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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-07-14 |
Environmental nano-particulates induced pre-implantation embryonic toxicity in pluripotent stem cell-derived blastoids
2025-Jul-09, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.126809
PMID:40645264
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research paper | 该研究利用多能干细胞衍生的blastoids模型评估了环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性影响 | 首次构建了灵长类多能干细胞衍生的blastoids平台,并整合单细胞RNA测序和质谱技术创建了多维度早期胚胎暴露组数据库 | 研究结果基于体外模型,与真实人类胚胎发育可能存在差异 | 探究环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性机制 | 灵长类多能干细胞衍生的blastoids模型 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 10X scRNA-seq, DIA-MS | blastoids模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA |
42 | 2025-07-14 |
Neuroimmune integration in chronic stress: mechanisms of TRPV1-CB2 crosstalk, inflammation, and neural resilience
2025-Jul-09, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.149826
PMID:40645538
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综述 | 本文综述了慢性压力下神经免疫整合的机制,重点关注TRPV1和CB2受体的相互作用、神经炎症级联反应以及氧化应激特征 | 整合了神经化学范式与TRPV1和CB2受体动态、神经炎症级联和氧化应激特征的前沿见解,并提出了神经免疫整合模型 | 分子网络间复杂的相互作用以及先进疗法获取的不平等性限制了研究的广泛适用性 | 探讨慢性压力下的神经免疫整合机制,并开发可广泛应用的神经保护治疗方法 | 慢性压力下的神经化学和神经免疫反应 | 神经科学 | 精神疾病和神经疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑和单细胞RNA测序 | 神经免疫整合模型 | NA | NA |
43 | 2025-07-14 |
Metabolic alterations driven by LDHA in CD8 + T cells promote immune evasion and therapy resistance in NSCLC
2025-Jul-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87361-5
PMID:40629035
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研究论文 | 本研究通过多模态数据分析方法,揭示了CD8+T细胞在非小细胞肺癌中的代谢重编程及其对免疫逃逸和治疗抵抗的影响 | 发现了LTB+LDHA+CD8+T细胞的独特代谢和免疫表型,以及LDHA作为关键基因对免疫治疗结果的显著影响 | 研究样本量相对较小,仅包含89名NSCLC患者 | 探索CD8+T细胞在非小细胞肺癌中的代谢重编程及其对免疫逃逸和治疗抵抗的作用机制 | 非小细胞肺癌患者的CD8+T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学 | StepCox[forward] + Lasso | 转录组数据、蛋白质组数据 | 89名NSCLC患者的9个单细胞数据集 |
44 | 2025-07-14 |
Duchenne Muscular Dystrophy Patient iPSCs-Derived Skeletal Muscle Organoids Exhibit a Developmental Delay in Myogenic Progenitor Maturation
2025-Jul-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14131033
PMID:40643552
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research paper | 该研究利用Duchenne肌营养不良症(DMD)患者来源的iPSCs构建3D骨骼肌类器官(SMO)模型,研究其肌源性祖细胞(MPs)的成熟延迟现象 | 首次使用3D骨骼肌类器官模型研究DMD患者肌源性祖细胞的发育延迟,并发现其趋向于胚胎和未成熟肌管状态 | 研究仅使用了3个DMD患者来源的iPSC系和2个健康对照,样本量有限 | 研究Duchenne肌营养不良症的发病机制和肌肉再生障碍 | DMD患者来源的iPSCs及其分化的骨骼肌类器官 | 干细胞与再生医学 | Duchenne肌营养不良症 | 3D类器官培养、scRNA-seq | 3D骨骼肌类器官(SMO)模型 | 单细胞转录组数据 | 3个DMD患者iPSC系和2个健康对照 |
45 | 2025-07-14 |
Emerging Techniques of Translational Research in Immuno-Oncology: A Focus on Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Jul-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132244
PMID:40647543
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综述 | 本文综述了免疫肿瘤学在非小细胞肺癌(NSCLC)中的新兴转化研究技术,重点介绍了诊断和治疗精度的提升 | 介绍了人工智能、液体活检、单细胞RNA测序和病理组学等新兴技术在NSCLC诊断和治疗中的应用 | 综述性质的文章,未涉及具体实验数据或样本量的详细分析 | 优化NSCLC的个性化治疗策略,提升诊断和治疗精度 | 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤微环境(TME) | 数字病理学 | 肺癌 | 人工智能、液体活检、单细胞RNA测序、病理组学 | Machine Learning、Deep Learning | NA | NA |
46 | 2025-07-14 |
Emerging Therapeutic Strategies Targeting GPX4-Mediated Ferroptosis in Head and Neck Cancer
2025-Jul-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136452
PMID:40650229
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综述 | 本文综述了靶向GPX4介导的铁死亡在头颈癌治疗中的新兴策略 | 探讨了GPX4的多方面调控机制及其在克服头颈癌治疗耐药性中的核心作用,并总结了预测铁死亡敏感性的新兴生物标志物 | 药物递送、毒性和耐药机制等挑战仍未解决 | 研究靶向GPX4介导的铁死亡作为克服头颈癌治疗耐药性的新策略 | 头颈癌(HNC) | 肿瘤学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
47 | 2025-07-14 |
Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury
2025-Jul-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.009
PMID:40651470
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研究论文 | 研究揭示了细菌代谢物ADP-heptose通过ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用 | 首次发现ADP-heptose通过ALPK1-TIFA信号通路调控肠道干细胞再生,揭示了细菌代谢物在肠道损伤修复中的新机制 | 研究主要在小鼠模型中进行,人类肠道中的类似机制尚未验证 | 探究ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用机制 | 肠道上皮干细胞(ISCs)和再生干细胞(revSCs) | 细胞生物学 | 肠道损伤 | 单细胞转录组学、谱系追踪实验 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
48 | 2025-07-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of heat shock protein 90AA1 in Müller cell proliferation via the Necroptosis/MAPK pathway in diabetic retinopathy
2025-Jul-03, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110508
PMID:40617280
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研究论文 | 本研究探讨了热休克蛋白90AA1(HSP90AA1)在糖尿病视网膜病变(DR)中Müller细胞(MCs)增殖中的作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了HSP90AA1通过坏死性凋亡/MAPK通路在糖尿病视网膜病变中Müller细胞增殖的新机制 | 样本量较小(4名糖尿病患者和2名非糖尿病患者) | 研究糖尿病视网膜病变的细胞和分子机制 | Müller细胞(MCs) | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 4名糖尿病患者和2名非糖尿病患者的视网膜样本 |
49 | 2025-07-14 |
TriCLFF: a multi-modal feature fusion framework using contrastive learning for spatial domain identification
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf316
PMID:40639417
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研究论文 | 提出了一种基于对比学习的多模态特征融合框架TriCLFF,用于有效整合空间关联、基因表达水平和组织学特征,以精确识别空间域 | TriCLFF框架通过先进的特征融合机制,在空间域识别任务中表现出更高的准确性和鲁棒性,并能识别更细粒度的结构和未知基因表达模式 | 未明确提及具体局限性 | 开发一个多模态特征融合框架,以精确识别空间转录组学中的空间域 | 空间转录组学数据(包括空间关联、基因表达水平和组织学特征) | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 对比学习 | TriCLFF | 多模态数据(空间关联、基因表达、组织学特征) | 四个数据集(小鼠大脑前部、小鼠嗅球、人类背外侧前额叶皮层和人类乳腺癌) |
50 | 2025-07-14 |
Stratification of Hepatocellular Carcinoma Using N6-Methyladenosine
2025-Jul-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132220
PMID:40647517
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研究论文 | 本研究通过m6A相关基因构建了一个风险模型,用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果 | 首次利用m6A相关基因构建风险评分模型,并验证其在预测HCC患者预后和免疫治疗反应中的价值 | 研究样本量有限,且需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的可靠性 | 评估m6A相关基因在预测肝细胞癌患者总体生存和免疫治疗效果中的潜力 | 肝细胞癌(HCC)患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | 485例HCC患者(TCGA-LIHC和GSE76427数据集) |
51 | 2025-07-14 |
Current Landscape of Preclinical Models for Pediatric Gliomas: Clinical Implications and Future Directions
2025-Jul-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132221
PMID:40647519
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综述 | 本文综述了儿童高级别胶质瘤(特别是弥漫性中线胶质瘤)的临床前模型研究进展及其临床意义 | 总结了最新的体外、离体和体内模型,包括患者来源的脑类器官、基因工程小鼠模型和特定区域中线类器官,以及利用CRISPR-Cas9等技术精确研究肿瘤起始、进展和治疗抵抗 | 未提及具体模型的局限性或现有技术的不足 | 推进儿童高级别胶质瘤的有效治疗研究 | 儿童高级别胶质瘤,特别是弥漫性中线胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GEMMs, 脑类器官 | NA | NA |
52 | 2025-07-14 |
Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08952-w
PMID:40335695
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研究论文 | 本文研究了蓝斑核(LC)及其周围神经元在调节觉醒和探索行为中的作用 | 发现了LC树突场中转录、空间和功能多样化的GABA能神经元群体,这些神经元通过调节LC的放电模式来控制全局觉醒水平和相关行为 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚待验证 | 探索LC及其周围神经元如何调节觉醒和回避状态 | 小鼠的蓝斑核(LC)及其周围神经元 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 病毒追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、神经活动数据 | NA |
53 | 2025-07-14 |
A visual-omics foundation model to bridge histopathology with spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02707-1
PMID:40442373
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研究论文 | 本文提出了一种名为OmiCLIP的视觉-组学基础模型,旨在整合组织病理学与空间转录组学数据 | 开发了OmiCLIP模型,首次实现了组织病理学图像与转录组学数据的整合,并构建了Loki平台提供多种功能 | 未提及具体局限性 | 开发能够整合组织病理学图像与转录组学数据的计算方法 | 组织病理学图像和转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | OmiCLIP(视觉-组学基础模型) | 图像、转录组数据 | 220万对组织图像和转录组数据,覆盖32个器官 |
54 | 2025-07-14 |
NRF2 modulates WNT signaling pathway to enhance photodynamic therapy resistance in oral leukoplakia
2025-Jul, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00256-w
PMID:40494896
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研究论文 | 本研究探讨了NRF2通过调节WNT信号通路增强口腔白斑光动力疗法耐药性的机制 | 首次揭示了NRF2通过激活WNT信号通路在口腔白斑光动力疗法耐药性中的关键作用,并提出了NRF2抑制作为增强治疗效果的潜在策略 | 样本量相对较小(n=117),且机制研究主要基于动物模型 | 探究口腔白斑光动力疗法耐药性的分子机制 | 口腔白斑患者样本和4NQO诱导的小鼠模型 | 分子病理学 | 口腔白斑 | 单细胞RNA测序 | 4NQO诱导的小鼠模型 | RNA测序数据 | 117例患者样本(3例敏感,3例耐药)和动物模型 |
55 | 2025-07-14 |
High-resolution transcriptome atlas of bladder cancer highlights the functional myeloid subsets in modulating immune microenvironment
2025-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105801
PMID:40561775
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研究论文 | 该研究通过高分辨率转录组图谱揭示了膀胱癌中髓系细胞亚群的功能及其在调节免疫微环境中的作用 | 揭示了TREM2+巨噬细胞和CMA1+肥大细胞在膀胱癌组织中的代谢改变,并发现Trem2敲除可显著重编程肿瘤微环境并上调树突状细胞上的PD-L1表达 | 样本量较小(仅11例患者),且部分发现仍需进一步体内外实验验证 | 探究膀胱癌中髓系细胞亚群的免疫功能及其调控机制 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和正常膀胱组织中的髓系免疫细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组分析、密度梯度离心、体外培养和小鼠肿瘤模型 | NA | 转录组数据 | 11例膀胱癌患者的配对肿瘤和正常组织 |
56 | 2025-07-14 |
Combination antiretroviral therapy and MCL-1 inhibition mitigate HTLV-1 infection in vivo
2025-Jul-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.023
PMID:40645177
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研究论文 | 本研究探讨了针对人类T细胞淋巴病毒1型C亚型(HTLV-1c)感染的预防和治疗药物 | 发现HTLV-1c疾病比HTLV-1a更具侵袭性,并验证了联合抗逆转录病毒治疗与MCL-1抑制在体内显著减少HTLV-1c传播和疾病进展的效果 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发针对HTLV-1c感染的有效治疗策略 | 人类T细胞淋巴病毒1型C亚型(HTLV-1c) | 病毒学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞内流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据、流式细胞数据 | 人源化小鼠模型 |
57 | 2025-07-14 |
Defining Keypoints to Align H&E Images and Xenium DAPI-Stained Images Automatically
2025-Jun-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14131000
PMID:40643521
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research paper | 提出了一种名为Xenium-Align的关键点识别方法,用于自动生成Xenium Explorer软件中图像配准所需的关键点文件 | 开发了自动生成关键点文件的方法,减少了人工标注的工作量 | 方法的运行效率和可用性有待进一步优化 | 实现H&E图像和Xenium DAPI染色图像的自动对齐 | 人类肾脏样本和皮肤样本 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics | NA | image | 14个人类肾脏样本和1个人类皮肤样本 |
58 | 2025-07-14 |
GPX1 and RCN1 as New Endoplasmic Reticulum Stress-Related Biomarkers in Multiple Sclerosis Brain Tissue and Their Involvement in the APP-CD74 Pathway: An Integrated Study Combining Machine Learning and Multi-Omics
2025-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136286
PMID:40650067
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析、单细胞测序和动物模型验证,鉴定了13个与多发性硬化症(MS)相关的内质网应激(ERS)生物标志物,并探讨了它们在APP-CD74通路中的作用 | 首次结合机器学习与多组学方法鉴定了MS中新的ERS相关生物标志物GPX1和RCN1,并揭示了它们在APP-CD74通路中的参与机制 | 研究结果主要基于生物信息学分析和动物模型,需要进一步临床验证 | 探索多发性硬化症中内质网应激相关生物标志物的作用机制及其诊断治疗潜力 | 多发性硬化症患者脑组织和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | 加权基因共表达网络分析、机器学习算法、单细胞测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,涉及MS患者和EAE小鼠模型 |
59 | 2025-07-14 |
Identification of Potential Therapeutic Targets for Coronary Atherosclerosis from an Inflammatory Perspective Through Integrated Proteomics and Single-Cell Omics
2025-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136201
PMID:40649979
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research paper | 通过整合蛋白质组学和单细胞组学,从炎症角度识别冠状动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次通过整合蛋白质组学和单细胞组学数据,识别出与冠状动脉粥样硬化相关的11种蛋白质,并确认其中5种基因在平滑肌细胞中的特异性表达 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能在其他种族中的适用性有限 | 识别冠状动脉粥样硬化的炎症相关治疗靶点 | 冠状动脉粥样硬化患者和健康人群的蛋白质组学数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | Mendelian randomization (MR), 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据, 单细胞RNA测序数据 | UK-PPP队列(54,219参与者, 2,923蛋白质), 冰岛队列(35,559参与者, 4,907蛋白质) |
60 | 2025-07-14 |
Applications of Spatial Transcriptomics in Veterinary Medicine: A Scoping Review of Research, Diagnostics, and Treatment Strategies
2025-Jun-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136163
PMID:40649940
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综述 | 本文综述了空间转录组学在兽医学中的应用,包括研究、诊断和治疗策略 | 首次全面评估空间转录组技术在兽医学中的应用现状及未来潜力 | 兽医领域相关研究数量有限,存在疾病、物种、器官和地理偏倚 | 评估空间转录组学在人类和动物健康研究中的当前应用情况 | 2016年至2025年初发表的1398项相关研究 | 兽医学 | NA | 空间转录组学(10× Visium, Slide-seq, Nanostring GeoMx/CosMX, MERFISH) | NA | 基因表达数据 | 1398项符合条件的研究 |