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当前共找到 32684 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-18 |
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index
2025-Nov, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC
PMID:40938630
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析识别了非结核分枝杆菌肺病的新遗传位点，并发现体重指数可能具有保护作用 | 发现了两个新的NTM-PD相关遗传位点，并验证了一个已知位点，首次通过孟德尔随机化证明体重指数与NTM-PD存在潜在因果关系 | 研究样本主要来自亚洲人群，欧洲队列样本量相对较小 | 识别NTM-PD的遗传结构并探索其与风险因素的关联 | 非结核分枝杆菌肺病患者和健康对照者 | 基因组学 | 肺部疾病 | 全基因组关联研究, 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 韩国队列: 1,949例患者和2,955例对照; 日本队列: 1,137例患者和1,546例对照; 欧洲队列: 243例患者和570例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-11-18 |
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
PMID:41145665
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研究论文 | 本文介绍了CytoTRACE 2，一种用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜力的可解释深度学习框架 | 开发了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，在预测发育层次结构方面优于先前方法，能够详细绘制单细胞分化图谱 | NA | 预测细胞的绝对发育潜力，即细胞分化成其他细胞类型的能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-11-18 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals neutrophil diversity and spatial heterogeneity in acute kidney injury
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148478
PMID:41135905
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 首次在AKI中鉴定出6个中性粒细胞亚群，其中3个为全新发现；发现了以中性粒细胞为中心的新型微环境单元 | NA | 阐明急性肾损伤中中性粒细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 急性肾损伤模型中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-18 |
The cell as a token: high-dimensional geometry in language models and cell embeddings
2025-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf595
PMID:41165609
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综述 | 探讨自然语言嵌入结构理解如何为单细胞数据集分析提供启示 | 将语言模型中的标记概念与细胞嵌入相类比，提出高维几何结构的相似性分析 | NA | 探索语言模型分析方法在单细胞数据分析中的应用前景 | 单细胞测序数据和语言模型嵌入结构 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型, 语言模型 | 单细胞数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-11-18 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
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研究论文 | 本研究通过随机双盲安慰剂对照试验评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对中年健康成年人免疫系统的影响 | 首次在人体临床试验中证实尿石素A能够改善年龄相关的免疫衰退，并揭示了其对免疫细胞组成和功能的调节作用 | 样本量较小（50名参与者），干预时间较短（4周），研究对象仅限于健康中年成年人 | 评估尿石素A对年龄相关免疫衰退的干预效果 | 50名健康中年成年人 | 免疫学 | 老年性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，代谢分析 | NA | 临床数据，分子数据，细胞表型数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-18 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
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研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法，用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间，并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 解决将高维单细胞和空间转录组数据转化为功能通路洞察的挑战 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, scATAC-seq | 多重对应分析, 线性回归 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, scATAC-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-18 |
Advancing Precision Medicine in Inflammatory Skin Disease
2025-Nov, American journal of clinical dermatology
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s40257-025-00963-7
PMID:40819342
|
观点文章 | 本文探讨精准医学在慢性炎症性皮肤病治疗中的应用前景与挑战 | 提出将单细胞RNA测序和空间转录组学等精准技术整合到皮肤病诊疗框架中，通过分子表型分析提升治疗精准度 | 生物标志物验证有限、成本高昂、研究队列广度不足 | 推动精准医学在皮肤病学领域的临床应用 | 慢性炎症性皮肤病患者 | 精准医学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 分子表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2025-11-18 |
Specificity of brassinosteroid perception and its integration at signaling crossroads in vascular development
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70570
PMID:41235729
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综述 | 本文综述了油菜素甾醇信号感知的特异性及其在维管发育信号交叉点的整合机制 | 揭示了BR感知主要具有细胞自主性和强烈环境依赖性，并作为模块化局部调节器通过典型和非典型途径协调植物发育 | NA | 探讨油菜素甾醇信号感知的特异性及其与其他信号通路的整合机制 | 植物维管发育系统 | 植物分子生物学 | NA | 组织特异性CRISPR、先进成像技术、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-11-18 |
CluVar: clustering of variants using autoencoder for inferring cancer subclones from single cell RNA sequencing data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf603
PMID:41240059
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研究论文 | 提出基于自编码器的CluVar框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断癌症亚克隆的系统发育关系 | 开发了针对scRNA-seq数据高缺失率特点的自定义损失函数和多隐藏层聚类优化方法 | 未明确说明样本规模和对不同癌症类型的普适性验证 | 从单细胞RNA测序数据重建癌症亚克隆的进化轨迹 | 肿瘤组织中的恶性亚克隆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-11-18 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human bladder cancer
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00947-z
PMID:40819112
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和空间代谢组技术，揭示了人类膀胱癌的代谢异质性 | 首次结合空间转录组学和空间代谢组学技术系统研究膀胱癌的分子机制 | NA | 探索膀胱癌恶性转化的分子机制 | 人类膀胱癌组织及癌旁正常组织 | 空间生物学 | 膀胱癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 51 | 2025-11-18 |
Characterization of tertiary lymphoid structure identifies competitive binding of CD40 and STING with TRAF2 driving IRF4-mediated B cell activation in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00944-2
PMID:40855365
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌中三级淋巴结构的特征，揭示了CD40和STING与TRAF2竞争性结合驱动IRF4介导的B细胞活化机制 | 首次发现CD40和STING通过竞争性结合TRAF2调控IRF4表达和B细胞活化，并阐明CD40减少STING泛素化同时促进其磷酸化的新机制 | 研究主要基于体外实验和转录组数据分析，缺乏体内功能验证实验 | 探究三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌中的临床意义及其抗肿瘤作用的生物学机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和体外培养的B细胞 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体外实验 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-18 |
Bone morphogenetic protein 1 as a macromolecular pan-cancer biomarker modulating the immune microenvironment and malignant phenotypes in glioblastoma
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148136
PMID:41067356
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示骨形态发生蛋白1(BMP1)在胶质母细胞瘤中的致癌作用，并发现AH.6809化合物能有效抑制肿瘤生长 | 首次系统阐明BMP1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的调控机制，并通过分子对接发现新型抑制剂AH.6809 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多体内实验验证 | 探索BMP1在胶质母细胞瘤进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,动态模拟,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 利用TCGA、CGGA、GEO、CPTAC、TISCH、HPA、SpatialTME等多个公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-18 |
GPX2 induces macrophage M2 polarization through the MIF signaling pathway to promote colorectal cancer progression
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148341
PMID:41106750
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研究论文 | 本研究揭示了GPX2通过MIF信号通路诱导巨噬细胞M2极化从而促进结直肠癌进展的新机制 | 首次发现GPX2通过USP7介导的去泛素化稳定MIF表达，进而促进巨噬细胞M2极化的新信号轴 | NA | 阐明GPX2在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、动物模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-18 |
PseudotimeDE-fast: fast testing of differential gene expression along cell pseudotime
2025-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf573
PMID:41117775
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PseudotimeDE-fast的可扩展方法，用于在细胞伪时间轴上检测差异表达基因，并提供校准良好的P值 | 该方法解决了现有方法在伪时间推断中忽略不确定性导致无效P值或难以扩展到大型数据集的问题，在计算效率上有显著提升 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种快速、准确的检测细胞伪时间轴上差异表达基因的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-18 |
Single-Cell and Machine Learning Analysis Reveal Novel Inflammatory Macrophage Subtypes and Biomarkers in Periodontitis
2025-Oct-30, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103983
PMID:41172679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习分析牙周炎中新型炎症巨噬细胞亚型及其生物标志物 | 首次识别牙周炎相关巨噬细胞新型亚群并构建具有诊断价值的基因特征 | 研究样本量有限，主要基于体外实验验证 | 探索牙周炎中巨噬细胞异质性及其诊断价值 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-18 |
IGF1R deficiency mitigates acute lung injury by promoting anti-inflammatory transcriptional profiles
2025-Oct-22, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03339-x
PMID:41126254
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研究论文 | 本研究揭示IGF1R缺陷通过促进抗炎转录谱减轻急性肺损伤的分子机制 | 首次在单细胞水平系统揭示IGF1R在肺损伤中的调控作用，发现其缺陷可逆转炎症相关基因表达并影响表观遗传调控 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；未涉及临床治疗干预 | 探究IGF1R在急性肺损伤发病机制中的作用及潜在治疗价值 | 人类COVID-19患者肺组织、小鼠肺组织、原代小鼠胚胎成纤维细胞 | 生物医学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质检测, DNA损伤评估, 甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 蛋白质数据 | 人类COVID-19病例和对照供体肺组织、小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-18 |
Multi-omics analysis of ketogenic diet-mediated neural repair in spinal cord injury: Targeting of lysosomal autophagy through CTSB/LAMP2 regulation
2025-Oct-20, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110152
PMID:41115614
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究生酮饮食通过调控CTSB/LAMP2轴促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次整合4D蛋白质组学、转录组学和单细胞RNA测序揭示生酮饮食通过调节溶酶体自噬和微胶质细胞动态的双重神经保护机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床试验中验证 | 阐明生酮饮食在脊髓损伤中促进神经修复的分子机制 | C5半挫伤小鼠模型和β-羟基丁酸处理的BV2小胶质细胞 | 多组学分析 | 脊髓损伤 | 4D蛋白质组学,转录组学,单细胞RNA测序,组织病理学分析 | 小鼠脊髓损伤模型 | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据,行为学数据 | 从急性期到慢性期(0-8周)的时序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-11-18 |
CASP1 as a potential target of Dendrobium in Sjögren's syndrome: Multi-omics analysis and preliminary experimental evidence
2025-10-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115670
PMID:41101222
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索CASP1在原发性干燥综合征发病机制中的作用及石斛的潜在治疗机制 | 首次通过多组学整合分析发现CASP1作为石斛治疗干燥综合征的潜在靶点，并结合单细胞测序和分子对接进行多维度验证 | 因果关系和治疗效果需要进一步的功能验证研究 | 探索CASP1在原发性干燥综合征发病机制中的作用及石斛的治疗机制 | 原发性干燥综合征患者和健康对照 | 生物信息学 | 干燥综合征 | 转录组分析, 网络药理学, 单细胞测序, 分子对接, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 临床样本 | 65例pSS患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-11-18 |
Single-cell transcriptomic and genomic changes in the ageing human brain
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09435-8
PMID:40903571
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了人类前额叶皮层从婴儿期到百岁老人整个生命周期中的基因表达和基因组变化 | 首次结合单核RNA测序、单细胞全基因组测序和空间转录组学技术，系统揭示人类大脑衰老过程中的转录组和基因组动态变化 | 研究主要聚焦前额叶皮层，未涵盖其他脑区；样本年龄跨度大但具体样本数量未明确说明 | 探索人类大脑发育和衰老过程中的关键分子机制 | 人类前额叶皮层细胞 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间表达数据 | 从婴儿到百岁老人的年龄跨度样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-18 |
Disease-associated microglia in neurodegenerative diseases: Friend or foe?
2025-Oct, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003426
PMID:41118343
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综述 | 本文探讨神经退行性疾病中疾病相关小胶质细胞(DAM)的动态特征、起源及其治疗潜力 | 首次系统讨论DAM是否在所有神经退行性疾病中发挥通用传感器作用 | DAM在阿尔茨海默病模型外的普适性尚未明确验证 | 阐明疾病相关小胶质细胞在神经退行性疾病中的功能角色 | 疾病相关小胶质细胞(DAM) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |