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当前共找到 38123 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-06 |
Transcriptome and DNA methylation profiling during the NSN to SN transition in mouse oocytes
2025-Jan-03, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00527-3
PMID:39754059
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和DNA甲基化分析，表征了小鼠卵母细胞从非环绕核仁到环绕核仁阶段的转录组和DNA甲基化变化 | 开发了一种基于转录组数据的分类器，可用于推断单细胞或批量RNA-seq数据中的染色质状态，并识别了与异常染色质修饰组合相关的晚期甲基化区域 | 研究仅基于小鼠模型，可能不直接适用于其他物种，且单细胞技术可能存在技术变异 | 探究小鼠卵母细胞在NSN到SN过渡期间的转录组和DNA甲基化动态变化 | 小鼠卵母细胞，特别是GV期卵母细胞，根据核染色分为NSN和SN阶段 | 表观遗传学 | NA | 单细胞M&T-seq（scM&T-seq）、scRNA-seq、sc-bisulphite-seq（scBS-seq）、Hoechst染色、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | 分类器（基于转录组数据） | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、染色质修饰数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多个已发表数据集的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-04-06 |
CD206+ Trem2+ macrophage accumulation in the murine knee joint after injury is associated with protection against post-traumatic osteoarthritis in MRL/MpJ mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312587
PMID:39752388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了小鼠膝关节损伤后免疫细胞变化与创伤后骨关节炎（PTOA）易感性之间的关系 | 首次在PTOA易感性和抵抗性小鼠模型中，通过单细胞RNA测序揭示了CD206+ Trem2+巨噬细胞在关节损伤后的积累与保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证，且样本量相对较小 | 探究创伤后骨关节炎（PTOA）发展或缓解的分子机制 | PTOA易感的C57BL/6J（B6）小鼠和PTOA抵抗的MRL/MpJ（MRL）小鼠的滑膜关节 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种小鼠品系（B6和MRL）的膝关节样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-04-06 |
Dissecting the molecular mechanisms of T cell infiltration in psoriatic lesions via cell-cell communication and regulatory network analysis
2025, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1231
PMID:41883387
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析，揭示了银屑病皮损中T细胞浸润的分子机制，并发现姜黄素类似物CuE通过抑制IL-6-STAT3-MDK信号轴缓解症状 | 首次结合单细胞RNA测序、假时间分析、细胞间通讯分析和调控网络分析，系统解析了银屑病中成纤维细胞通过MDK信号介导T细胞募集的机制，并验证了CuE通过靶向该信号轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析，人体组织样本的验证可能有限；信号通路的上下游调控细节有待进一步阐明 | 阐明银屑病皮损中T细胞浸润的细胞间通讯机制和调控网络，并探索潜在的治疗靶点 | 银屑病皮肤组织（小鼠模型及可能的人体样本）、T细胞、成纤维细胞、内皮细胞、黑色素细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-04-06 |
Rhythmic IL-17 production by γδ T cells maintains adipose de novo lipogenesis
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08131-3
PMID:39478228
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研究论文 | 本研究揭示了γδ T细胞通过昼夜节律性产生IL-17来维持脂肪组织从头脂肪生成，从而影响全身代谢稳态 | 首次发现IL-17产生的γδ T细胞依赖分子钟维持脂肪组织稳态，并揭示IL-17在全身代谢节律中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究免疫系统昼夜节律在组织稳态中的作用，特别是IL-17产生细胞对脂肪代谢的影响 | 小鼠的γδ T细胞、iNKT细胞、MAIT细胞及脂肪组织 | 免疫学与代谢研究 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、分子钟报告基因、遗传操作、全身代谢分析 | NA | RNA测序数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538498
PMID:37163077
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研究论文 | 本文开发了一种名为iAssembloids的3D共培养系统，结合CRISPRi筛选技术，用于研究神经元与胶质细胞之间的相互作用机制 | 首次将iAssembloids系统与大规模CRISPRi筛选结合，揭示了在3D共培养环境中GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激反应的新机制，这在2D单培养神经元筛选中未被发现 | 研究基于体外3D模型，可能无法完全模拟体内大脑的复杂环境，且样本规模可能有限 | 阐明神经元与胶质细胞在脑健康和疾病中的相互作用机制 | 神经元和胶质细胞（包括星形胶质细胞） | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、CRISPRi筛选、免疫组织化学 | iAssembloids（诱导多谱系组装体） | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-04-06 |
aKNNO: single-cell and spatial transcriptomics clustering with an optimized adaptive k-nearest neighbor graph
2024-Aug-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03339-y
PMID:39090647
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研究论文 | 本文介绍了一种名为aKNNO的新方法，用于单细胞和空间转录组学数据聚类，通过优化的自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | aKNNO通过自适应k近邻图优化，克服了传统方法在识别稀有细胞类型时性能下降的问题，实现了对丰富和稀有细胞类型的准确同时识别 | NA | 开发一种能同时准确识别丰富和稀有细胞类型的单细胞和空间转录组学聚类方法 | 单细胞和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 自适应k近邻图 | 基因表达数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-04-06 |
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1336135
PMID:38690527
|
研究论文 | 本文介绍了PAGER-scFGA工具，用于通过单细胞功能基因组学分析揭示细胞轨迹中的细胞功能和分子机制 | 开发了PAGER-scFGA工具，整合细胞功能注释和基因集富集分析到单细胞分析流程中，支持细胞轨迹的功能探索和基因网络构建 | NA | 促进细胞群的功能注释和细胞轨迹分子机制的表征 | 小鼠自然杀伤细胞 | 单细胞功能基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-04-06 |
Canine peripheral blood TCRαβ T cell atlas: Identification of diverse subsets including CD8A+ MAIT-like cells by combined single-cell transcriptome and V(D)J repertoire analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1123366
PMID:36911660
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，首次构建了健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱，并鉴定了包括CD8A+ MAIT样细胞在内的多种新亚群 | 首次在犬中结合单细胞转录组和V(D)J组库分析，揭示了犬T细胞多样性，特别是发现了犬黏膜相关恒定T细胞（MAIT）样细胞等先前未描述的亚群 | 研究仅基于健康犬外周血样本，未涉及疾病状态或其他组织，且犬特异性抗体的缺乏限制了传统流式细胞术验证 | 生成健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱，以增进对犬T细胞多样性的理解，并为人类疾病模型研究提供参考 | 健康犬的外周血TCRαβ T细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），免疫组库测序 | NA | 单细胞转录组数据，V(D)J序列数据 | 未明确指定样本数量，但基于健康犬外周血 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-04-06 |
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63333
PMID:33647234
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α（ERα）在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响，并证明ERα在此过程中的关键介导作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 | 小鼠 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-04-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
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研究论文 | 本研究通过清除老年小鼠体内的衰老细胞，减轻了大脑炎症并改善了认知功能 | 首次证明在正常衰老过程中清除衰老细胞可以改善认知功能障碍，并发现衰老细胞在小胶质细胞和少突胶质前体细胞中显著增加 | 研究仅在INK-ATTAC转基因小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能缓解衰老过程中的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | RNA测序数据 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | NA | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-04-06 |
Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses
2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw202
PMID:27153638
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA-seq数据分析的beta-Poisson混合模型，以捕捉基因表达的双峰分布特征 | 引入beta-Poisson混合模型来捕捉单细胞RNA-seq数据中的双峰分布，优于传统的gamma-Poisson模型 | 未明确说明模型在处理大规模数据集或复杂实验设计时的计算效率限制 | 开发一种适用于单细胞RNA-seq数据的统计模型，以改进差异表达分析 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | beta-Poisson混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-04-05 |
MLRR-ATV: A Robust Manifold Nonnegative Low-Rank Representation With Adaptive Total-Variation Regularization for scRNA-seq Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3432740
PMID:39046863
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MLRR-ATV的新型单细胞RNA测序数据聚类方法，通过自适应全变分正则化和流形学习来减少噪声影响并保留数据结构 | 将自适应全变分正则化引入低秩表示模型，通过梯度学习减少噪声，并同时学习线性和非线性流形结构 | 模型是非凸的，需要采用交替方向乘子法进行优化，可能影响计算效率 | 开发一种鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法，以改善基因表达数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-04-05 |
Deep Imputation Bi-Stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-Cell RNA-Sequencing Data
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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研究论文 | 提出一种基于深度矩阵分解和双随机图正则化的单细胞RNA测序数据聚类新方法 | 结合特征选择、缺失值填补、降维处理和双随机图正则化的深度矩阵分解框架 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率及对特定细胞类型的适用性 | 开发单细胞RNA测序数据的聚类算法以揭示细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 九个数据集（未指定具体样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-04-05 |
Human organoids with an autologous tissue-resident immune compartment
2024-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07791-5
PMID:39143209
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研究论文 | 本研究开发了包含自体组织驻留免疫细胞的人类肠道免疫类器官，用于模拟上皮与免疫系统的相互作用 | 首次构建了整合自体组织驻留记忆T细胞的人类肠道免疫类器官，能够模拟体内免疫-上皮相互作用 | 类器官系统可能无法完全复制体内复杂的微环境，且研究主要聚焦于T细胞，未涵盖所有免疫细胞类型 | 研究组织驻留免疫细胞与上皮细胞的相互作用机制，及其在疾病中的作用 | 人类肠道上皮细胞和自体组织驻留记忆T细胞 | 细胞生物学 | 自身免疫疾病和癌症 | 单细胞转录组学 | 人类肠道免疫类器官 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-04-05 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序，并鉴定了控制雄性发育的关键转录因子Myb-M | 推翻了现有模型，提出隐孢子虫仅存在三种细胞内阶段；首次鉴定了决定雄性命运的最早转录因子Myb-M；通过条件性表达和敲除证明了该因子对发育程序和感染的调控作用 | NA | 阐明隐孢子虫生命周期和性别发育的分子机制，为疫苗和治疗开发提供新靶点 | 隐孢子虫（Cryptosporidium parvum） | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 体外培养和感染动物模型中的隐孢子虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-04-05 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
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研究论文 | 本研究通过体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示了吉兰-巴雷综合征患者中靶向周围神经髓鞘抗原的自反应性T细胞的存在及其特征 | 首次在吉兰-巴雷综合征患者中鉴定出具有细胞毒性T辅助1样表型的自反应性记忆CD4 T细胞和罕见CD8 T细胞，并证明这些细胞在血液和脑脊液中共享，且直接参与疾病病理生理 | 研究样本量有限，仅从一名患者的神经活检中鉴定出自反应性T细胞，且疾病亚型聚焦于脱髓鞘变异型 | 探究吉兰-巴雷综合征的自免疫机制，特别是自反应性T细胞在疾病中的作用 | 吉兰-巴雷综合征患者（尤其是脱髓鞘变异型）的血液、脑脊液和神经活检样本 | 免疫学 | 吉兰-巴雷综合征 | 体外T细胞筛选、单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 超过1,000个自反应性单T细胞克隆，来自多名患者和对照个体的血液、脑脊液及一名患者的神经活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-04-05 |
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06797-9
PMID:38057662
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动促肿瘤性髓系生成的关键作用，并探索了其作为免疫检查点阻断联合疗法的潜力 | 首次在人类和小鼠非小细胞肺癌中通过单细胞RNA测序鉴定出IL-4是肿瘤浸润单核细胞来源巨噬细胞表型的主要驱动因子，并发现骨髓中嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞来源的IL-4通过作用于粒细胞-单核细胞祖细胞编程免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的发育 | 临床试验样本量较小（仅6名患者），且仅有一名患者显示出接近完全的临床反应，需要更大规模的验证 | 探究免疫抑制性髓系细胞状态的分子驱动机制，并开发针对癌症的系统性治疗策略 | 人类和小鼠的非小细胞肺癌病变组织及骨髓细胞 | 单细胞测序与免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠非小细胞肺癌样本，临床试验涉及6名复发或难治性非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-04-05 |
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37050-y
PMID:37330615
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了先天性膈疝（CDH）肺中微血管内皮细胞的异质性，特别是炎症性mvEC簇和mvCa4+ ECs的减少，可能参与疾病发病机制 | 首次在CDH模型中利用单细胞RNA测序识别出转录组学上不同的微血管内皮细胞簇，包括独特的炎症性mvEC簇和与肺发育相关的mvCa4+ ECs减少 | 研究基于大鼠硝苯酮模型，可能无法完全模拟人类CDH的复杂性；样本量相对较小；未进行功能验证实验 | 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 大鼠胎儿肺组织（E21.5），包括健康对照组、硝苯酮暴露对照组和硝苯酮诱导的CDH组 | 数字病理学 | 先天性膈疝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组大鼠胎儿肺组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-04-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类脉络膜中巨噬细胞的起源和异质性，特别是在稳态和实验性脉络膜新生血管形成（CNV）条件下的变化 | 首次系统性地揭示了脉络膜巨噬细胞在稳态和激光损伤后的异质性，并鉴定了小鼠和人类中不同的巨噬细胞亚群及其与疾病（如nAMD）的关联 | 研究主要基于小鼠模型和已发表的单细胞RNA-seq数据，可能无法完全反映人类nAMD的复杂性，且样本量有限 | 探究脉络膜巨噬细胞的起源、异质性及其在脉络膜新生血管形成（CNV）中的作用，以寻找nAMD的潜在治疗靶点 | 小鼠（野生型和Ccr2-/-突变体）以及人类脉络膜样本（来自健康个体和nAMD患者） | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA-seq、命运映射 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA-seq数据 | 小鼠模型和已发表的人类单细胞RNA-seq数据（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-04-05 |
Simultaneous single-cell profiling of lineages and cell types in the vertebrate brain
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4103
PMID:29608178
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研究论文 | 本研究开发了scGESTALT方法，结合CRISPR-Cas9条形码编辑和单细胞RNA测序，用于同时分析脊椎动物大脑中的细胞谱系和类型 | scGESTALT通过可诱导系统在多个时间点编辑条形码，首次实现了在发育后期同时进行大规模谱系追踪和细胞类型鉴定 | 方法目前主要应用于斑马鱼大脑，在其他生物体或疾病模型中的适用性有待进一步验证 | 开发一种同时分析细胞谱系关系和细胞类型的方法，以揭示脊椎动物大脑发育过程中的分化限制 | 斑马鱼大脑中的细胞 | 单细胞组学 | NA | CRISPR-Cas9条形码编辑，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约60,000个转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |