单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32658 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-17 |
Six1-Eya1 Axis Governs Myofiber Remodeling and Fibrosis in Extraocular Myopathy: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mesenchymal Stem Cell Therapy in Thyroid Eye Disease
2025-Oct-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211708
PMID:41227354
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和间充质干细胞治疗，揭示了Six1-Eya1轴在甲状腺眼病眼外肌肌纤维重塑和纤维化中的调控作用 | 首次发现Six1和Eya1作为肌纤维分化和纤维化抑制的核心调控因子，并验证其在甲状腺眼病中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步临床验证 | 探究甲状腺眼病中眼外肌肌病的分子机制和治疗策略 | 甲状腺眼病小鼠模型、正常人和TED患者的成肌细胞 | 单细胞测序分析 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照个体和TED患者的成肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-17 |
Comparative Oncology: Cross-Sectional Single-Cell Transcriptomic Profiling of the Tumor Microenvironment Across Seven Human Cancers
2025-Oct-31, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213527
PMID:41228323
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对七种人类癌症的肿瘤微环境进行比较分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术对七种不同癌症类型的肿瘤微环境进行跨癌种比较分析 | 基于公开数据集的分析，BC和GC癌症需要进行亚型特异性分析 | 阐明不同癌症类型中肿瘤成分的差异转录和细胞间信号特征 | 七种人类癌症：胰腺导管腺癌、肝细胞癌、食管鳞状细胞癌、乳腺癌、甲状腺癌、胃癌和结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自七种癌症类型的公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-11-17 |
Deciphering the potential pathogeny of rare tracheal adenoid cystic carcinoma by single-cell RNA-sequencing
2025-Oct-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2025-832
PMID:41234575
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术对罕见气管腺样囊性癌的潜在致病机制进行深入解析 | 首次在单细胞水平揭示TACC可能起源于纤毛上皮细胞，并发现间皮细胞通过MIF-CD74信号通路与巨噬细胞相互作用的新机制 | 研究样本量有限（单细胞RNA-seq仅1例患者，mIHC验证4例患者） | 阐明气管腺样囊性癌的分子特征和致病机制 | 气管腺样囊性癌患者的肿瘤组织、癌旁组织和外周血 | 数字病理学 | 气管腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序，荧光多重免疫组化 | 生物信息学分析，伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据，免疫组化图像数据 | 1例患者进行单细胞RNA-seq，4例患者进行mIHC验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-11-17 |
Single-cell RNA profiling reveals an immunosuppressive microenvironment in EGFR double-mutant non-small cell lung cancer
2025-Oct-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2025-708
PMID:41234595
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示EGFR双突变非小细胞肺癌中的免疫抑制微环境特征 | 首次使用scFocuSCOPE平台在单细胞水平精确识别罕见突变癌细胞，并系统描述EGFR双突变NSCLC的免疫抑制特征 | 样本量相对较小，双突变病例罕见限制了大规模验证 | 阐明双突变非小细胞肺癌的免疫微环境特征及其治疗意义 | EGFR突变非小细胞肺癌患者样本和EGFR突变细胞系 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像 | 25例EGFR突变NSCLC样本，2例双突变患者进行时间序列分析 | NA | 单细胞RNA测序 | scFocuSCOPE | 用于单细胞水平精确识别和表征罕见突变癌细胞的测序平台 |
| 45 | 2025-11-17 |
Integrated multi-omic analysis unravels the characteristics of the metabolism-related intratumoral microbes and establishes a novel signature for predicting prognosis and therapeutic response in lung adenocarcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-357
PMID:41234824
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了肺腺癌中代谢相关瘤内微生物的特征，并建立了一个预测预后和治疗反应的新型标志物 | 首次系统识别了肺腺癌中与代谢相关的瘤内微生物，建立了基于微生物丰度的预后预测标志物，并揭示了这些微生物与肿瘤微环境的关联 | 基于公开数据集的分析，需要实验验证；样本量有限；机制研究不够深入 | 探究代谢相关瘤内微生物在肺腺癌中的特征、预后意义及其与肿瘤微环境的关系 | 肺腺癌患者样本和相关的微生物组、转录组数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析、微生物组分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、Spearman相关分析、无监督聚类、Scissor算法 | 无监督聚类、预后预测模型 | 微生物组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微生物组分析 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-17 |
The role of liquid-liquid phase separation in hepatocellular carcinoma: single-cell analysis and identification of prognostic biomarkers
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-726
PMID:41234822
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了液-液相分离相关特征(LLPSRS)模型，用于预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平系统研究液-液相分离在肝细胞癌中的作用，并构建了9基因预后特征模型 | NA | 评估液-液相分离相关特征在肝细胞癌中的预测价值和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,LASSO Cox回归 | 风险预测评分模型,列线图 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-17 |
Bulk and single-cell transcriptomics of stomach adenocarcinoma provide prognostic insights via the application of a novel gene signature associated with manganese metabolism
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1826
PMID:41234821
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库的RNA测序数据和临床信息，开发了一个基于锰代谢相关基因的胃腺癌预后特征模型 | 首次将锰代谢相关基因应用于胃腺癌的预后预测，并通过单细胞RNA测序验证了关键基因在特定细胞亚型中的表达模式 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索锰代谢相关基因在胃腺癌预后评估中的作用 | 胃腺癌患者及其肿瘤组织样本 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后评分模型, 聚类分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-11-17 |
Prognostic significance of key immune cell functional alterations in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-971
PMID:41234823
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别透明细胞肾细胞癌中的关键免疫细胞并构建预后模型 | 首次系统揭示CD8+ T细胞和NK细胞在ccRCC中的功能极化状态，并建立基于10个免疫相关基因的预后特征 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 阐明关键免疫细胞功能状态及其在透明细胞肾细胞癌预后中的作用 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 支持向量机, LASSO, 随机森林, Cox回归 | 基因表达数据 | 训练集511例(TCGA-KIRC), 验证集101例(E-MTAB-1980) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-17 |
Single-cell analysis revealed a diagnostic model of hepatocellular carcinoma based on cancer stem cell-related gene
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-606
PMID:41234843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了基于癌症干细胞相关基因的肝细胞癌诊断模型 | 整合单细胞RNA测序数据与DDRTree算法识别肝细胞癌中的癌症干细胞，并构建4基因预后特征模型 | 模型验证仅限于两个独立数据集，需要更大样本量的外部验证 | 建立可靠的基于癌症干细胞的肝细胞癌预后特征模型 | 肝细胞癌患者和癌症干细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 多变量Cox回归 | 预后预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-LIHC队列训练集和两个独立验证数据集(GSE14520-GPL571, GSE14520-GPL3921) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-11-17 |
Bioinformatics analysis identifies ULK3 as a novel prognostic and immune-related biomarker in esophageal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-989
PMID:41234868
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析发现ULK3是食管癌的新型预后和免疫相关生物标志物 | 首次系统研究ULK3在食管癌中的表达模式、预后价值和免疫调节功能 | 主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 探讨ULK3在食管癌预后和肿瘤免疫中的作用 | 食管癌患者组织和相关基因表达数据 | 生物信息学 | 食管癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | Cox回归模型,孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 多个GEO数据集和TCGA队列(包括96例ESCC,88例EAC等) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-11-17 |
A novel manganese metabolism- and immune-related prognostic risk model for acute myeloid leukemia
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-933
PMID:41234859
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于锰代谢和免疫相关基因的急性髓系白血病预后风险模型 | 首次结合锰代谢相关基因和免疫相关基因构建AML预后模型，并验证了其预测效能 | NA | 建立急性髓系白血病的预后风险预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，Cox回归分析，KEGG/GO富集分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-17 |
Identification of cancer-associated fibroblast subpopulation and construction of an immunotherapy signature for gastric cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-996
PMID:41234876
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别胃癌微环境中癌症相关成纤维细胞的四个亚群，并构建与免疫治疗反应相关的预后特征 | 首次系统识别胃癌微环境中CAFs的四个异质性亚群，并发现基于Cluster3的评分系统能显著区分患者预后和免疫治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 识别胃癌中癌症相关成纤维细胞亚群并评估其预后和免疫治疗相关性 | 胃癌患者和相关的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序，基因表达谱分析，KEGG通路富集分析，CIBERSORT算法 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-11-17 |
Single-cell analysis of tumor microenvironment immune homeostasis and identification of prognostic biomarkers in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-999
PMID:41234874
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫稳态并鉴定预后生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下揭示HNSCC中T细胞从初始状态到耗竭状态的分化轨迹，并构建基于六个关键基因的预后风险模型 | 预后风险模型的曲线下面积仅为0.66，预测性能有待提高 | 阐明头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫稳态机制并开发预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的T细胞亚群 | 单细胞分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 来自GEO和TCGA-HNSC项目的样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-11-17 |
CC/CXC chemokine risk signature at single-cell resolution: a machine learning model for precision stratification in cervical cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1137
PMID:41234865
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研究论文 | 本研究开发了基于趋化因子相关基因的宫颈癌预后风险特征，并在单细胞分辨率下探索了其在肿瘤微环境中的作用 | 首次构建趋化因子相关基因风险特征，在单细胞分辨率下揭示肿瘤-免疫-基质相互作用网络 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证 | 开发宫颈癌预后风险分层模型并探索其临床效用 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习算法 | Cox风险模型, 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA-CESC队列和GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | 使用Seurat进行单细胞数据分析，CellChat分析细胞间通讯 |
| 55 | 2025-11-17 |
Molecular dynamics simulation and single-cell and spatial transcriptomics validate immune and prognostic biomarkers in colorectal cancer and construct a clinical prognostic model
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-918
PMID:41234880
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研究论文 | 本研究通过整合分子动力学模拟、单细胞和空间转录组学技术，验证了结直肠癌中的免疫和预后生物标志物，并构建了临床预后模型 | 首次结合分子动力学模拟与单细胞和空间转录组学验证结直肠癌生物标志物，并构建多基因预后模型 | 研究样本主要来自公共数据库，缺乏前瞻性临床验证 | 系统识别结直肠癌中与免疫和预后相关的差异表达基因，验证其临床意义并构建可靠预后模型 | 698例结直肠癌患者的临床和RNA测序数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | LASSO, Cox回归, 五种机器学习算法 | 基因表达数据, 临床数据 | 698例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-17 |
CCT4 as a prognostic biomarker correlated with immune infiltration and hepatocyte dedifferentiation in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1277
PMID:41234881
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，探讨CCT4在肝细胞癌中的生物学功能及其与免疫浸润和肝细胞去分化的关联 | 首次在单细胞水平揭示CCT4通过促进肝细胞去分化和改变免疫微环境驱动肝癌进展的机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证CCT4的具体分子机制 | 探究CCT4在肝细胞癌中的生物学功能及其预后价值 | 肝细胞癌患者组织和相关数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 生物信息学分析 | Cox回归模型, 列线图模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-11-17 |
The role of cancer stem cells in the progression of colorectal cancer and the tumor microenvironment: new perspectives from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analyses
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-586
PMID:41234894
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析结直肠癌干细胞亚型在肿瘤微环境中的作用及预后标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析结直肠癌干细胞亚型的空间分布特征及其与肿瘤微环境的相互作用机制 | 未明确说明样本规模及实验验证的局限性 | 阐明结直肠癌干细胞在肿瘤进展中的作用机制并发现新的预后标志物 | 结直肠癌干细胞亚型(Co-CSS)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CytoTRACE干细胞特性分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2025-11-17 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveal T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in colorectal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1104
PMID:41234898
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了结直肠癌中T细胞相关的预后风险模型并研究肿瘤免疫微环境调控 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别T细胞特征基因并构建三基因预后模型 | 使用公共数据库数据，缺乏实验验证和前瞻性临床验证 | 探索T细胞异质性，识别特征基因并开发可靠的预后模型以预测患者结局和免疫治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，Cox回归，LASSO回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-11-17 |
Single-Cell and Machine Learning Analysis Reveal Novel Inflammatory Macrophage Subtypes and Biomarkers in Periodontitis
2025-Oct-30, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103983
PMID:41172679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习分析牙周炎中新型炎症巨噬细胞亚型及其生物标志物 | 首次在牙周炎中鉴定出具有促炎和免疫代谢特征的新型巨噬细胞亚群，并开发了基于五个关键基因的诊断模型 | 研究样本量有限，主要基于体外细胞模型验证，需要更大规模的临床验证 | 识别与牙周炎相关的巨噬细胞新亚群并探索其诊断和预后价值 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织样本及THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序，机器学习算法，伪时间轨迹分析，细胞间通讯分析 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-17 |
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2025-Oct-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102572
PMID:41172875
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研究论文 | 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型，用于指导骨肉瘤的治疗策略 | 首次将甘油磷脂代谢与骨肉瘤预后和免疫治疗反应联系起来，开发了优于42个已发表特征的预后模型 | 样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Lasso-Cox模型 | 转录组数据 | TARGET队列85例，GEO队列124例，单细胞RNA-seq数据6个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |