1在控制巨噬细胞激活中的核心作用，提出二甲双胍作为治疗策略 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据重分析和体外实验，缺乏体内模型验证 | 探索环状肉芽肿和皮肤结节病的分子机制及潜在治疗靶点 | 环状肉芽肿和皮肤结节病的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肉芽肿性皮肤病 | NGS | NA | 单细胞RNA测序数据 | 重分析公开的单细胞RNA测序数据，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-05-31 |
Evolving strategies for lineage tracing: Genetic markers, synthetic barcodes, and natural variants
2026-May-29, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.05.001
PMID:42214336
|
综述 | 探讨谱系追踪技术的进化策略，包括遗传标记、合成条形码和自然变异，并整合多组学和空间图谱以解码细胞命运 | 系统提出谱系追踪的三个方法论支柱（前瞻性追踪、高通量图谱、回顾性追踪），并强调其与多组学和空间图谱的整合以及计算方法的创新 | 未详细讨论各技术在实际应用中的具体挑战，如双链条形码的噪音或单细胞测序的覆盖度问题 | 为实验设计提供系统指南，并强调将精确克隆分析转化为临床应用的前沿领域 | 细胞谱系追踪中的遗传标记、合成条形码和自然变异 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-05-31 |
First human decedent model of orthotopic multi-organ xenotransplantation: Whole liver and bilateral kidneys from a six-gene-edited pig
2026-May-29, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101148
PMID:42214339
|
研究论文 | 报告了从六基因编辑猪到人类尸体的原位联合全肝和双侧肾脏异种移植的首次模型 | 首次在人类尸体模型中实现了原位多器官（全肝和双侧肾脏）猪-人异种移植，并利用单细胞RNA测序、蛋白质组学和代谢组学系统分析了早期免疫和代谢特征 | 因使用人类尸体模型，无法完全模拟活体移植中的长期免疫排斥和生理反应 | 探索猪到人原位全肝加双侧肾脏异种移植的可行性并鉴定早期免疫和代谢特征 | 一名53岁人类尸体接受者和六基因编辑猪的全肝及双侧肾脏移植物 | 机器学... | 终末期器官衰竭 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | 1具人类尸体和1只猪 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-05-31 |
Tracing cell lineages in the developing brain: Insights from mosaic analysis and clone-resolved transcriptomics
2026-May-29, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102487
PMID:42214837
|
综述 | 综述了结合分子条形码和单细胞RNA测序的克隆解析转录组学在大脑发育中的细胞谱系追踪进展，重点关注大脑皮层 | 揭示了发育大脑中意料之外的谱系关系，阐明了物种特异性发育程序在细胞类型多样性生成中的作用，并将克隆结构变化与皮层进化中的谱系多样化联系起来 | 未明确提及局限性 | 总结克隆解析转录组学在大脑发育细胞谱系追踪中的最新进展，特别是大脑皮层中新的谱系关系及物种特异性差异 | 大脑发育中的放射状胶质祖细胞及其产生的神经元和胶质细胞 | 机器学习 | NA | 分子条形码、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞RNA测序 |
| 54 | 2026-05-31 |
Ripk2 promotes CD8+ T cell inactivation and hepatocellular carcinoma progression through Myb/Cxcl9 and Pax5/Adpgk signaling pathways
2026-May-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08849-0
PMID:42215445
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research paper | 通过巨噬细胞Ripk2基因敲除小鼠模型、单细胞测序和流式细胞术，揭示了Ripk2通过Myb/Cxcl9和Pax5/Adpgk信号通路促进CD8+ T细胞失活和肝细胞癌进展的机制 | 首次发现巨噬细胞Ripk2通过调节瘤内微生物群（特别是链霉菌丰度）影响CD8+ T细胞功能，并揭示Ripk2抑制剂联合PD-1/PD-L1抑制剂可减轻单药肝毒性并提高疗效 | 未提供明确的局限性信息 | 研究Ripk2在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其对巨噬细胞功能的影响 | 巨噬细胞Ripk2基因敲除小鼠模型中的肝细胞癌免疫微环境 | machine learning | liver cancer | scRNA-seq, flow cytometry, single-cell sequencing | NA | single-cell transcriptomic data | 巨噬细胞Ripk2基因敲除小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-05-31 |
GraphTME: graph-based framework for predicting immunotherapy response by interpreting tumour microenvironment interactions using spatial transcriptomics
2026-May-29, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00735-x
PMID:42215484
|
研究论文 | 提出GraphTME框架，通过空间转录组数据解释肿瘤微环境中的细胞间相互作用，预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 首次在空间转录组数据中定量捕获单细胞水平的细胞间互作，用于预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 未提及局限性 | 开发可解释的空间转录组分析框架，预测免疫治疗反应 | 非小细胞肺癌患者CD8 T细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学（MERFISH）, 单细胞RNA测序 | 多关系有向图模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 非小细胞肺癌患者样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | MERFISH | NA |
| 56 | 2026-05-31 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
|
综述 | 本文概述了单细胞RNA测序技术在真菌感染研究中的应用现状与潜力 | 系统性地总结了scRNA-seq在揭示宿主-真菌病原体相互作用动态方面的关键发现，并鼓励该领域更广泛地采用单细胞技术 | 当前scRNA-seq技术在真菌感染研究中存在局限性，包括技术应用不足和研究空白 | 推动单细胞技术在真菌感染研究中的采用，以促进诊断和治疗进展 | 真菌病原体及其与宿主的相互作用 | 机器学习 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-05-31 |
Identification and validation of a prognostic risk-scoring model in drug-resistant ALL and evaluation of immune micro-environment
2026-May-29, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-07080-3
PMID:42215742
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研究论文 | 通过转录组数据构建并验证儿童耐药急性淋巴细胞白血病预后风险评分模型，并评估免疫微环境的作用 | 首次基于Lasso回归构建13基因耐药相关预后指数（RAPI-13）并验证其预后价值，发现CD40激动剂联合化疗及免疫检查点阻断可逆转耐药 | 尚需更大规模前瞻性临床队列验证模型及三重疗法的临床转化可行性 | 开发耐药儿童急性淋巴细胞白血病的预后分层工具并探索免疫靶向治疗策略 | 化疗敏感与耐药的儿童急性淋巴细胞白血病患者样本及其转录组数据 | 机器学习 | 儿童急性淋巴细胞白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Lasso回归 | 转录组数据 | 来自GEO和TARGET数据集的多个队列样本（具体数量未提及） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-05-31 |
Spatial transcriptomics of cervical cancer reveals microenvironment shaped the malignant epithelial programs and ECM-associated immune niches
2026-May-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04439-3
PMID:42215810
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术分析宫颈癌肿瘤微环境对恶性上皮程序和细胞外基质相关免疫生态位的影响 | 首次利用Stereo-seq空间转录组学在宫颈癌FFPE标本中定义恶性上皮亚型及其微环境生态位，发现ITGA6⁺上皮程序与基质相互作用和THBS1信号通路密切相关 | NA | 探究宫颈癌中恶性上皮亚型的多样性及其与免疫细胞的相互作用机制 | 宫颈癌FFPE标本及CIN III和浸润性癌组织 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | Stereo-seq空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | FFPE宫颈癌标本 | 华大基因 | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组学用于FFPE标本 |
| 59 | 2026-05-31 |
scZGA: a novel model based on ZINB distribution and graph attention for scRNA-seq data clustering
2026-May-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06503-2
PMID:42215865
|
研究论文 | 提出基于ZINB分布和图注意力网络的新模型scZGA，用于聚类单细胞RNA测序数据 | scZGA结合ZINB模型和残差连接图自编码器，通过自优化嵌入算法提升聚类性能 | 未提及模型对大规模数据的计算效率及泛化到其他单细胞模态的适用性 | 解决scRNA-seq数据高丢失率和复杂细胞间关系导致的聚类难题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图注意力网络, ZINB模型, 图自编码器 | 基因表达数据 | 6个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-05-31 |
A continuous DNA repairing system for alleviating intervertebral disc degeneration
2026-May-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04615-8
PMID:42215985
|
研究论文 | 本研究提出了一种持续DNA修复系统，通过清除ROS、修复DNA损伤、促进DNA复制和基质合成来缓解椎间盘退变 | 首次提出结合双金属-姜黄素纳米酶与脐带间充质干细胞来源囊泡的连续DNA修复策略，从源头清除ROS到促进组织修复的全链条干预 | 尚未在更大动物模型或临床试验中验证系统安全性和长期有效性；机制研究主要限于体外和鼠尾针刺模型，可能无法完全模拟人类椎间盘退变 | 开发一种连续调控DNA修复的系统以逆转氧化应激诱导的髓核细胞衰老并治疗椎间盘退变 | 临床椎间盘样本、大鼠髓核细胞、鼠尾针刺椎间盘退变模型 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 临床患者髓核样本（具体数量未提供）及大鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |