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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-10 |
Screening of Demethylation-related Biomarkers and Exploration of Regulatory Mechanisms in Esophageal Cancer Patients Based on Machine Learning and Mendelian Randomization
2026-Jun-08, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
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研究论文 | 基于机器学习和孟德尔随机化筛选食管癌患者去甲基化相关生物标志物并探索调控机制 | 整合加权基因共表达网络分析、机器学习算法与孟德尔随机化方法，系统筛选食管鳞状细胞癌中与去甲基化相关的预后基因并构建风险预测模型 | 未提及具体局限性，但可能需进一步实验验证基因功能及更大样本队列确认模型普适性 | 筛选食管鳞状细胞癌中去甲基化相关的预后生物标志物，并探索其调控机制及治疗意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、qPCR | 随机生存森林、LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量，但包含组织样本用于qPCR验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-06-10 |
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Jun-07, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121951
PMID:42259422
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研究论文 | 探讨四逆汤通过抑制HIF-1α依赖的外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的机制 | 首次发现四逆汤通过靶向HIF-1α抑制ITGαvβ5富集的外泌体分泌，进而阻断M2巨噬细胞极化，揭示其抗转移新机制 | 未提及具体局限性 | 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制，重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 | 小鼠结直肠癌肝转移模型、luciferase标记的CT26细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、ELISA、Western blotting、光谱流式细胞术、网络药理学、分子对接、CETSA | NA | 基因表达数据、图像、组织病理数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-06-10 |
ArchVelo: archetypal velocity modeling for single-cell multi-omic trajectories
2026-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74000-4
PMID:42248920
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研究论文 | ArchVelo是一个从配对单细胞染色质可及性和转录组数据推断细胞轨迹的计算框架 | 将染色质可及性表示为共享调控程序的“原型”（archetypes），模型调控对转录的动态影响 | 未提及 | 从静态单细胞数据推断细胞动态和基因调控轨迹 | 小鼠脑、人类造血、病毒感染的CD8 T细胞 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞多组学 | 原型速度模型 | 单细胞染色质可及性（scATAC-seq）和转录组（scRNA-seq）数据 | 小鼠脑、人类造血数据集及病毒感染的CD8 T细胞样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-06-10 |
Establishment and multi-omics characterization of a PD-1-resistant murine esophageal squamous cell carcinoma cell line
2026-Jun-06, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154109
PMID:42259198
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研究论文 | 建立并多组学表征一种PD-1耐药的鼠食管鳞癌细胞系 | 首次建立一种新型鼠食管鳞癌细胞系mESCC-030，该细胞系来源于4-NQO诱导的原发性食管鳞癌肿瘤，经过连续体内选择获得，表现出对PD-1抗体治疗的明显耐药性，并提供了一个典型的免疫冷肿瘤模型 | 未提及具体的局限性 | 探索食管鳞癌免疫治疗耐药机制及开发联合治疗策略 | 4-NQO诱导的C57BL/6小鼠原发性食管鳞癌细胞系mESCC-030 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序， 批量转录组分析 | NA | 转录组数据， 单细胞RNA测序数据 | 来源于C57BL/6小鼠的细胞系，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-06-10 |
From Multiomics Discovery to Clinical Validation: Identification of Novel Noninvasive Biomarkers for Liver Fibrosis
2026-Jun-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c01198
PMID:42192591
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研究论文 | 通过多组学和单细胞测序整合分析，鉴定并验证了THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化的新型非侵入性生物标志物 | 首次通过多组学发现与临床验证相结合的方法，系统鉴定了三个新型肝纤维化生物标志物，并开发了整合生物标志物与临床变量的多变量模型，显著提高了风险分层准确性 | 未提及具体局限性 | 鉴定用于肝纤维化早期诊断的非侵入性生物标志物 | 肝纤维化患者 | 机器学习的临床应用 | 肝纤维化 | 多组学、单细胞测序 | 多变量模型 | 多组学数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-06-10 |
Obesity promotes aggressiveness of endometrial cancer via metabolic reprogramming and intercellular crosstalk in the tumor microenvironment
2026-Jun-05, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218649
PMID:42250754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了肥胖通过代谢重编程和细胞间通讯促进子宫内膜癌侵袭性的机制 | 首次在单细胞分辨率下阐明肥胖如何通过调控肿瘤微环境驱动子宫内膜癌的发生与进展，并发现SOX9LGR5上皮亚群具有癌症干细胞特征 | 未提及具体局限性 | 探究肥胖通过调控肿瘤微环境促进子宫内膜癌侵袭性的机制 | 遗传小鼠模型（pten条件敲除）、子宫内膜癌患者临床样本、10个子宫内膜肿瘤样本 | 自然语言处理 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个子宫内膜肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 47 | 2026-06-10 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Jun-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117423
PMID:42241286
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研究论文 | 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR扰动技术，揭示了衰老限制人类免疫中CXCL13+滤泡辅助性T细胞成熟，导致抗体反应下降 | 首次发现人类特异性免疫衰老机制：衰老阻断CXCL13+ GC-Tfh细胞成熟而非B细胞功能缺陷，并鉴定出BACH2和SOX4为年龄相关分化调控因子 | 研究主要基于扁桃体组织，可能未完全反映全身免疫衰老的复杂性；具体机制在体内验证有限 | 探究人类衰老过程中抗体反应下降的细胞和分子机制，特别聚焦于滤泡辅助性T细胞（Tfh） | 人类扁桃体类器官中的Tfh细胞和B细胞，以及来自年轻和老年供体的免疫细胞 | 单细胞生物学，免疫学 | 老年病 | 单细胞RNA测序，CRISPR扰动，类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用来自年轻和老年供体的人类扁桃体类器官样本 | 10x Genomics，Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium，Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序平台进行单细胞RNA测序，Illumina NovaSeq进行测序 |
| 48 | 2026-06-10 |
CIPHER: An end-to-end framework for designing optimized aggregated spatial transcriptomics experiments
2026-Jun-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014362
PMID:42241464
|
研究论文 | 提出了一个端到端框架CIPHER，用于设计优化的聚合空间转录组实验 | 创新性地将实验编码矩阵和下游细胞嵌入联合优化，将成像检测的物理限制直接融入损失函数，以平衡解码精度和实验可测量性 | 主要依赖小鼠大脑scRNA-seq参考数据验证，未说明在其他组织或条件下的通用性 | 为基于聚合测量的空间转录组设计目标导向的、与scRNA-seq对齐的特征 | 聚合转录特征中的基因聚合策略和细胞嵌入优化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, scRNA-seq | 神经网络 | 基因表达数据 | 大规模小鼠大脑scRNA-seq参考数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-06-10 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2026-Jun-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2026.05.005
PMID:42242209
|
研究论文 | 提出STACCato工具，通过监督张量分析识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 首次使用基于张量的回归模型进行条件相关CCC事件的统计推断，同时处理混杂因素和事件间依赖关系 | 实际应用中可能受限于单细胞数据的稀疏性和噪声影响 | 开发能全面解决现有CCC事件与生物条件关系分析方法局限性的计算工具 | 细胞间通讯（CCC）事件与生物条件（如疾病状态或组织类型）的关联 | 机器学习 | 自身免疫性疾病（狼疮），神经发育疾病（自闭症） | scRNA-seq, snRNA-seq | 张量回归模型 | 单细胞转录组数据 | 狼疮scRNA-seq数据集和自闭症snRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-06-10 |
Tissueformer: extending single-cell foundation models to predict population-level phenotypes
2026-Jun-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06490-4
PMID:42243667
|
研究论文 | 介绍TissueFormer，一种基于Transformer的神经网络，通过群体单细胞RNA图谱推断群体水平表型，优于单细胞基础模型和传统机器学习方法 | 首次将Transformer架构应用于从单细胞RNA图谱中同时保留单细胞分辨率并推断群体水平标签，克服了传统方法忽视样本内细胞组成的局限 | 未明确提及局限性 | 开发能够从单细胞RNA测序数据中预测群体水平表型的计算框架 | 人类血液样本中的COVID-19严重程度预测和小鼠大脑空间转录组学数据的皮层区域身份预测 | 机器学习 | 新型冠状病毒病，神经发育疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 人类血液样本（COVID-19研究）和小鼠大脑样本（空间转录组学研究） | 无 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 无 | 无 |
| 51 | 2026-06-10 |
Transcriptomic characters of cochlear vascular cells with pericyte-driven angiogenetic activity
2026-Jun-04, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-026-10060-w
PMID:42240743
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析成年小鼠耳蜗血管细胞，发现周细胞驱动的血管生成活性 | 首次发现耳蜗微血管内皮细胞和周细胞具有高于血脑屏障的血管生成潜力，并鉴定出两种新的周细胞亚型及其在血管新生中的尖端细胞样行为 | 研究基于小鼠模型，未在人类样本中验证；ex vivo模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明耳蜗血管细胞的转录组特征及其在血迷路屏障中的功能 | 成年小鼠耳蜗血管内皮细胞和周细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠耳蜗组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 52 | 2026-06-10 |
Decoding Occult Cervical Lymph Node Metastasis in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: From AI-Driven Multimodal Fusion to Clinical Translation
2026-Jun-04, Current oncology reports
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s11912-026-01802-6
PMID:42240903
|
综述 | 本文综述了传统宏观方法在检测头颈部鳞状细胞癌隐匿性颈淋巴结转移中的局限性，并探讨了多组学技术与人工智能驱动的跨尺度多模态融合如何重塑对临床淋巴结阴性患者的精准诊断 | 提出结合高通量组学数据（如全基因组DNA甲基化和空间转录组学）与影像组学，通过深度学习模型实现显著优于传统影像学的性能；引入栖息地影像组学和跨模态融合网络等新计算策略，更详细地表征空间肿瘤异质性并揭示早期转移过程中肿瘤微环境的演变 | 未明确提及具体局限性，但指出需要进一步验证以支持更安全的手术降级和个性化治疗策略 | 探讨多组学技术与人工智能驱动的多模态整合如何改善对临床淋巴结阴性头颈部鳞状细胞癌患者的精准诊断和风险分层 | 临床淋巴结阴性头颈部鳞状细胞癌患者的隐匿性颈淋巴结转移 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 全基因组DNA甲基化测序、空间转录组学、影像组学 | 深度学习 | 影像数据、组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-06-10 |
Chenodeoxycholic acid redirects the bile acid synthetic pathway to limit pro-inflammatory neutrophil infiltration and alleviate colitis
2026-Jun-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.004
PMID:41792997
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研究论文 | 揭示鹅去氧胆酸通过重编译胆汁酸合成途径限制促炎性中性粒细胞浸润并缓解结肠炎 | 首次阐明结肠炎对肝脏胆汁酸合成途径的影响，发现鹅去氧胆酸可通过替代途径减轻结肠炎，并揭示其通过维生素D受体抑制CXCL2的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床样本量有限，且未完全阐明胆汁酸代谢与肠道菌群的相互作用细节 | 探究结肠炎对肝脏胆汁酸合成的影响及鹅去氧胆酸的治疗潜力 | 炎症性肠病（IBD）患者样本、小鼠结肠炎模型、单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床样本 | 包含公开数据集、院内患者样本及动物模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台 | 单细胞RNA测序用于分析结肠上皮细胞和免疫细胞 |
| 54 | 2026-06-10 |
HIV-1 infection converts CD4+ T cells to HLA class II-restricted CD8+ T cells
2026-Jun-03, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aec4912
PMID:42234775
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研究论文 | 研究发现HIV-1感染可将CD4+ T细胞转化为HLA II类限制性CD8+ T细胞，揭示了病毒驱动宿主细胞重编程的新机制 | 首次发现HIV-1通过Vpr蛋白上调TGF-β1，诱导CD4 T细胞直接转化为CD8 T细胞，并证明此类CD8 T细胞构成HIV-1潜伏库中先前被忽视的组分 | 未在文中明确说明 | 探究HIV-1感染后CD4 T细胞能否恢复CD4表达及其命运轨迹 | HIV-1感染者的CD4和CD8 T细胞 | 机器学习 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 测序数据 | 来自未经治疗和抗逆转录病毒治疗抑制的HIV-1感染者以及健康对照者的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-06-10 |
Reference-informed spatial domain detection using weak supervision for spatial transcriptomics
2026-Jun-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281260.125
PMID:42236081
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研究论文 | 提出一种名为GraphScrDom的弱监督对比学习模型，整合参考单细胞RNA-seq数据和专家注释，用于空间转录组数据的组织分割 | 首次将参考信息与弱监督对比学习结合，仅需少量涂鸦注释即可实现空间域检测 | 依赖参考单细胞RNA-seq数据的质量，且涂鸦注释仍需专家参与 | 开发一种通用且稳健的空间转录组组织分割方法 | 空间转录组数据中的组织区域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | 对比学习模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-06-10 |
Modulation of intestinal bile acids influences colonic mucosal responses
2026-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55206-4
PMID:42236792
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研究论文 | 研究肠道胆汁酸调节对结肠黏膜反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序结合靶向定植小鼠和人类活检样本，详细解析次级胆汁酸（尤其是DCA）对结肠上皮细胞类型和功能的影响 | 未提及 | 确定肠道上皮对胆汁酸调节的体内和原位反应 | 小鼠结肠上皮细胞及人类结肠组织活检样本 | 转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、免疫染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 定植小鼠（具体数量未明确）及人类活检样本（包括观察性队列和干预研究） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-Seq |
| 57 | 2026-06-10 |
IL-22 promotes genesis of small intestinal secretory cells that protect against cholera in mice
2026-Jun-03, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02375-7
PMID:42236988
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-22促进小肠分泌细胞生成以保护小鼠免受霍乱弧菌感染 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统描绘了IL-22Fc预防治疗对婴儿小鼠小肠上皮和免疫细胞基因表达谱的影响，并揭示了IL-22通过促进抗菌蛋白Reg3β和黏液分泌细胞来限制霍乱弧菌定植的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结论向人类的转化仍需验证；IL-22Fc的预防性治疗策略在临床中的应用尚需进一步评估 | 阐明白介素-22在小肠先天免疫防御霍乱弧菌感染中的作用机制 | 婴儿小鼠和霍乱弧菌 | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 婴儿小鼠小肠上皮和免疫细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 58 | 2026-06-10 |
Modeling the role of urokinase-type plasminogen activator, uPA, and circulating cancer-associated fibroblasts (cCAFs) in breast cancer cell extravasation
2026-Jun-03, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10411-3
PMID:42234219
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研究论文 | 探讨尿激酶型纤溶酶原激活物（uPA）和循环肿瘤相关成纤维细胞（cCAFs）在乳腺癌细胞外渗中的作用 | 首次揭示cCAFs通过与三阴性乳腺癌细胞共簇上调PLAU/uPA表达，促进癌细胞从毛细血管后微静脉外渗至肺实质 | 基于小鼠尾静脉注射模型，可能无法完全模拟人类乳腺癌转移的微环境；体外实验使用HUVEC细胞，与肺毛细血管内皮细胞存在差异 | 阐明循环肿瘤相关成纤维细胞如何促进乳腺癌细胞外渗的分子机制 | 三阴性乳腺癌MDA-MB231细胞和CAF23成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用MDA-MB231细胞和CAF23细胞系，具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-06-10 |
Cucurbitacin B targets PPAT to suppress de novo purine biosynthesis in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Jun-03, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158362
PMID:42259163
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研究论文 | 本研究揭示葫芦素B通过靶向PPAT抑制食管鳞状细胞癌中从头嘌呤生物合成途径，从而抑制肿瘤生长并增强放射治疗疗效 | 首次发现葫芦素B通过TRIM38介导的泛素化降解PPAT，抑制从头嘌呤生物合成通路，并证实其作为放射增敏剂的潜力 | NA | 阐明PPAT在食管鳞状细胞癌进展中的作用及靶向PPAT的治疗潜力 | 食管鳞状细胞癌 | NA | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、基于结构的虚拟筛选、分子对接、pull-down、CETSA、泛素化分析 | NA | 细胞、动物模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-06-10 |
scMEDAL: interpretable single-cell transcriptomics analysis with batch effect visualization via deep mixed-effects autoencoder
2026-Jun-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72666-4
PMID:42230590
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研究论文 | 提出scMEDAL框架，通过深度混合效应自编码器可视化并建模单细胞转录组测序中的批次效应 | 首次设计随机效应贝叶斯自编码器（scMEDAL-RE），独立分离批次不变与批次特异性效应，并保留通常被标准校正方法丢弃的生物信息 | 未明确讨论计算复杂度或对超大规模的扩展性 | 开发一种可解释的批次效应建模方法，以保留与批次混杂的生物信号并提高疾病状态预测能力 | 来自自闭症、白血病和心血管疾病的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 自闭症、白血病、心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度混合效应自编码器、贝叶斯自编码器 | 单细胞转录组表达数据 | 涉及多种疾病（自闭症、白血病、心血管疾病）及不同细胞类型的技术和生物效应 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |