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当前共找到 32188 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-06 |
Identifying candidate genes for spermatogenic failure and predicting ICSI outcomes using single-cell RNA sequencing and protein-protein interaction networks
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf186
PMID:41033661
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过机器学习框架识别精子发生障碍候选基因并预测ICSI治疗结局 | 首次将单细胞转录组数据与PPI网络结合，利用机器学习算法同时实现基因优先排序和临床结局预测 | 训练数据依赖文献整理和数据库标注，可能存在错误分类或注释偏差；缺乏实验验证；外部队列样本量有限且多样性不足 | 改进精子发生障碍的基因优先排序方法并预测ICSI治疗结局 | 精子发生障碍患者（包括无精子症、弱精子症、畸形精子症） | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 随机森林, Node2Vec | 单细胞转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 临床数据 | 34名精子发生障碍亚型患者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-06 |
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02064-4
PMID:41044343
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研究论文 | 本研究揭示胶质母细胞瘤通过改变破骨细胞活性和增加颅骨通道数量，导致颅骨骨髓免疫景观改变并影响肿瘤进展 | 首次发现脑肿瘤可引起颅骨骨髓免疫景观改变，并证明骨吸收抑制在间充质亚型肿瘤中会促进肿瘤进展并抵消免疫检查点抑制剂疗效 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究脑肿瘤对颅骨骨髓免疫环境的影响机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Novel Prognostic Signatures in HNSCC Immunotherapy Response
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70171
PMID:40791099
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应，开发预后风险分层模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据开发LASSO-Cox风险分层模型，识别治疗前后免疫细胞亚群变化 | 样本量较小（仅3例患者），需更大队列验证 | 分析HNSCC免疫微环境变化并建立免疫治疗预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 3例HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别胰腺癌肝转移中新型OLR1+SLC7A7+肝脏富集转移亚群及其免疫代谢重编程特征 | 首次发现并表征了胰腺癌肝转移中具有代谢重编程和免疫抑制通路超活化的终末分化恶性细胞亚群LEMS | 需要扩大临床队列和体内模型以全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PDAC原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-11-06 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
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研究论文 | 通过回顾性转录组分析研究容积性肌肉损失损伤后线粒体基因和代谢通路的时间性失调 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集系统分析VML损伤后代谢转录组的动态变化 | 研究基于现有公开数据集，缺乏实验验证和功能研究 | 探究VML损伤后线粒体和代谢转录组的变化特征 | 大鼠和小鼠的肌肉组织样本 | 转录组学 | 肌肉损伤疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因集富集分析 | NA | 转录组测序数据 | 批量RNA-seq数据集（大鼠）和单细胞RNA-seq数据集（小鼠） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-11-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间代谢组学技术，揭示了人参属植物根尖细胞分化及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 首次在人参属植物中构建单细胞转录图谱，发现新型转录因子调控内皮层木栓化和人参皂苷生物合成，揭示跨物种保守及分化的配体-受体互作模式 | 研究仅聚焦于根尖发育早期阶段，未涵盖完整根系发育过程 | 探究人参属植物根尖细胞分化轨迹及人参皂苷生物合成的细胞特异性机制 | 三种人参属植物（Panax ginseng, Panax quinquefolius, Panax notoginseng）的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 双荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率实验, RNA原位杂交, 质谱成像, LC-MS/MS | NA | 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 质谱数据 | 三种人参属植物的根尖样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 47 | 2025-11-06 |
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70018
PMID:40044625
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研究论文 | 本研究探讨了miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡、炎症和氧化应激在骨关节炎治疗中的潜力 | 首次发现miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡参与骨关节炎发病机制 | 铁死亡在OA中的精确作用和潜在机制仍不完全清楚 | 探索骨关节炎的新型治疗策略 | 骨关节炎患者样本和C28/I2细胞系 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-11-06 |
SLGCA: spatial cross-level graph contrastive autoencoder for multislice spatial domain identification and microenvironment exploration
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf574
PMID:41182757
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研究论文 | 提出一种基于跨层级图对比学习的空间转录组数据分析方法SLGCA，用于多切片空间域识别和微环境探索 | 采用双通道学习机制，结合基于空间邻域信息的局部对比学习和跨视图的全局信息对比学习，无需预对齐即可整合多组织切片 | NA | 提升空间转录组数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,肝癌 | 空间转录组技术 | 图对比自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-06 |
Deciphering genetic associations with blood pressure in peripheral blood mononuclear cells through single-cell transcriptomic profiling
2025-Nov, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-025-02344-3
PMID:40877473
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示外周血单个核细胞中与血压相关的遗传关联 | 首次在14种不同免疫细胞类型中系统识别血压相关基因，并发现ERAP2基因在CD8+T细胞和自然杀伤细胞中的显著异常表达 | 样本量相对有限（18名个体），需要在更大规模人群中验证 | 识别免疫细胞中与血压相关的功能基因 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，全基因组关联研究，基于汇总数据的孟德尔随机化 | SMR方法 | 单细胞转录组数据 | 18名个体（10名主要研究+8名验证），总计140,613个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-11-06 |
Discovering Heterogeneous Leukocytes Subsets Associated With Alcoholic Steatohepatitis by scRNAseq Analysis
2025-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70448
PMID:41190282
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与酒精性脂肪性肝炎相关的异质性白细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统分析酒精性脂肪性肝炎中异质性免疫白细胞的组成变化和基因表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索酒精性肝病中免疫细胞类型对酒精性脂肪性肝炎的响应机制 | 酒精性肝病诱导小鼠和健康对照小鼠的免疫白细胞 | 单细胞基因组学 | 酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, SingleR | 单细胞基因表达数据 | 酒精性肝病诱导小鼠和健康对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-11-06 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Oct-31, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
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研究论文 | 一项随机双盲安慰剂对照试验，研究线粒体自噬诱导剂尿石素A对中年健康成年人免疫系统的影响 | 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够通过调节免疫细胞组成和功能来对抗年龄相关的免疫衰退 | 样本量较小(50人)，干预时间较短(4周)，研究对象仅限于健康中年人群 | 评估尿石素A对年龄相关免疫衰退的干预效果 | 50名健康中年成年人 | NA | 老年性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 代谢分析 | NA | 临床数据, 分子数据, 细胞数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-06 |
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013063
PMID:41176316
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研究论文 | 本研究揭示NRF2转录因子通过应激反应轴极化肿瘤相关巨噬细胞，导致免疫抑制并削弱免疫治疗效果 | 首次发现NRF2介导的应激反应轴在肿瘤巨噬细胞极化中的关键作用，并证明其与免疫治疗抵抗的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步开展 | 探究NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化及免疫治疗响应中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞、小鼠结肠癌模型MC38、乳腺癌模型MMTV-PyMT | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-06 |
Targeting neuronal cuproptosis and neuroinflammation with biomimetic nanoparticle for the therapy of radiotherapy-induced brain injury
2025-Oct-30, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种仿生纳米颗粒递送系统，用于治疗放疗引起的脑损伤 | 首次发现神经元铜死亡在放疗性脑损伤中的关键作用，并构建了能够同时抑制铜死亡和神经炎症的双重载药仿生递送系统 | 研究仍处于动物实验阶段，治疗机制仅初步揭示，需要进一步临床验证 | 开发治疗放疗性脑损伤的有效药物递送平台和治疗策略 | 放疗性脑损伤小鼠模型 | 神经科学 | 脑损伤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，行为学数据，组织学数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-06 |
Translational framework linking perfluoroheptanoic acid (PFHpA) exposure to metabolic dysfunction associated steatotic liver disease in adolescents
2025-Oct-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-01168-z
PMID:41162609
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研究论文 | 开发了一个连接PFHpA暴露与青少年代谢功能障碍相关脂肪肝病的转化研究框架 | 首次将人类队列数据与体外单细胞转录组学整合，揭示短链未受监管的PFAS同系物PFHpA与MASLD的关联 | 样本量相对较小(n=136)，且研究对象仅限于接受减肥手术的肥胖青少年 | 阐明PFAS对代谢功能障碍相关脂肪肝病发展的影响 | 青少年肥胖患者(平均年龄16.8岁)和体外培养的人肝球状体 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、肝活检 | LUCID模型 | 血浆样本、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 136名青少年肥胖患者 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-06 |
Cross-expression meta-analysis of mouse brain slices reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03747-8
PMID:41163012
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研究论文 | 本研究通过跨表达元分析揭示小鼠脑切片中空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 提出'跨表达'概念，避免使用人工标注数据库和细胞类型标签，同时控制细胞内在过程，从基因中心视角研究空间相邻细胞的表达协调 | 方法仅需要基因表达和细胞位置矩阵，但未明确说明对技术批次效应的处理细节 | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 小鼠脑组织切片 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学 | 跨表达网络分析 | 基因表达矩阵、空间位置数据 | 约2500万个细胞，695个切片来自52个大脑 | 多种技术平台（未具体说明） | 空间转录组学 | 8种不同技术 | 整合了8种不同技术的空间转录组学数据集 |
| 56 | 2025-11-06 |
Principles of protein abundance regulation across single cells in a mammalian tissue
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676955
PMID:41000751
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和蛋白质组学，首次在哺乳动物组织中系统量化了4200多个细胞的蛋白质合成与清除调控机制 | 首次在复杂组织单细胞水平进行蛋白质合成与清除的定量分析，揭示了翻译和蛋白质清除对细胞生长速率的线性依赖关系 | 研究仅限于单一原代组织样本，未验证其他组织或疾病状态下的普适性 | 探究哺乳动物组织中单细胞水平的蛋白质丰度调控机制 | 从小鼠原代组织中分离的4200多个单细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞转录组学，蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质丰度数据 | 超过4200个原代组织单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-06 |
Invariant HVC size in female canaries singing under testosterone: Unlocking function through neural differentiation, not growth
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426847122
PMID:41115194
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研究论文 | 通过体内成像和空间转录组学研究发现，睾酮诱导雌性金丝雀唱歌时HVC核团大小保持不变，而是通过神经元表型和基因网络变化实现功能分化 | 挑战了传统认为HVC核团在功能状态转换时会发生显著大小变化的观点，揭示了功能分化可在稳定解剖框架内通过转录组重组实现 | 研究仅针对雌性金丝雀，未验证其他物种或性别；样本数量有限 | 探究睾酮诱导唱歌行为时HVC核团的神经机制变化 | 成年雌性金丝雀的HVC song control nucleus | 神经科学 | NA | 双光子体内成像，空间转录组学 | NA | 图像数据，转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2025-11-06 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
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研究论文 | 本研究开发了一种名为DAISEE的新算法，用于分析复杂实验设计下收集的单细胞数据中的扰动响应 | 提出了DAISEE算法，能更有效地从混杂变异中分离扰动响应，并发现过度激活的信号传导能在发育胚胎中诱导新的基因表达状态 | NA | 研究发育信号传导扰动对胚胎细胞转录状态的影响 | 5小时龄斑马鱼胚胎细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-11-06 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示感觉神经元介导的CGRP信号是肉瘤进展的关键驱动因素 | 首次发现感觉神经元通过CGRP信号通路调控骨肉瘤进展，并验证FDA批准的药物干预神经支配可抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控功能 | 骨肉瘤小鼠模型和人类骨肉瘤样本 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序, 多组学分析 | TrkA基因敲入小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | 转基因小鼠模型和人类骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-06 |
Spatial gene expression analysis reveals pathological niches in Japanese encephalitis virus neuroinvasion
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515006122
PMID:41129224
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析日本脑炎病毒在小鼠大脑中的早期感染过程 | 首次在单细胞分辨率下绘制JEV感染过程中病毒RNA和宿主基因表达的空间分布图谱 | 研究仅关注感染早期阶段（1-4天），未涵盖疾病全程发展 | 阐明日本脑炎病毒神经侵袭的细胞动力学和病理生态位 | JEV感染的小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠大脑切片（1dpi和4dpi时间点） | NA | 空间转录组学 | NA | 高多重空间转录组平台 |